MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_011852	CAC	2	6	1213331	1213336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871403
19003	NC_011852	ATG	2	6	1213373	1213378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871403
19004	NC_011852	CTG	2	6	1213394	1213399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871403
19005	NC_011852	ATA	2	6	1213446	1213451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871403
19006	NC_011852	TTCAC	2	10	1213542	1213551	20 %	40 %	0 %	40 %	219871404
19007	NC_011852	GCTT	2	8	1213561	1213568	0 %	50 %	25 %	25 %	219871404
19008	NC_011852	GGC	2	6	1213609	1213614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871404
19009	NC_011852	AACGT	2	10	1213672	1213681	40 %	20 %	20 %	20 %	219871404
19010	NC_011852	TGG	2	6	1213694	1213699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871404
19011	NC_011852	AGT	2	6	1213856	1213861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871404
19012	NC_011852	CA	3	6	1214050	1214055	50 %	0 %	0 %	50 %	219871404
19013	NC_011852	CAC	2	6	1214073	1214078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871404
19014	NC_011852	ATC	2	6	1214089	1214094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871404
19015	NC_011852	CAC	2	6	1214113	1214118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871404
19016	NC_011852	TTC	2	6	1214156	1214161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871404
19017	NC_011852	CGA	2	6	1214219	1214224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871404
19018	NC_011852	TGCCG	2	10	1214254	1214263	0 %	20 %	40 %	40 %	219871404
19019	NC_011852	CTT	2	6	1214298	1214303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871404
19020	NC_011852	CA	3	6	1214306	1214311	50 %	0 %	0 %	50 %	219871404
19021	NC_011852	TGGC	2	8	1214367	1214374	0 %	25 %	50 %	25 %	219871404
19022	NC_011852	T	6	6	1214398	1214403	0 %	100 %	0 %	0 %	219871404
19023	NC_011852	TTGG	2	8	1214413	1214420	0 %	50 %	50 %	0 %	219871404
19024	NC_011852	AAT	2	6	1214440	1214445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871404
19025	NC_011852	TAA	2	6	1214526	1214531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871405
19026	NC_011852	TTA	2	6	1214540	1214545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871405
19027	NC_011852	GCTTCA	2	12	1214603	1214614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219871405
19028	NC_011852	CATA	2	8	1214922	1214929	50 %	25 %	0 %	25 %	219871405
19029	NC_011852	CAC	2	6	1214964	1214969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871405
19030	NC_011852	TCG	2	6	1215071	1215076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871405
19031	NC_011852	TGTT	2	8	1215079	1215086	0 %	75 %	25 %	0 %	219871405
19032	NC_011852	CT	3	6	1215293	1215298	0 %	50 %	0 %	50 %	219871406
19033	NC_011852	CAT	2	6	1215351	1215356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871406
19034	NC_011852	CACC	2	8	1215378	1215385	25 %	0 %	0 %	75 %	219871406
19035	NC_011852	TGAA	2	8	1215396	1215403	50 %	25 %	25 %	0 %	219871406
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19037	NC_011852	TTAA	2	8	1215591	1215598	50 %	50 %	0 %	0 %	219871407
19038	NC_011852	CTT	2	6	1215653	1215658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871407
19039	NC_011852	T	6	6	1215767	1215772	0 %	100 %	0 %	0 %	219871407
19040	NC_011852	CTG	2	6	1215797	1215802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871407
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19042	NC_011852	CTG	2	6	1215902	1215907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871407
19043	NC_011852	T	6	6	1215954	1215959	0 %	100 %	0 %	0 %	219871407
19044	NC_011852	TGT	2	6	1216142	1216147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871407
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19052	NC_011852	GCTA	2	8	1216608	1216615	25 %	25 %	25 %	25 %	219871407
19053	NC_011852	G	6	6	1216667	1216672	0 %	0 %	100 %	0 %	219871407
19054	NC_011852	TACTT	2	10	1216755	1216764	20 %	60 %	0 %	20 %	219871407
19055	NC_011852	CTAT	2	8	1216783	1216790	25 %	50 %	0 %	25 %	219871408
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19099	NC_011852	G	6	6	1218738	1218743	0 %	0 %	100 %	0 %	219871409
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19102	NC_011852	TAC	2	6	1219052	1219057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871410
19103	NC_011852	CCGC	2	8	1219063	1219070	0 %	0 %	25 %	75 %	219871410
19104	NC_011852	AAT	2	6	1219080	1219085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871410
19105	NC_011852	AACC	2	8	1219129	1219136	50 %	0 %	0 %	50 %	219871410
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19107	NC_011852	CAT	2	6	1219169	1219174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871410
19108	NC_011852	ATTA	2	8	1219275	1219282	50 %	50 %	0 %	0 %	219871410
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19115	NC_011852	T	6	6	1219731	1219736	0 %	100 %	0 %	0 %	219871410
19116	NC_011852	TCT	2	6	1219912	1219917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871410
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19118	NC_011852	CAA	2	6	1219952	1219957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871410
19119	NC_011852	ATT	2	6	1219962	1219967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871410
19120	NC_011852	CTG	2	6	1220002	1220007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871410
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19233	NC_011852	A	7	7	1227723	1227729	100 %	0 %	0 %	0 %	219871417
19234	NC_011852	AAT	2	6	1227735	1227740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871417
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19236	NC_011852	TATT	2	8	1227838	1227845	25 %	75 %	0 %	0 %	219871417
19237	NC_011852	TCA	2	6	1227869	1227874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871417
19238	NC_011852	AAC	2	6	1227883	1227888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871417
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