MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_011852	ATG	2	6	1179570	1179575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871374
18503	NC_011852	TGA	2	6	1179689	1179694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871374
18504	NC_011852	TTC	2	6	1179805	1179810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871374
18505	NC_011852	CCA	2	6	1179818	1179823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871374
18506	NC_011852	ATCA	2	8	1179874	1179881	50 %	25 %	0 %	25 %	219871374
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18509	NC_011852	ACG	2	6	1180081	1180086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871374
18510	NC_011852	GCAC	2	8	1180103	1180110	25 %	0 %	25 %	50 %	219871374
18511	NC_011852	ATCAC	2	10	1180112	1180121	40 %	20 %	0 %	40 %	219871374
18512	NC_011852	TGA	2	6	1180127	1180132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871374
18513	NC_011852	T	6	6	1180165	1180170	0 %	100 %	0 %	0 %	219871374
18514	NC_011852	TAA	2	6	1180189	1180194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871374
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18517	NC_011852	CTT	2	6	1180293	1180298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871374
18518	NC_011852	ACG	2	6	1180327	1180332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871374
18519	NC_011852	GCC	2	6	1180409	1180414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871374
18520	NC_011852	TTA	2	6	1180418	1180423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871374
18521	NC_011852	CTT	2	6	1180464	1180469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871374
18522	NC_011852	AAT	2	6	1180471	1180476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871374
18523	NC_011852	GGAA	2	8	1180547	1180554	50 %	0 %	50 %	0 %	219871374
18524	NC_011852	TGC	2	6	1180585	1180590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871374
18525	NC_011852	CTTT	2	8	1180638	1180645	0 %	75 %	0 %	25 %	219871374
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18528	NC_011852	GCT	2	6	1181100	1181105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871375
18529	NC_011852	TC	3	6	1181120	1181125	0 %	50 %	0 %	50 %	219871375
18530	NC_011852	TAA	2	6	1181126	1181131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871375
18531	NC_011852	TGA	2	6	1181136	1181141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871375
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18533	NC_011852	CAAT	2	8	1181203	1181210	50 %	25 %	0 %	25 %	219871375
18534	NC_011852	GGCT	2	8	1181247	1181254	0 %	25 %	50 %	25 %	219871375
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18542	NC_011852	TGC	2	6	1181748	1181753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871375
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18545	NC_011852	TGT	2	6	1181908	1181913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871375
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18553	NC_011852	TGG	2	6	1182353	1182358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871375
18554	NC_011852	CT	3	6	1182398	1182403	0 %	50 %	0 %	50 %	219871375
18555	NC_011852	AAT	2	6	1182407	1182412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871375
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18967	NC_011852	GAT	2	6	1210535	1210540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871400
18968	NC_011852	TAA	2	6	1210565	1210570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871400
18969	NC_011852	TGC	2	6	1210607	1210612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871400
18970	NC_011852	ACT	2	6	1210614	1210619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871400
18971	NC_011852	TGT	2	6	1210717	1210722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871400
18972	NC_011852	TCT	2	6	1210764	1210769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871400
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18974	NC_011852	GCA	2	6	1210800	1210805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871400
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18990	NC_011852	CAA	2	6	1212612	1212617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871402
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18995	NC_011852	TAC	2	6	1213010	1213015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871403
18996	NC_011852	A	6	6	1213045	1213050	100 %	0 %	0 %	0 %	219871403
18997	NC_011852	TATCG	2	10	1213059	1213068	20 %	40 %	20 %	20 %	219871403
18998	NC_011852	A	7	7	1213224	1213230	100 %	0 %	0 %	0 %	219871403
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19000	NC_011852	TTA	2	6	1213249	1213254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871403

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