MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011852	GTT	2	6	1144964	1144969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871342
18002	NC_011852	ATC	2	6	1145124	1145129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871342
18003	NC_011852	GTT	2	6	1145168	1145173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871342
18004	NC_011852	CTG	2	6	1145213	1145218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871342
18005	NC_011852	AAT	2	6	1145291	1145296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871342
18006	NC_011852	TGT	2	6	1145418	1145423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871342
18007	NC_011852	TTA	2	6	1145446	1145451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871343
18008	NC_011852	TTG	2	6	1145604	1145609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871343
18009	NC_011852	CT	4	8	1145709	1145716	0 %	50 %	0 %	50 %	219871343
18010	NC_011852	TTC	2	6	1145718	1145723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871343
18011	NC_011852	CTT	2	6	1145759	1145764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871343
18012	NC_011852	TGCG	2	8	1145828	1145835	0 %	25 %	50 %	25 %	219871343
18013	NC_011852	CTCCG	2	10	1145850	1145859	0 %	20 %	20 %	60 %	219871343
18014	NC_011852	TTC	2	6	1145880	1145885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871343
18015	NC_011852	CTT	2	6	1145936	1145941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871344
18016	NC_011852	ATC	2	6	1146807	1146812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871345
18017	NC_011852	CGGT	2	8	1146902	1146909	0 %	25 %	50 %	25 %	219871345
18018	NC_011852	A	7	7	1146927	1146933	100 %	0 %	0 %	0 %	219871345
18019	NC_011852	CGG	2	6	1146935	1146940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871345
18020	NC_011852	AAC	2	6	1147022	1147027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871345
18021	NC_011852	CAA	3	9	1147063	1147071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871345
18022	NC_011852	TTA	2	6	1147116	1147121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871345
18023	NC_011852	GCA	2	6	1147125	1147130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871345
18024	NC_011852	AAC	2	6	1147253	1147258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871345
18025	NC_011852	TGG	2	6	1147325	1147330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871345
18026	NC_011852	AAT	2	6	1147387	1147392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871345
18027	NC_011852	GGTTC	2	10	1147534	1147543	0 %	40 %	40 %	20 %	219871345
18028	NC_011852	GCG	2	6	1147826	1147831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871345
18029	NC_011852	ACCAA	2	10	1147898	1147907	60 %	0 %	0 %	40 %	219871345
18030	NC_011852	CTT	2	6	1147919	1147924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871345
18031	NC_011852	ACC	2	6	1148227	1148232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871346
18032	NC_011852	CTG	2	6	1148280	1148285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871346
18033	NC_011852	TGA	2	6	1148290	1148295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871346
18034	NC_011852	CCAAC	2	10	1148297	1148306	40 %	0 %	0 %	60 %	219871346
18035	NC_011852	GCC	2	6	1148349	1148354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871346
18036	NC_011852	TG	3	6	1148377	1148382	0 %	50 %	50 %	0 %	219871346
18037	NC_011852	ATC	2	6	1148407	1148412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871346
18038	NC_011852	GTTG	2	8	1148519	1148526	0 %	50 %	50 %	0 %	219871346
18039	NC_011852	AGAT	2	8	1148551	1148558	50 %	25 %	25 %	0 %	219871346
18040	NC_011852	T	7	7	1148558	1148564	0 %	100 %	0 %	0 %	219871346
18041	NC_011852	ATA	2	6	1148680	1148685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871346
18042	NC_011852	TCA	2	6	1148707	1148712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871346
18043	NC_011852	GTT	2	6	1148762	1148767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871346
18044	NC_011852	A	6	6	1148799	1148804	100 %	0 %	0 %	0 %	219871346
18045	NC_011852	TCA	2	6	1148819	1148824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871346
18046	NC_011852	ATCC	2	8	1149080	1149087	25 %	25 %	0 %	50 %	219871347
18047	NC_011852	ACGC	2	8	1149129	1149136	25 %	0 %	25 %	50 %	219871347
18048	NC_011852	GTT	2	6	1149169	1149174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871347
18049	NC_011852	ACA	2	6	1149214	1149219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871347
18050	NC_011852	AAT	2	6	1149233	1149238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871347
18051	NC_011852	TCT	2	6	1149270	1149275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871347
18052	NC_011852	CTT	2	6	1149301	1149306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871347
18053	NC_011852	GTT	2	6	1149307	1149312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871347
18054	NC_011852	TTG	2	6	1149376	1149381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871347
18055	NC_011852	CTG	2	6	1149515	1149520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871348
18056	NC_011852	T	6	6	1149531	1149536	0 %	100 %	0 %	0 %	219871348
18057	NC_011852	TGG	2	6	1149552	1149557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871348
18058	NC_011852	ATG	2	6	1149602	1149607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871348
18059	NC_011852	TGA	2	6	1149675	1149680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871348
18060	NC_011852	GAA	2	6	1149712	1149717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871348
18061	NC_011852	T	6	6	1149762	1149767	0 %	100 %	0 %	0 %	219871348
18062	NC_011852	TGA	2	6	1149831	1149836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871348
18063	NC_011852	GAA	2	6	1149868	1149873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871348
18064	NC_011852	ATG	2	6	1149881	1149886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871348
18065	NC_011852	GAA	2	6	1149904	1149909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871348
18066	NC_011852	ATT	2	6	1149910	1149915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871348
18067	NC_011852	GTC	2	6	1149928	1149933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871348
18068	NC_011852	TAT	2	6	1150019	1150024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871349
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18072	NC_011852	CT	3	6	1150414	1150419	0 %	50 %	0 %	50 %	219871349
18073	NC_011852	AT	3	6	1150574	1150579	50 %	50 %	0 %	0 %	219871349
18074	NC_011852	CAT	2	6	1150680	1150685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871349
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18084	NC_011852	A	6	6	1151480	1151485	100 %	0 %	0 %	0 %	219871349
18085	NC_011852	GATT	2	8	1151628	1151635	25 %	50 %	25 %	0 %	219871349
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18104	NC_011852	CAA	2	6	1152959	1152964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871351
18105	NC_011852	TAAAAG	2	12	1152968	1152979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219871351
18106	NC_011852	AAT	2	6	1152993	1152998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871351
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18109	NC_011852	TG	3	6	1153358	1153363	0 %	50 %	50 %	0 %	219871352
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18113	NC_011852	CT	3	6	1153707	1153712	0 %	50 %	0 %	50 %	219871352
18114	NC_011852	TAT	2	6	1153798	1153803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871352
18115	NC_011852	CTGA	2	8	1153987	1153994	25 %	25 %	25 %	25 %	219871352
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18117	NC_011852	TTG	2	6	1154033	1154038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871352
18118	NC_011852	CTG	2	6	1154066	1154071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871352
18119	NC_011852	TTC	2	6	1154088	1154093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871352
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18471	NC_011852	TTC	2	6	1178137	1178142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871374
18472	NC_011852	ACG	2	6	1178281	1178286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871374
18473	NC_011852	TGA	2	6	1178360	1178365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871374
18474	NC_011852	TGT	2	6	1178438	1178443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871374
18475	NC_011852	TCA	2	6	1178450	1178455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871374
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18492	NC_011852	AAT	2	6	1179067	1179072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871374
18493	NC_011852	TTA	2	6	1179173	1179178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871374
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18499	NC_011852	CTT	3	9	1179465	1179473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871374
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