MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_011852	CACC	2	8	1114438	1114445	25 %	0 %	0 %	75 %	219871309
17503	NC_011852	TTTA	2	8	1114451	1114458	25 %	75 %	0 %	0 %	219871309
17504	NC_011852	TGG	2	6	1114509	1114514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871309
17505	NC_011852	TGG	2	6	1114603	1114608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871309
17506	NC_011852	TTA	2	6	1114611	1114616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871309
17507	NC_011852	G	7	7	1114628	1114634	0 %	0 %	100 %	0 %	219871309
17508	NC_011852	TGG	2	6	1114636	1114641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871309
17509	NC_011852	TTA	2	6	1114753	1114758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871309
17510	NC_011852	CTTTGC	2	12	1114764	1114775	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219871309
17511	NC_011852	GTTC	2	8	1114801	1114808	0 %	50 %	25 %	25 %	219871309
17512	NC_011852	TTG	2	6	1114892	1114897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871309
17513	NC_011852	GGCAA	2	10	1114931	1114940	40 %	0 %	40 %	20 %	219871309
17514	NC_011852	ATT	3	9	1114974	1114982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871309
17515	NC_011852	TGG	2	6	1115012	1115017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871309
17516	NC_011852	GAT	2	6	1115040	1115045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871309
17517	NC_011852	TCGG	2	8	1115074	1115081	0 %	25 %	50 %	25 %	219871309
17518	NC_011852	ATG	2	6	1115419	1115424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871309
17519	NC_011852	TAT	2	6	1115431	1115436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871309
17520	NC_011852	TGA	2	6	1115439	1115444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871309
17521	NC_011852	CTG	2	6	1115474	1115479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871309
17522	NC_011852	CAT	2	6	1115575	1115580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871309
17523	NC_011852	TTG	2	6	1115596	1115601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871309
17524	NC_011852	ATG	2	6	1115618	1115623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871309
17525	NC_011852	ACAATG	2	12	1115629	1115640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219871309
17526	NC_011852	GAT	2	6	1115671	1115676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871309
17527	NC_011852	TAA	2	6	1115706	1115711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871309
17528	NC_011852	AAT	2	6	1115772	1115777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871309
17529	NC_011852	TTGG	2	8	1115800	1115807	0 %	50 %	50 %	0 %	219871309
17530	NC_011852	A	7	7	1115817	1115823	100 %	0 %	0 %	0 %	219871309
17531	NC_011852	A	6	6	1115826	1115831	100 %	0 %	0 %	0 %	219871309
17532	NC_011852	T	7	7	1115875	1115881	0 %	100 %	0 %	0 %	219871310
17533	NC_011852	AAAAGA	2	12	1115894	1115905	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219871310
17534	NC_011852	TTTTA	2	10	1116017	1116026	20 %	80 %	0 %	0 %	219871310
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17536	NC_011852	TTG	2	6	1116106	1116111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871310
17537	NC_011852	TGAT	2	8	1116184	1116191	25 %	50 %	25 %	0 %	219871310
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17539	NC_011852	TCT	2	6	1116231	1116236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871310
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17542	NC_011852	GTT	2	6	1116483	1116488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871311
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17552	NC_011852	TTG	2	6	1116927	1116932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871312
17553	NC_011852	TAT	2	6	1116957	1116962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871312
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17555	NC_011852	GAA	2	6	1117035	1117040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871312
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17557	NC_011852	ATG	2	6	1117105	1117110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871312
17558	NC_011852	ACTC	2	8	1117141	1117148	25 %	25 %	0 %	50 %	219871312
17559	NC_011852	GCAA	2	8	1117274	1117281	50 %	0 %	25 %	25 %	219871312
17560	NC_011852	GGCTT	2	10	1117283	1117292	0 %	40 %	40 %	20 %	219871312
17561	NC_011852	GAGC	2	8	1117293	1117300	25 %	0 %	50 %	25 %	219871312
17562	NC_011852	TGA	2	6	1117310	1117315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871312
17563	NC_011852	AG	3	6	1117319	1117324	50 %	0 %	50 %	0 %	219871312
17564	NC_011852	GCTT	2	8	1117330	1117337	0 %	50 %	25 %	25 %	219871312
17565	NC_011852	TTGC	2	8	1117338	1117345	0 %	50 %	25 %	25 %	219871312
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17601	NC_011852	AAT	2	6	1119837	1119842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871314
17602	NC_011852	GCAA	2	8	1119954	1119961	50 %	0 %	25 %	25 %	219871314
17603	NC_011852	T	6	6	1119978	1119983	0 %	100 %	0 %	0 %	219871314
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17605	NC_011852	A	8	8	1120030	1120037	100 %	0 %	0 %	0 %	219871314
17606	NC_011852	GAC	2	6	1120045	1120050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871314
17607	NC_011852	GCAA	2	8	1120157	1120164	50 %	0 %	25 %	25 %	219871314
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