MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_011852	AT	3	6	1021942	1021947	50 %	50 %	0 %	0 %	219871215
16003	NC_011852	GAA	2	6	1021953	1021958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871215
16004	NC_011852	ATAA	2	8	1022086	1022093	75 %	25 %	0 %	0 %	219871215
16005	NC_011852	ATC	2	6	1022096	1022101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871215
16006	NC_011852	TTA	2	6	1022127	1022132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871215
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16009	NC_011852	TAA	2	6	1022344	1022349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871215
16010	NC_011852	CTT	2	6	1022672	1022677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871216
16011	NC_011852	TCA	2	6	1022713	1022718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871216
16012	NC_011852	GTAAT	2	10	1022746	1022755	40 %	40 %	20 %	0 %	219871216
16013	NC_011852	ATT	2	6	1022763	1022768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871216
16014	NC_011852	ATA	2	6	1022782	1022787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871216
16015	NC_011852	T	7	7	1022794	1022800	0 %	100 %	0 %	0 %	219871216
16016	NC_011852	A	6	6	1022808	1022813	100 %	0 %	0 %	0 %	219871216
16017	NC_011852	TTG	2	6	1022830	1022835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871216
16018	NC_011852	CTA	2	6	1022840	1022845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871216
16019	NC_011852	T	6	6	1022862	1022867	0 %	100 %	0 %	0 %	219871216
16020	NC_011852	TTC	2	6	1022904	1022909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871216
16021	NC_011852	TA	3	6	1022942	1022947	50 %	50 %	0 %	0 %	219871216
16022	NC_011852	TTCA	2	8	1022955	1022962	25 %	50 %	0 %	25 %	219871216
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16024	NC_011852	TCA	2	6	1022982	1022987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871217
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16033	NC_011852	T	7	7	1023701	1023707	0 %	100 %	0 %	0 %	219871219
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16044	NC_011852	GAA	2	6	1024256	1024261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871219
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16052	NC_011852	GT	3	6	1024550	1024555	0 %	50 %	50 %	0 %	219871219
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16056	NC_011852	TGAG	2	8	1025043	1025050	25 %	25 %	50 %	0 %	219871220
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16119	NC_011852	CTT	2	6	1029289	1029294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871225
16120	NC_011852	AAT	2	6	1029353	1029358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871225
16121	NC_011852	TCA	2	6	1029360	1029365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871225
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16123	NC_011852	TCA	2	6	1029543	1029548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871225
16124	NC_011852	AAT	2	6	1029633	1029638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871225
16125	NC_011852	GTC	2	6	1029640	1029645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871225
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16132	NC_011852	TTG	2	6	1030004	1030009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871225
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16143	NC_011852	CTG	2	6	1030495	1030500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871225
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16145	NC_011852	TTTC	2	8	1030615	1030622	0 %	75 %	0 %	25 %	219871225
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16152	NC_011852	CTT	2	6	1031263	1031268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871227
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16223	NC_011852	TCT	2	6	1035616	1035621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871231
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16231	NC_011852	TTA	2	6	1035886	1035891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871231
16232	NC_011852	GGC	2	6	1036119	1036124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871232
16233	NC_011852	A	6	6	1036162	1036167	100 %	0 %	0 %	0 %	219871232
16234	NC_011852	AAG	2	6	1036171	1036176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871232
16235	NC_011852	GTC	2	6	1036252	1036257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871232
16236	NC_011852	GAT	2	6	1036287	1036292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871232
16237	NC_011852	ACG	2	6	1036330	1036335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871232
16238	NC_011852	TGA	2	6	1036349	1036354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871232
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16240	NC_011852	ATC	2	6	1036582	1036587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871233
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16244	NC_011852	ATCT	2	8	1036825	1036832	25 %	50 %	0 %	25 %	219871233
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16253	NC_011852	TAT	2	6	1037320	1037325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871234
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16256	NC_011852	CGA	2	6	1037541	1037546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871234
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16263	NC_011852	CT	3	6	1037804	1037809	0 %	50 %	0 %	50 %	219871234
16264	NC_011852	TTA	2	6	1037957	1037962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871234
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16346	NC_011852	T	6	6	1042995	1043000	0 %	100 %	0 %	0 %	219871238
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16353	NC_011852	TCA	2	6	1043479	1043484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871238
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16468	NC_011852	CG	3	6	1050171	1050176	0 %	0 %	50 %	50 %	219871248
16469	NC_011852	TTC	2	6	1050207	1050212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871248
16470	NC_011852	GCT	2	6	1050270	1050275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871248
16471	NC_011852	AAG	2	6	1050385	1050390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871248
16472	NC_011852	GCAC	2	8	1050502	1050509	25 %	0 %	25 %	50 %	219871248
16473	NC_011852	CAC	2	6	1050527	1050532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871248
16474	NC_011852	CAC	2	6	1050551	1050556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871248
16475	NC_011852	AAC	2	6	1050603	1050608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871248
16476	NC_011852	CGT	2	6	1050662	1050667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871248
16477	NC_011852	TCA	2	6	1050682	1050687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871248
16478	NC_011852	ATTGA	2	10	1050695	1050704	40 %	40 %	20 %	0 %	219871248
16479	NC_011852	TGG	2	6	1050770	1050775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871248
16480	NC_011852	TAA	2	6	1050777	1050782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871248
16481	NC_011852	TCA	2	6	1050818	1050823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871248
16482	NC_011852	AGC	2	6	1050830	1050835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871248
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16484	NC_011852	TTG	2	6	1050897	1050902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871248
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16488	NC_011852	GTC	2	6	1051035	1051040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871248
16489	NC_011852	TG	3	6	1051050	1051055	0 %	50 %	50 %	0 %	219871248
16490	NC_011852	AAC	2	6	1051063	1051068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871248
16491	NC_011852	CTT	2	6	1051105	1051110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871248
16492	NC_011852	T	6	6	1051167	1051172	0 %	100 %	0 %	0 %	219871248
16493	NC_011852	TGT	2	6	1051254	1051259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871248
16494	NC_011852	GTTG	2	8	1051391	1051398	0 %	50 %	50 %	0 %	219871248
16495	NC_011852	CAACC	2	10	1051502	1051511	40 %	0 %	0 %	60 %	219871248
16496	NC_011852	CAA	2	6	1051553	1051558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871248
16497	NC_011852	TAA	2	6	1051575	1051580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871248
16498	NC_011852	TTG	2	6	1051595	1051600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871248
16499	NC_011852	ATG	2	6	1051618	1051623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871248
16500	NC_011852	TAA	2	6	1051712	1051717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871249

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