MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_011852	T	6	6	926329	926334	0 %	100 %	0 %	0 %	219871143
14503	NC_011852	TAAA	2	8	926337	926344	75 %	25 %	0 %	0 %	219871143
14504	NC_011852	ACC	2	6	926374	926379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871143
14505	NC_011852	ACC	2	6	926458	926463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871143
14506	NC_011852	ATC	2	6	926503	926508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871143
14507	NC_011852	ATT	2	6	926560	926565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871143
14508	NC_011852	CCA	2	6	926618	926623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871143
14509	NC_011852	AATT	2	8	926653	926660	50 %	50 %	0 %	0 %	219871143
14510	NC_011852	TGC	2	6	926692	926697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871143
14511	NC_011852	ATT	2	6	926923	926928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871144
14512	NC_011852	CAT	2	6	926952	926957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871144
14513	NC_011852	TAT	2	6	927042	927047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871144
14514	NC_011852	AAT	2	6	927139	927144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871144
14515	NC_011852	CTT	2	6	927156	927161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871144
14516	NC_011852	ATC	2	6	927241	927246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871144
14517	NC_011852	T	7	7	927276	927282	0 %	100 %	0 %	0 %	219871144
14518	NC_011852	CAC	2	6	927292	927297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871144
14519	NC_011852	AAG	2	6	927737	927742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871145
14520	NC_011852	GCT	2	6	927760	927765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871145
14521	NC_011852	ATC	2	6	927877	927882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871145
14522	NC_011852	TTTA	2	8	928022	928029	25 %	75 %	0 %	0 %	219871145
14523	NC_011852	GAAG	2	8	928044	928051	50 %	0 %	50 %	0 %	219871145
14524	NC_011852	CCA	2	6	928083	928088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871145
14525	NC_011852	ATG	2	6	928124	928129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871145
14526	NC_011852	CAA	2	6	928180	928185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871145
14527	NC_011852	TAA	2	6	928191	928196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871145
14528	NC_011852	ATT	2	6	928209	928214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871145
14529	NC_011852	GTT	2	6	928255	928260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871145
14530	NC_011852	GAA	2	6	928261	928266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871145
14531	NC_011852	TCCTT	2	10	928278	928287	0 %	60 %	0 %	40 %	219871145
14532	NC_011852	GAAG	2	8	928293	928300	50 %	0 %	50 %	0 %	219871145
14533	NC_011852	CTT	2	6	928313	928318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871145
14534	NC_011852	T	6	6	928321	928326	0 %	100 %	0 %	0 %	219871145
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14536	NC_011852	T	6	6	928645	928650	0 %	100 %	0 %	0 %	219871146
14537	NC_011852	ATT	2	6	928705	928710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871146
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14539	NC_011852	GTTG	2	8	928785	928792	0 %	50 %	50 %	0 %	219871146
14540	NC_011852	TGTT	2	8	928950	928957	0 %	75 %	25 %	0 %	219871146
14541	NC_011852	CAA	2	6	928990	928995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871146
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14543	NC_011852	TGG	2	6	929015	929020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871146
14544	NC_011852	AAG	2	6	929021	929026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871146
14545	NC_011852	CAAC	2	8	929040	929047	50 %	0 %	0 %	50 %	219871146
14546	NC_011852	TTGC	2	8	929054	929061	0 %	50 %	25 %	25 %	219871146
14547	NC_011852	GGCA	2	8	929067	929074	25 %	0 %	50 %	25 %	219871146
14548	NC_011852	ATT	2	6	929089	929094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871146
14549	NC_011852	TTTGGT	2	12	929107	929118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871146
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14552	NC_011852	GCAG	2	8	929254	929261	25 %	0 %	50 %	25 %	219871146
14553	NC_011852	ATGA	2	8	929359	929366	50 %	25 %	25 %	0 %	219871146
14554	NC_011852	A	6	6	929375	929380	100 %	0 %	0 %	0 %	219871146
14555	NC_011852	A	6	6	929430	929435	100 %	0 %	0 %	0 %	219871147
14556	NC_011852	TGGC	2	8	929511	929518	0 %	25 %	50 %	25 %	219871147
14557	NC_011852	TTGG	2	8	929536	929543	0 %	50 %	50 %	0 %	219871147
14558	NC_011852	CAC	2	6	929567	929572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871147
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14561	NC_011852	TTAA	2	8	929652	929659	50 %	50 %	0 %	0 %	219871147
14562	NC_011852	TGA	2	6	929678	929683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871147
14563	NC_011852	TGC	2	6	929684	929689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871147
14564	NC_011852	TGA	2	6	929702	929707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871147
14565	NC_011852	TGC	2	6	929889	929894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871148
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14570	NC_011852	TTTG	2	8	929997	930004	0 %	75 %	25 %	0 %	219871148
14571	NC_011852	CAGA	2	8	930049	930056	50 %	0 %	25 %	25 %	219871148
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14573	NC_011852	CA	3	6	930100	930105	50 %	0 %	0 %	50 %	219871148
14574	NC_011852	TGAA	2	8	930122	930129	50 %	25 %	25 %	0 %	219871148
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14604	NC_011852	AATA	2	8	931594	931601	75 %	25 %	0 %	0 %	219871150
14605	NC_011852	CAT	2	6	931659	931664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871150
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14612	NC_011852	GA	4	8	932140	932147	50 %	0 %	50 %	0 %	219871151
14613	NC_011852	T	7	7	932149	932155	0 %	100 %	0 %	0 %	219871151
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14622	NC_011852	CAT	2	6	932888	932893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871152
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14984	NC_011852	T	6	6	957452	957457	0 %	100 %	0 %	0 %	219871169
14985	NC_011852	TTC	2	6	957536	957541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871169
14986	NC_011852	T	6	6	957623	957628	0 %	100 %	0 %	0 %	219871169
14987	NC_011852	CTT	2	6	957643	957648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871169
14988	NC_011852	CACT	2	8	957708	957715	25 %	25 %	0 %	50 %	219871169
14989	NC_011852	AATA	2	8	957728	957735	75 %	25 %	0 %	0 %	219871169
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14991	NC_011852	CTT	2	6	957982	957987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871170
14992	NC_011852	CCATA	2	10	958014	958023	40 %	20 %	0 %	40 %	219871170
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