MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_011852	TGG	2	6	892887	892892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871111
14003	NC_011852	TAAA	2	8	893150	893157	75 %	25 %	0 %	0 %	219871111
14004	NC_011852	TGG	2	6	893490	893495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871112
14005	NC_011852	TGTGG	2	10	893569	893578	0 %	40 %	60 %	0 %	219871112
14006	NC_011852	CCG	2	6	893700	893705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871112
14007	NC_011852	CGA	2	6	893722	893727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871112
14008	NC_011852	GAA	2	6	893800	893805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871112
14009	NC_011852	CAT	2	6	893941	893946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871112
14010	NC_011852	TGG	2	6	893983	893988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871112
14011	NC_011852	GT	3	6	893991	893996	0 %	50 %	50 %	0 %	219871112
14012	NC_011852	AAC	2	6	894080	894085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871112
14013	NC_011852	TCG	2	6	894100	894105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871112
14014	NC_011852	TGGCG	2	10	894235	894244	0 %	20 %	60 %	20 %	219871112
14015	NC_011852	TTG	2	6	894306	894311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871112
14016	NC_011852	CTC	2	6	894330	894335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219871112
14017	NC_011852	AC	3	6	894371	894376	50 %	0 %	0 %	50 %	219871112
14018	NC_011852	TGA	2	6	894499	894504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871112
14019	NC_011852	AGT	2	6	894509	894514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871112
14020	NC_011852	CACCTA	2	12	894627	894638	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	219871112
14021	NC_011852	GTATCG	2	12	894644	894655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219871112
14022	NC_011852	CAAC	2	8	894729	894736	50 %	0 %	0 %	50 %	219871112
14023	NC_011852	AC	3	6	894829	894834	50 %	0 %	0 %	50 %	219871112
14024	NC_011852	TGAA	2	8	894921	894928	50 %	25 %	25 %	0 %	219871112
14025	NC_011852	GAA	2	6	894950	894955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871112
14026	NC_011852	GAT	2	6	894991	894996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871112
14027	NC_011852	AGT	2	6	895142	895147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871112
14028	NC_011852	TTA	2	6	895164	895169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871112
14029	NC_011852	AGCA	2	8	895183	895190	50 %	0 %	25 %	25 %	219871112
14030	NC_011852	AAT	2	6	895199	895204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871112
14031	NC_011852	GAA	2	6	895394	895399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871112
14032	NC_011852	AAC	2	6	895437	895442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871112
14033	NC_011852	AAC	2	6	895507	895512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871112
14034	NC_011852	CAAT	2	8	895529	895536	50 %	25 %	0 %	25 %	219871112
14035	NC_011852	CA	3	6	895538	895543	50 %	0 %	0 %	50 %	219871112
14036	NC_011852	GGA	2	6	895607	895612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219871112
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14039	NC_011852	ATG	2	6	895760	895765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871112
14040	NC_011852	CGC	2	6	895780	895785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871112
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14042	NC_011852	TGG	2	6	895944	895949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871112
14043	NC_011852	TTC	2	6	895971	895976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871112
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14046	NC_011852	TGG	2	6	896071	896076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871112
14047	NC_011852	CTG	2	6	896208	896213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871112
14048	NC_011852	TGG	2	6	896218	896223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871112
14049	NC_011852	A	6	6	896248	896253	100 %	0 %	0 %	0 %	219871112
14050	NC_011852	CAG	2	6	896256	896261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871112
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14052	NC_011852	GTT	2	6	896381	896386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871112
14053	NC_011852	TA	3	6	896402	896407	50 %	50 %	0 %	0 %	219871112
14054	NC_011852	GAT	2	6	896465	896470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871113
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14091	NC_011852	T	7	7	899043	899049	0 %	100 %	0 %	0 %	219871115
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14102	NC_011852	TGT	2	6	899919	899924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871115
14103	NC_011852	GTTT	3	12	900012	900023	0 %	75 %	25 %	0 %	219871115
14104	NC_011852	A	6	6	900302	900307	100 %	0 %	0 %	0 %	219871116
14105	NC_011852	TTAA	2	8	900308	900315	50 %	50 %	0 %	0 %	219871116
14106	NC_011852	CA	3	6	900582	900587	50 %	0 %	0 %	50 %	219871117
14107	NC_011852	ATC	2	6	900807	900812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871117
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14110	NC_011852	AGT	2	6	900923	900928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871117
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14120	NC_011852	GT	3	6	901578	901583	0 %	50 %	50 %	0 %	219871117
14121	NC_011852	TAT	2	6	901607	901612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871117
14122	NC_011852	ATG	2	6	901634	901639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871117
14123	NC_011852	ACCA	2	8	901646	901653	50 %	0 %	0 %	50 %	219871117
14124	NC_011852	GTT	2	6	901712	901717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871117
14125	NC_011852	CA	3	6	901753	901758	50 %	0 %	0 %	50 %	219871117
14126	NC_011852	TCT	2	6	901795	901800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871117
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14152	NC_011852	GTT	2	6	903751	903756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871118
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14241	NC_011852	GTC	2	6	909476	909481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871124
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14244	NC_011852	CGT	2	6	910110	910115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871125
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14483	NC_011852	TGT	2	6	925456	925461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871142
14484	NC_011852	TACC	2	8	925563	925570	25 %	25 %	0 %	50 %	219871142
14485	NC_011852	T	6	6	925573	925578	0 %	100 %	0 %	0 %	219871142
14486	NC_011852	CAGTTG	2	12	925590	925601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219871142
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