MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_011852	GAT	2	6	832828	832833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871038
13003	NC_011852	TTGT	2	8	832876	832883	0 %	75 %	25 %	0 %	219871038
13004	NC_011852	TTG	2	6	832907	832912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871038
13005	NC_011852	GCA	2	6	832925	832930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871038
13006	NC_011852	TGAA	2	8	832944	832951	50 %	25 %	25 %	0 %	219871038
13007	NC_011852	T	6	6	833064	833069	0 %	100 %	0 %	0 %	219871038
13008	NC_011852	TGT	2	6	833113	833118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871038
13009	NC_011852	T	7	7	833148	833154	0 %	100 %	0 %	0 %	219871038
13010	NC_011852	TTGC	2	8	833169	833176	0 %	50 %	25 %	25 %	219871038
13011	NC_011852	TCA	2	6	833180	833185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871038
13012	NC_011852	TAAACC	2	12	833191	833202	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219871038
13013	NC_011852	CTT	2	6	833292	833297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871038
13014	NC_011852	CCCA	2	8	833300	833307	25 %	0 %	0 %	75 %	219871038
13015	NC_011852	CTT	2	6	833379	833384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871038
13016	NC_011852	CTT	2	6	833424	833429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871038
13017	NC_011852	AC	3	6	833439	833444	50 %	0 %	0 %	50 %	219871038
13018	NC_011852	CGG	2	6	833489	833494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871038
13019	NC_011852	ATG	3	9	833528	833536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871038
13020	NC_011852	CTT	2	6	833541	833546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871038
13021	NC_011852	TAA	2	6	833557	833562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871038
13022	NC_011852	GCAC	2	8	833594	833601	25 %	0 %	25 %	50 %	219871038
13023	NC_011852	TCT	2	6	833645	833650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871038
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13025	NC_011852	CGC	2	6	833683	833688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871038
13026	NC_011852	GTA	2	6	833717	833722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871038
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13029	NC_011852	AT	3	6	834216	834221	50 %	50 %	0 %	0 %	219871039
13030	NC_011852	AAT	2	6	834254	834259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871039
13031	NC_011852	ATA	2	6	834266	834271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871039
13032	NC_011852	T	6	6	834303	834308	0 %	100 %	0 %	0 %	219871039
13033	NC_011852	CACG	2	8	834340	834347	25 %	0 %	25 %	50 %	219871039
13034	NC_011852	TTA	2	6	834402	834407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871039
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13040	NC_011852	TTGA	2	8	834545	834552	25 %	50 %	25 %	0 %	219871039
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13049	NC_011852	TA	3	6	834919	834924	50 %	50 %	0 %	0 %	219871040
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13052	NC_011852	TGCCT	2	10	834993	835002	0 %	40 %	20 %	40 %	219871040
13053	NC_011852	ATT	2	6	835092	835097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871040
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13056	NC_011852	AT	3	6	835181	835186	50 %	50 %	0 %	0 %	219871041
13057	NC_011852	ATC	2	6	835282	835287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871041
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13059	NC_011852	CATA	2	8	835320	835327	50 %	25 %	0 %	25 %	219871041
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13065	NC_011852	ATCA	2	8	835513	835520	50 %	25 %	0 %	25 %	219871041
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13121	NC_011852	TTG	2	6	838997	839002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871044
13122	NC_011852	CT	3	6	839124	839129	0 %	50 %	0 %	50 %	219871044
13123	NC_011852	TAA	2	6	839188	839193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871044
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13151	NC_011852	TCT	2	6	842004	842009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871047
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13364	NC_011852	AAC	2	6	853698	853703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871057
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13483	NC_011852	TCT	2	6	860434	860439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871068
13484	NC_011852	TTC	2	6	860470	860475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871068
13485	NC_011852	GTC	2	6	860514	860519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871068
13486	NC_011852	GGTT	2	8	860611	860618	0 %	50 %	50 %	0 %	219871068
13487	NC_011852	AGC	2	6	860637	860642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871068
13488	NC_011852	TCT	2	6	860653	860658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871068
13489	NC_011852	ATCA	2	8	860763	860770	50 %	25 %	0 %	25 %	219871068
13490	NC_011852	GTC	2	6	861037	861042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871069
13491	NC_011852	T	6	6	861060	861065	0 %	100 %	0 %	0 %	219871069
13492	NC_011852	TTG	2	6	861208	861213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871069
13493	NC_011852	CTC	2	6	861246	861251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219871069
13494	NC_011852	CAC	2	6	861309	861314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871069
13495	NC_011852	CTGCAC	2	12	861369	861380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219871069
13496	NC_011852	TACC	2	8	861404	861411	25 %	25 %	0 %	50 %	219871069
13497	NC_011852	ATC	2	6	861520	861525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871069
13498	NC_011852	TGAA	2	8	861615	861622	50 %	25 %	25 %	0 %	219871069
13499	NC_011852	A	6	6	861879	861884	100 %	0 %	0 %	0 %	219871069
13500	NC_011852	T	6	6	861903	861908	0 %	100 %	0 %	0 %	219871069

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