MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011852	GTA	2	6	312119	312124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870545
5002	NC_011852	TC	3	6	312160	312165	0 %	50 %	0 %	50 %	219870545
5003	NC_011852	CGC	2	6	312309	312314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219870546
5004	NC_011852	A	6	6	312355	312360	100 %	0 %	0 %	0 %	219870546
5005	NC_011852	TGG	2	6	312380	312385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870546
5006	NC_011852	CTG	3	9	312407	312415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870546
5007	NC_011852	TGAA	2	8	312548	312555	50 %	25 %	25 %	0 %	219870546
5008	NC_011852	TGA	2	6	312639	312644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870546
5009	NC_011852	TG	3	6	312688	312693	0 %	50 %	50 %	0 %	219870546
5010	NC_011852	GAA	2	6	312787	312792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870546
5011	NC_011852	CTG	2	6	312803	312808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870546
5012	NC_011852	GTT	2	6	312900	312905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870546
5013	NC_011852	CTT	2	6	313040	313045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870546
5014	NC_011852	GAT	2	6	313080	313085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870546
5015	NC_011852	CGA	2	6	313163	313168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870546
5016	NC_011852	GAA	2	6	313240	313245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870546
5017	NC_011852	CAAGG	2	10	313252	313261	40 %	0 %	40 %	20 %	219870546
5018	NC_011852	A	6	6	313316	313321	100 %	0 %	0 %	0 %	219870546
5019	NC_011852	TTA	2	6	313370	313375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870546
5020	NC_011852	ACG	2	6	313415	313420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870546
5021	NC_011852	GAA	2	6	313429	313434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870546
5022	NC_011852	GAA	2	6	313477	313482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870546
5023	NC_011852	ACC	2	6	313539	313544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870546
5024	NC_011852	CT	3	6	313573	313578	0 %	50 %	0 %	50 %	219870546
5025	NC_011852	TGCG	2	8	313583	313590	0 %	25 %	50 %	25 %	219870546
5026	NC_011852	AATT	2	8	313592	313599	50 %	50 %	0 %	0 %	219870546
5027	NC_011852	AAG	2	6	313613	313618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870546
5028	NC_011852	AGA	2	6	313689	313694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870546
5029	NC_011852	AGA	2	6	313725	313730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870546
5030	NC_011852	A	6	6	313762	313767	100 %	0 %	0 %	0 %	219870546
5031	NC_011852	TGA	2	6	313800	313805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870546
5032	NC_011852	GTGC	2	8	313820	313827	0 %	25 %	50 %	25 %	219870546
5033	NC_011852	CCG	2	6	313941	313946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219870546
5034	NC_011852	AATGG	2	10	314015	314024	40 %	20 %	40 %	0 %	219870546
5035	NC_011852	TGC	2	6	314061	314066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870546
5036	NC_011852	CGTG	2	8	314127	314134	0 %	25 %	50 %	25 %	219870546
5037	NC_011852	CTG	2	6	314273	314278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870546
5038	NC_011852	ACA	2	6	314296	314301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870546
5039	NC_011852	ACT	2	6	314324	314329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870546
5040	NC_011852	CT	3	6	314342	314347	0 %	50 %	0 %	50 %	219870546
5041	NC_011852	GAAA	2	8	314400	314407	75 %	0 %	25 %	0 %	219870546
5042	NC_011852	TAA	2	6	314415	314420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870546
5043	NC_011852	GTG	2	6	314473	314478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870546
5044	NC_011852	A	6	6	314572	314577	100 %	0 %	0 %	0 %	219870546
5045	NC_011852	ATGT	2	8	314643	314650	25 %	50 %	25 %	0 %	219870546
5046	NC_011852	ATA	2	6	314679	314684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870546
5047	NC_011852	ATT	2	6	314708	314713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870547
5048	NC_011852	ACC	2	6	314740	314745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870547
5049	NC_011852	AAGTGG	2	12	314766	314777	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219870547
5050	NC_011852	ATTG	2	8	314782	314789	25 %	50 %	25 %	0 %	219870547
5051	NC_011852	CAC	2	6	314794	314799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870547
5052	NC_011852	GAA	2	6	314945	314950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870547
5053	NC_011852	GT	3	6	315156	315161	0 %	50 %	50 %	0 %	219870547
5054	NC_011852	TG	3	6	315176	315181	0 %	50 %	50 %	0 %	219870547
5055	NC_011852	TG	3	6	315212	315217	0 %	50 %	50 %	0 %	219870547
5056	NC_011852	AGA	2	6	315256	315261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870547
5057	NC_011852	AC	3	6	315353	315358	50 %	0 %	0 %	50 %	219870547
5058	NC_011852	TATG	2	8	315361	315368	25 %	50 %	25 %	0 %	219870547
5059	NC_011852	GATT	2	8	315424	315431	25 %	50 %	25 %	0 %	219870547
5060	NC_011852	TGC	2	6	315469	315474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870547
5061	NC_011852	GGC	2	6	315485	315490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219870547
5062	NC_011852	TTCT	2	8	315495	315502	0 %	75 %	0 %	25 %	219870547
5063	NC_011852	AGA	2	6	315538	315543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870547
5064	NC_011852	GAA	2	6	315557	315562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870547
5065	NC_011852	GAA	2	6	315581	315586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870547
5066	NC_011852	AGG	2	6	315592	315597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219870547
5067	NC_011852	CTT	2	6	315689	315694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870548
5068	NC_011852	TTC	3	9	315720	315728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870548
5069	NC_011852	ATT	2	6	315801	315806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870548
5070	NC_011852	CAT	2	6	315846	315851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870548
5071	NC_011852	GTTA	2	8	315881	315888	25 %	50 %	25 %	0 %	219870548
5072	NC_011852	A	6	6	315955	315960	100 %	0 %	0 %	0 %	219870548
5073	NC_011852	TGT	2	6	315961	315966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870548
5074	NC_011852	ATT	2	6	316011	316016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870548
5075	NC_011852	TGT	2	6	316099	316104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870548
5076	NC_011852	CAT	2	6	316112	316117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870548
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5078	NC_011852	CAC	2	6	316203	316208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870548
5079	NC_011852	GAA	2	6	316224	316229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870548
5080	NC_011852	GAA	2	6	316259	316264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870548
5081	NC_011852	T	6	6	317446	317451	0 %	100 %	0 %	0 %	219870549
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5087	NC_011852	AGCAG	2	10	318000	318009	40 %	0 %	40 %	20 %	219870550
5088	NC_011852	TTA	2	6	318017	318022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870550
5089	NC_011852	TGA	2	6	318060	318065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870550
5090	NC_011852	CTT	2	6	318072	318077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870550
5091	NC_011852	TGC	2	6	318078	318083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870550
5092	NC_011852	TGGT	2	8	318089	318096	0 %	50 %	50 %	0 %	219870550
5093	NC_011852	A	6	6	318098	318103	100 %	0 %	0 %	0 %	219870550
5094	NC_011852	TGG	2	6	318326	318331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870550
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5096	NC_011852	TAGA	2	8	318449	318456	50 %	25 %	25 %	0 %	219870550
5097	NC_011852	TTG	2	6	318548	318553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870550
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5101	NC_011852	CAAC	2	8	318772	318779	50 %	0 %	0 %	50 %	219870550
5102	NC_011852	GGT	2	6	318879	318884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870550
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5105	NC_011852	TGCGT	2	10	319071	319080	0 %	40 %	40 %	20 %	219870550
5106	NC_011852	AAG	2	6	319214	319219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870550
5107	NC_011852	CTT	2	6	319253	319258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870550
5108	NC_011852	ATC	2	6	319376	319381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870550
5109	NC_011852	CAA	2	6	319504	319509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870550
5110	NC_011852	A	6	6	319558	319563	100 %	0 %	0 %	0 %	219870550
5111	NC_011852	AG	3	6	319614	319619	50 %	0 %	50 %	0 %	219870550
5112	NC_011852	CTG	2	6	319742	319747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870550
5113	NC_011852	TGGT	2	8	319756	319763	0 %	50 %	50 %	0 %	219870550
5114	NC_011852	TGA	2	6	319767	319772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870550
5115	NC_011852	ATT	2	6	319825	319830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870550
5116	NC_011852	ACTCAG	2	12	319913	319924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219870550
5117	NC_011852	GTA	2	6	319937	319942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870550
5118	NC_011852	CGA	2	6	320030	320035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870550
5119	NC_011852	AAG	2	6	320048	320053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870550
5120	NC_011852	A	6	6	320071	320076	100 %	0 %	0 %	0 %	219870550
5121	NC_011852	GAA	2	6	320079	320084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870550
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5123	NC_011852	A	6	6	320149	320154	100 %	0 %	0 %	0 %	219870550
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5490	NC_011852	TAT	2	6	342634	342639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870572
5491	NC_011852	ATC	2	6	342663	342668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870572
5492	NC_011852	AT	3	6	342720	342725	50 %	50 %	0 %	0 %	219870572
5493	NC_011852	CAT	2	6	342836	342841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870573
5494	NC_011852	TGA	2	6	342880	342885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870573
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5496	NC_011852	AAAC	2	8	343055	343062	75 %	0 %	0 %	25 %	219870574
5497	NC_011852	TGA	2	6	343104	343109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870574
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5499	NC_011852	TGAAA	2	10	343392	343401	60 %	20 %	20 %	0 %	219870575
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