MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori P12 plasmid HPP12

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011499	A	6	6	88	93	100 %	0 %	0 %	0 %	210135771
2	NC_011499	ATA	2	6	123	128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135771
3	NC_011499	TATG	2	8	227	234	25 %	50 %	25 %	0 %	210135771
4	NC_011499	TA	3	6	254	259	50 %	50 %	0 %	0 %	210135771
5	NC_011499	AT	3	6	339	344	50 %	50 %	0 %	0 %	210135771
6	NC_011499	AGT	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135771
7	NC_011499	TTTG	2	8	433	440	0 %	75 %	25 %	0 %	210135771
8	NC_011499	AAG	2	6	444	449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135771
9	NC_011499	A	6	6	479	484	100 %	0 %	0 %	0 %	210135771
10	NC_011499	AAG	2	6	521	526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135771
11	NC_011499	CT	3	6	542	547	0 %	50 %	0 %	50 %	210135771
12	NC_011499	TGT	2	6	564	569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135771
13	NC_011499	TGT	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135771
14	NC_011499	T	8	8	590	597	0 %	100 %	0 %	0 %	210135771
15	NC_011499	GAA	2	6	609	614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135771
16	NC_011499	A	6	6	623	628	100 %	0 %	0 %	0 %	210135771
17	NC_011499	ATG	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135771
18	NC_011499	GTA	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135771
19	NC_011499	AATG	2	8	767	774	50 %	25 %	25 %	0 %	210135771
20	NC_011499	TCT	2	6	783	788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210135771
21	NC_011499	A	8	8	910	917	100 %	0 %	0 %	0 %	210135771
22	NC_011499	TATT	2	8	961	968	25 %	75 %	0 %	0 %	210135771
23	NC_011499	AC	3	6	979	984	50 %	0 %	0 %	50 %	210135771
24	NC_011499	AC	3	6	1008	1013	50 %	0 %	0 %	50 %	210135771
25	NC_011499	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135771
26	NC_011499	TGT	2	6	1257	1262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135772
27	NC_011499	ATC	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135772
28	NC_011499	GCTAG	2	10	1337	1346	20 %	20 %	40 %	20 %	210135772
29	NC_011499	A	6	6	1364	1369	100 %	0 %	0 %	0 %	210135772
30	NC_011499	T	6	6	1429	1434	0 %	100 %	0 %	0 %	210135772
31	NC_011499	ATC	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135772
32	NC_011499	TAT	2	6	1452	1457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135772
33	NC_011499	ACA	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135772
34	NC_011499	A	7	7	1557	1563	100 %	0 %	0 %	0 %	210135772
35	NC_011499	CAAA	2	8	1611	1618	75 %	0 %	0 %	25 %	210135772
36	NC_011499	T	6	6	1624	1629	0 %	100 %	0 %	0 %	210135772
37	NC_011499	A	6	6	1638	1643	100 %	0 %	0 %	0 %	210135772
38	NC_011499	TTC	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210135772
39	NC_011499	ATC	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135772
40	NC_011499	CTA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135772
41	NC_011499	T	7	7	1822	1828	0 %	100 %	0 %	0 %	210135772
42	NC_011499	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135772
43	NC_011499	ATT	2	6	1909	1914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135772
44	NC_011499	GGT	2	6	1956	1961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210135772
45	NC_011499	TTTG	2	8	1971	1978	0 %	75 %	25 %	0 %	210135772
46	NC_011499	ATGA	2	8	1994	2001	50 %	25 %	25 %	0 %	210135772
47	NC_011499	TAA	2	6	2004	2009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135772
48	NC_011499	TCAT	2	8	2078	2085	25 %	50 %	0 %	25 %	210135772
49	NC_011499	TTC	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210135772
50	NC_011499	AAT	2	6	2111	2116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135772
51	NC_011499	AAT	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135772
52	NC_011499	ATAA	2	8	2234	2241	75 %	25 %	0 %	0 %	210135772
53	NC_011499	T	6	6	2556	2561	0 %	100 %	0 %	0 %	210135774
54	NC_011499	TGT	2	6	2593	2598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
55	NC_011499	CT	3	6	2611	2616	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
56	NC_011499	CTTG	2	8	2765	2772	0 %	50 %	25 %	25 %	210135774
57	NC_011499	GTT	2	6	2776	2781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
58	NC_011499	TTTGA	2	10	2841	2850	20 %	60 %	20 %	0 %	210135774
59	NC_011499	TTG	2	6	2865	2870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
60	NC_011499	TC	3	6	2917	2922	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
61	NC_011499	CT	4	8	2957	2964	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
62	NC_011499	CT	4	8	2966	2973	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
63	NC_011499	TAA	2	6	2991	2996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135774
64	NC_011499	TGT	2	6	2999	3004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
65	NC_011499	CT	3	6	3028	3033	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
66	NC_011499	TTCAAG	2	12	3034	3045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	210135774
67	NC_011499	CTG	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210135774
68	NC_011499	CT	3	6	3145	3150	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
69	NC_011499	TTCTT	2	10	3160	3169	0 %	80 %	0 %	20 %	210135774
70	NC_011499	T	6	6	3254	3259	0 %	100 %	0 %	0 %	210135774
71	NC_011499	ATTG	2	8	3280	3287	25 %	50 %	25 %	0 %	210135774
72	NC_011499	TTTC	2	8	3347	3354	0 %	75 %	0 %	25 %	210135774
73	NC_011499	ATG	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135774
74	NC_011499	ATG	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135774
75	NC_011499	TTG	2	6	3532	3537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
76	NC_011499	TTG	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
77	NC_011499	CT	3	6	3583	3588	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
78	NC_011499	TAG	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135774
79	NC_011499	GTT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
80	NC_011499	CT	3	6	3760	3765	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
81	NC_011499	CCTTG	2	10	3858	3867	0 %	40 %	20 %	40 %	210135774
82	NC_011499	A	6	6	3896	3901	100 %	0 %	0 %	0 %	210135774
83	NC_011499	GTT	2	6	3974	3979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
84	NC_011499	GTT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
85	NC_011499	TGT	2	6	4023	4028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
86	NC_011499	ATA	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135774
87	NC_011499	TC	3	6	4144	4149	0 %	50 %	0 %	50 %	210135774
88	NC_011499	TG	3	6	4198	4203	0 %	50 %	50 %	0 %	210135774
89	NC_011499	TG	3	6	4241	4246	0 %	50 %	50 %	0 %	210135774
90	NC_011499	AG	4	8	4352	4359	50 %	0 %	50 %	0 %	210135774
91	NC_011499	TTAG	2	8	4370	4377	25 %	50 %	25 %	0 %	210135774
92	NC_011499	CATCAC	2	12	4449	4460	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	210135774
93	NC_011499	TAAC	2	8	4488	4495	50 %	25 %	0 %	25 %	210135774
94	NC_011499	GTT	2	6	4510	4515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135777
95	NC_011499	ATTG	2	8	4519	4526	25 %	50 %	25 %	0 %	210135777
96	NC_011499	GTT	2	6	4540	4545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135777
97	NC_011499	TTA	2	6	4572	4577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135777
98	NC_011499	GATTT	2	10	4595	4604	20 %	60 %	20 %	0 %	210135777
99	NC_011499	TTA	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135777
100	NC_011499	T	6	6	4664	4669	0 %	100 %	0 %	0 %	210135777
101	NC_011499	TTG	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135777
102	NC_011499	AG	3	6	4704	4709	50 %	0 %	50 %	0 %	210135777
103	NC_011499	T	7	7	4737	4743	0 %	100 %	0 %	0 %	210135777
104	NC_011499	T	8	8	4807	4814	0 %	100 %	0 %	0 %	210135777
105	NC_011499	A	6	6	5031	5036	100 %	0 %	0 %	0 %	210135778
106	NC_011499	AAAGT	2	10	5102	5111	60 %	20 %	20 %	0 %	210135778
107	NC_011499	A	6	6	5122	5127	100 %	0 %	0 %	0 %	210135778
108	NC_011499	ATG	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135778
109	NC_011499	TTA	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135778
110	NC_011499	TGA	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135778
111	NC_011499	TAC	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135778
112	NC_011499	A	6	6	5333	5338	100 %	0 %	0 %	0 %	210135779
113	NC_011499	A	6	6	5357	5362	100 %	0 %	0 %	0 %	210135779
114	NC_011499	A	6	6	5377	5382	100 %	0 %	0 %	0 %	210135779
115	NC_011499	AAATC	2	10	5423	5432	60 %	20 %	0 %	20 %	210135779
116	NC_011499	AG	3	6	5487	5492	50 %	0 %	50 %	0 %	210135779
117	NC_011499	GTT	2	6	5576	5581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135779
118	NC_011499	ATT	2	6	7581	7586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135780
119	NC_011499	AGA	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135780
120	NC_011499	ACAAAA	2	12	7629	7640	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	210135780
121	NC_011499	AGA	2	6	7740	7745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135780
122	NC_011499	CAA	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
123	NC_011499	ACC	2	6	7771	7776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	210135780
124	NC_011499	CAA	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
125	NC_011499	CAA	2	6	7848	7853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
126	NC_011499	TTTG	2	8	7893	7900	0 %	75 %	25 %	0 %	210135780
127	NC_011499	TTA	2	6	8012	8017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135780
128	NC_011499	ATTGA	2	10	8116	8125	40 %	40 %	20 %	0 %	210135780
129	NC_011499	CAA	2	6	8190	8195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
130	NC_011499	CTT	2	6	8216	8221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210135780
131	NC_011499	A	6	6	8446	8451	100 %	0 %	0 %	0 %	210135780
132	NC_011499	CAA	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
133	NC_011499	TTGAA	2	10	8645	8654	40 %	40 %	20 %	0 %	210135780
134	NC_011499	ACA	2	6	8681	8686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
135	NC_011499	ACG	2	6	8708	8713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	210135780
136	NC_011499	CAA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
137	NC_011499	ACT	2	6	8805	8810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135780
138	NC_011499	A	7	7	8832	8838	100 %	0 %	0 %	0 %	210135780
139	NC_011499	AGA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135780
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.