MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori P12 chromosome

Total Repeats: 31079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011498	TGAG	2	8	29	36	25 %	25 %	50 %	0 %	210134202
2	NC_011498	CATT	2	8	116	123	25 %	50 %	0 %	25 %	210134202
3	NC_011498	GAT	3	9	124	132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134202
4	NC_011498	TG	3	6	140	145	0 %	50 %	50 %	0 %	210134202
5	NC_011498	TTCT	2	8	261	268	0 %	75 %	0 %	25 %	210134202
6	NC_011498	AAAGCG	2	12	290	301	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	210134202
7	NC_011498	GTT	2	6	307	312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134202
8	NC_011498	T	7	7	320	326	0 %	100 %	0 %	0 %	210134202
9	NC_011498	T	7	7	348	354	0 %	100 %	0 %	0 %	210134202
10	NC_011498	TTC	2	6	358	363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134202
11	NC_011498	ACA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134202
12	NC_011498	C	6	6	402	407	0 %	0 %	0 %	100 %	210134202
13	NC_011498	CAA	2	6	458	463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134203
14	NC_011498	TTA	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134203
15	NC_011498	C	6	6	644	649	0 %	0 %	0 %	100 %	210134203
16	NC_011498	TAA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134203
17	NC_011498	AAC	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134203
18	NC_011498	CT	3	6	705	710	0 %	50 %	0 %	50 %	210134203
19	NC_011498	CTT	2	6	802	807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134203
20	NC_011498	TCTG	2	8	812	819	0 %	50 %	25 %	25 %	210134203
21	NC_011498	TGA	2	6	820	825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134203
22	NC_011498	AAAT	2	8	914	921	75 %	25 %	0 %	0 %	210134204
23	NC_011498	TCA	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134204
24	NC_011498	AAC	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134204
25	NC_011498	CCG	3	9	1045	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134204
26	NC_011498	CCA	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	210134204
27	NC_011498	GCT	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134204
28	NC_011498	CA	3	6	1228	1233	50 %	0 %	0 %	50 %	210134204
29	NC_011498	T	6	6	1245	1250	0 %	100 %	0 %	0 %	210134204
30	NC_011498	CTA	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134204
31	NC_011498	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	210134204
32	NC_011498	GGC	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	210134204
33	NC_011498	GCT	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134204
34	NC_011498	GCTT	2	8	1457	1464	0 %	50 %	25 %	25 %	210134204
35	NC_011498	CT	3	6	1563	1568	0 %	50 %	0 %	50 %	210134204
36	NC_011498	TAAAA	2	10	1603	1612	80 %	20 %	0 %	0 %	210134204
37	NC_011498	GTT	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134204
38	NC_011498	CTT	2	6	1659	1664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134204
39	NC_011498	TTC	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134205
40	NC_011498	A	7	7	1779	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	210134205
41	NC_011498	ATTATA	2	12	1797	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	210134205
42	NC_011498	CCAA	2	8	1836	1843	50 %	0 %	0 %	50 %	210134205
43	NC_011498	ATTC	2	8	1853	1860	25 %	50 %	0 %	25 %	210134205
44	NC_011498	TGAA	2	8	1876	1883	50 %	25 %	25 %	0 %	210134205
45	NC_011498	GTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134205
46	NC_011498	T	6	6	1978	1983	0 %	100 %	0 %	0 %	210134205
47	NC_011498	TTC	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134205
48	NC_011498	TCA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134205
49	NC_011498	TTAA	2	8	2059	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	210134205
50	NC_011498	AAT	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134205
51	NC_011498	CATG	2	8	2129	2136	25 %	25 %	25 %	25 %	210134205
52	NC_011498	G	6	6	2191	2196	0 %	0 %	100 %	0 %	210134205
53	NC_011498	GATTA	2	10	2250	2259	40 %	40 %	20 %	0 %	210134205
54	NC_011498	ATTC	2	8	2351	2358	25 %	50 %	0 %	25 %	210134205
55	NC_011498	A	8	8	2543	2550	100 %	0 %	0 %	0 %	210134206
56	NC_011498	TCTT	2	8	2559	2566	0 %	75 %	0 %	25 %	210134206
57	NC_011498	T	7	7	2639	2645	0 %	100 %	0 %	0 %	210134206
58	NC_011498	T	7	7	2681	2687	0 %	100 %	0 %	0 %	210134206
59	NC_011498	A	6	6	2830	2835	100 %	0 %	0 %	0 %	210134206
60	NC_011498	ATTAA	2	10	2926	2935	60 %	40 %	0 %	0 %	210134206
61	NC_011498	AG	3	6	2949	2954	50 %	0 %	50 %	0 %	210134206
62	NC_011498	GTG	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134206
63	NC_011498	T	6	6	3021	3026	0 %	100 %	0 %	0 %	210134206
64	NC_011498	AGA	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134206
65	NC_011498	GTG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134206
66	NC_011498	GCC	2	6	3134	3139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134206
67	NC_011498	AG	3	6	3229	3234	50 %	0 %	50 %	0 %	210134207
68	NC_011498	GAAA	2	8	3249	3256	75 %	0 %	25 %	0 %	210134207
69	NC_011498	GAAA	2	8	3324	3331	75 %	0 %	25 %	0 %	210134207
70	NC_011498	TG	3	6	3431	3436	0 %	50 %	50 %	0 %	210134207
71	NC_011498	GTT	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134207
72	NC_011498	AGAA	2	8	3780	3787	75 %	0 %	25 %	0 %	210134207
73	NC_011498	A	6	6	3868	3873	100 %	0 %	0 %	0 %	210134207
74	NC_011498	ATT	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134207
75	NC_011498	GGC	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	210134207
76	NC_011498	AAT	3	9	5139	5147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134208
77	NC_011498	TCGC	2	8	5204	5211	0 %	25 %	25 %	50 %	210134208
78	NC_011498	ATTC	2	8	5233	5240	25 %	50 %	0 %	25 %	210134208
79	NC_011498	CATT	2	8	5277	5284	25 %	50 %	0 %	25 %	210134208
80	NC_011498	ATT	2	6	5299	5304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134208
81	NC_011498	C	6	6	5362	5367	0 %	0 %	0 %	100 %	210134208
82	NC_011498	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134208
83	NC_011498	A	6	6	5509	5514	100 %	0 %	0 %	0 %	210134208
84	NC_011498	TCT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134208
85	NC_011498	T	6	6	5541	5546	0 %	100 %	0 %	0 %	210134208
86	NC_011498	A	6	6	5551	5556	100 %	0 %	0 %	0 %	210134208
87	NC_011498	TTG	2	6	5600	5605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
88	NC_011498	GTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134208
89	NC_011498	TAA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134208
90	NC_011498	TTA	2	6	5726	5731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134208
91	NC_011498	GTG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134208
92	NC_011498	GTT	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
93	NC_011498	GC	3	6	5857	5862	0 %	0 %	50 %	50 %	210134208
94	NC_011498	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134208
95	NC_011498	TGT	2	6	5916	5921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
96	NC_011498	C	6	6	5961	5966	0 %	0 %	0 %	100 %	210134208
97	NC_011498	GTT	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
98	NC_011498	T	6	6	6067	6072	0 %	100 %	0 %	0 %	210134208
99	NC_011498	GCTTGC	2	12	6101	6112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134208
100	NC_011498	CAG	2	6	6147	6152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	210134208
101	NC_011498	TTGCT	2	10	6188	6197	0 %	60 %	20 %	20 %	210134208
102	NC_011498	GTT	2	6	6199	6204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
103	NC_011498	TCA	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134208
104	NC_011498	TGCT	2	8	6396	6403	0 %	50 %	25 %	25 %	210134208
105	NC_011498	TGT	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
106	NC_011498	GCT	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134208
107	NC_011498	ATT	2	6	6484	6489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134208
108	NC_011498	TTA	2	6	6500	6505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134208
109	NC_011498	CCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134208
110	NC_011498	TGTT	2	8	6538	6545	0 %	75 %	25 %	0 %	210134208
111	NC_011498	GTATGT	2	12	6553	6564	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	210134208
112	NC_011498	TGT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
113	NC_011498	TTG	2	6	6625	6630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
114	NC_011498	TGGT	2	8	6739	6746	0 %	50 %	50 %	0 %	210134208
115	NC_011498	CGTTCC	2	12	6783	6794	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	210134208
116	NC_011498	GCG	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	210134208
117	NC_011498	T	6	6	6882	6887	0 %	100 %	0 %	0 %	210134208
118	NC_011498	TG	3	6	6902	6907	0 %	50 %	50 %	0 %	210134208
119	NC_011498	ATCG	2	8	6922	6929	25 %	25 %	25 %	25 %	210134208
120	NC_011498	GCT	2	6	6949	6954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134208
121	NC_011498	CGTT	2	8	6957	6964	0 %	50 %	25 %	25 %	210134208
122	NC_011498	GTT	2	6	6979	6984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
123	NC_011498	A	6	6	7096	7101	100 %	0 %	0 %	0 %	210134208
124	NC_011498	GA	7	14	7135	7148	50 %	0 %	50 %	0 %	210134208
125	NC_011498	T	7	7	7158	7164	0 %	100 %	0 %	0 %	210134208
126	NC_011498	CAT	2	6	7489	7494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134209
127	NC_011498	TCT	2	6	7556	7561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
128	NC_011498	GAAACC	2	12	7604	7615	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	210134209
129	NC_011498	AAT	2	6	7654	7659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134209
130	NC_011498	CTT	2	6	7662	7667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
131	NC_011498	TTCA	2	8	7732	7739	25 %	50 %	0 %	25 %	210134209
132	NC_011498	CAT	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134209
133	NC_011498	GC	3	6	7799	7804	0 %	0 %	50 %	50 %	210134209
134	NC_011498	ATG	2	6	7805	7810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134209
135	NC_011498	TCA	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134209
136	NC_011498	CG	3	6	7864	7869	0 %	0 %	50 %	50 %	210134209
137	NC_011498	CCG	2	6	7883	7888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134209
138	NC_011498	CTT	2	6	7902	7907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
139	NC_011498	CCG	2	6	7911	7916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134209
140	NC_011498	T	6	6	7951	7956	0 %	100 %	0 %	0 %	210134209
141	NC_011498	AG	3	6	8011	8016	50 %	0 %	50 %	0 %	210134209
142	NC_011498	TCTT	2	8	8026	8033	0 %	75 %	0 %	25 %	210134209
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153	NC_011498	CTT	2	6	8592	8597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
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268	NC_011498	A	6	6	14562	14567	100 %	0 %	0 %	0 %	210134216
269	NC_011498	CATG	2	8	14573	14580	25 %	25 %	25 %	25 %	210134216
270	NC_011498	TC	3	6	14606	14611	0 %	50 %	0 %	50 %	210134216
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272	NC_011498	TAG	2	6	14755	14760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134216
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401	NC_011498	GC	3	6	23331	23336	0 %	0 %	50 %	50 %	210134222
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404	NC_011498	TGA	2	6	23550	23555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134222
405	NC_011498	TAT	2	6	23625	23630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134222
406	NC_011498	GTA	2	6	23656	23661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134222
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408	NC_011498	TGG	2	6	23742	23747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134222
409	NC_011498	GCG	2	6	23753	23758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	210134222
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