MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 32875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011126	TAT	2	6	145409	145414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952540
3002	NC_011126	TCT	2	6	145431	145436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952540
3003	NC_011126	GAT	2	6	145463	145468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952540
3004	NC_011126	CTTTT	2	10	145484	145493	0 %	80 %	0 %	20 %	195952540
3005	NC_011126	AT	3	6	145496	145501	50 %	50 %	0 %	0 %	195952540
3006	NC_011126	ATG	2	6	145538	145543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952540
3007	NC_011126	TGG	2	6	145621	145626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952540
3008	NC_011126	A	6	6	145685	145690	100 %	0 %	0 %	0 %	195952540
3009	NC_011126	CTT	2	6	145720	145725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952540
3010	NC_011126	T	6	6	145760	145765	0 %	100 %	0 %	0 %	195952540
3011	NC_011126	TCT	2	6	145791	145796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952540
3012	NC_011126	CT	3	6	145802	145807	0 %	50 %	0 %	50 %	195952540
3013	NC_011126	AAC	2	6	145841	145846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952540
3014	NC_011126	T	6	6	145880	145885	0 %	100 %	0 %	0 %	195952540
3015	NC_011126	A	6	6	145886	145891	100 %	0 %	0 %	0 %	195952540
3016	NC_011126	ATA	2	6	145896	145901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952540
3017	NC_011126	T	6	6	145920	145925	0 %	100 %	0 %	0 %	195952540
3018	NC_011126	ATTT	2	8	145946	145953	25 %	75 %	0 %	0 %	195952540
3019	NC_011126	CTT	2	6	146003	146008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952541
3020	NC_011126	TA	3	6	146041	146046	50 %	50 %	0 %	0 %	195952541
3021	NC_011126	T	7	7	146213	146219	0 %	100 %	0 %	0 %	195952541
3022	NC_011126	TA	3	6	146250	146255	50 %	50 %	0 %	0 %	195952541
3023	NC_011126	AGG	2	6	146267	146272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952541
3024	NC_011126	CTGT	2	8	146278	146285	0 %	50 %	25 %	25 %	195952541
3025	NC_011126	TCC	2	6	146316	146321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952541
3026	NC_011126	GAAA	2	8	146325	146332	75 %	0 %	25 %	0 %	195952541
3027	NC_011126	TAT	2	6	146397	146402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952541
3028	NC_011126	TTTCT	2	10	146435	146444	0 %	80 %	0 %	20 %	195952541
3029	NC_011126	T	6	6	146466	146471	0 %	100 %	0 %	0 %	195952541
3030	NC_011126	ATG	2	6	146473	146478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952541
3031	NC_011126	TA	3	6	146553	146558	50 %	50 %	0 %	0 %	195952541
3032	NC_011126	AAG	2	6	146614	146619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952541
3033	NC_011126	T	7	7	146631	146637	0 %	100 %	0 %	0 %	195952541
3034	NC_011126	CTT	2	6	146855	146860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952541
3035	NC_011126	T	7	7	146868	146874	0 %	100 %	0 %	0 %	195952541
3036	NC_011126	TATCC	2	10	147066	147075	20 %	40 %	0 %	40 %	195952541
3037	NC_011126	T	6	6	147089	147094	0 %	100 %	0 %	0 %	195952542
3038	NC_011126	TTA	2	6	147102	147107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952542
3039	NC_011126	TA	3	6	147173	147178	50 %	50 %	0 %	0 %	195952542
3040	NC_011126	CTT	2	6	147210	147215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952542
3041	NC_011126	T	6	6	147298	147303	0 %	100 %	0 %	0 %	195952542
3042	NC_011126	CTA	2	6	147309	147314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952542
3043	NC_011126	TA	3	6	147385	147390	50 %	50 %	0 %	0 %	195952542
3044	NC_011126	GCT	2	6	147449	147454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952542
3045	NC_011126	AT	3	6	147472	147477	50 %	50 %	0 %	0 %	195952542
3046	NC_011126	TCT	2	6	147554	147559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952542
3047	NC_011126	TCT	3	9	147575	147583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952542
3048	NC_011126	GGA	2	6	147635	147640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952542
3049	NC_011126	TG	3	6	147660	147665	0 %	50 %	50 %	0 %	195952542
3050	NC_011126	TTG	2	6	147677	147682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952542
3051	NC_011126	TTC	2	6	147688	147693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952542
3052	NC_011126	ATT	2	6	147719	147724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952542
3053	NC_011126	TTC	2	6	147766	147771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952542
3054	NC_011126	ATAC	2	8	147791	147798	50 %	25 %	0 %	25 %	195952542
3055	NC_011126	T	6	6	147872	147877	0 %	100 %	0 %	0 %	195952542
3056	NC_011126	ATT	2	6	147893	147898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952542
3057	NC_011126	TGT	2	6	147942	147947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952542
3058	NC_011126	TTTTCA	2	12	148023	148034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	195952542
3059	NC_011126	AAAGG	2	10	148129	148138	60 %	0 %	40 %	0 %	195952543
3060	NC_011126	AAGT	2	8	148157	148164	50 %	25 %	25 %	0 %	195952543
3061	NC_011126	GA	3	6	148259	148264	50 %	0 %	50 %	0 %	195952543
3062	NC_011126	AAG	2	6	148265	148270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952543
3063	NC_011126	AAG	2	6	148298	148303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952543
3064	NC_011126	TGAAGA	2	12	148353	148364	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	195952543
3065	NC_011126	ATT	2	6	148437	148442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952544
3066	NC_011126	A	6	6	148560	148565	100 %	0 %	0 %	0 %	195952544
3067	NC_011126	TACC	2	8	148599	148606	25 %	25 %	0 %	50 %	195952544
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3069	NC_011126	GA	3	6	148722	148727	50 %	0 %	50 %	0 %	195952544
3070	NC_011126	AG	3	6	148759	148764	50 %	0 %	50 %	0 %	195952544
3071	NC_011126	TAT	2	6	148792	148797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952544
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3073	NC_011126	GTA	2	6	148907	148912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952544
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3083	NC_011126	TAAA	2	8	149295	149302	75 %	25 %	0 %	0 %	195952544
3084	NC_011126	TGG	2	6	149319	149324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952544
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3088	NC_011126	TGA	2	6	149493	149498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952545
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3090	NC_011126	TTG	2	6	149573	149578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952545
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3096	NC_011126	A	6	6	149910	149915	100 %	0 %	0 %	0 %	195952545
3097	NC_011126	GAA	2	6	149949	149954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952545
3098	NC_011126	TAA	2	6	150049	150054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952546
3099	NC_011126	TA	3	6	150074	150079	50 %	50 %	0 %	0 %	195952546
3100	NC_011126	TAT	2	6	150227	150232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952546
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3104	NC_011126	CTG	2	6	150277	150282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952546
3105	NC_011126	TA	3	6	150303	150308	50 %	50 %	0 %	0 %	195952546
3106	NC_011126	ATG	2	6	150312	150317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952546
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3108	NC_011126	ACAA	2	8	150339	150346	75 %	0 %	0 %	25 %	195952546
3109	NC_011126	AT	3	6	150376	150381	50 %	50 %	0 %	0 %	195952546
3110	NC_011126	AAG	2	6	150403	150408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952546
3111	NC_011126	CCA	2	6	150439	150444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952546
3112	NC_011126	GCTATG	2	12	150468	150479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	195952546
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3114	NC_011126	AAG	2	6	150549	150554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952546
3115	NC_011126	A	7	7	150605	150611	100 %	0 %	0 %	0 %	195952546
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3119	NC_011126	AAAGT	2	10	150736	150745	60 %	20 %	20 %	0 %	195952546
3120	NC_011126	GT	3	6	150763	150768	0 %	50 %	50 %	0 %	195952546
3121	NC_011126	AGA	2	6	150869	150874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952546
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3125	NC_011126	T	6	6	151037	151042	0 %	100 %	0 %	0 %	195952547
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3250	NC_011126	AGA	2	6	157433	157438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952554
3251	NC_011126	CTT	2	6	157583	157588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952555
3252	NC_011126	TA	3	6	157615	157620	50 %	50 %	0 %	0 %	195952555
3253	NC_011126	TAC	2	6	157659	157664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952555
3254	NC_011126	TGCA	2	8	157683	157690	25 %	25 %	25 %	25 %	195952555
3255	NC_011126	TCT	2	6	157792	157797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952555
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3258	NC_011126	TAC	2	6	157908	157913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952555
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3289	NC_011126	T	6	6	159210	159215	0 %	100 %	0 %	0 %	195952556
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3361	NC_011126	AGAT	2	8	162409	162416	50 %	25 %	25 %	0 %	195952560
3362	NC_011126	TTTC	2	8	162439	162446	0 %	75 %	0 %	25 %	195952560
3363	NC_011126	T	7	7	162513	162519	0 %	100 %	0 %	0 %	195952561
3364	NC_011126	T	6	6	162539	162544	0 %	100 %	0 %	0 %	195952561
3365	NC_011126	CAA	2	6	162573	162578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952561
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3370	NC_011126	ACT	2	6	162873	162878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952561
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3499	NC_011126	AGA	2	6	169253	169258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952572
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