MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 32875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011126	ATG	2	6	48818	48823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952434
1002	NC_011126	TGG	2	6	48847	48852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952434
1003	NC_011126	TTA	2	6	48885	48890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952434
1004	NC_011126	TTGGC	2	10	48921	48930	0 %	40 %	40 %	20 %	195952434
1005	NC_011126	CA	3	6	48937	48942	50 %	0 %	0 %	50 %	195952434
1006	NC_011126	CTG	2	6	48990	48995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952434
1007	NC_011126	T	6	6	48997	49002	0 %	100 %	0 %	0 %	195952434
1008	NC_011126	CGT	2	6	49047	49052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952434
1009	NC_011126	T	6	6	49102	49107	0 %	100 %	0 %	0 %	195952434
1010	NC_011126	TCT	2	6	49115	49120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952434
1011	NC_011126	ATC	2	6	49162	49167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952434
1012	NC_011126	AAG	2	6	49189	49194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952434
1013	NC_011126	CTTGG	2	10	49283	49292	0 %	40 %	40 %	20 %	195952434
1014	NC_011126	CTA	2	6	49305	49310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952434
1015	NC_011126	GGT	2	6	49328	49333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952434
1016	NC_011126	TGA	2	6	49350	49355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952434
1017	NC_011126	CTCC	2	8	49375	49382	0 %	25 %	0 %	75 %	195952434
1018	NC_011126	AT	3	6	49707	49712	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1019	NC_011126	T	7	7	49753	49759	0 %	100 %	0 %	0 %	195952435
1020	NC_011126	GTT	2	6	49763	49768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952435
1021	NC_011126	TAA	2	6	49894	49899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952435
1022	NC_011126	GGTG	2	8	49909	49916	0 %	25 %	75 %	0 %	195952435
1023	NC_011126	CTTT	2	8	49979	49986	0 %	75 %	0 %	25 %	195952435
1024	NC_011126	A	6	6	49994	49999	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1025	NC_011126	A	6	6	50006	50011	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1026	NC_011126	TATG	2	8	50047	50054	25 %	50 %	25 %	0 %	195952435
1027	NC_011126	TTA	2	6	50142	50147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952435
1028	NC_011126	TA	3	6	50159	50164	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1029	NC_011126	T	6	6	50219	50224	0 %	100 %	0 %	0 %	195952435
1030	NC_011126	ATT	2	6	50240	50245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952435
1031	NC_011126	AT	3	6	50289	50294	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1032	NC_011126	CAA	2	6	50384	50389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952435
1033	NC_011126	AT	3	6	50395	50400	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1034	NC_011126	AGC	2	6	50435	50440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952435
1035	NC_011126	TCTG	2	8	50518	50525	0 %	50 %	25 %	25 %	195952435
1036	NC_011126	AT	3	6	50542	50547	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1037	NC_011126	A	6	6	50574	50579	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1038	NC_011126	AG	3	6	50593	50598	50 %	0 %	50 %	0 %	195952435
1039	NC_011126	CT	3	6	50629	50634	0 %	50 %	0 %	50 %	195952435
1040	NC_011126	TAT	2	6	50769	50774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952435
1041	NC_011126	AAC	2	6	50813	50818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952435
1042	NC_011126	CTA	2	6	50970	50975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952435
1043	NC_011126	GA	3	6	50978	50983	50 %	0 %	50 %	0 %	195952435
1044	NC_011126	ATG	2	6	51051	51056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952435
1045	NC_011126	CAA	2	6	51058	51063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952435
1046	NC_011126	GAA	2	6	51134	51139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
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1048	NC_011126	A	6	6	51268	51273	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
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1050	NC_011126	ATG	2	6	51347	51352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952435
1051	NC_011126	A	6	6	51364	51369	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1052	NC_011126	AACAG	2	10	51403	51412	60 %	0 %	20 %	20 %	195952435
1053	NC_011126	GAA	2	6	51499	51504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
1054	NC_011126	GGT	2	6	51521	51526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952435
1055	NC_011126	ATT	2	6	51609	51614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952435
1056	NC_011126	AAG	2	6	51648	51653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
1057	NC_011126	TCT	2	6	51668	51673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952435
1058	NC_011126	AGA	2	6	51679	51684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
1059	NC_011126	AAC	2	6	51710	51715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952435
1060	NC_011126	GGC	2	6	51751	51756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195952435
1061	NC_011126	AGA	2	6	51763	51768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
1062	NC_011126	TTA	2	6	51914	51919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952436
1063	NC_011126	GTG	2	6	52067	52072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952436
1064	NC_011126	AAC	2	6	52103	52108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952436
1065	NC_011126	GCTC	2	8	52130	52137	0 %	25 %	25 %	50 %	195952436
1066	NC_011126	TTA	2	6	52176	52181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952436
1067	NC_011126	A	6	6	52193	52198	100 %	0 %	0 %	0 %	195952436
1068	NC_011126	T	7	7	52221	52227	0 %	100 %	0 %	0 %	195952436
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1070	NC_011126	AGA	2	6	52282	52287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952436
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1072	NC_011126	ACAA	2	8	52336	52343	75 %	0 %	0 %	25 %	195952436
1073	NC_011126	ATG	2	6	52374	52379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952436
1074	NC_011126	TAT	2	6	52513	52518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952436
1075	NC_011126	AAC	2	6	52553	52558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952436
1076	NC_011126	TAGAA	2	10	52585	52594	60 %	20 %	20 %	0 %	195952436
1077	NC_011126	T	6	6	52652	52657	0 %	100 %	0 %	0 %	195952436
1078	NC_011126	CAAA	2	8	52742	52749	75 %	0 %	0 %	25 %	195952436
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1082	NC_011126	TAT	2	6	52922	52927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952436
1083	NC_011126	GATA	2	8	52949	52956	50 %	25 %	25 %	0 %	195952436
1084	NC_011126	GAA	2	6	52994	52999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952436
1085	NC_011126	TAT	2	6	53015	53020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952436
1086	NC_011126	ATT	2	6	53085	53090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952436
1087	NC_011126	ATA	2	6	53181	53186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952436
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1090	NC_011126	AT	3	6	53371	53376	50 %	50 %	0 %	0 %	195952437
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1093	NC_011126	TTC	2	6	53506	53511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952437
1094	NC_011126	TA	3	6	53516	53521	50 %	50 %	0 %	0 %	195952437
1095	NC_011126	T	6	6	53524	53529	0 %	100 %	0 %	0 %	195952437
1096	NC_011126	TCT	2	6	53543	53548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952437
1097	NC_011126	T	8	8	53567	53574	0 %	100 %	0 %	0 %	195952437
1098	NC_011126	A	6	6	53604	53609	100 %	0 %	0 %	0 %	195952437
1099	NC_011126	TAC	2	6	53665	53670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952437
1100	NC_011126	CTG	2	6	53673	53678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952437
1101	NC_011126	A	6	6	53734	53739	100 %	0 %	0 %	0 %	195952437
1102	NC_011126	TCA	2	6	53843	53848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952438
1103	NC_011126	ATT	4	12	53866	53877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952438
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1105	NC_011126	ATACG	2	10	53954	53963	40 %	20 %	20 %	20 %	195952438
1106	NC_011126	AAG	2	6	54001	54006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952438
1107	NC_011126	TGT	2	6	54014	54019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952438
1108	NC_011126	AAG	2	6	54042	54047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952438
1109	NC_011126	TTA	2	6	54062	54067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952438
1110	NC_011126	ACG	2	6	54166	54171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952438
1111	NC_011126	AAG	2	6	54203	54208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952438
1112	NC_011126	ACA	2	6	54211	54216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952438
1113	NC_011126	ACA	2	6	54226	54231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952438
1114	NC_011126	GTG	2	6	54303	54308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952438
1115	NC_011126	CTGG	2	8	54399	54406	0 %	25 %	50 %	25 %	195952438
1116	NC_011126	ACC	2	6	54488	54493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952438
1117	NC_011126	AT	3	6	54536	54541	50 %	50 %	0 %	0 %	195952438
1118	NC_011126	ATC	2	6	54689	54694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952439
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1120	NC_011126	TTC	2	6	54758	54763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952439
1121	NC_011126	GTAA	2	8	54784	54791	50 %	25 %	25 %	0 %	195952439
1122	NC_011126	T	6	6	54860	54865	0 %	100 %	0 %	0 %	195952439
1123	NC_011126	AAG	2	6	54888	54893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952439
1124	NC_011126	AG	3	6	54914	54919	50 %	0 %	50 %	0 %	195952439
1125	NC_011126	TA	3	6	54930	54935	50 %	50 %	0 %	0 %	195952439
1126	NC_011126	ATA	2	6	54940	54945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952439
1127	NC_011126	TCT	2	6	54969	54974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952439
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1254	NC_011126	TA	3	6	60953	60958	50 %	50 %	0 %	0 %	195952444
1255	NC_011126	GATT	2	8	60988	60995	25 %	50 %	25 %	0 %	195952444
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