MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 29730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	188526813
2	NC_010698	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	188526813
3	NC_010698	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526813
4	NC_010698	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	188526813
5	NC_010698	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526813
6	NC_010698	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	188526813
7	NC_010698	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	188526813
8	NC_010698	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526813
9	NC_010698	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526813
10	NC_010698	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526813
11	NC_010698	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	188526813
12	NC_010698	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526814
13	NC_010698	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	188526814
14	NC_010698	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526814
15	NC_010698	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526814
16	NC_010698	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	188526814
17	NC_010698	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526814
18	NC_010698	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	188526814
19	NC_010698	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526814
20	NC_010698	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	188526815
21	NC_010698	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526815
22	NC_010698	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526815
23	NC_010698	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526815
24	NC_010698	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526815
25	NC_010698	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	188526815
26	NC_010698	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	188526815
27	NC_010698	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526815
28	NC_010698	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	188526815
29	NC_010698	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	188526815
30	NC_010698	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188526815
31	NC_010698	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	188526815
32	NC_010698	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	188526815
33	NC_010698	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	188526815
34	NC_010698	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526815
35	NC_010698	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526815
36	NC_010698	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526816
37	NC_010698	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	188526816
38	NC_010698	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	188526816
39	NC_010698	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	188526816
40	NC_010698	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526816
41	NC_010698	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	188526816
42	NC_010698	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	188526816
43	NC_010698	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526816
44	NC_010698	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	188526816
45	NC_010698	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526816
46	NC_010698	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526816
47	NC_010698	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526816
48	NC_010698	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	188526816
49	NC_010698	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526816
50	NC_010698	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526816
51	NC_010698	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	188526816
52	NC_010698	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	188526816
53	NC_010698	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	188526817
54	NC_010698	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	188526817
55	NC_010698	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	188526817
56	NC_010698	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	188526817
57	NC_010698	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188526817
58	NC_010698	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	188526817
59	NC_010698	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	188526817
60	NC_010698	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	188526817
61	NC_010698	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526817
62	NC_010698	T	6	6	3020	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	188526817
63	NC_010698	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526817
64	NC_010698	CAAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	0 %	25 %	188526817
65	NC_010698	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526817
66	NC_010698	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526817
67	NC_010698	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	188526818
68	NC_010698	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	188526818
69	NC_010698	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	188526818
70	NC_010698	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	188526818
71	NC_010698	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526818
72	NC_010698	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526818
73	NC_010698	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188526818
74	NC_010698	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	188526818
75	NC_010698	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	188526818
76	NC_010698	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526818
77	NC_010698	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188526818
78	NC_010698	G	6	6	7242	7247	0 %	0 %	100 %	0 %	188526819
79	NC_010698	TGT	2	6	7270	7275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526819
80	NC_010698	CAAA	2	8	7306	7313	75 %	0 %	0 %	25 %	188526819
81	NC_010698	CAT	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
82	NC_010698	GCC	2	6	7365	7370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526820
83	NC_010698	TCT	2	6	7426	7431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
84	NC_010698	GAAACC	2	12	7474	7485	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	188526820
85	NC_010698	AAT	2	6	7524	7529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526820
86	NC_010698	CTT	2	6	7532	7537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
87	NC_010698	TTCA	2	8	7602	7609	25 %	50 %	0 %	25 %	188526820
88	NC_010698	CAT	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
89	NC_010698	GC	3	6	7669	7674	0 %	0 %	50 %	50 %	188526820
90	NC_010698	ATG	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526820
91	NC_010698	TCA	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
92	NC_010698	CCG	2	6	7753	7758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526820
93	NC_010698	CTT	2	6	7772	7777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
94	NC_010698	TCA	2	6	7807	7812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
95	NC_010698	T	6	6	7821	7826	0 %	100 %	0 %	0 %	188526820
96	NC_010698	AG	3	6	7881	7886	50 %	0 %	50 %	0 %	188526820
97	NC_010698	TCTT	2	8	7896	7903	0 %	75 %	0 %	25 %	188526820
98	NC_010698	CAT	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
99	NC_010698	GTG	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526820
100	NC_010698	TTC	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
101	NC_010698	TAA	2	6	8096	8101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526820
102	NC_010698	CCG	2	6	8107	8112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526820
103	NC_010698	TTTCT	2	10	8138	8147	0 %	80 %	0 %	20 %	188526820
104	NC_010698	CAC	2	6	8208	8213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526820
105	NC_010698	GAT	2	6	8250	8255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526820
106	NC_010698	T	6	6	8282	8287	0 %	100 %	0 %	0 %	188526820
107	NC_010698	TAG	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526820
108	NC_010698	T	7	7	8321	8327	0 %	100 %	0 %	0 %	188526820
109	NC_010698	GA	3	6	8398	8403	50 %	0 %	50 %	0 %	188526820
110	NC_010698	CTT	2	6	8462	8467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
111	NC_010698	TCT	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
112	NC_010698	T	6	6	8589	8594	0 %	100 %	0 %	0 %	188526820
113	NC_010698	T	6	6	8601	8606	0 %	100 %	0 %	0 %	188526820
114	NC_010698	TAA	2	6	8615	8620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526820
115	NC_010698	AAGC	2	8	8711	8718	50 %	0 %	25 %	25 %	188526820
116	NC_010698	GCA	2	6	8746	8751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188526820
117	NC_010698	CTT	2	6	8771	8776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
118	NC_010698	T	6	6	8873	8878	0 %	100 %	0 %	0 %	188526820
119	NC_010698	CAAA	2	8	8948	8955	75 %	0 %	0 %	25 %	188526820
120	NC_010698	T	6	6	9027	9032	0 %	100 %	0 %	0 %	188526821
121	NC_010698	ACA	2	6	9093	9098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526821
122	NC_010698	TCT	2	6	9127	9132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526821
123	NC_010698	CTT	2	6	9209	9214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526821
124	NC_010698	GAT	3	9	9297	9305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526821
125	NC_010698	TCT	2	6	9325	9330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526821
126	NC_010698	CTA	2	6	9341	9346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526821
127	NC_010698	GATA	2	8	9701	9708	50 %	25 %	25 %	0 %	188526822
128	NC_010698	TTG	2	6	9767	9772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526822
129	NC_010698	GAA	2	6	9783	9788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526822
130	NC_010698	TCAA	2	8	9808	9815	50 %	25 %	0 %	25 %	188526822
131	NC_010698	TTA	2	6	9962	9967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526822
132	NC_010698	AGA	2	6	9977	9982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526822
133	NC_010698	ACC	2	6	9985	9990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526822
134	NC_010698	AAG	2	6	10018	10023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526822
135	NC_010698	T	8	8	10041	10048	0 %	100 %	0 %	0 %	188526822
136	NC_010698	ATT	2	6	10051	10056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526822
137	NC_010698	A	6	6	10060	10065	100 %	0 %	0 %	0 %	188526822
138	NC_010698	AG	3	6	10079	10084	50 %	0 %	50 %	0 %	188526822
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401	NC_010698	ATA	2	6	24359	24364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526834
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