MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 41066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_010519	AAT	2	6	2260556	2260561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718319
41002	NC_010519	AATATG	2	12	2260580	2260591	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170718319
41003	NC_010519	GTT	2	6	2260611	2260616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718319
41004	NC_010519	GCC	2	6	2260638	2260643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170718319
41005	NC_010519	GT	3	6	2260657	2260662	0 %	50 %	50 %	0 %	170718319
41006	NC_010519	TAA	2	6	2260664	2260669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718319
41007	NC_010519	ACT	2	6	2260704	2260709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718319
41008	NC_010519	T	6	6	2260749	2260754	0 %	100 %	0 %	0 %	170718319
41009	NC_010519	TTC	2	6	2260823	2260828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718319
41010	NC_010519	TGC	2	6	2260844	2260849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718319
41011	NC_010519	TAAA	2	8	2260865	2260872	75 %	25 %	0 %	0 %	170718319
41012	NC_010519	TGC	2	6	2260940	2260945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718319
41013	NC_010519	TAA	2	6	2261081	2261086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718319
41014	NC_010519	CTG	2	6	2261270	2261275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718319
41015	NC_010519	CCA	2	6	2261310	2261315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718319
41016	NC_010519	ATT	2	6	2261444	2261449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718320
41017	NC_010519	T	7	7	2261448	2261454	0 %	100 %	0 %	0 %	170718320
41018	NC_010519	T	6	6	2261472	2261477	0 %	100 %	0 %	0 %	170718320
41019	NC_010519	TTG	2	6	2261502	2261507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718320
41020	NC_010519	TAA	2	6	2261516	2261521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718320
41021	NC_010519	GAA	2	6	2261559	2261564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718320
41022	NC_010519	AAG	2	6	2261566	2261571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718320
41023	NC_010519	TCA	2	6	2261600	2261605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718320
41024	NC_010519	ATCGG	2	10	2261617	2261626	20 %	20 %	40 %	20 %	170718320
41025	NC_010519	T	6	6	2261645	2261650	0 %	100 %	0 %	0 %	170718320
41026	NC_010519	CCAA	2	8	2261724	2261731	50 %	0 %	0 %	50 %	170718320
41027	NC_010519	AGA	2	6	2261803	2261808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718320
41028	NC_010519	TCT	2	6	2261842	2261847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718320
41029	NC_010519	TCA	2	6	2261858	2261863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718320
41030	NC_010519	TAC	2	6	2261991	2261996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718320
41031	NC_010519	AAT	2	6	2262009	2262014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718320
41032	NC_010519	TAT	2	6	2262272	2262277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718320
41033	NC_010519	AAT	2	6	2262311	2262316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718320
41034	NC_010519	CAA	2	6	2262321	2262326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718320
41035	NC_010519	CAACC	2	10	2262329	2262338	40 %	0 %	0 %	60 %	170718320
41036	NC_010519	T	6	6	2262390	2262395	0 %	100 %	0 %	0 %	170718320
41037	NC_010519	CCG	2	6	2262424	2262429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170718320
41038	NC_010519	TGGT	2	8	2262520	2262527	0 %	50 %	50 %	0 %	170718320
41039	NC_010519	CTG	2	6	2262630	2262635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718320
41040	NC_010519	T	6	6	2262706	2262711	0 %	100 %	0 %	0 %	170718320
41041	NC_010519	AT	3	6	2262733	2262738	50 %	50 %	0 %	0 %	170718320
41042	NC_010519	TAA	2	6	2262759	2262764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718320
41043	NC_010519	GAA	2	6	2262778	2262783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718320
41044	NC_010519	CAT	2	6	2262794	2262799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718320
41045	NC_010519	AAT	2	6	2262805	2262810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718320
41046	NC_010519	C	8	8	2262827	2262834	0 %	0 %	0 %	100 %	170718320
41047	NC_010519	CAT	2	6	2262860	2262865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718320
41048	NC_010519	TAA	2	6	2262875	2262880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718320
41049	NC_010519	ATAA	2	8	2263011	2263018	75 %	25 %	0 %	0 %	170718320
41050	NC_010519	GGAA	2	8	2263019	2263026	50 %	0 %	50 %	0 %	170718320
41051	NC_010519	AAG	2	6	2263032	2263037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718320
41052	NC_010519	ATAA	2	8	2263042	2263049	75 %	25 %	0 %	0 %	170718320
41053	NC_010519	ATT	2	6	2263069	2263074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718320
41054	NC_010519	TGT	2	6	2263084	2263089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718321
41055	NC_010519	TAC	2	6	2263178	2263183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718321
41056	NC_010519	AACAAG	2	12	2263213	2263224	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	170718321
41057	NC_010519	ATC	2	6	2263263	2263268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718321
41058	NC_010519	AAT	2	6	2263349	2263354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718323
41059	NC_010519	CTTT	2	8	2263380	2263387	0 %	75 %	0 %	25 %	170718323
41060	NC_010519	TTA	3	9	2263389	2263397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718323
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41064	NC_010519	T	6	6	2263535	2263540	0 %	100 %	0 %	0 %	170718323
41065	NC_010519	ACG	3	9	2263698	2263706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718324
41066	NC_010519	GT	3	6	2263755	2263760	0 %	50 %	50 %	0 %	170718324

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.