MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 41066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010519	AT	3	6	297183	297188	50 %	50 %	0 %	0 %	170718404
5502	NC_010519	TAT	2	6	297386	297391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718405
5503	NC_010519	ACC	2	6	297434	297439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718405
5504	NC_010519	A	8	8	297586	297593	100 %	0 %	0 %	0 %	170718405
5505	NC_010519	GT	3	6	297618	297623	0 %	50 %	50 %	0 %	170718405
5506	NC_010519	GAA	2	6	297624	297629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718405
5507	NC_010519	ACA	2	6	298443	298448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718406
5508	NC_010519	CAGG	2	8	298474	298481	25 %	0 %	50 %	25 %	170718406
5509	NC_010519	TTTC	2	8	298525	298532	0 %	75 %	0 %	25 %	170718406
5510	NC_010519	TCA	2	6	298545	298550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718406
5511	NC_010519	AGA	2	6	298614	298619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718406
5512	NC_010519	TTC	2	6	298662	298667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718406
5513	NC_010519	GGC	2	6	298674	298679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170718406
5514	NC_010519	ATT	2	6	298686	298691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718406
5515	NC_010519	TGA	2	6	298713	298718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718406
5516	NC_010519	GAA	2	6	298825	298830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718406
5517	NC_010519	TTG	2	6	298868	298873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718406
5518	NC_010519	GAA	2	6	298897	298902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718406
5519	NC_010519	A	6	6	298933	298938	100 %	0 %	0 %	0 %	170718406
5520	NC_010519	ATTG	2	8	298950	298957	25 %	50 %	25 %	0 %	170718406
5521	NC_010519	T	6	6	298968	298973	0 %	100 %	0 %	0 %	170718406
5522	NC_010519	TTTA	2	8	298983	298990	25 %	75 %	0 %	0 %	170718406
5523	NC_010519	AT	3	6	299037	299042	50 %	50 %	0 %	0 %	170718406
5524	NC_010519	TAG	2	6	299063	299068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718406
5525	NC_010519	TTG	2	6	299075	299080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718406
5526	NC_010519	TTATA	2	10	299107	299116	40 %	60 %	0 %	0 %	170718406
5527	NC_010519	TAT	2	6	299138	299143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718406
5528	NC_010519	TCA	2	6	299205	299210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718406
5529	NC_010519	AGG	2	6	299283	299288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170718406
5530	NC_010519	TAC	2	6	299468	299473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718406
5531	NC_010519	AGA	2	6	299499	299504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718406
5532	NC_010519	TACA	2	8	299725	299732	50 %	25 %	0 %	25 %	170718407
5533	NC_010519	TAT	2	6	299779	299784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718407
5534	NC_010519	TGA	2	6	299891	299896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718407
5535	NC_010519	TTC	2	6	299949	299954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718407
5536	NC_010519	AAG	2	6	299956	299961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718407
5537	NC_010519	A	6	6	299996	300001	100 %	0 %	0 %	0 %	170718407
5538	NC_010519	TTTC	2	8	300167	300174	0 %	75 %	0 %	25 %	170718408
5539	NC_010519	TAA	2	6	300222	300227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718408
5540	NC_010519	TAA	2	6	300273	300278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718408
5541	NC_010519	A	6	6	300277	300282	100 %	0 %	0 %	0 %	170718408
5542	NC_010519	ATC	2	6	300291	300296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718408
5543	NC_010519	TGT	2	6	300349	300354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718408
5544	NC_010519	GATT	2	8	300439	300446	25 %	50 %	25 %	0 %	170718408
5545	NC_010519	TTA	2	6	300452	300457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718408
5546	NC_010519	CT	3	6	300475	300480	0 %	50 %	0 %	50 %	170718408
5547	NC_010519	TATTC	2	10	300483	300492	20 %	60 %	0 %	20 %	170718408
5548	NC_010519	TAT	2	6	300531	300536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718408
5549	NC_010519	ATC	2	6	300546	300551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718408
5550	NC_010519	AAAC	2	8	300553	300560	75 %	0 %	0 %	25 %	170718408
5551	NC_010519	TTGCG	2	10	300637	300646	0 %	40 %	40 %	20 %	170718408
5552	NC_010519	A	6	6	300652	300657	100 %	0 %	0 %	0 %	170718408
5553	NC_010519	TCC	2	6	300702	300707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170718408
5554	NC_010519	AAAG	2	8	300717	300724	75 %	0 %	25 %	0 %	170718408
5555	NC_010519	ATT	2	6	300774	300779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718408
5556	NC_010519	ATC	2	6	300804	300809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718408
5557	NC_010519	TGA	2	6	300817	300822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718408
5558	NC_010519	GTT	2	6	300836	300841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718408
5559	NC_010519	A	6	6	300847	300852	100 %	0 %	0 %	0 %	170718408
5560	NC_010519	TCT	2	6	300939	300944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718410
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5562	NC_010519	CCA	2	6	301047	301052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718410
5563	NC_010519	ATA	2	6	301077	301082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718410
5564	NC_010519	ACG	2	6	301140	301145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718410
5565	NC_010519	CAT	2	6	301166	301171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718410
5566	NC_010519	CTG	2	6	301252	301257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718410
5567	NC_010519	TGG	2	6	301331	301336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170718410
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5570	NC_010519	ATAA	2	8	301587	301594	75 %	25 %	0 %	0 %	170718410
5571	NC_010519	TCA	2	6	301642	301647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718410
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5579	NC_010519	ATTGG	2	10	301939	301948	20 %	40 %	40 %	0 %	170718410
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5582	NC_010519	TAA	2	6	302036	302041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718410
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5593	NC_010519	ACCA	2	8	302733	302740	50 %	0 %	0 %	50 %	170718411
5594	NC_010519	GTA	2	6	302831	302836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718411
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5603	NC_010519	TG	3	6	303384	303389	0 %	50 %	50 %	0 %	170718412
5604	NC_010519	CAA	2	6	303646	303651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718412
5605	NC_010519	TGT	2	6	303667	303672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718412
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5607	NC_010519	TTCCTT	2	12	303736	303747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718412
5608	NC_010519	A	6	6	303749	303754	100 %	0 %	0 %	0 %	170718412
5609	NC_010519	CGA	2	6	303801	303806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718412
5610	NC_010519	A	6	6	303820	303825	100 %	0 %	0 %	0 %	170718412
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5614	NC_010519	T	6	6	304170	304175	0 %	100 %	0 %	0 %	170718413
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5621	NC_010519	AGCA	2	8	304743	304750	50 %	0 %	25 %	25 %	170718413
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5623	NC_010519	CCA	2	6	304807	304812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718413
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5743	NC_010519	GTT	2	6	312692	312697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718418
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5993	NC_010519	AAT	2	6	325975	325980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718437
5994	NC_010519	ATCAA	2	10	325987	325996	60 %	20 %	0 %	20 %	170718437
5995	NC_010519	CAA	2	6	326031	326036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718437
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