MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 5313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010368	CACG	2	8	73161	73168	25 %	0 %	25 %	50 %	169237429
1502	NC_010368	TCG	2	6	73190	73195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237429
1503	NC_010368	GAT	2	6	73207	73212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237429
1504	NC_010368	GTC	2	6	73213	73218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237429
1505	NC_010368	CGT	2	6	73239	73244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237429
1506	NC_010368	CCAG	2	8	73245	73252	25 %	0 %	25 %	50 %	169237429
1507	NC_010368	AGC	2	6	73259	73264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237429
1508	NC_010368	GTC	2	6	73270	73275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237429
1509	NC_010368	GCG	2	6	73284	73289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237429
1510	NC_010368	ATC	2	6	73312	73317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237429
1511	NC_010368	GTC	2	6	73336	73341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237429
1512	NC_010368	TGG	2	6	73344	73349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237429
1513	NC_010368	GCC	2	6	73358	73363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237429
1514	NC_010368	GCCG	2	8	73408	73415	0 %	0 %	50 %	50 %	169237429
1515	NC_010368	CATC	2	8	73416	73423	25 %	25 %	0 %	50 %	169237429
1516	NC_010368	GTC	2	6	73447	73452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237429
1517	NC_010368	AGC	2	6	73521	73526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1518	NC_010368	TGA	2	6	73639	73644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237430
1519	NC_010368	CGT	2	6	73654	73659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1520	NC_010368	AGC	2	6	73740	73745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1521	NC_010368	TCGG	2	8	73815	73822	0 %	25 %	50 %	25 %	169237430
1522	NC_010368	GTG	2	6	73824	73829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237430
1523	NC_010368	GTCG	2	8	73843	73850	0 %	25 %	50 %	25 %	169237430
1524	NC_010368	CGT	3	9	73861	73869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1525	NC_010368	GCA	2	6	73957	73962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1526	NC_010368	G	7	7	73982	73988	0 %	0 %	100 %	0 %	169237430
1527	NC_010368	ACG	2	6	73989	73994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1528	NC_010368	GAC	2	6	74090	74095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1529	NC_010368	CGC	2	6	74098	74103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237430
1530	NC_010368	C	7	7	74111	74117	0 %	0 %	0 %	100 %	169237430
1531	NC_010368	TCG	2	6	74193	74198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1532	NC_010368	ACG	2	6	74364	74369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1533	NC_010368	CGA	2	6	74374	74379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1534	NC_010368	GTTG	2	8	74458	74465	0 %	50 %	50 %	0 %	169237430
1535	NC_010368	TGGG	2	8	74482	74489	0 %	25 %	75 %	0 %	169237430
1536	NC_010368	GGCG	2	8	74497	74504	0 %	0 %	75 %	25 %	169237430
1537	NC_010368	GCC	2	6	74524	74529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237430
1538	NC_010368	TGG	2	6	74554	74559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237430
1539	NC_010368	CATC	2	8	74629	74636	25 %	25 %	0 %	50 %	169237430
1540	NC_010368	GCG	2	6	74688	74693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237430
1541	NC_010368	CG	3	6	74734	74739	0 %	0 %	50 %	50 %	169237430
1542	NC_010368	CAG	2	6	74831	74836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237430
1543	NC_010368	CCG	2	6	74864	74869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237430
1544	NC_010368	GCGT	2	8	74923	74930	0 %	25 %	50 %	25 %	169237430
1545	NC_010368	CTC	2	6	75221	75226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237431
1546	NC_010368	GTC	2	6	75270	75275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237431
1547	NC_010368	CGT	2	6	75332	75337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237431
1548	NC_010368	TCC	2	6	75358	75363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237431
1549	NC_010368	ACC	2	6	75544	75549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237432
1550	NC_010368	GAT	2	6	75557	75562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237432
1551	NC_010368	GGC	2	6	75572	75577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237432
1552	NC_010368	GAG	2	6	75615	75620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237432
1553	NC_010368	CGC	2	6	75623	75628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237432
1554	NC_010368	GCGG	2	8	75683	75690	0 %	0 %	75 %	25 %	169237432
1555	NC_010368	CTG	2	6	75721	75726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1556	NC_010368	CAC	2	6	75735	75740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237432
1557	NC_010368	CCG	2	6	75748	75753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237432
1558	NC_010368	GCG	2	6	75783	75788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237432
1559	NC_010368	ACC	2	6	75801	75806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237432
1560	NC_010368	CGC	3	9	75821	75829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237432
1561	NC_010368	ACG	2	6	75835	75840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1562	NC_010368	GAG	2	6	75876	75881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237432
1563	NC_010368	CGAC	2	8	75895	75902	25 %	0 %	25 %	50 %	169237432
1564	NC_010368	ACC	2	6	75915	75920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237432
1565	NC_010368	CCG	2	6	75934	75939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237432
1566	NC_010368	CGC	2	6	75959	75964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237432
1567	NC_010368	CGG	2	6	75970	75975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237432
1568	NC_010368	CGT	2	6	75976	75981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1569	NC_010368	AGG	2	6	75994	75999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237432
1570	NC_010368	ACG	2	6	76018	76023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1571	NC_010368	CGA	2	6	76082	76087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1572	NC_010368	GCG	2	6	76092	76097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237432
1573	NC_010368	TGC	2	6	76103	76108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1574	NC_010368	AC	3	6	76130	76135	50 %	0 %	0 %	50 %	169237432
1575	NC_010368	CGA	2	6	76136	76141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1576	NC_010368	GACG	2	8	76154	76161	25 %	0 %	50 %	25 %	169237432
1577	NC_010368	CGA	2	6	76163	76168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1578	NC_010368	CAC	2	6	76169	76174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237432
1579	NC_010368	GACG	2	8	76181	76188	25 %	0 %	50 %	25 %	169237432
1580	NC_010368	GGCCA	2	10	76197	76206	20 %	0 %	40 %	40 %	169237432
1581	NC_010368	GAC	2	6	76233	76238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1582	NC_010368	GAG	2	6	76272	76277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237432
1583	NC_010368	TAC	2	6	76278	76283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237432
1584	NC_010368	CGA	2	6	76340	76345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237432
1585	NC_010368	CCGG	2	8	76367	76374	0 %	0 %	50 %	50 %	169237432
1586	NC_010368	GTCA	2	8	76452	76459	25 %	25 %	25 %	25 %	169237433
1587	NC_010368	CG	3	6	76498	76503	0 %	0 %	50 %	50 %	169237433
1588	NC_010368	GCAG	2	8	76519	76526	25 %	0 %	50 %	25 %	169237433
1589	NC_010368	CGA	2	6	76555	76560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237433
1590	NC_010368	ACCG	2	8	76598	76605	25 %	0 %	25 %	50 %	169237433
1591	NC_010368	GCG	2	6	76609	76614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237433
1592	NC_010368	CGAC	2	8	76627	76634	25 %	0 %	25 %	50 %	169237433
1593	NC_010368	CCGG	2	8	76705	76712	0 %	0 %	50 %	50 %	169237433
1594	NC_010368	ACG	2	6	76742	76747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237433
1595	NC_010368	CGT	2	6	76813	76818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237433
1596	NC_010368	AGG	2	6	76878	76883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237433
1597	NC_010368	CAA	2	6	76930	76935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237433
1598	NC_010368	GAG	2	6	76955	76960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237433
1599	NC_010368	CCGAGA	2	12	77127	77138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237433
1600	NC_010368	TCGT	2	8	77145	77152	0 %	50 %	25 %	25 %	169237433
1601	NC_010368	GGC	2	6	77164	77169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237433
1602	NC_010368	GAT	2	6	77197	77202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237433
1603	NC_010368	CGC	2	6	77245	77250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237433
1604	NC_010368	GGC	2	6	77257	77262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237433
1605	NC_010368	CGA	2	6	77281	77286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237433
1606	NC_010368	CGT	2	6	77302	77307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237433
1607	NC_010368	GT	3	6	77312	77317	0 %	50 %	50 %	0 %	169237433
1608	NC_010368	AGCGA	2	10	77346	77355	40 %	0 %	40 %	20 %	169237433
1609	NC_010368	GAG	2	6	77381	77386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237433
1610	NC_010368	GCTG	2	8	77389	77396	0 %	25 %	50 %	25 %	169237433
1611	NC_010368	TCG	2	6	77508	77513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237434
1612	NC_010368	GCT	2	6	77564	77569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237434
1613	NC_010368	CAT	2	6	77588	77593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237434
1614	NC_010368	CCG	2	6	77596	77601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237434
1615	NC_010368	CGG	2	6	77615	77620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237434
1616	NC_010368	GAGCG	2	10	77646	77655	20 %	0 %	60 %	20 %	169237434
1617	NC_010368	CAT	2	6	77675	77680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237434
1618	NC_010368	CGA	2	6	77702	77707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237434
1619	NC_010368	CGG	2	6	77708	77713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237434
1620	NC_010368	CGGCG	2	10	77748	77757	0 %	0 %	60 %	40 %	169237434
1621	NC_010368	TCA	2	6	77875	77880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237435
1622	NC_010368	TCG	2	6	77881	77886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237435
1623	NC_010368	TGG	2	6	77911	77916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237435
1624	NC_010368	GTC	4	12	77943	77954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237435
1625	NC_010368	G	6	6	77964	77969	0 %	0 %	100 %	0 %	169237435
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1997	NC_010368	GACCGC	2	12	91839	91850	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	169237449
1998	NC_010368	GC	3	6	91886	91891	0 %	0 %	50 %	50 %	169237449
1999	NC_010368	ACG	2	6	91945	91950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237449
2000	NC_010368	GAG	2	6	92028	92033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237449

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