MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 2689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010366	GAAGTC	2	12	135388	135399	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169237295
2502	NC_010366	CGT	2	6	135456	135461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237295
2503	NC_010366	CGA	2	6	135471	135476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237295
2504	NC_010366	CGA	2	6	135483	135488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237295
2505	NC_010366	GAG	2	6	135520	135525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237295
2506	NC_010366	CGG	2	6	135533	135538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237295
2507	NC_010366	GTG	2	6	135640	135645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237295
2508	NC_010366	GAT	2	6	135721	135726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237295
2509	NC_010366	GCG	2	6	135754	135759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237295
2510	NC_010366	TCC	2	6	135785	135790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237295
2511	NC_010366	CCG	2	6	135823	135828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237295
2512	NC_010366	AGA	2	6	135857	135862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237295
2513	NC_010366	CGCT	2	8	135893	135900	0 %	25 %	25 %	50 %	169237295
2514	NC_010366	CTT	2	6	136180	136185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237296
2515	NC_010366	GTCT	2	8	136243	136250	0 %	50 %	25 %	25 %	169237296
2516	NC_010366	GCG	2	6	136267	136272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237296
2517	NC_010366	GAC	2	6	136355	136360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237296
2518	NC_010366	CGT	2	6	136378	136383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237296
2519	NC_010366	CTG	2	6	136439	136444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237296
2520	NC_010366	TCGG	2	8	136445	136452	0 %	25 %	50 %	25 %	169237296
2521	NC_010366	CAG	2	6	136454	136459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237296
2522	NC_010366	AACA	2	8	136532	136539	75 %	0 %	0 %	25 %	169237296
2523	NC_010366	CG	3	6	136573	136578	0 %	0 %	50 %	50 %	169237296
2524	NC_010366	TCG	2	6	136647	136652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237296
2525	NC_010366	CGGCA	2	10	136933	136942	20 %	0 %	40 %	40 %	169237296
2526	NC_010366	CAT	2	6	137027	137032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237296
2527	NC_010366	CTG	2	6	137636	137641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237297
2528	NC_010366	CGG	2	6	137671	137676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237297
2529	NC_010366	CGT	2	6	137679	137684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237297
2530	NC_010366	CAAG	2	8	137768	137775	50 %	0 %	25 %	25 %	169237297
2531	NC_010366	ATG	2	6	137861	137866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237297
2532	NC_010366	GGA	2	6	137958	137963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237297
2533	NC_010366	TGC	2	6	138001	138006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237298
2534	NC_010366	CGCC	2	8	138017	138024	0 %	0 %	25 %	75 %	169237298
2535	NC_010366	CAG	2	6	138064	138069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237298
2536	NC_010366	GCG	2	6	138101	138106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237298
2537	NC_010366	CGCTG	2	10	138125	138134	0 %	20 %	40 %	40 %	169237298
2538	NC_010366	GAG	2	6	138159	138164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237298
2539	NC_010366	GT	3	6	138185	138190	0 %	50 %	50 %	0 %	169237298
2540	NC_010366	CCA	2	6	138216	138221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237298
2541	NC_010366	GTC	2	6	138307	138312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237298
2542	NC_010366	GC	3	6	138340	138345	0 %	0 %	50 %	50 %	169237298
2543	NC_010366	CCG	2	6	138378	138383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237298
2544	NC_010366	CTC	2	6	138396	138401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237298
2545	NC_010366	GAC	2	6	138464	138469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237298
2546	NC_010366	CT	3	6	138561	138566	0 %	50 %	0 %	50 %	169237298
2547	NC_010366	CAT	2	6	138567	138572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237298
2548	NC_010366	GCA	2	6	138575	138580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237298
2549	NC_010366	GTC	2	6	138594	138599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237298
2550	NC_010366	GAC	2	6	138660	138665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237298
2551	NC_010366	GCTC	2	8	138704	138711	0 %	25 %	25 %	50 %	169237299
2552	NC_010366	ACG	2	6	138712	138717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2553	NC_010366	CGAC	2	8	138764	138771	25 %	0 %	25 %	50 %	169237299
2554	NC_010366	GCT	2	6	138792	138797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2555	NC_010366	CCAGAC	2	12	138847	138858	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	169237299
2556	NC_010366	CGG	2	6	138866	138871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237299
2557	NC_010366	CAG	2	6	138928	138933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2558	NC_010366	CAC	2	6	138979	138984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237299
2559	NC_010366	CAG	2	6	139055	139060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2560	NC_010366	GGT	2	6	139077	139082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237299
2561	NC_010366	AGA	2	6	139092	139097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237299
2562	NC_010366	CGA	2	6	139107	139112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2563	NC_010366	TGG	2	6	139128	139133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237299
2564	NC_010366	GTG	2	6	139136	139141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237299
2565	NC_010366	AGCG	2	8	139175	139182	25 %	0 %	50 %	25 %	169237299
2566	NC_010366	GCG	2	6	139204	139209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237299
2567	NC_010366	GTC	2	6	139243	139248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2568	NC_010366	ACG	2	6	139254	139259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2569	NC_010366	TCG	2	6	139289	139294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2570	NC_010366	GAT	2	6	139315	139320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237299
2571	NC_010366	CGG	2	6	139331	139336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237299
2572	NC_010366	TGCC	2	8	139365	139372	0 %	25 %	25 %	50 %	169237299
2573	NC_010366	ACTGA	2	10	139399	139408	40 %	20 %	20 %	20 %	169237299
2574	NC_010366	CTCA	2	8	139455	139462	25 %	25 %	0 %	50 %	169237299
2575	NC_010366	GGC	2	6	139529	139534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237299
2576	NC_010366	GAGT	2	8	139584	139591	25 %	25 %	50 %	0 %	169237299
2577	NC_010366	CCGG	2	8	139627	139634	0 %	0 %	50 %	50 %	169237299
2578	NC_010366	GAC	2	6	139663	139668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2579	NC_010366	CGA	2	6	139671	139676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2580	NC_010366	GCT	2	6	139690	139695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237299
2581	NC_010366	TCC	2	6	139728	139733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237300
2582	NC_010366	CCT	2	6	139763	139768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237300
2583	NC_010366	GAT	2	6	139954	139959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237301
2584	NC_010366	ACG	2	6	140114	140119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237301
2585	NC_010366	TCG	2	6	140120	140125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237301
2586	NC_010366	CTA	2	6	140142	140147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237301
2587	NC_010366	GAT	2	6	140233	140238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237301
2588	NC_010366	GGA	2	6	140259	140264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237301
2589	NC_010366	G	6	6	140289	140294	0 %	0 %	100 %	0 %	169237301
2590	NC_010366	GGCA	2	8	140529	140536	25 %	0 %	50 %	25 %	169237302
2591	NC_010366	CGT	2	6	140550	140555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237302
2592	NC_010366	AC	3	6	140816	140821	50 %	0 %	0 %	50 %	169237303
2593	NC_010366	GT	4	8	140936	140943	0 %	50 %	50 %	0 %	169237303
2594	NC_010366	ACG	2	6	140947	140952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237303
2595	NC_010366	AGT	2	6	141054	141059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237303
2596	NC_010366	ACA	2	6	141064	141069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237303
2597	NC_010366	AGT	2	6	141076	141081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237303
2598	NC_010366	GTG	2	6	141389	141394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237304
2599	NC_010366	ACGAA	2	10	141428	141437	60 %	0 %	20 %	20 %	169237304
2600	NC_010366	TGT	2	6	141480	141485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237304
2601	NC_010366	ACTC	2	8	141518	141525	25 %	25 %	0 %	50 %	169237305
2602	NC_010366	GAC	2	6	141587	141592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237305
2603	NC_010366	TCT	2	6	141655	141660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237305
2604	NC_010366	GAG	2	6	141743	141748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237306
2605	NC_010366	GAT	2	6	141773	141778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237306
2606	NC_010366	GTG	2	6	141788	141793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237306
2607	NC_010366	CGT	2	6	141796	141801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237306
2608	NC_010366	TGA	2	6	141820	141825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237306
2609	NC_010366	AAC	3	9	141843	141851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237306
2610	NC_010366	GTTCAG	2	12	141947	141958	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169237306
2611	NC_010366	CGG	2	6	142004	142009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237306
2612	NC_010366	CGA	3	9	142048	142056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237306
2613	NC_010366	CGT	2	6	142066	142071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237306
2614	NC_010366	CGT	2	6	142075	142080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237306
2615	NC_010366	TCG	2	6	142146	142151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237306
2616	NC_010366	CGA	2	6	142255	142260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237306
2617	NC_010366	ATG	2	6	142574	142579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237307
2618	NC_010366	GCG	2	6	142697	142702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237307
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2620	NC_010366	GGA	2	6	142813	142818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237307
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.