MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 2689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010366	TCG	2	6	110050	110055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237280
2002	NC_010366	GCT	2	6	110119	110124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237280
2003	NC_010366	TC	3	6	110126	110131	0 %	50 %	0 %	50 %	169237280
2004	NC_010366	GCG	2	6	110162	110167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237280
2005	NC_010366	GGC	3	9	110232	110240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237281
2006	NC_010366	GTC	2	6	110266	110271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2007	NC_010366	TGA	2	6	110274	110279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237281
2008	NC_010366	TCT	2	6	110306	110311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237281
2009	NC_010366	AG	3	6	110368	110373	50 %	0 %	50 %	0 %	169237281
2010	NC_010366	AAT	2	6	110374	110379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237281
2011	NC_010366	TGACG	2	10	110425	110434	20 %	20 %	40 %	20 %	169237281
2012	NC_010366	GTCT	2	8	110485	110492	0 %	50 %	25 %	25 %	169237281
2013	NC_010366	GTGA	2	8	110500	110507	25 %	25 %	50 %	0 %	169237281
2014	NC_010366	GA	3	6	110529	110534	50 %	0 %	50 %	0 %	169237281
2015	NC_010366	GTT	2	6	110551	110556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237281
2016	NC_010366	GAT	2	6	110566	110571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237281
2017	NC_010366	TCT	2	6	110622	110627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237281
2018	NC_010366	CGG	2	6	110628	110633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237281
2019	NC_010366	CGA	2	6	110675	110680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2020	NC_010366	CGT	2	6	110745	110750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2021	NC_010366	TCG	3	9	110783	110791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2022	NC_010366	TTC	2	6	110803	110808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237281
2023	NC_010366	TCG	2	6	110870	110875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2024	NC_010366	GAC	2	6	110890	110895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2025	NC_010366	TCG	2	6	111029	111034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2026	NC_010366	ACG	2	6	111035	111040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2027	NC_010366	GTT	2	6	111095	111100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237281
2028	NC_010366	GCC	3	9	111127	111135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237281
2029	NC_010366	CAG	2	6	111202	111207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2030	NC_010366	TTG	2	6	111213	111218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237281
2031	NC_010366	GAC	2	6	111220	111225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2032	NC_010366	GGA	2	6	111294	111299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237281
2033	NC_010366	CGG	2	6	111311	111316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237281
2034	NC_010366	GGTC	2	8	111321	111328	0 %	25 %	50 %	25 %	169237281
2035	NC_010366	AGC	2	6	111331	111336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2036	NC_010366	CTG	2	6	111346	111351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2037	NC_010366	CAG	2	6	111375	111380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2038	NC_010366	TCA	2	6	111413	111418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237281
2039	NC_010366	TCG	2	6	111428	111433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2040	NC_010366	GT	3	6	111434	111439	0 %	50 %	50 %	0 %	169237281
2041	NC_010366	TCG	2	6	111524	111529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2042	NC_010366	CAT	2	6	111591	111596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237281
2043	NC_010366	TGA	2	6	112018	112023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237282
2044	NC_010366	CT	3	6	112025	112030	0 %	50 %	0 %	50 %	169237282
2045	NC_010366	CGA	2	6	112108	112113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237282
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2048	NC_010366	GGC	2	6	112320	112325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237282
2049	NC_010366	GCT	2	6	112343	112348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237282
2050	NC_010366	ACACC	2	10	112758	112767	40 %	0 %	0 %	60 %	169237283
2051	NC_010366	TCG	2	6	112775	112780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2052	NC_010366	GCT	2	6	112781	112786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2053	NC_010366	CGA	2	6	112794	112799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2054	NC_010366	CCG	3	9	112811	112819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2055	NC_010366	ACC	2	6	112852	112857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237283
2056	NC_010366	ACCG	2	8	112894	112901	25 %	0 %	25 %	50 %	169237283
2057	NC_010366	TCG	2	6	112910	112915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2058	NC_010366	GAC	2	6	112984	112989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2060	NC_010366	CGC	2	6	113019	113024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2061	NC_010366	GTC	2	6	113028	113033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2062	NC_010366	CGA	2	6	113040	113045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2063	NC_010366	GGC	2	6	113046	113051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2064	NC_010366	CCG	2	6	113055	113060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2065	NC_010366	GAC	2	6	113074	113079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2067	NC_010366	TCCGC	2	10	113090	113099	0 %	20 %	20 %	60 %	169237283
2068	NC_010366	CGA	2	6	113111	113116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2069	NC_010366	TCC	2	6	113119	113124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237283
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2073	NC_010366	GAC	2	6	113262	113267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2082	NC_010366	TC	3	6	113740	113745	0 %	50 %	0 %	50 %	169237283
2083	NC_010366	GC	3	6	113747	113752	0 %	0 %	50 %	50 %	169237283
2084	NC_010366	CTC	2	6	113815	113820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237283
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2089	NC_010366	GAC	3	9	114040	114048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2091	NC_010366	GCA	2	6	114065	114070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2092	NC_010366	CGA	2	6	114084	114089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2094	NC_010366	GTC	2	6	114142	114147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2096	NC_010366	CAA	2	6	114271	114276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237283
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2098	NC_010366	CCA	2	6	114294	114299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237283
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2102	NC_010366	GGAG	2	8	114465	114472	25 %	0 %	75 %	0 %	169237283
2103	NC_010366	GTCG	2	8	114474	114481	0 %	25 %	50 %	25 %	169237283
2104	NC_010366	CGA	2	6	114507	114512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2106	NC_010366	GAC	2	6	114553	114558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2109	NC_010366	GCA	2	6	114668	114673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2110	NC_010366	GGGC	2	8	114689	114696	0 %	0 %	75 %	25 %	169237283
2111	NC_010366	GC	3	6	114740	114745	0 %	0 %	50 %	50 %	169237283
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2119	NC_010366	CGGT	2	8	115024	115031	0 %	25 %	50 %	25 %	169237283
2120	NC_010366	CGC	2	6	115099	115104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2121	NC_010366	GCG	2	6	115119	115124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2122	NC_010366	GC	3	6	115229	115234	0 %	0 %	50 %	50 %	169237283
2123	NC_010366	AGG	2	6	115271	115276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237283
2124	NC_010366	GAG	2	6	115282	115287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237283
2125	NC_010366	CGGAG	2	10	115323	115332	20 %	0 %	60 %	20 %	169237283
2126	NC_010366	ACG	2	6	115333	115338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2127	NC_010366	TCG	2	6	115346	115351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
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2129	NC_010366	GGC	2	6	115470	115475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2130	NC_010366	TGA	2	6	115587	115592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237283
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2134	NC_010366	ATG	2	6	115829	115834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237283
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2144	NC_010366	CGA	2	6	116221	116226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237284
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2149	NC_010366	GATATC	2	12	116749	116760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169237285
2150	NC_010366	TAC	2	6	116829	116834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237285
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2152	NC_010366	TACC	2	8	116862	116869	25 %	25 %	0 %	50 %	169237286
2153	NC_010366	CGA	2	6	116904	116909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237286
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2210	NC_010366	CCG	2	6	119000	119005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237286
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2219	NC_010366	ACGG	2	8	119371	119378	25 %	0 %	50 %	25 %	169237286
2220	NC_010366	GTT	2	6	119380	119385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237286
2221	NC_010366	CAAA	2	8	119399	119406	75 %	0 %	0 %	25 %	169237286
2222	NC_010366	CAT	2	6	119445	119450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237286
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2224	NC_010366	CAGAA	2	10	119538	119547	60 %	0 %	20 %	20 %	169237286
2225	NC_010366	GATG	2	8	119625	119632	25 %	25 %	50 %	0 %	169237286
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2229	NC_010366	CCT	2	6	119821	119826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237286
2230	NC_010366	AAG	2	6	119839	119844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237286
2231	NC_010366	TCA	2	6	119846	119851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237286
2232	NC_010366	AGG	2	6	119856	119861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237286
2233	NC_010366	AGA	2	6	119892	119897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237286
2234	NC_010366	ACT	2	6	119915	119920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237286
2235	NC_010366	CAATA	2	10	119977	119986	60 %	20 %	0 %	20 %	169237286
2236	NC_010366	CGTT	2	8	120029	120036	0 %	50 %	25 %	25 %	169237286
2237	NC_010366	TAC	2	6	120103	120108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237286
2238	NC_010366	GAG	3	9	120176	120184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237286
2239	NC_010366	CTG	2	6	120449	120454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237286
2240	NC_010366	GCT	2	6	120525	120530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237286
2241	NC_010366	GTG	2	6	120584	120589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237286
2242	NC_010366	TGA	3	9	120633	120641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237286
2243	NC_010366	GAAT	2	8	120681	120688	50 %	25 %	25 %	0 %	169237286
2244	NC_010366	ATG	2	6	120698	120703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237286
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2249	NC_010366	TGAC	2	8	121030	121037	25 %	25 %	25 %	25 %	169237286
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2352	NC_010366	TGA	2	6	127259	127264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237291
2353	NC_010366	CGA	2	6	127280	127285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237291
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2355	NC_010366	CTT	2	6	127428	127433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237291
2356	NC_010366	AGT	2	6	127441	127446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237291
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2361	NC_010366	TTC	2	6	128187	128192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237292
2362	NC_010366	TC	3	6	128259	128264	0 %	50 %	0 %	50 %	169237292
2363	NC_010366	GCA	2	6	128344	128349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237292
2364	NC_010366	CATC	2	8	128359	128366	25 %	25 %	0 %	50 %	169237292
2365	NC_010366	CGAG	2	8	128371	128378	25 %	0 %	50 %	25 %	169237292
2366	NC_010366	AGT	2	6	128398	128403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237292
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2475	NC_010366	GTG	2	6	133622	133627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237294
2476	NC_010366	CTT	2	6	133636	133641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237294
2477	NC_010366	GC	4	8	133667	133674	0 %	0 %	50 %	50 %	169237294
2478	NC_010366	CGT	2	6	133708	133713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237294
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2480	NC_010366	CGG	2	6	133882	133887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237294
2481	NC_010366	ATCA	2	8	133921	133928	50 %	25 %	0 %	25 %	169237294
2482	NC_010366	CGC	3	9	133971	133979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237294
2483	NC_010366	GA	3	6	134003	134008	50 %	0 %	50 %	0 %	169237294
2484	NC_010366	GCG	2	6	134026	134031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237294
2485	NC_010366	CGA	2	6	134046	134051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237294
2486	NC_010366	TAG	2	6	134058	134063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237294
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2499	NC_010366	GCAA	2	8	135335	135342	50 %	0 %	25 %	25 %	169237295
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