MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 2689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010366	GCGG	2	8	82976	82983	0 %	0 %	75 %	25 %	169237244
1502	NC_010366	TCG	2	6	83005	83010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237244
1503	NC_010366	GCT	2	6	83014	83019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237244
1504	NC_010366	TCA	2	6	83115	83120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237244
1505	NC_010366	CGT	2	6	83128	83133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237244
1506	NC_010366	TGT	2	6	83142	83147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237244
1507	NC_010366	GCGG	2	8	83234	83241	0 %	0 %	75 %	25 %	169237245
1508	NC_010366	CTC	2	6	83269	83274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237245
1509	NC_010366	GCA	2	6	83405	83410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1510	NC_010366	TGCC	2	8	83494	83501	0 %	25 %	25 %	50 %	169237245
1511	NC_010366	GTC	2	6	83575	83580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1512	NC_010366	CGA	2	6	83646	83651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1513	NC_010366	GTCG	2	8	83678	83685	0 %	25 %	50 %	25 %	169237245
1514	NC_010366	GCT	2	6	83691	83696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1515	NC_010366	CGC	2	6	83744	83749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237245
1516	NC_010366	CAG	2	6	83760	83765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1517	NC_010366	CGA	3	9	83814	83822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1518	NC_010366	GCAG	2	8	83905	83912	25 %	0 %	50 %	25 %	169237245
1519	NC_010366	TCG	2	6	83924	83929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1520	NC_010366	TCG	2	6	83933	83938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1521	NC_010366	CGT	2	6	83940	83945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1522	NC_010366	GAA	2	6	83983	83988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237245
1523	NC_010366	CTG	2	6	84067	84072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1524	NC_010366	TTG	2	6	84073	84078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237245
1525	NC_010366	AGCCG	2	10	84111	84120	20 %	0 %	40 %	40 %	169237245
1526	NC_010366	GGA	2	6	84150	84155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237245
1527	NC_010366	GGT	2	6	84162	84167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237245
1528	NC_010366	TGC	2	6	84201	84206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237245
1529	NC_010366	GGT	2	6	84360	84365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237246
1530	NC_010366	TC	3	6	84387	84392	0 %	50 %	0 %	50 %	169237246
1531	NC_010366	GAA	2	6	84432	84437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237246
1532	NC_010366	CGA	2	6	84441	84446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237246
1533	NC_010366	GC	3	6	84456	84461	0 %	0 %	50 %	50 %	169237246
1534	NC_010366	GAAC	2	8	84469	84476	50 %	0 %	25 %	25 %	169237246
1535	NC_010366	TCA	2	6	84627	84632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237246
1536	NC_010366	GCT	2	6	84672	84677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237247
1537	NC_010366	CGC	2	6	84695	84700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237247
1538	NC_010366	GAT	2	6	84711	84716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237247
1539	NC_010366	CGC	2	6	84731	84736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237247
1540	NC_010366	GTT	2	6	84789	84794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237247
1541	NC_010366	CGCT	2	8	84820	84827	0 %	25 %	25 %	50 %	169237247
1542	NC_010366	CTG	2	6	84842	84847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237247
1543	NC_010366	GTC	2	6	84885	84890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237247
1544	NC_010366	CGG	2	6	85241	85246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237248
1545	NC_010366	CA	3	6	85287	85292	50 %	0 %	0 %	50 %	169237248
1546	NC_010366	GAG	2	6	85311	85316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237248
1547	NC_010366	GGT	2	6	85352	85357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237248
1548	NC_010366	ATC	2	6	85410	85415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237248
1549	NC_010366	CGG	2	6	85420	85425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237248
1550	NC_010366	TGG	2	6	85430	85435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237248
1551	NC_010366	TCGA	2	8	85453	85460	25 %	25 %	25 %	25 %	169237248
1552	NC_010366	CGA	2	6	85481	85486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237248
1553	NC_010366	GAG	2	6	85548	85553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237248
1554	NC_010366	GGC	2	6	85592	85597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237248
1555	NC_010366	TGA	2	6	85598	85603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237248
1556	NC_010366	CAAG	2	8	85611	85618	50 %	0 %	25 %	25 %	169237248
1557	NC_010366	GAT	2	6	85787	85792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237248
1558	NC_010366	CGA	2	6	85799	85804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237248
1559	NC_010366	GC	3	6	85816	85821	0 %	0 %	50 %	50 %	169237248
1560	NC_010366	GAT	2	6	86012	86017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237249
1561	NC_010366	ACC	2	6	86056	86061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237249
1562	NC_010366	CGA	3	9	86095	86103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237249
1563	NC_010366	CGT	3	9	86104	86112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237249
1564	NC_010366	CTT	2	6	86179	86184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237249
1565	NC_010366	CG	3	6	86197	86202	0 %	0 %	50 %	50 %	169237249
1566	NC_010366	CGA	2	6	86221	86226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237249
1567	NC_010366	CTC	2	6	86493	86498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237250
1568	NC_010366	TCG	2	6	86521	86526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237250
1569	NC_010366	CTG	2	6	86538	86543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237250
1570	NC_010366	GTA	2	6	86551	86556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237250
1571	NC_010366	GTC	2	6	86610	86615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237250
1572	NC_010366	ACTC	2	8	86624	86631	25 %	25 %	0 %	50 %	169237250
1573	NC_010366	GGT	2	6	86666	86671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237250
1574	NC_010366	GAGG	2	8	86694	86701	25 %	0 %	75 %	0 %	169237250
1575	NC_010366	CTG	2	6	86754	86759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237250
1576	NC_010366	CCAC	2	8	86803	86810	25 %	0 %	0 %	75 %	169237250
1577	NC_010366	GAGG	2	8	87297	87304	25 %	0 %	75 %	0 %	169237251
1578	NC_010366	TC	3	6	87330	87335	0 %	50 %	0 %	50 %	169237251
1579	NC_010366	GCA	2	6	87358	87363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237251
1580	NC_010366	TGT	2	6	87423	87428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237251
1581	NC_010366	CGGT	2	8	87440	87447	0 %	25 %	50 %	25 %	169237251
1582	NC_010366	ATCT	2	8	87469	87476	25 %	50 %	0 %	25 %	169237251
1583	NC_010366	TCT	2	6	87635	87640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237252
1584	NC_010366	GGCG	2	8	87657	87664	0 %	0 %	75 %	25 %	169237252
1585	NC_010366	TCG	2	6	87952	87957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237253
1586	NC_010366	CCG	2	6	88009	88014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237253
1587	NC_010366	CCT	2	6	88079	88084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237253
1588	NC_010366	CGT	2	6	88085	88090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237253
1589	NC_010366	GAGCGC	2	12	88107	88118	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	169237253
1590	NC_010366	GAC	2	6	88266	88271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237253
1591	NC_010366	CCG	2	6	88451	88456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237254
1592	NC_010366	TCG	2	6	88480	88485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237254
1593	NC_010366	CGT	2	6	88556	88561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237254
1594	NC_010366	TGG	2	6	88573	88578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237254
1595	NC_010366	TCG	2	6	88618	88623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237254
1596	NC_010366	TCG	2	6	88630	88635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237254
1597	NC_010366	CCT	2	6	88640	88645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237254
1598	NC_010366	CTC	2	6	88671	88676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237254
1599	NC_010366	AGC	2	6	88702	88707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237254
1600	NC_010366	CGT	2	6	88776	88781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237254
1601	NC_010366	TCC	2	6	88783	88788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237254
1602	NC_010366	GTA	2	6	88803	88808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237254
1603	NC_010366	CGA	2	6	88841	88846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237254
1604	NC_010366	TCGA	2	8	88848	88855	25 %	25 %	25 %	25 %	169237254
1605	NC_010366	CAT	2	6	88880	88885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237254
1606	NC_010366	CGCT	2	8	89031	89038	0 %	25 %	25 %	50 %	169237255
1607	NC_010366	CGT	2	6	89042	89047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237255
1608	NC_010366	CGC	2	6	89127	89132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237255
1609	NC_010366	GAA	2	6	89193	89198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237255
1610	NC_010366	GCG	2	6	89267	89272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237255
1611	NC_010366	CGG	2	6	89288	89293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237255
1612	NC_010366	TCG	2	6	89308	89313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237255
1613	NC_010366	CGCT	2	8	89315	89322	0 %	25 %	25 %	50 %	169237255
1614	NC_010366	GTC	2	6	89451	89456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237255
1615	NC_010366	GGA	2	6	89716	89721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237256
1616	NC_010366	GAT	2	6	89804	89809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237256
1617	NC_010366	CTC	2	6	89819	89824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237256
1618	NC_010366	CGT	2	6	89912	89917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237256
1619	NC_010366	GCT	2	6	89919	89924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237256
1620	NC_010366	ATCA	2	8	90249	90256	50 %	25 %	0 %	25 %	169237257
1621	NC_010366	GTTGA	2	10	90277	90286	20 %	40 %	40 %	0 %	169237257
1622	NC_010366	GAG	2	6	90359	90364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237257
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1624	NC_010366	AGCG	2	8	90587	90594	25 %	0 %	50 %	25 %	169237257
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1988	NC_010366	GATA	2	8	109514	109521	50 %	25 %	25 %	0 %	169237280
1989	NC_010366	CGT	2	6	109601	109606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237280
1990	NC_010366	GAG	2	6	109644	109649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237280
1991	NC_010366	CCACT	2	10	109650	109659	20 %	20 %	0 %	60 %	169237280
1992	NC_010366	CGT	2	6	109707	109712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237280
1993	NC_010366	GTC	2	6	109740	109745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237280
1994	NC_010366	TGTT	2	8	109774	109781	0 %	75 %	25 %	0 %	169237280
1995	NC_010366	TGG	2	6	109807	109812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237280
1996	NC_010366	CAG	2	6	109847	109852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237280
1997	NC_010366	CCAG	2	8	109862	109869	25 %	0 %	25 %	50 %	169237280
1998	NC_010366	CTG	2	6	109935	109940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237280
1999	NC_010366	TC	3	6	109946	109951	0 %	50 %	0 %	50 %	169237280
2000	NC_010366	GCG	2	6	109963	109968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237280

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