MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 2689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010366	TGA	2	6	53028	53033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237214
1002	NC_010366	CGG	2	6	53070	53075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237214
1003	NC_010366	GCA	2	6	53159	53164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237214
1004	NC_010366	AGT	2	6	53209	53214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237214
1005	NC_010366	TGGA	2	8	53222	53229	25 %	25 %	50 %	0 %	169237214
1006	NC_010366	ACC	2	6	53260	53265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237214
1007	NC_010366	TGCGCC	2	12	53266	53277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	169237214
1008	NC_010366	GAT	2	6	53508	53513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237215
1009	NC_010366	ACCG	2	8	53532	53539	25 %	0 %	25 %	50 %	169237215
1010	NC_010366	AGC	2	6	53544	53549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237215
1011	NC_010366	TCC	2	6	53585	53590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237215
1012	NC_010366	CTG	2	6	53683	53688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1013	NC_010366	CTT	2	6	53697	53702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237216
1014	NC_010366	CGGGTT	2	12	53706	53717	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	169237216
1015	NC_010366	CTT	2	6	53739	53744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237216
1016	NC_010366	ACT	2	6	53778	53783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237216
1017	NC_010366	GC	3	6	53855	53860	0 %	0 %	50 %	50 %	169237216
1018	NC_010366	TCA	2	6	53903	53908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237216
1019	NC_010366	GTC	2	6	53950	53955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1020	NC_010366	TCA	2	6	53990	53995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237216
1021	NC_010366	CTG	2	6	54013	54018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1022	NC_010366	CAC	2	6	54063	54068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237216
1023	NC_010366	TCC	2	6	54111	54116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237216
1024	NC_010366	CAT	2	6	54156	54161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237216
1025	NC_010366	GTC	2	6	54178	54183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1026	NC_010366	TCGGCG	2	12	54203	54214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	169237216
1027	NC_010366	GAT	2	6	54237	54242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237216
1028	NC_010366	GCCATC	2	12	54265	54276	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169237216
1029	NC_010366	TCC	2	6	54287	54292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237216
1030	NC_010366	TCG	2	6	54344	54349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1031	NC_010366	GCT	2	6	54369	54374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1032	NC_010366	GC	3	6	54383	54388	0 %	0 %	50 %	50 %	169237216
1033	NC_010366	GC	4	8	54392	54399	0 %	0 %	50 %	50 %	169237216
1034	NC_010366	TCG	2	6	54422	54427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1035	NC_010366	GAC	2	6	54433	54438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1036	NC_010366	CGA	2	6	54455	54460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1037	NC_010366	CGTCGC	2	12	54477	54488	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	169237216
1038	NC_010366	CGT	3	9	54564	54572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1039	NC_010366	GTG	2	6	54575	54580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237216
1040	NC_010366	CGA	2	6	54612	54617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237216
1041	NC_010366	AAC	2	6	54786	54791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237217
1042	NC_010366	GCT	2	6	54817	54822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237217
1043	NC_010366	TCG	2	6	54873	54878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237217
1044	NC_010366	CGA	2	6	54901	54906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237217
1045	NC_010366	CCT	2	6	54961	54966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237217
1046	NC_010366	CTA	2	6	55015	55020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237217
1047	NC_010366	CAGA	2	8	55413	55420	50 %	0 %	25 %	25 %	169237218
1048	NC_010366	CGA	2	6	55424	55429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237218
1049	NC_010366	ACG	2	6	55444	55449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237218
1050	NC_010366	CGT	2	6	55505	55510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237218
1051	NC_010366	TCGACG	2	12	55552	55563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169237218
1052	NC_010366	GCG	2	6	55597	55602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237218
1053	NC_010366	GTC	2	6	55647	55652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237218
1054	NC_010366	CGA	2	6	55814	55819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237219
1055	NC_010366	GGC	2	6	55824	55829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237219
1056	NC_010366	GAC	2	6	55841	55846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237219
1057	NC_010366	CGG	2	6	55883	55888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237219
1058	NC_010366	TCG	2	6	56035	56040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237219
1059	NC_010366	GC	4	8	56053	56060	0 %	0 %	50 %	50 %	169237219
1060	NC_010366	CGA	2	6	56144	56149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237219
1061	NC_010366	TCG	3	9	56155	56163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237219
1062	NC_010366	GCG	3	9	56164	56172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237219
1063	NC_010366	GGA	2	6	56183	56188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237219
1064	NC_010366	GTT	2	6	56192	56197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237219
1065	NC_010366	GTC	2	6	56226	56231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237219
1066	NC_010366	GAG	2	6	56241	56246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237219
1067	NC_010366	TGCG	2	8	56248	56255	0 %	25 %	50 %	25 %	169237219
1068	NC_010366	ACG	3	9	56287	56295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237219
1069	NC_010366	AGG	2	6	57054	57059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237220
1070	NC_010366	CCT	2	6	57093	57098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237220
1071	NC_010366	CGG	2	6	57108	57113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237220
1072	NC_010366	GCCG	2	8	57147	57154	0 %	0 %	50 %	50 %	169237220
1073	NC_010366	AAT	2	6	57168	57173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237220
1074	NC_010366	GTC	2	6	57236	57241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1075	NC_010366	GGC	2	6	57248	57253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237220
1076	NC_010366	GCA	2	6	57270	57275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1077	NC_010366	TCG	2	6	57278	57283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1078	NC_010366	TCGCGT	2	12	57329	57340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1079	NC_010366	GCT	2	6	57342	57347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1080	NC_010366	CGG	2	6	57402	57407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237220
1081	NC_010366	CGA	2	6	57414	57419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1082	NC_010366	GC	3	6	57430	57435	0 %	0 %	50 %	50 %	169237220
1083	NC_010366	TCA	2	6	57501	57506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237220
1084	NC_010366	CGCC	2	8	57507	57514	0 %	0 %	25 %	75 %	169237220
1085	NC_010366	CGTC	2	8	57525	57532	0 %	25 %	25 %	50 %	169237220
1086	NC_010366	GCG	2	6	57547	57552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237220
1087	NC_010366	CG	3	6	57634	57639	0 %	0 %	50 %	50 %	169237220
1088	NC_010366	GCG	2	6	57641	57646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237220
1089	NC_010366	GCT	2	6	57649	57654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1090	NC_010366	GCA	2	6	57668	57673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1091	NC_010366	GC	3	6	57677	57682	0 %	0 %	50 %	50 %	169237220
1092	NC_010366	TCG	2	6	57683	57688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1093	NC_010366	CGT	2	6	57741	57746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
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1095	NC_010366	CGG	2	6	57771	57776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237220
1096	NC_010366	GTC	2	6	57779	57784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1097	NC_010366	CCA	2	6	57820	57825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237220
1098	NC_010366	GC	4	8	57836	57843	0 %	0 %	50 %	50 %	169237220
1099	NC_010366	TCT	2	6	57884	57889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237220
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1102	NC_010366	TTG	2	6	57983	57988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237220
1103	NC_010366	GTC	2	6	58042	58047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1104	NC_010366	GAG	2	6	58048	58053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237220
1105	NC_010366	CGT	2	6	58083	58088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237220
1106	NC_010366	GTG	2	6	58194	58199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237221
1107	NC_010366	TCG	2	6	58230	58235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237221
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1109	NC_010366	CGA	2	6	58249	58254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237221
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1112	NC_010366	CGCT	2	8	58322	58329	0 %	25 %	25 %	50 %	169237221
1113	NC_010366	CTGG	2	8	58828	58835	0 %	25 %	50 %	25 %	169237222
1114	NC_010366	TGTC	2	8	58867	58874	0 %	50 %	25 %	25 %	169237222
1115	NC_010366	TC	3	6	58902	58907	0 %	50 %	0 %	50 %	169237222
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1118	NC_010366	ACT	2	6	59138	59143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237222
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1120	NC_010366	TC	3	6	59454	59459	0 %	50 %	0 %	50 %	169237223
1121	NC_010366	ACT	2	6	59693	59698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237224
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1123	NC_010366	CG	3	6	59726	59731	0 %	0 %	50 %	50 %	169237224
1124	NC_010366	CTG	2	6	59757	59762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237224
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1242	NC_010366	GCTC	2	8	66832	66839	0 %	25 %	25 %	50 %	169237231
1243	NC_010366	AGC	2	6	66852	66857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237231
1244	NC_010366	CGA	2	6	66880	66885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237231
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1493	NC_010366	CCT	2	6	82444	82449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237243
1494	NC_010366	TCG	2	6	82498	82503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237243
1495	NC_010366	TGA	2	6	82522	82527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237243
1496	NC_010366	CTC	2	6	82589	82594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237243
1497	NC_010366	CGA	2	6	82621	82626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237243
1498	NC_010366	TCG	2	6	82629	82634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237243
1499	NC_010366	GCT	2	6	82818	82823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237244
1500	NC_010366	ACC	2	6	82969	82974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237244

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