MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Heliobacterium modesticaldum Ice1 chromosome

Total Repeats: 57271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010337	TCG	2	6	32087	32092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628178
502	NC_010337	GTTCCT	2	12	32124	32135	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167628178
503	NC_010337	CCT	2	6	32156	32161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628179
504	NC_010337	GGGT	2	8	32204	32211	0 %	25 %	75 %	0 %	167628179
505	NC_010337	TG	3	6	32238	32243	0 %	50 %	50 %	0 %	167628179
506	NC_010337	TG	3	6	32529	32534	0 %	50 %	50 %	0 %	167628180
507	NC_010337	CGA	2	6	32629	32634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628180
508	NC_010337	TTA	2	6	32682	32687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628180
509	NC_010337	AT	3	6	32931	32936	50 %	50 %	0 %	0 %	167628181
510	NC_010337	A	6	6	32938	32943	100 %	0 %	0 %	0 %	167628181
511	NC_010337	GGT	2	6	33086	33091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628181
512	NC_010337	GCG	2	6	33194	33199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628181
513	NC_010337	GGA	2	6	33209	33214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628181
514	NC_010337	GGA	2	6	33274	33279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628181
515	NC_010337	GCT	2	6	33410	33415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628181
516	NC_010337	ATT	2	6	33519	33524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628181
517	NC_010337	CCT	2	6	33525	33530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628181
518	NC_010337	GCT	2	6	33647	33652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628181
519	NC_010337	TCG	3	9	33833	33841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628182
520	NC_010337	GCA	2	6	33997	34002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628182
521	NC_010337	TTC	2	6	34035	34040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628182
522	NC_010337	CTG	2	6	34335	34340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628183
523	NC_010337	A	6	6	34358	34363	100 %	0 %	0 %	0 %	167628183
524	NC_010337	CTG	2	6	34404	34409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628183
525	NC_010337	A	6	6	34472	34477	100 %	0 %	0 %	0 %	167628183
526	NC_010337	GGCC	2	8	34511	34518	0 %	0 %	50 %	50 %	167628183
527	NC_010337	CGG	2	6	34534	34539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628183
528	NC_010337	CGA	2	6	34554	34559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628183
529	NC_010337	GAA	2	6	34562	34567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628183
530	NC_010337	A	6	6	34566	34571	100 %	0 %	0 %	0 %	167628183
531	NC_010337	ACA	2	6	34667	34672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167628184
532	NC_010337	GCC	2	6	34684	34689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628184
533	NC_010337	TTA	2	6	34697	34702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628184
534	NC_010337	GTG	2	6	34721	34726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628184
535	NC_010337	TGA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628184
536	NC_010337	A	6	6	34994	34999	100 %	0 %	0 %	0 %	167628184
537	NC_010337	GGT	2	6	35127	35132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628184
538	NC_010337	TGA	2	6	35134	35139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628184
539	NC_010337	CCCT	2	8	36592	36599	0 %	25 %	0 %	75 %	167628185
540	NC_010337	TCG	2	6	36644	36649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628185
541	NC_010337	GTC	2	6	36655	36660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628185
542	NC_010337	ATG	2	6	36686	36691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628185
543	NC_010337	ACG	2	6	36695	36700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628185
544	NC_010337	CCG	2	6	36845	36850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628185
545	NC_010337	CAG	2	6	36871	36876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628185
546	NC_010337	CCA	2	6	36889	36894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628185
547	NC_010337	GC	3	6	36911	36916	0 %	0 %	50 %	50 %	167628185
548	NC_010337	ATG	2	6	36935	36940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628185
549	NC_010337	ATG	2	6	36986	36991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628185
550	NC_010337	CATG	2	8	36998	37005	25 %	25 %	25 %	25 %	167628185
551	NC_010337	GCC	2	6	37021	37026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628185
552	NC_010337	TTGC	2	8	37082	37089	0 %	50 %	25 %	25 %	167628185
553	NC_010337	ACC	2	6	37110	37115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628185
554	NC_010337	T	6	6	37155	37160	0 %	100 %	0 %	0 %	167628185
555	NC_010337	GCT	2	6	37180	37185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628185
556	NC_010337	TTG	2	6	37238	37243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628185
557	NC_010337	GAA	2	6	37336	37341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628185
558	NC_010337	CCG	2	6	37347	37352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628185
559	NC_010337	TGT	2	6	37353	37358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628185
560	NC_010337	TCC	2	6	37594	37599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628185
561	NC_010337	GCC	2	6	37672	37677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628185
562	NC_010337	CCAA	2	8	37724	37731	50 %	0 %	0 %	50 %	167628185
563	NC_010337	GCTCCA	2	12	37739	37750	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167628185
564	NC_010337	CAA	2	6	37824	37829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167628185
565	NC_010337	CCGCT	2	10	37830	37839	0 %	20 %	20 %	60 %	167628185
566	NC_010337	AAG	2	6	37852	37857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628185
567	NC_010337	CAT	2	6	37920	37925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628185
568	NC_010337	CGC	2	6	37926	37931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628185
569	NC_010337	ACA	2	6	38033	38038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167628185
570	NC_010337	TC	3	6	38045	38050	0 %	50 %	0 %	50 %	167628185
571	NC_010337	GTC	2	6	38095	38100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628185
572	NC_010337	CGC	2	6	38110	38115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628185
573	NC_010337	CTT	2	6	38211	38216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628185
574	NC_010337	T	6	6	38215	38220	0 %	100 %	0 %	0 %	167628185
575	NC_010337	GCC	2	6	38327	38332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628185
576	NC_010337	GTT	2	6	38366	38371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628185
577	NC_010337	CAT	2	6	38388	38393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628185
578	NC_010337	CAG	2	6	38394	38399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628185
579	NC_010337	CTG	2	6	38433	38438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628185
580	NC_010337	TCC	2	6	38521	38526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628185
581	NC_010337	GCC	2	6	38575	38580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628185
582	NC_010337	CAA	2	6	38688	38693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167628185
583	NC_010337	CCGC	2	8	38714	38721	0 %	0 %	25 %	75 %	167628185
584	NC_010337	CTA	2	6	38868	38873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628185
585	NC_010337	CTT	2	6	38914	38919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628185
586	NC_010337	ATG	2	6	38954	38959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628185
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588	NC_010337	TCT	2	6	39075	39080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628185
589	NC_010337	GGC	2	6	39124	39129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628185
590	NC_010337	CTC	2	6	39223	39228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628185
591	NC_010337	CGG	2	6	39384	39389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628185
592	NC_010337	TAAC	2	8	39438	39445	50 %	25 %	0 %	25 %	167628185
593	NC_010337	T	6	6	39499	39504	0 %	100 %	0 %	0 %	167628185
594	NC_010337	CAG	2	6	39549	39554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628185
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596	NC_010337	TCC	2	6	39660	39665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628185
597	NC_010337	TGC	2	6	39672	39677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628185
598	NC_010337	TGT	2	6	39843	39848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628185
599	NC_010337	TC	3	6	39882	39887	0 %	50 %	0 %	50 %	167628185
600	NC_010337	TC	3	6	39995	40000	0 %	50 %	0 %	50 %	167628186
601	NC_010337	T	7	7	40007	40013	0 %	100 %	0 %	0 %	167628186
602	NC_010337	TCG	2	6	40023	40028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628186
603	NC_010337	TTGGGT	2	12	40105	40116	0 %	50 %	50 %	0 %	167628186
604	NC_010337	CGC	2	6	40148	40153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628186
605	NC_010337	CT	3	6	40154	40159	0 %	50 %	0 %	50 %	167628186
606	NC_010337	TCC	2	6	40167	40172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628186
607	NC_010337	GCC	2	6	40224	40229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628186
608	NC_010337	GTT	2	6	40337	40342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628186
609	NC_010337	ATA	2	6	40356	40361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167628186
610	NC_010337	AAT	2	6	40389	40394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167628186
611	NC_010337	GCT	2	6	40406	40411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628186
612	NC_010337	GTATC	2	10	40482	40491	20 %	40 %	20 %	20 %	167628186
613	NC_010337	GAT	2	6	40496	40501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628186
614	NC_010337	CGG	2	6	40590	40595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628186
615	NC_010337	CAG	2	6	40619	40624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628186
616	NC_010337	GTC	2	6	40646	40651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628186
617	NC_010337	TTCC	2	8	40669	40676	0 %	50 %	0 %	50 %	167628186
618	NC_010337	AGCC	2	8	40696	40703	25 %	0 %	25 %	50 %	167628186
619	NC_010337	GCG	2	6	40742	40747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628186
620	NC_010337	GGA	2	6	40777	40782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628186
621	NC_010337	AGC	3	9	40827	40835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628186
622	NC_010337	GCG	2	6	40870	40875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628186
623	NC_010337	ATC	2	6	40907	40912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628186
624	NC_010337	AG	3	6	40927	40932	50 %	0 %	50 %	0 %	167628186
625	NC_010337	TACT	2	8	40983	40990	25 %	50 %	0 %	25 %	167628186
626	NC_010337	CCAA	2	8	41051	41058	50 %	0 %	0 %	50 %	167628186
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