MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 1606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009974	T	6	6	100	105	0 %	100 %	0 %	0 %	159901743
2	NC_009974	GGTCGT	2	12	128	139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159901743
3	NC_009974	CG	3	6	140	145	0 %	0 %	50 %	50 %	159901743
4	NC_009974	TCT	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901743
5	NC_009974	CGCAA	2	10	204	213	40 %	0 %	20 %	40 %	159901743
6	NC_009974	CCA	2	6	234	239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
7	NC_009974	CGT	2	6	251	256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901743
8	NC_009974	CGC	2	6	270	275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
9	NC_009974	CCG	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
10	NC_009974	TCT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901743
11	NC_009974	GGC	2	6	394	399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
12	NC_009974	GAC	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901743
13	NC_009974	CAC	2	6	473	478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
14	NC_009974	CAC	2	6	518	523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
15	NC_009974	TGATC	2	10	526	535	20 %	40 %	20 %	20 %	159901743
16	NC_009974	GGC	2	6	614	619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
17	NC_009974	CGG	2	6	637	642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
18	NC_009974	GAG	2	6	660	665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901743
19	NC_009974	TCA	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901743
20	NC_009974	GCCAAG	2	12	720	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901743
21	NC_009974	CCCAC	2	10	770	779	20 %	0 %	0 %	80 %	159901743
22	NC_009974	CCG	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
23	NC_009974	CAA	2	6	836	841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901743
24	NC_009974	GGCGG	2	10	878	887	0 %	0 %	80 %	20 %	159901743
25	NC_009974	GCG	2	6	932	937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
26	NC_009974	CGT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
27	NC_009974	TCC	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
28	NC_009974	CGG	2	6	1091	1096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
29	NC_009974	GTC	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
30	NC_009974	GTG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
31	NC_009974	CAT	2	6	1113	1118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
32	NC_009974	TCC	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
33	NC_009974	CGG	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
34	NC_009974	CAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
35	NC_009974	CCT	3	9	1358	1366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
36	NC_009974	TTGC	2	8	1395	1402	0 %	50 %	25 %	25 %	159901744
37	NC_009974	TCG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
38	NC_009974	TCA	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
39	NC_009974	TTC	2	6	1458	1463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
40	NC_009974	CAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901744
41	NC_009974	TCG	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
42	NC_009974	GCG	2	6	1653	1658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
43	NC_009974	AGT	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901744
44	NC_009974	TCC	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
45	NC_009974	GGC	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
46	NC_009974	GCCA	2	8	1787	1794	25 %	0 %	25 %	50 %	159901744
47	NC_009974	CCG	2	6	1797	1802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
48	NC_009974	CGCTG	2	10	1860	1869	0 %	20 %	40 %	40 %	159901744
49	NC_009974	GTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901744
50	NC_009974	TTC	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
51	NC_009974	TTC	2	6	1950	1955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
52	NC_009974	CTT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
53	NC_009974	CATCA	2	10	2154	2163	40 %	20 %	0 %	40 %	159901744
54	NC_009974	TGA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901744
55	NC_009974	AGC	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901744
56	NC_009974	AT	3	6	2332	2337	50 %	50 %	0 %	0 %	159901744
57	NC_009974	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901744
58	NC_009974	CGC	2	6	2445	2450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
59	NC_009974	CGT	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
60	NC_009974	TTG	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901744
61	NC_009974	CCA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901744
62	NC_009974	TGG	2	6	2779	2784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
63	NC_009974	CAC	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901744
64	NC_009974	CAT	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
65	NC_009974	CGC	2	6	2879	2884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
66	NC_009974	GCT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
67	NC_009974	GGT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
68	NC_009974	CCAT	2	8	3094	3101	25 %	25 %	0 %	50 %	159901745
69	NC_009974	CTG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
70	NC_009974	TGA	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901745
71	NC_009974	GGGCA	2	10	3215	3224	20 %	0 %	60 %	20 %	159901745
72	NC_009974	CCAC	3	12	3244	3255	25 %	0 %	0 %	75 %	159901745
73	NC_009974	TCA	3	9	3297	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901745
74	NC_009974	GCT	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
75	NC_009974	GAC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901745
76	NC_009974	TGGT	2	8	3485	3492	0 %	50 %	50 %	0 %	159901745
77	NC_009974	CCG	2	6	3517	3522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901745
78	NC_009974	ATG	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901745
79	NC_009974	CAC	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901745
80	NC_009974	GCT	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
81	NC_009974	AGC	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901746
82	NC_009974	GTCG	2	8	3832	3839	0 %	25 %	50 %	25 %	159901746
83	NC_009974	CAG	2	6	3943	3948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901746
84	NC_009974	TTGCG	2	10	4114	4123	0 %	40 %	40 %	20 %	159901746
85	NC_009974	CAA	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901746
86	NC_009974	TGGGGG	2	12	4339	4350	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	159901746
87	NC_009974	CGAA	2	8	4418	4425	50 %	0 %	25 %	25 %	159901747
88	NC_009974	GCG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901747
89	NC_009974	CCAT	2	8	4462	4469	25 %	25 %	0 %	50 %	159901747
90	NC_009974	TGG	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901747
91	NC_009974	GCA	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901747
92	NC_009974	CG	3	6	4579	4584	0 %	0 %	50 %	50 %	159901747
93	NC_009974	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
94	NC_009974	ACC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
95	NC_009974	CCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
96	NC_009974	GCC	2	6	4805	4810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
97	NC_009974	CCA	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
98	NC_009974	CGGCG	2	10	4841	4850	0 %	0 %	60 %	40 %	159901747
99	NC_009974	GCGT	2	8	4867	4874	0 %	25 %	50 %	25 %	159901747
100	NC_009974	CCA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
101	NC_009974	AAC	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901748
102	NC_009974	AATG	2	8	5131	5138	50 %	25 %	25 %	0 %	159901748
103	NC_009974	AAC	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901748
104	NC_009974	CGC	3	9	5197	5205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901748
105	NC_009974	ACT	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901748
106	NC_009974	GGT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901748
107	NC_009974	GCCC	2	8	5386	5393	0 %	0 %	25 %	75 %	159901748
108	NC_009974	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901748
109	NC_009974	CGC	2	6	5443	5448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901748
110	NC_009974	TGC	3	9	5514	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901748
111	NC_009974	ACC	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901748
112	NC_009974	ACC	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
113	NC_009974	CACC	2	8	5854	5861	25 %	0 %	0 %	75 %	159901749
114	NC_009974	CAT	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
115	NC_009974	ATC	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
116	NC_009974	ATC	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
117	NC_009974	CCA	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
118	NC_009974	GGT	2	6	5987	5992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901749
119	NC_009974	CAC	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
120	NC_009974	ACC	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
121	NC_009974	CTT	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901750
122	NC_009974	TGG	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901750
123	NC_009974	GCC	2	6	6490	6495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901750
124	NC_009974	CGG	2	6	6508	6513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901750
125	NC_009974	TGT	2	6	6514	6519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901750
126	NC_009974	GTC	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901750
127	NC_009974	ACC	2	6	6557	6562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901750
128	NC_009974	TCG	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901750
129	NC_009974	T	6	6	6644	6649	0 %	100 %	0 %	0 %	159901750
130	NC_009974	CCA	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901750
131	NC_009974	CA	3	6	6689	6694	50 %	0 %	0 %	50 %	159901750
132	NC_009974	TCG	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901750
133	NC_009974	GTT	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901750
134	NC_009974	CCA	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901750
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248	NC_009974	CTCA	2	8	13814	13821	25 %	25 %	0 %	50 %	159901754
249	NC_009974	GCGG	2	8	13893	13900	0 %	0 %	75 %	25 %	159901755
250	NC_009974	GGTC	2	8	13991	13998	0 %	25 %	50 %	25 %	159901755
251	NC_009974	GTCA	2	8	14031	14038	25 %	25 %	25 %	25 %	159901755
252	NC_009974	TCG	2	6	14065	14070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901755
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256	NC_009974	GTTG	2	8	14224	14231	0 %	50 %	50 %	0 %	159901755
257	NC_009974	CAC	2	6	14288	14293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901755
258	NC_009974	TGCCG	2	10	14316	14325	0 %	20 %	40 %	40 %	159901755
259	NC_009974	GCCGTG	2	12	14344	14355	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159901755
260	NC_009974	CGTT	2	8	14404	14411	0 %	50 %	25 %	25 %	159901755
261	NC_009974	CAG	2	6	14445	14450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901755
262	NC_009974	CA	3	6	14481	14486	50 %	0 %	0 %	50 %	159901755
263	NC_009974	TGC	2	6	14498	14503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901755
264	NC_009974	TCG	2	6	14509	14514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901755
265	NC_009974	CGT	3	9	14522	14530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901755
266	NC_009974	CTG	2	6	14594	14599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901755
267	NC_009974	GTG	2	6	14605	14610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901755
268	NC_009974	GCCC	2	8	14627	14634	0 %	0 %	25 %	75 %	159901755
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270	NC_009974	GGGTG	2	10	14811	14820	0 %	20 %	80 %	0 %	159901755
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285	NC_009974	GCG	2	6	15656	15661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901755
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382	NC_009974	GATT	2	8	19980	19987	25 %	50 %	25 %	0 %	159901759
383	NC_009974	CGG	2	6	20110	20115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901759
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387	NC_009974	GCTC	2	8	20276	20283	0 %	25 %	25 %	50 %	159901759
388	NC_009974	GCC	2	6	20341	20346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901760
389	NC_009974	TCCA	2	8	20381	20388	25 %	25 %	0 %	50 %	159901760
390	NC_009974	GCGG	2	8	20434	20441	0 %	0 %	75 %	25 %	159901760
391	NC_009974	GCG	2	6	20446	20451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901760
392	NC_009974	GTG	2	6	20483	20488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901760
393	NC_009974	TCA	2	6	20496	20501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901760
394	NC_009974	ACTGGG	2	12	20650	20661	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159901760
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397	NC_009974	GTGG	2	8	20725	20732	0 %	25 %	75 %	0 %	159901760
398	NC_009974	CG	3	6	20769	20774	0 %	0 %	50 %	50 %	159901760
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