MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 5559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009973	ATT	2	6	243701	243706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901676
4002	NC_009973	TCA	2	6	243716	243721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
4003	NC_009973	CGTG	2	8	243798	243805	0 %	25 %	50 %	25 %	159901676
4004	NC_009973	TCG	2	6	243920	243925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901676
4005	NC_009973	GTG	2	6	244090	244095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901676
4006	NC_009973	CCG	2	6	244108	244113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901676
4007	NC_009973	ATC	2	6	244135	244140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
4008	NC_009973	CAGC	2	8	244176	244183	25 %	0 %	25 %	50 %	159901676
4009	NC_009973	TGC	2	6	244187	244192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901676
4010	NC_009973	TGC	2	6	244225	244230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901676
4011	NC_009973	CAG	2	6	244246	244251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901676
4012	NC_009973	ATGCA	2	10	244255	244264	40 %	20 %	20 %	20 %	159901676
4013	NC_009973	AAC	2	6	244562	244567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901676
4014	NC_009973	CAT	2	6	244584	244589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
4015	NC_009973	CAATA	2	10	244683	244692	60 %	20 %	0 %	20 %	159901676
4016	NC_009973	CACGAT	2	12	244744	244755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159901676
4017	NC_009973	TGG	3	9	244759	244767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901676
4018	NC_009973	GCG	2	6	244770	244775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901676
4019	NC_009973	CG	3	6	244791	244796	0 %	0 %	50 %	50 %	159901676
4020	NC_009973	AGAT	2	8	244835	244842	50 %	25 %	25 %	0 %	159901676
4021	NC_009973	GA	3	6	244865	244870	50 %	0 %	50 %	0 %	159901676
4022	NC_009973	A	6	6	244885	244890	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
4023	NC_009973	TAA	2	6	244900	244905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901676
4024	NC_009973	GA	3	6	244937	244942	50 %	0 %	50 %	0 %	159901676
4025	NC_009973	AAC	2	6	244979	244984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901676
4026	NC_009973	C	6	6	245117	245122	0 %	0 %	0 %	100 %	159901676
4027	NC_009973	CGAC	2	8	245174	245181	25 %	0 %	25 %	50 %	159901676
4028	NC_009973	CCA	2	6	245300	245305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901676
4029	NC_009973	GCT	2	6	245316	245321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901676
4030	NC_009973	GGTA	2	8	245421	245428	25 %	25 %	50 %	0 %	159901676
4031	NC_009973	GCG	2	6	245488	245493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901676
4032	NC_009973	CAG	2	6	245555	245560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901676
4033	NC_009973	CAC	3	9	245569	245577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901676
4034	NC_009973	ACC	2	6	245625	245630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901676
4035	NC_009973	ATC	2	6	245653	245658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
4036	NC_009973	AAAT	2	8	245744	245751	75 %	25 %	0 %	0 %	159901676
4037	NC_009973	CAGG	2	8	245858	245865	25 %	0 %	50 %	25 %	159901676
4038	NC_009973	CAT	2	6	245895	245900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
4039	NC_009973	GCTG	2	8	246027	246034	0 %	25 %	50 %	25 %	159901677
4040	NC_009973	TAG	2	6	246040	246045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901677
4041	NC_009973	CTG	2	6	246071	246076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901677
4042	NC_009973	GCG	2	6	246090	246095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901677
4043	NC_009973	TCCA	2	8	246110	246117	25 %	25 %	0 %	50 %	159901677
4044	NC_009973	GGA	2	6	246151	246156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901677
4045	NC_009973	GGT	2	6	246212	246217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901677
4046	NC_009973	TCA	2	6	246291	246296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901677
4047	NC_009973	CCG	2	6	246326	246331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901677
4048	NC_009973	ATG	2	6	246420	246425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901677
4049	NC_009973	TCG	2	6	246433	246438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901677
4050	NC_009973	TGC	2	6	246510	246515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901678
4051	NC_009973	GTG	2	6	246522	246527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901678
4052	NC_009973	ATGG	2	8	246529	246536	25 %	25 %	50 %	0 %	159901678
4053	NC_009973	GGT	2	6	246634	246639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901678
4054	NC_009973	GGTATA	2	12	246694	246705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901678
4055	NC_009973	CGT	2	6	246712	246717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901678
4056	NC_009973	GAT	2	6	246728	246733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901678
4057	NC_009973	GGT	2	6	246775	246780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901678
4058	NC_009973	GCC	2	6	246812	246817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901678
4059	NC_009973	ACC	2	6	246847	246852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901678
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4061	NC_009973	T	7	7	247074	247080	0 %	100 %	0 %	0 %	159901678
4062	NC_009973	TGGA	2	8	247083	247090	25 %	25 %	50 %	0 %	159901678
4063	NC_009973	CCTG	2	8	247094	247101	0 %	25 %	25 %	50 %	159901678
4064	NC_009973	ACC	2	6	247130	247135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901678
4065	NC_009973	CCCAG	2	10	247149	247158	20 %	0 %	20 %	60 %	159901678
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4111	NC_009973	ATC	2	6	250248	250253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901680
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4117	NC_009973	TAGA	2	8	250750	250757	50 %	25 %	25 %	0 %	159901680
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4121	NC_009973	TA	3	6	250967	250972	50 %	50 %	0 %	0 %	159901680
4122	NC_009973	AGA	2	6	250974	250979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901680
4123	NC_009973	AGA	2	6	250988	250993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901680
4124	NC_009973	TGC	2	6	251034	251039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901680
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4225	NC_009973	TCGCC	2	10	256719	256728	0 %	20 %	20 %	60 %	159901684
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4234	NC_009973	CAG	2	6	259227	259232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901685
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4236	NC_009973	GCGG	2	8	259338	259345	0 %	0 %	75 %	25 %	159901685
4237	NC_009973	CAG	2	6	259383	259388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901685
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4240	NC_009973	CAT	2	6	259459	259464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901685
4241	NC_009973	TGA	2	6	259771	259776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901686
4242	NC_009973	CAT	2	6	259948	259953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901686
4243	NC_009973	CCTCAC	2	12	260068	260079	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	159901686
4244	NC_009973	ACC	2	6	260133	260138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901686
4245	NC_009973	CACGG	2	10	260354	260363	20 %	0 %	40 %	40 %	159901687
4246	NC_009973	GTC	2	6	260402	260407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901687
4247	NC_009973	CTG	2	6	260473	260478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901687
4248	NC_009973	GCT	2	6	260486	260491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901687
4249	NC_009973	CG	3	6	260536	260541	0 %	0 %	50 %	50 %	159901687
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4255	NC_009973	GGTG	2	8	260990	260997	0 %	25 %	75 %	0 %	159901688
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4257	NC_009973	GGC	2	6	261190	261195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901689
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4262	NC_009973	TTC	2	6	261622	261627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901690
4263	NC_009973	CGG	2	6	261708	261713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901690
4264	NC_009973	GAG	2	6	261736	261741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901690
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4267	NC_009973	CGTT	2	8	261967	261974	0 %	50 %	25 %	25 %	159901690
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4272	NC_009973	CTG	2	6	262439	262444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901691
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4278	NC_009973	AATT	2	8	262577	262584	50 %	50 %	0 %	0 %	159901691
4279	NC_009973	CA	3	6	262598	262603	50 %	0 %	0 %	50 %	159901691
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4332	NC_009973	ACCAT	2	10	266323	266332	40 %	20 %	0 %	40 %	159901693
4333	NC_009973	GT	3	6	266402	266407	0 %	50 %	50 %	0 %	159901693
4334	NC_009973	A	6	6	266484	266489	100 %	0 %	0 %	0 %	159901693
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4347	NC_009973	CGATCA	2	12	267554	267565	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159901694
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4352	NC_009973	GTGC	2	8	267871	267878	0 %	25 %	50 %	25 %	159901694
4353	NC_009973	GATC	2	8	267942	267949	25 %	25 %	25 %	25 %	159901694
4354	NC_009973	CTG	2	6	268004	268009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901694
4355	NC_009973	ATG	2	6	268022	268027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901694
4356	NC_009973	CA	3	6	268041	268046	50 %	0 %	0 %	50 %	159901694
4357	NC_009973	CGG	2	6	268058	268063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901694
4358	NC_009973	TAC	2	6	268118	268123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901694
4359	NC_009973	ATC	2	6	268180	268185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901694
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4363	NC_009973	CTG	2	6	268343	268348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901694
4364	NC_009973	GCG	2	6	268372	268377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901694
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4484	NC_009973	AACG	2	8	276000	276007	50 %	0 %	25 %	25 %	159901700
4485	NC_009973	ATC	2	6	276076	276081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901700
4486	NC_009973	CAT	2	6	276210	276215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901700
4487	NC_009973	AC	3	6	276244	276249	50 %	0 %	0 %	50 %	159901700
4488	NC_009973	CGC	2	6	276257	276262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901700
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4490	NC_009973	CCG	2	6	276321	276326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901700
4491	NC_009973	GTCA	2	8	276361	276368	25 %	25 %	25 %	25 %	159901700
4492	NC_009973	GTT	2	6	276397	276402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901700
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