MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 5559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009973	CGC	2	6	215814	215819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901659
3502	NC_009973	CAT	2	6	215833	215838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901659
3503	NC_009973	GAAC	2	8	215857	215864	50 %	0 %	25 %	25 %	159901659
3504	NC_009973	CAC	2	6	215904	215909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901659
3505	NC_009973	GCA	2	6	215910	215915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901659
3506	NC_009973	GAGC	2	8	216044	216051	25 %	0 %	50 %	25 %	159901659
3507	NC_009973	CTGC	2	8	216117	216124	0 %	25 %	25 %	50 %	159901659
3508	NC_009973	GTCA	2	8	216182	216189	25 %	25 %	25 %	25 %	159901659
3509	NC_009973	CG	3	6	216215	216220	0 %	0 %	50 %	50 %	159901659
3510	NC_009973	ACC	2	6	216305	216310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901659
3511	NC_009973	CTG	2	6	216404	216409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901659
3512	NC_009973	AGT	2	6	216434	216439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901659
3513	NC_009973	AACC	2	8	216451	216458	50 %	0 %	0 %	50 %	159901659
3514	NC_009973	C	7	7	216581	216587	0 %	0 %	0 %	100 %	159901659
3515	NC_009973	ACG	2	6	216612	216617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901659
3516	NC_009973	CG	3	6	216638	216643	0 %	0 %	50 %	50 %	159901659
3517	NC_009973	CAA	2	6	216673	216678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901659
3518	NC_009973	GGTA	2	8	216853	216860	25 %	25 %	50 %	0 %	159901659
3519	NC_009973	CAG	2	6	216872	216877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901659
3520	NC_009973	AGG	2	6	216915	216920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901659
3521	NC_009973	GTT	2	6	216964	216969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901659
3522	NC_009973	AT	3	6	216981	216986	50 %	50 %	0 %	0 %	159901659
3523	NC_009973	GTG	2	6	217032	217037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901659
3524	NC_009973	T	7	7	217051	217057	0 %	100 %	0 %	0 %	159901659
3525	NC_009973	CTT	2	6	217252	217257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901659
3526	NC_009973	ATG	2	6	217311	217316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901659
3527	NC_009973	GAT	2	6	217720	217725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901660
3528	NC_009973	CAA	2	6	217750	217755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901660
3529	NC_009973	TAT	2	6	217765	217770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901660
3530	NC_009973	A	8	8	217818	217825	100 %	0 %	0 %	0 %	159901660
3531	NC_009973	GGC	2	6	217828	217833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901660
3532	NC_009973	CAA	2	6	217876	217881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901660
3533	NC_009973	TCC	2	6	217888	217893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901660
3534	NC_009973	TGC	2	6	217965	217970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
3535	NC_009973	CAA	2	6	217980	217985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901660
3536	NC_009973	TTTC	2	8	218016	218023	0 %	75 %	0 %	25 %	159901660
3537	NC_009973	CATC	2	8	218024	218031	25 %	25 %	0 %	50 %	159901660
3538	NC_009973	GAG	2	6	218083	218088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901660
3539	NC_009973	CTG	2	6	218112	218117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
3540	NC_009973	GAT	2	6	218245	218250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901660
3541	NC_009973	ACC	2	6	218277	218282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901660
3542	NC_009973	CGT	2	6	218296	218301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
3543	NC_009973	GTC	2	6	218405	218410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
3544	NC_009973	AAG	2	6	218414	218419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901660
3545	NC_009973	GATT	2	8	218462	218469	25 %	50 %	25 %	0 %	159901660
3546	NC_009973	CATG	2	8	218491	218498	25 %	25 %	25 %	25 %	159901660
3547	NC_009973	TGC	2	6	218517	218522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
3548	NC_009973	ACT	2	6	218531	218536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901660
3549	NC_009973	TGGTA	2	10	218622	218631	20 %	40 %	40 %	0 %	159901660
3550	NC_009973	GCA	2	6	218701	218706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901660
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3552	NC_009973	TGA	2	6	218847	218852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901660
3553	NC_009973	A	8	8	218883	218890	100 %	0 %	0 %	0 %	159901660
3554	NC_009973	CTA	2	6	218895	218900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901660
3555	NC_009973	ATT	3	9	218926	218934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901660
3556	NC_009973	GTT	2	6	218937	218942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901660
3557	NC_009973	ATT	2	6	218962	218967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901660
3558	NC_009973	ATC	2	6	219041	219046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901660
3559	NC_009973	AC	4	8	219049	219056	50 %	0 %	0 %	50 %	159901660
3560	NC_009973	CTT	2	6	219100	219105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901660
3561	NC_009973	GAC	2	6	219119	219124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901660
3562	NC_009973	CCTG	2	8	219188	219195	0 %	25 %	25 %	50 %	159901660
3563	NC_009973	TCG	2	6	219199	219204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
3564	NC_009973	AAGA	2	8	219211	219218	75 %	0 %	25 %	0 %	159901660
3565	NC_009973	ATT	2	6	219232	219237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901660
3566	NC_009973	ATC	2	6	219260	219265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901660
3567	NC_009973	TTC	2	6	219305	219310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901660
3568	NC_009973	TTC	2	6	219380	219385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901660
3569	NC_009973	ACAA	2	8	219394	219401	75 %	0 %	0 %	25 %	159901660
3570	NC_009973	AAG	2	6	219472	219477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901661
3571	NC_009973	CATGC	2	10	219480	219489	20 %	20 %	20 %	40 %	159901661
3572	NC_009973	TAA	2	6	219513	219518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901661
3573	NC_009973	CCG	2	6	219559	219564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901661
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3575	NC_009973	CAT	2	6	219637	219642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901661
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3579	NC_009973	GCGA	2	8	219962	219969	25 %	0 %	50 %	25 %	159901661
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3583	NC_009973	TGA	2	6	220241	220246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901661
3584	NC_009973	ACG	2	6	220248	220253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901661
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3587	NC_009973	AATT	2	8	220408	220415	50 %	50 %	0 %	0 %	159901661
3588	NC_009973	ATAA	2	8	220510	220517	75 %	25 %	0 %	0 %	159901661
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3593	NC_009973	TGG	2	6	220932	220937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901662
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3595	NC_009973	GT	3	6	220956	220961	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
3596	NC_009973	GTTG	2	8	220972	220979	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
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3602	NC_009973	GTTG	2	8	221152	221159	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
3603	NC_009973	TCG	2	6	221178	221183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901662
3604	NC_009973	GTTG	2	8	221200	221207	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
3605	NC_009973	GT	3	6	221208	221213	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
3606	NC_009973	GTTG	2	8	221242	221249	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
3607	NC_009973	CGTTGG	2	12	221263	221274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159901662
3608	NC_009973	A	6	6	221323	221328	100 %	0 %	0 %	0 %	159901662
3609	NC_009973	TTC	2	6	221365	221370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901662
3610	NC_009973	CTGC	2	8	221388	221395	0 %	25 %	25 %	50 %	159901662
3611	NC_009973	GAT	2	6	221482	221487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901662
3612	NC_009973	G	6	6	221504	221509	0 %	0 %	100 %	0 %	159901662
3613	NC_009973	AGGA	2	8	221615	221622	50 %	0 %	50 %	0 %	159901662
3614	NC_009973	CG	3	6	221724	221729	0 %	0 %	50 %	50 %	159901662
3615	NC_009973	GGACT	2	10	221785	221794	20 %	20 %	40 %	20 %	159901662
3616	NC_009973	TCCG	2	8	221803	221810	0 %	25 %	25 %	50 %	159901662
3617	NC_009973	GACC	2	8	221830	221837	25 %	0 %	25 %	50 %	159901662
3618	NC_009973	GC	3	6	221862	221867	0 %	0 %	50 %	50 %	159901662
3619	NC_009973	GCG	2	6	221886	221891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901662
3620	NC_009973	TAGA	2	8	221911	221918	50 %	25 %	25 %	0 %	159901662
3621	NC_009973	CCA	2	6	221943	221948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901662
3622	NC_009973	CCCACC	2	12	221960	221971	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	159901662
3623	NC_009973	GAC	2	6	222008	222013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901662
3624	NC_009973	ATG	2	6	222623	222628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901663
3625	NC_009973	CCA	2	6	222672	222677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901663
3626	NC_009973	CGC	2	6	222704	222709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901663
3627	NC_009973	CGC	2	6	222764	222769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901663
3628	NC_009973	TCA	2	6	222849	222854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901663
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3640	NC_009973	TCCA	2	8	224212	224219	25 %	25 %	0 %	50 %	159901664
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3663	NC_009973	ATC	2	6	225333	225338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901664
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3702	NC_009973	CGGA	2	8	227216	227223	25 %	0 %	50 %	25 %	159901664
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3724	NC_009973	CTG	2	6	228003	228008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901664
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3730	NC_009973	CAT	2	6	228230	228235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901664
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3732	NC_009973	CAA	2	6	228297	228302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901664
3733	NC_009973	TCG	2	6	228311	228316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901664
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3735	NC_009973	GAG	2	6	228387	228392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901664
3736	NC_009973	TCG	2	6	228427	228432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901664
3737	NC_009973	CAG	2	6	228441	228446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901664
3738	NC_009973	GCA	2	6	228453	228458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901664
3739	NC_009973	ACC	2	6	228463	228468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901664
3740	NC_009973	GAA	2	6	228611	228616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901664
3741	NC_009973	GCT	2	6	228624	228629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901664
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3743	NC_009973	CATCGG	2	12	228737	228748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159901664
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3745	NC_009973	CAT	2	6	228833	228838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901664
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