MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 5559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009973	GCC	2	6	186611	186616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901644
3002	NC_009973	TGA	2	6	186636	186641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901644
3003	NC_009973	AAT	2	6	187194	187199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901645
3004	NC_009973	TAATA	2	10	187215	187224	60 %	40 %	0 %	0 %	159901645
3005	NC_009973	ATCAT	2	10	187234	187243	40 %	40 %	0 %	20 %	159901645
3006	NC_009973	GAT	2	6	187253	187258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901645
3007	NC_009973	TC	3	6	187264	187269	0 %	50 %	0 %	50 %	159901645
3008	NC_009973	AT	3	6	187273	187278	50 %	50 %	0 %	0 %	159901645
3009	NC_009973	AT	3	6	187450	187455	50 %	50 %	0 %	0 %	159901645
3010	NC_009973	TCACTT	2	12	187537	187548	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159901645
3011	NC_009973	TTA	2	6	187573	187578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901645
3012	NC_009973	ATA	2	6	187607	187612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901646
3013	NC_009973	AAT	2	6	187705	187710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901646
3014	NC_009973	ATA	2	6	187718	187723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901646
3015	NC_009973	CCAA	2	8	187734	187741	50 %	0 %	0 %	50 %	159901646
3016	NC_009973	TAC	2	6	187755	187760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901646
3017	NC_009973	ATT	2	6	187780	187785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901646
3018	NC_009973	GTA	2	6	187799	187804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901646
3019	NC_009973	AT	3	6	187809	187814	50 %	50 %	0 %	0 %	159901646
3020	NC_009973	ATA	2	6	187907	187912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901646
3021	NC_009973	TTA	2	6	187914	187919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901646
3022	NC_009973	AT	3	6	187932	187937	50 %	50 %	0 %	0 %	159901646
3023	NC_009973	TAAA	2	8	187995	188002	75 %	25 %	0 %	0 %	159901646
3024	NC_009973	TTA	2	6	188018	188023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901646
3025	NC_009973	CAC	2	6	188061	188066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901646
3026	NC_009973	TTTTG	2	10	188165	188174	0 %	80 %	20 %	0 %	159901646
3027	NC_009973	CTG	2	6	188185	188190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901646
3028	NC_009973	AT	3	6	188212	188217	50 %	50 %	0 %	0 %	159901646
3029	NC_009973	TAT	2	6	188238	188243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901646
3030	NC_009973	GATA	2	8	188253	188260	50 %	25 %	25 %	0 %	159901646
3031	NC_009973	TAT	2	6	188307	188312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901646
3032	NC_009973	ATGT	2	8	188316	188323	25 %	50 %	25 %	0 %	159901646
3033	NC_009973	TAT	2	6	188817	188822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901647
3034	NC_009973	ATC	2	6	188911	188916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901647
3035	NC_009973	ACA	2	6	189358	189363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901648
3036	NC_009973	GTA	2	6	189411	189416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901648
3037	NC_009973	CAT	2	6	189424	189429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901648
3038	NC_009973	AAAC	2	8	189441	189448	75 %	0 %	0 %	25 %	159901648
3039	NC_009973	ATC	2	6	189472	189477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901648
3040	NC_009973	ATG	2	6	189546	189551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901648
3041	NC_009973	TCCG	2	8	189553	189560	0 %	25 %	25 %	50 %	159901648
3042	NC_009973	AT	3	6	189570	189575	50 %	50 %	0 %	0 %	159901648
3043	NC_009973	TTC	2	6	189581	189586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901648
3044	NC_009973	TGA	2	6	189595	189600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901648
3045	NC_009973	CTG	2	6	189636	189641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901648
3046	NC_009973	ATA	2	6	189734	189739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901648
3047	NC_009973	TGG	2	6	189845	189850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901648
3048	NC_009973	TTA	2	6	189885	189890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901648
3049	NC_009973	TTG	2	6	190014	190019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901648
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3052	NC_009973	TATG	2	8	190117	190124	25 %	50 %	25 %	0 %	159901649
3053	NC_009973	TGA	2	6	190171	190176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901649
3054	NC_009973	TA	4	8	190234	190241	50 %	50 %	0 %	0 %	159901649
3055	NC_009973	GAA	3	9	190250	190258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901649
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3057	NC_009973	TAA	2	6	190335	190340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901649
3058	NC_009973	GAA	2	6	190343	190348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901649
3059	NC_009973	CTCA	2	8	190360	190367	25 %	25 %	0 %	50 %	159901649
3060	NC_009973	ATT	2	6	190388	190393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901649
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3065	NC_009973	ATT	3	9	190539	190547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901649
3066	NC_009973	TA	3	6	190574	190579	50 %	50 %	0 %	0 %	159901649
3067	NC_009973	ACA	2	6	190600	190605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901649
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3079	NC_009973	ATT	2	6	191038	191043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901649
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3093	NC_009973	TA	3	6	191421	191426	50 %	50 %	0 %	0 %	159901650
3094	NC_009973	A	6	6	191441	191446	100 %	0 %	0 %	0 %	159901650
3095	NC_009973	AT	3	6	191474	191479	50 %	50 %	0 %	0 %	159901650
3096	NC_009973	A	6	6	191498	191503	100 %	0 %	0 %	0 %	159901650
3097	NC_009973	TAA	2	6	191507	191512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901650
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3101	NC_009973	TA	3	6	191831	191836	50 %	50 %	0 %	0 %	159901650
3102	NC_009973	CTG	2	6	191843	191848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901650
3103	NC_009973	TAT	2	6	191853	191858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901650
3104	NC_009973	ATAA	2	8	191878	191885	75 %	25 %	0 %	0 %	159901650
3105	NC_009973	TGT	2	6	191927	191932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901650
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3107	NC_009973	GTA	2	6	192004	192009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901650
3108	NC_009973	AGA	3	9	192033	192041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901650
3109	NC_009973	AAC	2	6	192066	192071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901650
3110	NC_009973	CTG	2	6	192106	192111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901650
3111	NC_009973	ATC	2	6	192114	192119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901650
3112	NC_009973	TCT	2	6	192171	192176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901650
3113	NC_009973	GAT	2	6	192211	192216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901650
3114	NC_009973	GAT	2	6	192220	192225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901650
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3116	NC_009973	GGAT	2	8	192242	192249	25 %	25 %	50 %	0 %	159901650
3117	NC_009973	TCCA	2	8	192897	192904	25 %	25 %	0 %	50 %	159901651
3118	NC_009973	GCC	2	6	192968	192973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901651
3119	NC_009973	CAT	2	6	192980	192985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901651
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3121	NC_009973	CCT	2	6	193576	193581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901652
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3123	NC_009973	TAC	2	6	193609	193614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
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3242	NC_009973	CAT	2	6	200869	200874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901655
3243	NC_009973	CGA	2	6	200932	200937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901655
3244	NC_009973	TTG	2	6	201035	201040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901655
3245	NC_009973	CT	3	6	201075	201080	0 %	50 %	0 %	50 %	159901655
3246	NC_009973	TG	3	6	201190	201195	0 %	50 %	50 %	0 %	159901655
3247	NC_009973	CTT	2	6	201197	201202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901655
3248	NC_009973	CTG	2	6	201266	201271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901655
3249	NC_009973	TA	3	6	201339	201344	50 %	50 %	0 %	0 %	159901655
3250	NC_009973	TTC	2	6	201348	201353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901655
3251	NC_009973	AT	3	6	201416	201421	50 %	50 %	0 %	0 %	159901655
3252	NC_009973	ATTC	2	8	201479	201486	25 %	50 %	0 %	25 %	159901655
3253	NC_009973	CA	3	6	201600	201605	50 %	0 %	0 %	50 %	159901655
3254	NC_009973	CAATAA	2	12	201687	201698	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	159901655
3255	NC_009973	TGG	2	6	201839	201844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901655
3256	NC_009973	AT	3	6	201869	201874	50 %	50 %	0 %	0 %	159901655
3257	NC_009973	CA	3	6	201906	201911	50 %	0 %	0 %	50 %	159901655
3258	NC_009973	ACT	2	6	201913	201918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901655
3259	NC_009973	TGA	2	6	201952	201957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901655
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3261	NC_009973	GCT	2	6	202010	202015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901655
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3263	NC_009973	CA	4	8	202102	202109	50 %	0 %	0 %	50 %	159901655
3264	NC_009973	AATG	2	8	202147	202154	50 %	25 %	25 %	0 %	159901655
3265	NC_009973	GA	4	8	202420	202427	50 %	0 %	50 %	0 %	159901655
3266	NC_009973	CAAT	2	8	202502	202509	50 %	25 %	0 %	25 %	159901655
3267	NC_009973	AT	3	6	202525	202530	50 %	50 %	0 %	0 %	159901655
3268	NC_009973	AAG	2	6	202552	202557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901655
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3270	NC_009973	TGA	2	6	202747	202752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901655
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3272	NC_009973	AGA	2	6	202838	202843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901655
3273	NC_009973	GAT	3	9	202883	202891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901655
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3276	NC_009973	TCA	2	6	203369	203374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901656
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3281	NC_009973	TGG	2	6	203516	203521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901656
3282	NC_009973	ACCC	2	8	203526	203533	25 %	0 %	0 %	75 %	159901656
3283	NC_009973	CACCAT	2	12	203564	203575	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	159901656
3284	NC_009973	CGCGTC	2	12	203627	203638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159901656
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3287	NC_009973	TGG	2	6	203734	203739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901656
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3289	NC_009973	ACC	2	6	203812	203817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
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3291	NC_009973	ACC	2	6	203911	203916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
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3300	NC_009973	ACC	2	6	204274	204279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
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3311	NC_009973	CTT	2	6	205149	205154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901656
3312	NC_009973	GCC	2	6	205180	205185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901656
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3314	NC_009973	ACC	2	6	205258	205263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
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3317	NC_009973	CGG	2	6	205456	205461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901656
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3327	NC_009973	AGC	2	6	205808	205813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901656
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3330	NC_009973	CAC	2	6	205998	206003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3331	NC_009973	ACCTAT	2	12	206005	206016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901656
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3333	NC_009973	ACC	2	6	206062	206067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3334	NC_009973	ACC	2	6	206071	206076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3335	NC_009973	ACG	2	6	206104	206109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901656
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3339	NC_009973	CGC	2	6	206370	206375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901656
3340	NC_009973	ACC	2	6	206398	206403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3341	NC_009973	ATG	2	6	206414	206419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
3342	NC_009973	ACC	2	6	206443	206448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3343	NC_009973	ATG	2	6	206582	206587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
3344	NC_009973	ACC	3	9	206665	206673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3345	NC_009973	GAT	2	6	206683	206688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
3346	NC_009973	ATG	2	6	206750	206755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
3347	NC_009973	CGT	2	6	206766	206771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901656
3348	NC_009973	GCC	2	6	206815	206820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901656
3349	NC_009973	CAC	2	6	206835	206840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3350	NC_009973	GCCA	2	8	206901	206908	25 %	0 %	25 %	50 %	159901656
3351	NC_009973	CG	3	6	206959	206964	0 %	0 %	50 %	50 %	159901656
3352	NC_009973	GAC	2	6	207024	207029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901656
3353	NC_009973	ATG	2	6	207041	207046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
3354	NC_009973	GCT	2	6	207162	207167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901656
3355	NC_009973	CAGC	2	8	207195	207202	25 %	0 %	25 %	50 %	159901656
3356	NC_009973	ACGGC	2	10	207280	207289	20 %	0 %	40 %	40 %	159901656
3357	NC_009973	ACC	2	6	207403	207408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3358	NC_009973	ATG	2	6	207443	207448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
3359	NC_009973	TCG	2	6	207461	207466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901656
3360	NC_009973	TAC	2	6	207538	207543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901656
3361	NC_009973	CGA	2	6	207566	207571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901656
3362	NC_009973	ACC	2	6	207586	207591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3363	NC_009973	TGA	2	6	207633	207638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
3364	NC_009973	GATG	2	8	207645	207652	25 %	25 %	50 %	0 %	159901656
3365	NC_009973	TGC	3	9	207720	207728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901656
3366	NC_009973	ACC	2	6	207760	207765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3367	NC_009973	CCA	3	9	207794	207802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901656
3368	NC_009973	ACG	2	6	207817	207822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901656
3369	NC_009973	CTG	2	6	207823	207828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901656
3370	NC_009973	GAT	2	6	207841	207846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
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3384	NC_009973	ATG	2	6	208301	208306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
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3392	NC_009973	ATG	2	6	208973	208978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901656
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3396	NC_009973	GGC	2	6	209056	209061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901656
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3455	NC_009973	ATA	2	6	212308	212313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901657
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3459	NC_009973	CAT	2	6	212353	212358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901657
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3470	NC_009973	TGGAAT	2	12	212778	212789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901657
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3472	NC_009973	AGCG	2	8	212941	212948	25 %	0 %	50 %	25 %	159901658
3473	NC_009973	GA	3	6	213130	213135	50 %	0 %	50 %	0 %	159901658
3474	NC_009973	TGA	2	6	213185	213190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901658
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3476	NC_009973	TGGC	2	8	213370	213377	0 %	25 %	50 %	25 %	159901658
3477	NC_009973	GAC	2	6	213507	213512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901658
3478	NC_009973	GCTG	2	8	213514	213521	0 %	25 %	50 %	25 %	159901658
3479	NC_009973	CGC	3	9	213534	213542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901658
3480	NC_009973	CGAC	2	8	213565	213572	25 %	0 %	25 %	50 %	159901658
3481	NC_009973	ATGA	2	8	213756	213763	50 %	25 %	25 %	0 %	159901658
3482	NC_009973	ACC	2	6	213835	213840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901658
3483	NC_009973	CTTTTT	2	12	214004	214015	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	159901659
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3491	NC_009973	CCTA	2	8	215090	215097	25 %	25 %	0 %	50 %	159901659
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