MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 5559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009973	CTC	2	6	337049	337054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901740
5502	NC_009973	GAG	2	6	337058	337063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901740
5503	NC_009973	TCA	2	6	337080	337085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901740
5504	NC_009973	TGA	2	6	337128	337133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901740
5505	NC_009973	TGC	2	6	337155	337160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901740
5506	NC_009973	GGT	2	6	337162	337167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901740
5507	NC_009973	TGA	2	6	337207	337212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901740
5508	NC_009973	CAG	2	6	337247	337252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901740
5509	NC_009973	AAC	2	6	337269	337274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901740
5510	NC_009973	CAT	2	6	337333	337338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901740
5511	NC_009973	CGC	2	6	337405	337410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901740
5512	NC_009973	GT	3	6	337498	337503	0 %	50 %	50 %	0 %	159901740
5513	NC_009973	C	6	6	337508	337513	0 %	0 %	0 %	100 %	159901740
5514	NC_009973	TGCC	2	8	337517	337524	0 %	25 %	25 %	50 %	159901740
5515	NC_009973	CGT	2	6	337561	337566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901740
5516	NC_009973	GCC	2	6	337586	337591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901740
5517	NC_009973	CGCCA	2	10	337619	337628	20 %	0 %	20 %	60 %	159901740
5518	NC_009973	GCA	2	6	337639	337644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901740
5519	NC_009973	CCA	2	6	337656	337661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901740
5520	NC_009973	CTA	2	6	337684	337689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901740
5521	NC_009973	GCA	2	6	337729	337734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901740
5522	NC_009973	TGCCGT	2	12	337758	337769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901740
5523	NC_009973	CCA	4	12	337782	337793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901740
5524	NC_009973	TCC	2	6	337794	337799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901740
5525	NC_009973	CTGG	2	8	337927	337934	0 %	25 %	50 %	25 %	159901740
5526	NC_009973	ATC	2	6	338042	338047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901740
5527	NC_009973	CCA	2	6	338124	338129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901740
5528	NC_009973	CTG	3	9	338272	338280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901741
5529	NC_009973	GCT	2	6	338285	338290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901741
5530	NC_009973	CCG	2	6	338305	338310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901741
5531	NC_009973	GCC	2	6	338319	338324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901741
5532	NC_009973	CCG	2	6	338395	338400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901741
5533	NC_009973	TGCC	2	8	338441	338448	0 %	25 %	25 %	50 %	159901741
5534	NC_009973	ACC	2	6	338466	338471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5535	NC_009973	C	6	6	338535	338540	0 %	0 %	0 %	100 %	159901741
5536	NC_009973	GAG	2	6	338562	338567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901741
5537	NC_009973	CGC	2	6	338589	338594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901741
5538	NC_009973	CGCC	2	8	338690	338697	0 %	0 %	25 %	75 %	159901741
5539	NC_009973	CTGC	2	8	338724	338731	0 %	25 %	25 %	50 %	159901741
5540	NC_009973	CAC	2	6	338816	338821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5541	NC_009973	ACC	2	6	338826	338831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5542	NC_009973	CCA	2	6	338896	338901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5543	NC_009973	CCA	2	6	338905	338910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5544	NC_009973	GGA	2	6	338918	338923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901741
5545	NC_009973	CCA	2	6	338950	338955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5546	NC_009973	TGA	2	6	338965	338970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901741
5547	NC_009973	GCG	2	6	339066	339071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901741
5548	NC_009973	ACC	2	6	339147	339152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5549	NC_009973	GAA	2	6	339183	339188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901741
5550	NC_009973	TCA	2	6	339205	339210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901741
5551	NC_009973	CCA	2	6	339212	339217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5552	NC_009973	CGC	2	6	339341	339346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901741
5553	NC_009973	CCG	2	6	339352	339357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901741
5554	NC_009973	CTG	2	6	339462	339467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901741
5555	NC_009973	TGG	2	6	339484	339489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901741
5556	NC_009973	ACC	2	6	339510	339515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5557	NC_009973	GCT	2	6	339551	339556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901741
5558	NC_009973	CCA	2	6	339583	339588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901741
5559	NC_009973	CAA	2	6	339618	339623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901741

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.