MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 5559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009973	ACCA	2	8	277322	277329	50 %	0 %	0 %	50 %	159901701
4502	NC_009973	GTG	2	6	277346	277351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901701
4503	NC_009973	TGG	2	6	277525	277530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901701
4504	NC_009973	AGT	2	6	277580	277585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901701
4505	NC_009973	CAAAA	2	10	277638	277647	80 %	0 %	0 %	20 %	159901701
4506	NC_009973	GCA	2	6	277683	277688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901701
4507	NC_009973	GGC	2	6	277706	277711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901701
4508	NC_009973	TCAG	2	8	277775	277782	25 %	25 %	25 %	25 %	159901701
4509	NC_009973	CGG	2	6	278155	278160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901702
4510	NC_009973	CGTTGG	2	12	278178	278189	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159901702
4511	NC_009973	GTC	2	6	278197	278202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901702
4512	NC_009973	G	6	6	278282	278287	0 %	0 %	100 %	0 %	159901702
4513	NC_009973	GCA	2	6	278290	278295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901702
4514	NC_009973	CAC	2	6	278352	278357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901702
4515	NC_009973	ACA	2	6	278454	278459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901702
4516	NC_009973	GTC	2	6	278495	278500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901702
4517	NC_009973	GCG	2	6	278512	278517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901702
4518	NC_009973	AAC	2	6	278529	278534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901702
4519	NC_009973	GCAC	2	8	278610	278617	25 %	0 %	25 %	50 %	159901702
4520	NC_009973	GCT	2	6	278649	278654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901702
4521	NC_009973	CCA	2	6	278667	278672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901702
4522	NC_009973	GGC	2	6	278931	278936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901702
4523	NC_009973	ATC	2	6	278980	278985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901702
4524	NC_009973	GTG	2	6	279035	279040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901702
4525	NC_009973	CCGT	2	8	279044	279051	0 %	25 %	25 %	50 %	159901702
4526	NC_009973	GCC	2	6	279070	279075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901702
4527	NC_009973	ACC	2	6	279088	279093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901702
4528	NC_009973	ATC	2	6	279194	279199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901702
4529	NC_009973	CGTT	2	8	279228	279235	0 %	50 %	25 %	25 %	159901703
4530	NC_009973	TCC	2	6	279252	279257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901703
4531	NC_009973	T	6	6	279314	279319	0 %	100 %	0 %	0 %	159901703
4532	NC_009973	TAAG	2	8	279327	279334	50 %	25 %	25 %	0 %	159901703
4533	NC_009973	TTG	2	6	279465	279470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901703
4534	NC_009973	CTG	2	6	279648	279653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901703
4535	NC_009973	TTG	2	6	279660	279665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901703
4536	NC_009973	ACG	2	6	279671	279676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901703
4537	NC_009973	G	6	6	279765	279770	0 %	0 %	100 %	0 %	159901703
4538	NC_009973	AGC	2	6	279796	279801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901703
4539	NC_009973	TGGATG	2	12	279906	279917	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	159901703
4540	NC_009973	TG	3	6	279916	279921	0 %	50 %	50 %	0 %	159901703
4541	NC_009973	GC	4	8	279954	279961	0 %	0 %	50 %	50 %	159901703
4542	NC_009973	GCA	2	6	280028	280033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901703
4543	NC_009973	ATTG	2	8	280072	280079	25 %	50 %	25 %	0 %	159901703
4544	NC_009973	TAAA	2	8	280135	280142	75 %	25 %	0 %	0 %	159901703
4545	NC_009973	GAT	2	6	281044	281049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901704
4546	NC_009973	TAT	2	6	281098	281103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901704
4547	NC_009973	TCG	2	6	281111	281116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901704
4548	NC_009973	GGT	2	6	281179	281184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901704
4549	NC_009973	ACG	2	6	281276	281281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901704
4550	NC_009973	CAG	2	6	281375	281380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901704
4551	NC_009973	GGT	2	6	281386	281391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901704
4552	NC_009973	AAT	2	6	281420	281425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901704
4553	NC_009973	GCT	2	6	281443	281448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901704
4554	NC_009973	TG	3	6	281510	281515	0 %	50 %	50 %	0 %	159901704
4555	NC_009973	CGA	3	9	281578	281586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901704
4556	NC_009973	GCA	2	6	281590	281595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901704
4557	NC_009973	CAG	2	6	281600	281605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901704
4558	NC_009973	ACT	2	6	281634	281639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901704
4559	NC_009973	GGC	2	6	281669	281674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901704
4560	NC_009973	TGA	2	6	281840	281845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901704
4561	NC_009973	GCG	2	6	282634	282639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901705
4562	NC_009973	CCA	2	6	282671	282676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901705
4563	NC_009973	AGC	2	6	282709	282714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901705
4564	NC_009973	CAT	2	6	282753	282758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901705
4565	NC_009973	GGT	2	6	282812	282817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901705
4566	NC_009973	GGC	2	6	282837	282842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901705
4567	NC_009973	ACC	2	6	282907	282912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901705
4568	NC_009973	GTTC	2	8	283003	283010	0 %	50 %	25 %	25 %	159901705
4569	NC_009973	CTG	2	6	283059	283064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901705
4570	NC_009973	TGA	2	6	283079	283084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901705
4571	NC_009973	TGC	3	9	283099	283107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901705
4572	NC_009973	TCA	2	6	283196	283201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901705
4573	NC_009973	GCA	2	6	283256	283261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901705
4574	NC_009973	CGA	2	6	283301	283306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901705
4575	NC_009973	AACAC	2	10	283327	283336	60 %	0 %	0 %	40 %	159901705
4576	NC_009973	GTG	2	6	283420	283425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901705
4577	NC_009973	ACCA	2	8	283435	283442	50 %	0 %	0 %	50 %	159901705
4578	NC_009973	C	6	6	283444	283449	0 %	0 %	0 %	100 %	159901705
4579	NC_009973	CGC	2	6	283521	283526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901705
4580	NC_009973	TGC	2	6	283531	283536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901705
4581	NC_009973	GAG	2	6	283581	283586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901705
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4583	NC_009973	GAT	2	6	283640	283645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901705
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4585	NC_009973	AAC	2	6	284112	284117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901706
4586	NC_009973	AAT	2	6	284155	284160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901706
4587	NC_009973	CCAT	2	8	284213	284220	25 %	25 %	0 %	50 %	159901706
4588	NC_009973	ATCACA	2	12	284240	284251	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	159901706
4589	NC_009973	GCGA	2	8	284300	284307	25 %	0 %	50 %	25 %	159901706
4590	NC_009973	TCT	2	6	284366	284371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901706
4591	NC_009973	TAA	2	6	284374	284379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901706
4592	NC_009973	CGTC	2	8	284391	284398	0 %	25 %	25 %	50 %	159901706
4593	NC_009973	GAT	2	6	284443	284448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901707
4594	NC_009973	GCATA	2	10	284459	284468	40 %	20 %	20 %	20 %	159901707
4595	NC_009973	TGG	2	6	284479	284484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901707
4596	NC_009973	GCT	2	6	284602	284607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901707
4597	NC_009973	CGTAT	2	10	284728	284737	20 %	40 %	20 %	20 %	159901707
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4600	NC_009973	ATC	2	6	284944	284949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901707
4601	NC_009973	TC	3	6	284993	284998	0 %	50 %	0 %	50 %	159901707
4602	NC_009973	TTC	2	6	285102	285107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901707
4603	NC_009973	CAG	2	6	285134	285139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901707
4604	NC_009973	CCG	2	6	285216	285221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901707
4605	NC_009973	GCGT	2	8	285243	285250	0 %	25 %	50 %	25 %	159901707
4606	NC_009973	GCCC	2	8	285307	285314	0 %	0 %	25 %	75 %	159901707
4607	NC_009973	CAG	2	6	285328	285333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901707
4608	NC_009973	GAT	2	6	285387	285392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901707
4609	NC_009973	CGC	2	6	285393	285398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901707
4610	NC_009973	TAT	2	6	285464	285469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901707
4611	NC_009973	AGTG	2	8	285495	285502	25 %	25 %	50 %	0 %	159901707
4612	NC_009973	TGAG	2	8	285584	285591	25 %	25 %	50 %	0 %	159901707
4613	NC_009973	GAC	2	6	285612	285617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901707
4614	NC_009973	ATC	2	6	285813	285818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901707
4615	NC_009973	TTCG	2	8	285884	285891	0 %	50 %	25 %	25 %	159901707
4616	NC_009973	ACA	2	6	285908	285913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901707
4617	NC_009973	CTG	2	6	285915	285920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901707
4618	NC_009973	ATCG	2	8	285951	285958	25 %	25 %	25 %	25 %	159901707
4619	NC_009973	TCA	2	6	286004	286009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901707
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4621	NC_009973	CATG	2	8	286034	286041	25 %	25 %	25 %	25 %	159901707
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4862	NC_009973	TCT	2	6	300573	300578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901718
4863	NC_009973	AAT	2	6	300614	300619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901718
4864	NC_009973	AAT	2	6	300665	300670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901718
4865	NC_009973	TTC	2	6	300725	300730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901718
4866	NC_009973	TTC	2	6	300763	300768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901718
4867	NC_009973	AGC	2	6	300827	300832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901718
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4870	NC_009973	TGC	2	6	301410	301415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901719
4871	NC_009973	CAAG	2	8	301435	301442	50 %	0 %	25 %	25 %	159901719
4872	NC_009973	CAG	2	6	301466	301471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901719
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4882	NC_009973	CCG	2	6	302083	302088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901719
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4890	NC_009973	GCA	2	6	302338	302343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901719
4891	NC_009973	CCG	2	6	302426	302431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901719
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4895	NC_009973	CGT	2	6	302828	302833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901719
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4951	NC_009973	AGAT	2	8	305316	305323	50 %	25 %	25 %	0 %	159901719
4952	NC_009973	CGG	2	6	305398	305403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901719
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4955	NC_009973	GCT	2	6	305555	305560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901719
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4958	NC_009973	CCCG	2	8	305653	305660	0 %	0 %	25 %	75 %	159901719
4959	NC_009973	GAT	2	6	305704	305709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901719
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4963	NC_009973	CAT	2	6	305975	305980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901720
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4965	NC_009973	GCA	2	6	306016	306021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901720
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4972	NC_009973	CCTT	2	8	306244	306251	0 %	50 %	0 %	50 %	159901720
4973	NC_009973	CGA	2	6	306328	306333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901720
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4975	NC_009973	CATGC	2	10	306505	306514	20 %	20 %	20 %	40 %	159901721
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4981	NC_009973	GCT	2	6	306918	306923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901721
4982	NC_009973	ACAT	2	8	306950	306957	50 %	25 %	0 %	25 %	159901721
4983	NC_009973	GTCG	2	8	307015	307022	0 %	25 %	50 %	25 %	159901721
4984	NC_009973	AGC	2	6	307052	307057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901721
4985	NC_009973	CGA	2	6	307086	307091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901721
4986	NC_009973	CGA	2	6	307183	307188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901721
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4989	NC_009973	CTG	2	6	307330	307335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901722
4990	NC_009973	TAA	2	6	307338	307343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901722
4991	NC_009973	GTC	2	6	307353	307358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901722
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4994	NC_009973	CACC	2	8	307446	307453	25 %	0 %	0 %	75 %	159901722
4995	NC_009973	AAT	2	6	307460	307465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901722
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4997	NC_009973	GTG	2	6	307661	307666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901723
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