MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 111733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_009972	AGC	2	6	728963	728968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897159
13003	NC_009972	TGC	2	6	729079	729084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897159
13004	NC_009972	CTT	2	6	729116	729121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159897159
13005	NC_009972	CGC	2	6	729124	729129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159897159
13006	NC_009972	GGC	2	6	729146	729151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159897159
13007	NC_009972	TGGC	2	8	729180	729187	0 %	25 %	50 %	25 %	159897160
13008	NC_009972	GCA	2	6	729219	729224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897160
13009	NC_009972	TGC	2	6	729230	729235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897160
13010	NC_009972	GCGCC	2	10	729289	729298	0 %	0 %	40 %	60 %	159897160
13011	NC_009972	GAC	3	9	729340	729348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897160
13012	NC_009972	TTG	2	6	729393	729398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159897160
13013	NC_009972	GACCAA	2	12	729401	729412	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	159897160
13014	NC_009972	TCT	2	6	729427	729432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159897160
13015	NC_009972	GCTC	2	8	729436	729443	0 %	25 %	25 %	50 %	159897160
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13017	NC_009972	TGC	2	6	729549	729554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897160
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13019	NC_009972	TTAC	2	8	729789	729796	25 %	50 %	0 %	25 %	159897161
13020	NC_009972	CGC	2	6	729843	729848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159897161
13021	NC_009972	TTATC	2	10	729945	729954	20 %	60 %	0 %	20 %	159897161
13022	NC_009972	TGG	2	6	729993	729998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159897161
13023	NC_009972	GGC	2	6	730007	730012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159897161
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13026	NC_009972	TGA	2	6	730213	730218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897161
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13028	NC_009972	TTA	2	6	730283	730288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897161
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13032	NC_009972	GAA	2	6	730466	730471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159897161
13033	NC_009972	CAA	2	6	730492	730497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159897161
13034	NC_009972	ATTC	2	8	730612	730619	25 %	50 %	0 %	25 %	159897161
13035	NC_009972	T	6	6	730789	730794	0 %	100 %	0 %	0 %	159897161
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13037	NC_009972	GCG	2	6	730958	730963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159897162
13038	NC_009972	CGTT	2	8	730968	730975	0 %	50 %	25 %	25 %	159897162
13039	NC_009972	GAA	2	6	730981	730986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159897162
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13041	NC_009972	AGT	2	6	731050	731055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897162
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13045	NC_009972	ATT	2	6	731194	731199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897162
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13052	NC_009972	CAA	2	6	731413	731418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159897162
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13054	NC_009972	GCA	2	6	731448	731453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897162
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13056	NC_009972	AAAC	2	8	731563	731570	75 %	0 %	0 %	25 %	159897162
13057	NC_009972	AGC	2	6	731620	731625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897162
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13060	NC_009972	TGG	2	6	731864	731869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159897162
13061	NC_009972	AGC	2	6	731894	731899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897162
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13063	NC_009972	CGGG	2	8	732079	732086	0 %	0 %	75 %	25 %	159897162
13064	NC_009972	GAA	2	6	732097	732102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159897162
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13071	NC_009972	GCG	2	6	732294	732299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159897162
13072	NC_009972	TTC	2	6	732486	732491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159897163
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13074	NC_009972	ATA	2	6	732531	732536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159897163
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13077	NC_009972	CTAG	2	8	732748	732755	25 %	25 %	25 %	25 %	159897163
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13082	NC_009972	ATC	2	6	732913	732918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897163
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13086	NC_009972	ACC	2	6	733006	733011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159897163
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13088	NC_009972	A	6	6	733032	733037	100 %	0 %	0 %	0 %	159897163
13089	NC_009972	CGTT	2	8	733039	733046	0 %	50 %	25 %	25 %	159897163
13090	NC_009972	CGG	3	9	733070	733078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159897163
13091	NC_009972	GGC	2	6	733151	733156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159897163
13092	NC_009972	TCA	2	6	733168	733173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897163
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13096	NC_009972	GGGT	2	8	733553	733560	0 %	25 %	75 %	0 %	159897164
13097	NC_009972	A	6	6	733605	733610	100 %	0 %	0 %	0 %	159897164
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13100	NC_009972	TGCC	2	8	733774	733781	0 %	25 %	25 %	50 %	159897165
13101	NC_009972	GTT	2	6	733824	733829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159897165
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13104	NC_009972	CGC	2	6	733998	734003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159897165
13105	NC_009972	A	6	6	734010	734015	100 %	0 %	0 %	0 %	159897165
13106	NC_009972	CCA	2	6	734025	734030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159897165
13107	NC_009972	ATC	2	6	734059	734064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897165
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13110	NC_009972	CTG	2	6	734301	734306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897165
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13112	NC_009972	GCT	2	6	734403	734408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897165
13113	NC_009972	GCG	2	6	734440	734445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159897165
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13479	NC_009972	TGC	2	6	755855	755860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897187
13480	NC_009972	GCC	2	6	755952	755957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159897187
13481	NC_009972	GTC	2	6	755962	755967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897187
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