MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 111733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009972	ATC	2	6	623888	623893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897067
11002	NC_009972	CCA	2	6	623964	623969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159897067
11003	NC_009972	AAT	2	6	623994	623999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159897067
11004	NC_009972	TTAT	2	8	624105	624112	25 %	75 %	0 %	0 %	159897067
11005	NC_009972	TCCCT	2	10	624116	624125	0 %	40 %	0 %	60 %	159897067
11006	NC_009972	GAT	2	6	624143	624148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897067
11007	NC_009972	TGA	2	6	624164	624169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897067
11008	NC_009972	CTG	2	6	624178	624183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897067
11009	NC_009972	TGGT	2	8	624247	624254	0 %	50 %	50 %	0 %	159897067
11010	NC_009972	ATT	2	6	624518	624523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897068
11011	NC_009972	AGC	2	6	624534	624539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897068
11012	NC_009972	GAT	2	6	624574	624579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897068
11013	NC_009972	TGC	2	6	624627	624632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897068
11014	NC_009972	TAT	2	6	624655	624660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897068
11015	NC_009972	TAA	2	6	624706	624711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159897068
11016	NC_009972	GAT	2	6	624713	624718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897068
11017	NC_009972	ATT	2	6	624731	624736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897068
11018	NC_009972	CAA	2	6	624743	624748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159897068
11019	NC_009972	TTG	2	6	624795	624800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159897068
11020	NC_009972	CAT	2	6	624812	624817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897068
11021	NC_009972	GAT	2	6	624845	624850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897068
11022	NC_009972	TGA	2	6	624853	624858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897068
11023	NC_009972	TG	3	6	624878	624883	0 %	50 %	50 %	0 %	159897068
11024	NC_009972	ACC	2	6	624959	624964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159897068
11025	NC_009972	TTG	2	6	625090	625095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159897069
11026	NC_009972	TGG	2	6	625100	625105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159897069
11027	NC_009972	A	6	6	625214	625219	100 %	0 %	0 %	0 %	159897069
11028	NC_009972	GTC	2	6	625225	625230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897069
11029	NC_009972	GATC	2	8	625331	625338	25 %	25 %	25 %	25 %	159897069
11030	NC_009972	TTG	2	6	625411	625416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159897069
11031	NC_009972	ATG	2	6	625456	625461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897069
11032	NC_009972	ACC	2	6	625634	625639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159897069
11033	NC_009972	GCA	2	6	625658	625663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897069
11034	NC_009972	CTTA	2	8	625703	625710	25 %	50 %	0 %	25 %	159897069
11035	NC_009972	TTG	2	6	625732	625737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159897069
11036	NC_009972	ATC	2	6	625755	625760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897069
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11038	NC_009972	TTG	2	6	626189	626194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159897070
11039	NC_009972	AGCAA	2	10	626275	626284	60 %	0 %	20 %	20 %	159897070
11040	NC_009972	ACC	2	6	626291	626296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159897070
11041	NC_009972	AGCA	2	8	626304	626311	50 %	0 %	25 %	25 %	159897070
11042	NC_009972	CAG	2	6	626328	626333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897070
11043	NC_009972	CAG	2	6	626340	626345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897070
11044	NC_009972	C	6	6	626374	626379	0 %	0 %	0 %	100 %	159897070
11045	NC_009972	TCA	2	6	626385	626390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897070
11046	NC_009972	TGA	2	6	626449	626454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897070
11047	NC_009972	AGCC	3	12	626473	626484	25 %	0 %	25 %	50 %	159897070
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11049	NC_009972	ACC	2	6	626518	626523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159897070
11050	NC_009972	CCAA	2	8	626539	626546	50 %	0 %	0 %	50 %	159897070
11051	NC_009972	GTG	2	6	626597	626602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159897070
11052	NC_009972	TTA	2	6	626651	626656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897070
11053	NC_009972	CATT	2	8	626697	626704	25 %	50 %	0 %	25 %	159897070
11054	NC_009972	AGC	2	6	626725	626730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897070
11055	NC_009972	CAT	2	6	626733	626738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897070
11056	NC_009972	TTG	2	6	626774	626779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159897070
11057	NC_009972	ATG	2	6	626899	626904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897071
11058	NC_009972	ATT	2	6	626941	626946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897071
11059	NC_009972	TGA	2	6	627000	627005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897071
11060	NC_009972	TAT	2	6	627009	627014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897071
11061	NC_009972	TAATA	2	10	627075	627084	60 %	40 %	0 %	0 %	159897071
11062	NC_009972	ATA	2	6	627098	627103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159897071
11063	NC_009972	AATTT	2	10	627107	627116	40 %	60 %	0 %	0 %	159897071
11064	NC_009972	TAT	2	6	627117	627122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897071
11065	NC_009972	TTC	2	6	627162	627167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159897071
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11067	NC_009972	TAAATT	2	12	627221	627232	50 %	50 %	0 %	0 %	159897071
11068	NC_009972	TCAA	2	8	627243	627250	50 %	25 %	0 %	25 %	159897071
11069	NC_009972	GAT	2	6	627286	627291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159897071
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11071	NC_009972	ATA	2	6	627325	627330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159897071
11072	NC_009972	A	7	7	627333	627339	100 %	0 %	0 %	0 %	159897071
11073	NC_009972	TCA	2	6	627346	627351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897071
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11075	NC_009972	AT	3	6	627462	627467	50 %	50 %	0 %	0 %	159897071
11076	NC_009972	TCCAT	2	10	627471	627480	20 %	40 %	0 %	40 %	159897071
11077	NC_009972	ATA	2	6	627488	627493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159897071
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11083	NC_009972	AT	3	6	627627	627632	50 %	50 %	0 %	0 %	159897071
11084	NC_009972	AGA	2	6	627648	627653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159897071
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11087	NC_009972	AAT	2	6	627694	627699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159897071
11088	NC_009972	TCAA	2	8	627744	627751	50 %	25 %	0 %	25 %	159897071
11089	NC_009972	AT	3	6	627797	627802	50 %	50 %	0 %	0 %	159897071
11090	NC_009972	TATT	2	8	627833	627840	25 %	75 %	0 %	0 %	159897071
11091	NC_009972	TAT	2	6	627849	627854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897071
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11094	NC_009972	A	7	7	627928	627934	100 %	0 %	0 %	0 %	159897071
11095	NC_009972	ATC	2	6	627941	627946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897071
11096	NC_009972	A	6	6	627960	627965	100 %	0 %	0 %	0 %	159897071
11097	NC_009972	GAAA	2	8	628002	628009	75 %	0 %	25 %	0 %	159897071
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11100	NC_009972	ATA	2	6	628069	628074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159897071
11101	NC_009972	TCA	2	6	628580	628585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897072
11102	NC_009972	TCG	2	6	628629	628634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897072
11103	NC_009972	GCTT	2	8	628647	628654	0 %	50 %	25 %	25 %	159897072
11104	NC_009972	TCG	2	6	628731	628736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897072
11105	NC_009972	GTG	2	6	628791	628796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159897072
11106	NC_009972	GCTGG	2	10	628798	628807	0 %	20 %	60 %	20 %	159897072
11107	NC_009972	TA	3	6	628824	628829	50 %	50 %	0 %	0 %	159897072
11108	NC_009972	GAA	2	6	628880	628885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159897072
11109	NC_009972	GGCT	2	8	628896	628903	0 %	25 %	50 %	25 %	159897072
11110	NC_009972	TCA	2	6	628959	628964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159897072
11111	NC_009972	GTG	2	6	629072	629077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159897072
11112	NC_009972	CGC	2	6	629078	629083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159897072
11113	NC_009972	TCG	2	6	629117	629122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897072
11114	NC_009972	CAA	2	6	629147	629152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159897072
11115	NC_009972	GATC	2	8	629161	629168	25 %	25 %	25 %	25 %	159897072
11116	NC_009972	ATT	2	6	629213	629218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159897072
11117	NC_009972	CGC	2	6	629315	629320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159897072
11118	NC_009972	GCT	2	6	629368	629373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159897072
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11481	NC_009972	CAC	2	6	647683	647688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159897084
11482	NC_009972	GGTG	2	8	647727	647734	0 %	25 %	75 %	0 %	159897084
11483	NC_009972	GGCA	2	8	647770	647777	25 %	0 %	50 %	25 %	159897084
11484	NC_009972	CCG	2	6	647805	647810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159897084
11485	NC_009972	CGA	2	6	647872	647877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159897084
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