MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 29696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	GGGGA	2	10	397	406	20 %	0 %	80 %	0 %	148826758
2	NC_009567	ATT	2	6	421	426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826758
3	NC_009567	CAG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826758
4	NC_009567	GTT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826758
5	NC_009567	GTT	2	6	541	546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826758
6	NC_009567	A	7	7	650	656	100 %	0 %	0 %	0 %	148826759
7	NC_009567	TGG	3	9	841	849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
8	NC_009567	GGT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
9	NC_009567	GTA	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826759
10	NC_009567	GGT	2	6	884	889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
11	NC_009567	GCA	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826759
12	NC_009567	GAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826759
13	NC_009567	A	6	6	957	962	100 %	0 %	0 %	0 %	148826759
14	NC_009567	AAGA	2	8	995	1002	75 %	0 %	25 %	0 %	148826759
15	NC_009567	GTT	3	9	1019	1027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826759
16	NC_009567	CAG	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826759
17	NC_009567	TTG	2	6	1071	1076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826759
18	NC_009567	GGC	2	6	1079	1084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148826759
19	NC_009567	TGA	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826760
20	NC_009567	AAC	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826760
21	NC_009567	CTA	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
22	NC_009567	TCT	2	6	1693	1698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826760
23	NC_009567	TTA	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826760
24	NC_009567	CT	3	6	1734	1739	0 %	50 %	0 %	50 %	148826760
25	NC_009567	GTT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826760
26	NC_009567	AT	3	6	1835	1840	50 %	50 %	0 %	0 %	148826760
27	NC_009567	AAT	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826760
28	NC_009567	ATC	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
29	NC_009567	AAC	2	6	2015	2020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826760
30	NC_009567	TATT	2	8	2059	2066	25 %	75 %	0 %	0 %	148826760
31	NC_009567	TCT	2	6	2104	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826760
32	NC_009567	CAT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
33	NC_009567	TAA	2	6	2180	2185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826760
34	NC_009567	TA	3	6	2205	2210	50 %	50 %	0 %	0 %	148826760
35	NC_009567	A	6	6	2231	2236	100 %	0 %	0 %	0 %	148826760
36	NC_009567	AATT	2	8	2358	2365	50 %	50 %	0 %	0 %	148826761
37	NC_009567	T	7	7	2387	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	148826761
38	NC_009567	TAC	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826761
39	NC_009567	AAT	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826761
40	NC_009567	ACC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826761
41	NC_009567	A	6	6	2573	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	148826761
42	NC_009567	CAC	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826762
43	NC_009567	AAT	2	6	2911	2916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
44	NC_009567	ATTG	2	8	2933	2940	25 %	50 %	25 %	0 %	148826763
45	NC_009567	TTG	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
46	NC_009567	GAA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826763
47	NC_009567	GTT	2	6	3017	3022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
48	NC_009567	CATA	2	8	3095	3102	50 %	25 %	0 %	25 %	148826763
49	NC_009567	T	6	6	3134	3139	0 %	100 %	0 %	0 %	148826763
50	NC_009567	TTA	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826763
51	NC_009567	T	6	6	3196	3201	0 %	100 %	0 %	0 %	148826763
52	NC_009567	CAT	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826763
53	NC_009567	CTT	3	9	3245	3253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826763
54	NC_009567	AATGCT	2	12	3265	3276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826763
55	NC_009567	AAG	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826763
56	NC_009567	TGA	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
57	NC_009567	GTG	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826763
58	NC_009567	TGA	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
59	NC_009567	TGT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
60	NC_009567	TTG	2	6	3513	3518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
61	NC_009567	AGT	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
62	NC_009567	GC	3	6	3674	3679	0 %	0 %	50 %	50 %	148826763
63	NC_009567	TAA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
64	NC_009567	TGC	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826763
65	NC_009567	GCT	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826763
66	NC_009567	T	7	7	3981	3987	0 %	100 %	0 %	0 %	148826763
67	NC_009567	TG	3	6	4001	4006	0 %	50 %	50 %	0 %	148826763
68	NC_009567	CCA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826763
69	NC_009567	ATA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
70	NC_009567	CAA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826763
71	NC_009567	GCA	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826763
72	NC_009567	GATT	2	8	4298	4305	25 %	50 %	25 %	0 %	148826763
73	NC_009567	T	6	6	4304	4309	0 %	100 %	0 %	0 %	148826763
74	NC_009567	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826763
75	NC_009567	GC	3	6	4343	4348	0 %	0 %	50 %	50 %	148826763
76	NC_009567	GTT	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
77	NC_009567	TGAT	2	8	4387	4394	25 %	50 %	25 %	0 %	148826763
78	NC_009567	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
79	NC_009567	AAT	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
80	NC_009567	T	7	7	4459	4465	0 %	100 %	0 %	0 %	148826763
81	NC_009567	TAAA	2	8	4472	4479	75 %	25 %	0 %	0 %	148826763
82	NC_009567	TGG	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826763
83	NC_009567	GA	3	6	4521	4526	50 %	0 %	50 %	0 %	148826763
84	NC_009567	AC	3	6	4838	4843	50 %	0 %	0 %	50 %	148826764
85	NC_009567	CAA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826764
86	NC_009567	TAAA	2	8	4872	4879	75 %	25 %	0 %	0 %	148826764
87	NC_009567	CG	3	6	4901	4906	0 %	0 %	50 %	50 %	148826764
88	NC_009567	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148826764
89	NC_009567	ATG	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826764
90	NC_009567	TCA	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826764
91	NC_009567	ATA	2	6	5095	5100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
92	NC_009567	GCC	2	6	5148	5153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148826764
93	NC_009567	A	6	6	5200	5205	100 %	0 %	0 %	0 %	148826764
94	NC_009567	GATT	2	8	5207	5214	25 %	50 %	25 %	0 %	148826764
95	NC_009567	TCGGC	2	10	5245	5254	0 %	20 %	40 %	40 %	148826764
96	NC_009567	T	6	6	5298	5303	0 %	100 %	0 %	0 %	148826764
97	NC_009567	AAT	2	6	5318	5323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
98	NC_009567	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826764
99	NC_009567	CAC	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826764
100	NC_009567	ATT	2	6	5454	5459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
101	NC_009567	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	148826764
102	NC_009567	TAA	2	6	5505	5510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
103	NC_009567	CAA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826764
104	NC_009567	AAT	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
105	NC_009567	ATT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
106	NC_009567	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
107	NC_009567	ATT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
108	NC_009567	CAA	2	6	7307	7312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826765
109	NC_009567	ACC	2	6	7350	7355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
110	NC_009567	ATAA	2	8	7385	7392	75 %	25 %	0 %	0 %	148826765
111	NC_009567	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
112	NC_009567	TTC	2	6	7446	7451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826765
113	NC_009567	TAA	2	6	7557	7562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
114	NC_009567	TGC	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
115	NC_009567	T	6	6	7709	7714	0 %	100 %	0 %	0 %	148826765
116	NC_009567	TGC	2	6	7740	7745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
117	NC_009567	CTG	3	9	7769	7777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
118	NC_009567	CAT	2	6	7878	7883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
119	NC_009567	ACG	2	6	7923	7928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826765
120	NC_009567	AATT	2	8	7929	7936	50 %	50 %	0 %	0 %	148826765
121	NC_009567	T	6	6	7935	7940	0 %	100 %	0 %	0 %	148826765
122	NC_009567	CAC	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
123	NC_009567	ATA	2	6	8020	8025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
124	NC_009567	TCA	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
125	NC_009567	TTG	2	6	8100	8105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826765
126	NC_009567	GAAA	2	8	8148	8155	75 %	0 %	25 %	0 %	148826765
127	NC_009567	TAA	2	6	8189	8194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
128	NC_009567	TTA	2	6	8248	8253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
129	NC_009567	TAT	2	6	8261	8266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
130	NC_009567	ACC	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
131	NC_009567	ATA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
132	NC_009567	CAT	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
133	NC_009567	TAA	2	6	8352	8357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
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135	NC_009567	T	6	6	8559	8564	0 %	100 %	0 %	0 %	148826765
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