MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 30133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009566	CAAT	2	8	227142	227149	50 %	25 %	0 %	25 %	148825356
4002	NC_009566	AAC	2	6	227154	227159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825356
4003	NC_009566	CAC	2	6	227166	227171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825356
4004	NC_009566	TGAT	2	8	227187	227194	25 %	50 %	25 %	0 %	148825356
4005	NC_009566	CAA	2	6	227258	227263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825356
4006	NC_009566	AAAG	2	8	227270	227277	75 %	0 %	25 %	0 %	148825356
4007	NC_009566	AAT	2	6	227397	227402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825356
4008	NC_009566	ATG	2	6	227432	227437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825357
4009	NC_009566	ACA	2	6	227450	227455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825357
4010	NC_009566	ATT	2	6	227547	227552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825357
4011	NC_009566	CAA	2	6	227581	227586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825357
4012	NC_009566	AGA	2	6	227661	227666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825357
4013	NC_009566	CAGTGT	2	12	227684	227695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825357
4014	NC_009566	ATG	2	6	227696	227701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825357
4015	NC_009566	TGA	2	6	227705	227710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825357
4016	NC_009566	TTC	2	6	227735	227740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825357
4017	NC_009566	A	6	6	227845	227850	100 %	0 %	0 %	0 %	148825357
4018	NC_009566	CAA	2	6	227878	227883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825357
4019	NC_009566	ATT	2	6	227890	227895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825357
4020	NC_009566	TTG	2	6	227945	227950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825357
4021	NC_009566	TCT	2	6	227952	227957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825357
4022	NC_009566	GAA	2	6	227971	227976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825357
4023	NC_009566	CGC	2	6	228063	228068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148825357
4024	NC_009566	AGA	2	6	228078	228083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825357
4025	NC_009566	TGG	2	6	228117	228122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825357
4026	NC_009566	ATT	2	6	228141	228146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825357
4027	NC_009566	ATG	2	6	228164	228169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825357
4028	NC_009566	GAT	2	6	228199	228204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825357
4029	NC_009566	CAA	2	6	228254	228259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825357
4030	NC_009566	GAT	2	6	228375	228380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825358
4031	NC_009566	T	6	6	228411	228416	0 %	100 %	0 %	0 %	148825358
4032	NC_009566	T	6	6	228532	228537	0 %	100 %	0 %	0 %	148825358
4033	NC_009566	AGA	2	6	228594	228599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825358
4034	NC_009566	CTTT	2	8	228626	228633	0 %	75 %	0 %	25 %	148825358
4035	NC_009566	TGA	2	6	228717	228722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825358
4036	NC_009566	ATC	2	6	228745	228750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825358
4037	NC_009566	GTTT	2	8	228754	228761	0 %	75 %	25 %	0 %	148825358
4038	NC_009566	TAT	2	6	228773	228778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825358
4039	NC_009566	CTG	2	6	228793	228798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825358
4040	NC_009566	T	8	8	228800	228807	0 %	100 %	0 %	0 %	148825358
4041	NC_009566	ATT	2	6	228843	228848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825358
4042	NC_009566	ATTTT	2	10	228856	228865	20 %	80 %	0 %	0 %	148825358
4043	NC_009566	ATT	2	6	228870	228875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825358
4044	NC_009566	TG	3	6	228883	228888	0 %	50 %	50 %	0 %	148825358
4045	NC_009566	TGC	2	6	228891	228896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825358
4046	NC_009566	ATC	2	6	228991	228996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825358
4047	NC_009566	TAT	2	6	228999	229004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825358
4048	NC_009566	TTG	2	6	229025	229030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825358
4049	NC_009566	TAT	2	6	229045	229050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825358
4050	NC_009566	ATT	2	6	229092	229097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825358
4051	NC_009566	TTA	2	6	229135	229140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825358
4052	NC_009566	TAA	2	6	229146	229151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825358
4053	NC_009566	ATTG	2	8	229228	229235	25 %	50 %	25 %	0 %	148825359
4054	NC_009566	T	6	6	229386	229391	0 %	100 %	0 %	0 %	148825359
4055	NC_009566	GAAA	2	8	229414	229421	75 %	0 %	25 %	0 %	148825359
4056	NC_009566	AGA	2	6	229435	229440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825359
4057	NC_009566	TTGGT	2	10	229479	229488	0 %	60 %	40 %	0 %	148825359
4058	NC_009566	AACAG	2	10	229507	229516	60 %	0 %	20 %	20 %	148825359
4059	NC_009566	TTTG	2	8	229531	229538	0 %	75 %	25 %	0 %	148825359
4060	NC_009566	TCA	2	6	229558	229563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825359
4061	NC_009566	T	6	6	229599	229604	0 %	100 %	0 %	0 %	148825359
4062	NC_009566	TTA	2	6	229703	229708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825359
4063	NC_009566	TGG	3	9	229761	229769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825359
4064	NC_009566	CTTACT	2	12	229799	229810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148825359
4065	NC_009566	TAT	2	6	229915	229920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825359
4066	NC_009566	TCT	2	6	229921	229926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825359
4067	NC_009566	T	6	6	229937	229942	0 %	100 %	0 %	0 %	148825359
4068	NC_009566	CTAAGC	2	12	230075	230086	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825360
4069	NC_009566	GTG	2	6	230133	230138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825360
4070	NC_009566	TTG	2	6	230222	230227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825360
4071	NC_009566	AAT	2	6	230470	230475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825360
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4073	NC_009566	AAT	2	6	230614	230619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825360
4074	NC_009566	AT	3	6	230679	230684	50 %	50 %	0 %	0 %	148825360
4075	NC_009566	TTG	2	6	230705	230710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825360
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4079	NC_009566	TTG	2	6	230816	230821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825361
4080	NC_009566	T	7	7	231007	231013	0 %	100 %	0 %	0 %	148825361
4081	NC_009566	TTA	2	6	231030	231035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825361
4082	NC_009566	TCA	2	6	231051	231056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825361
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4084	NC_009566	CTT	2	6	231097	231102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825361
4085	NC_009566	AAGC	2	8	231112	231119	50 %	0 %	25 %	25 %	148825361
4086	NC_009566	AGGG	2	8	231177	231184	25 %	0 %	75 %	0 %	148825361
4087	NC_009566	T	6	6	231296	231301	0 %	100 %	0 %	0 %	148825361
4088	NC_009566	T	6	6	231336	231341	0 %	100 %	0 %	0 %	148825361
4089	NC_009566	TTG	2	6	231413	231418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825361
4090	NC_009566	CGG	2	6	231476	231481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148825361
4091	NC_009566	CAG	2	6	231493	231498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825361
4092	NC_009566	T	7	7	231525	231531	0 %	100 %	0 %	0 %	148825361
4093	NC_009566	A	6	6	231533	231538	100 %	0 %	0 %	0 %	148825361
4094	NC_009566	TTG	2	6	231545	231550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825361
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4098	NC_009566	CAAT	2	8	231735	231742	50 %	25 %	0 %	25 %	148825362
4099	NC_009566	GGC	2	6	231785	231790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148825362
4100	NC_009566	ATC	2	6	231828	231833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825362
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4102	NC_009566	CAT	2	6	232030	232035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825362
4103	NC_009566	CAA	2	6	232118	232123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825362
4104	NC_009566	CAA	2	6	232208	232213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825362
4105	NC_009566	AAC	2	6	232242	232247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825362
4106	NC_009566	AAC	2	6	232266	232271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825362
4107	NC_009566	TGC	2	6	232284	232289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825362
4108	NC_009566	GT	3	6	232304	232309	0 %	50 %	50 %	0 %	148825362
4109	NC_009566	CTG	2	6	232316	232321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825362
4110	NC_009566	ATC	2	6	232389	232394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825362
4111	NC_009566	AAC	2	6	232395	232400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825362
4112	NC_009566	CAA	2	6	232405	232410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825362
4113	NC_009566	AAT	2	6	232463	232468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825363
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4118	NC_009566	AAATC	2	10	232722	232731	60 %	20 %	0 %	20 %	148825363
4119	NC_009566	GTGC	2	8	232748	232755	0 %	25 %	50 %	25 %	148825363
4120	NC_009566	GTT	2	6	232767	232772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825363
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4122	NC_009566	TGC	2	6	232813	232818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825363
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4359	NC_009566	ACAG	2	8	247950	247957	50 %	0 %	25 %	25 %	148825378
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4490	NC_009566	CTT	2	6	254826	254831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825385
4491	NC_009566	CTT	2	6	254836	254841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825385
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4495	NC_009566	GTAAT	2	10	255015	255024	40 %	40 %	20 %	0 %	148825385
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