MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 30133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009566	TAT	2	6	30272	30277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825156
502	NC_009566	GTT	2	6	30371	30376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825156
503	NC_009566	TACAAT	2	12	30392	30403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825156
504	NC_009566	AATCC	2	10	30417	30426	40 %	20 %	0 %	40 %	148825156
505	NC_009566	TGA	2	6	30439	30444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825156
506	NC_009566	TTCC	2	8	30660	30667	0 %	50 %	0 %	50 %	148825157
507	NC_009566	A	6	6	30702	30707	100 %	0 %	0 %	0 %	148825157
508	NC_009566	GAC	2	6	30744	30749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825157
509	NC_009566	GCCACC	2	12	30778	30789	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148825157
510	NC_009566	GAA	2	6	30797	30802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825157
511	NC_009566	CCTA	2	8	30846	30853	25 %	25 %	0 %	50 %	148825157
512	NC_009566	TCG	2	6	31103	31108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825158
513	NC_009566	CAT	2	6	31127	31132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825158
514	NC_009566	AG	3	6	31236	31241	50 %	0 %	50 %	0 %	148825159
515	NC_009566	ATT	2	6	31264	31269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825159
516	NC_009566	TTC	2	6	31433	31438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825160
517	NC_009566	T	6	6	31484	31489	0 %	100 %	0 %	0 %	148825160
518	NC_009566	ACC	2	6	31526	31531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825160
519	NC_009566	TAA	2	6	31559	31564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825160
520	NC_009566	TGT	2	6	31739	31744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825160
521	NC_009566	TCA	2	6	31749	31754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825160
522	NC_009566	CAT	2	6	31771	31776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825160
523	NC_009566	GCC	2	6	31799	31804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148825160
524	NC_009566	GAA	2	6	31924	31929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825160
525	NC_009566	GGAA	2	8	31931	31938	50 %	0 %	50 %	0 %	148825160
526	NC_009566	ACG	2	6	32024	32029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825160
527	NC_009566	AACA	2	8	32126	32133	75 %	0 %	0 %	25 %	148825160
528	NC_009566	TCT	2	6	32142	32147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825160
529	NC_009566	AAT	2	6	32318	32323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825160
530	NC_009566	TTC	2	6	32358	32363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825160
531	NC_009566	TTG	3	9	32378	32386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825160
532	NC_009566	AAAT	2	8	32389	32396	75 %	25 %	0 %	0 %	148825160
533	NC_009566	A	6	6	32586	32591	100 %	0 %	0 %	0 %	148825161
534	NC_009566	A	6	6	32685	32690	100 %	0 %	0 %	0 %	148825161
535	NC_009566	TAT	2	6	32704	32709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825161
536	NC_009566	ATT	2	6	32726	32731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825161
537	NC_009566	ATG	2	6	32751	32756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825161
538	NC_009566	TGT	2	6	32759	32764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825161
539	NC_009566	ATT	2	6	32774	32779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825161
540	NC_009566	TGA	2	6	32830	32835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825161
541	NC_009566	AGT	2	6	32836	32841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825161
542	NC_009566	TAT	2	6	32849	32854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825161
543	NC_009566	TGA	2	6	32886	32891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825161
544	NC_009566	CA	3	6	32894	32899	50 %	0 %	0 %	50 %	148825161
545	NC_009566	TGA	2	6	32944	32949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825161
546	NC_009566	TC	3	6	33076	33081	0 %	50 %	0 %	50 %	148825162
547	NC_009566	T	6	6	33087	33092	0 %	100 %	0 %	0 %	148825162
548	NC_009566	CGA	2	6	33100	33105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825162
549	NC_009566	ATT	2	6	33129	33134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825162
550	NC_009566	T	6	6	33133	33138	0 %	100 %	0 %	0 %	148825162
551	NC_009566	TCT	2	6	33154	33159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825162
552	NC_009566	T	7	7	33161	33167	0 %	100 %	0 %	0 %	148825162
553	NC_009566	TTTCTT	2	12	33248	33259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148825162
554	NC_009566	TACT	2	8	33305	33312	25 %	50 %	0 %	25 %	148825162
555	NC_009566	CG	3	6	33315	33320	0 %	0 %	50 %	50 %	148825162
556	NC_009566	GTT	2	6	33324	33329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825162
557	NC_009566	ATC	2	6	33352	33357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825162
558	NC_009566	CTT	2	6	33419	33424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825162
559	NC_009566	ATT	2	6	33433	33438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825162
560	NC_009566	ATA	2	6	33856	33861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825163
561	NC_009566	CAG	2	6	33883	33888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825163
562	NC_009566	TCT	2	6	33897	33902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825163
563	NC_009566	ATG	2	6	33930	33935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825163
564	NC_009566	TGG	2	6	33986	33991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825163
565	NC_009566	TGG	2	6	34033	34038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825163
566	NC_009566	GGT	2	6	34140	34145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825163
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569	NC_009566	CGG	2	6	34298	34303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148825163
570	NC_009566	AGA	2	6	34367	34372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825163
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572	NC_009566	TATTGA	2	12	34562	34573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825163
573	NC_009566	GCG	2	6	34650	34655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148825163
574	NC_009566	TTA	2	6	34683	34688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825163
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576	NC_009566	ATT	2	6	34800	34805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825163
577	NC_009566	TTA	2	6	34974	34979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825163
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584	NC_009566	CAA	2	6	35270	35275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825163
585	NC_009566	ACC	2	6	35321	35326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825163
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588	NC_009566	CATT	2	8	35491	35498	25 %	50 %	0 %	25 %	148825163
589	NC_009566	A	6	6	35640	35645	100 %	0 %	0 %	0 %	148825163
590	NC_009566	CTTA	2	8	35714	35721	25 %	50 %	0 %	25 %	148825164
591	NC_009566	T	7	7	35732	35738	0 %	100 %	0 %	0 %	148825164
592	NC_009566	GAT	2	6	35785	35790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825164
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594	NC_009566	CCA	2	6	35849	35854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825164
595	NC_009566	AC	3	6	35897	35902	50 %	0 %	0 %	50 %	148825164
596	NC_009566	TCATT	2	10	35939	35948	20 %	60 %	0 %	20 %	148825164
597	NC_009566	TTATTT	2	12	35970	35981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148825164
598	NC_009566	TTA	2	6	35983	35988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825164
599	NC_009566	TAA	2	6	36050	36055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825164
600	NC_009566	T	6	6	36071	36076	0 %	100 %	0 %	0 %	148825164
601	NC_009566	TGC	2	6	36101	36106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825164
602	NC_009566	AAT	2	6	36119	36124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825164
603	NC_009566	ACTT	2	8	36147	36154	25 %	50 %	0 %	25 %	148825165
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607	NC_009566	GAA	2	6	36356	36361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825165
608	NC_009566	TTGA	2	8	36386	36393	25 %	50 %	25 %	0 %	148825165
609	NC_009566	CA	3	6	36406	36411	50 %	0 %	0 %	50 %	148825165
610	NC_009566	TTA	2	6	36417	36422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825165
611	NC_009566	TTA	2	6	36514	36519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825165
612	NC_009566	A	6	6	36545	36550	100 %	0 %	0 %	0 %	148825165
613	NC_009566	A	7	7	36565	36571	100 %	0 %	0 %	0 %	148825165
614	NC_009566	TGT	2	6	36682	36687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825165
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616	NC_009566	TGG	2	6	36717	36722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825165
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618	NC_009566	TGG	2	6	36888	36893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825165
619	NC_009566	ATTG	2	8	36933	36940	25 %	50 %	25 %	0 %	148825165
620	NC_009566	ATA	2	6	37023	37028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825166
621	NC_009566	A	7	7	37178	37184	100 %	0 %	0 %	0 %	148825166
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623	NC_009566	ACA	2	6	37214	37219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825166
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626	NC_009566	TAT	2	6	37447	37452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825166
627	NC_009566	A	6	6	37479	37484	100 %	0 %	0 %	0 %	148825166
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