MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008818	GAC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026907
2	NC_008818	TAG	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026907
3	NC_008818	GCT	3	9	983	991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
4	NC_008818	ATGG	2	8	1108	1115	25 %	25 %	50 %	0 %	124026907
5	NC_008818	TCC	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026907
6	NC_008818	TAT	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026907
7	NC_008818	CAA	2	6	1218	1223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026907
8	NC_008818	ATT	2	6	1229	1234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026907
9	NC_008818	TGC	2	6	1246	1251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
10	NC_008818	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
11	NC_008818	TCC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026907
12	NC_008818	GAG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026907
13	NC_008818	TGC	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
14	NC_008818	GA	3	6	1406	1411	50 %	0 %	50 %	0 %	124026907
15	NC_008818	TCC	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026907
16	NC_008818	TGC	2	6	1549	1554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
17	NC_008818	TAT	2	6	1555	1560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026907
18	NC_008818	CTG	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
19	NC_008818	CA	3	6	1667	1672	50 %	0 %	0 %	50 %	124026907
20	NC_008818	ACA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026907
21	NC_008818	CAG	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026907
22	NC_008818	GCG	2	6	3434	3439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026908
23	NC_008818	AAG	3	9	3463	3471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026908
24	NC_008818	GAG	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026908
25	NC_008818	GTT	2	6	3685	3690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026908
26	NC_008818	GA	3	6	3707	3712	50 %	0 %	50 %	0 %	124026908
27	NC_008818	GAG	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026908
28	NC_008818	GA	3	6	3738	3743	50 %	0 %	50 %	0 %	124026909
29	NC_008818	CTT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026909
30	NC_008818	ACT	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026909
31	NC_008818	TAC	2	6	3825	3830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026909
32	NC_008818	TGG	2	6	3835	3840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026909
33	NC_008818	CAA	2	6	3937	3942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026909
34	NC_008818	TGA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026909
35	NC_008818	TTG	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026909
36	NC_008818	CAT	2	6	4078	4083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026909
37	NC_008818	GGT	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026909
38	NC_008818	TA	3	6	4148	4153	50 %	50 %	0 %	0 %	124026909
39	NC_008818	GCA	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026909
40	NC_008818	AGGC	2	8	4209	4216	25 %	0 %	50 %	25 %	124026909
41	NC_008818	GCT	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026909
42	NC_008818	TAG	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026909
43	NC_008818	TGG	3	9	4294	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026909
44	NC_008818	CGT	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026909
45	NC_008818	AAG	2	6	4417	4422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026910
46	NC_008818	CTC	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026910
47	NC_008818	GCCTGT	2	12	4439	4450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026910
48	NC_008818	CTT	3	9	4481	4489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026910
49	NC_008818	CAGC	2	8	4600	4607	25 %	0 %	25 %	50 %	124026910
50	NC_008818	CCT	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026910
51	NC_008818	TCC	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026911
52	NC_008818	CAG	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026911
53	NC_008818	TCT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026911
54	NC_008818	GCTACG	2	12	4981	4992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124026911
55	NC_008818	CCT	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026911
56	NC_008818	TAT	2	6	5538	5543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026912
57	NC_008818	ATGG	2	8	5561	5568	25 %	25 %	50 %	0 %	124026912
58	NC_008818	TC	3	6	5609	5614	0 %	50 %	0 %	50 %	124026912
59	NC_008818	GGC	2	6	5616	5621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026912
60	NC_008818	GGT	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026912
61	NC_008818	TGC	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026912
62	NC_008818	GGA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026912
63	NC_008818	TTG	2	6	5683	5688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026912
64	NC_008818	GT	3	6	5763	5768	0 %	50 %	50 %	0 %	124026912
65	NC_008818	TGT	2	6	5872	5877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026912
66	NC_008818	TCC	3	9	6039	6047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026912
67	NC_008818	GAT	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026912
68	NC_008818	TG	3	6	6079	6084	0 %	50 %	50 %	0 %	124026912
69	NC_008818	CTC	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026912
70	NC_008818	TG	3	6	6275	6280	0 %	50 %	50 %	0 %	124026912
71	NC_008818	TTA	2	6	6286	6291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026912
72	NC_008818	GGC	2	6	6305	6310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026912
73	NC_008818	CTA	2	6	6319	6324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026912
74	NC_008818	AGT	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026912
75	NC_008818	CTT	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026912
76	NC_008818	G	6	6	6760	6765	0 %	0 %	100 %	0 %	124026912
77	NC_008818	GAG	2	6	6791	6796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026912
78	NC_008818	TCC	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026912
79	NC_008818	TGA	2	6	6956	6961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026913
80	NC_008818	TC	3	6	6982	6987	0 %	50 %	0 %	50 %	124026913
81	NC_008818	TCG	2	6	7098	7103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026913
82	NC_008818	AGT	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026913
83	NC_008818	AGACA	2	10	7318	7327	60 %	0 %	20 %	20 %	124026914
84	NC_008818	GTGC	2	8	7381	7388	0 %	25 %	50 %	25 %	124026914
85	NC_008818	GCC	2	6	7389	7394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026914
86	NC_008818	GTT	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026914
87	NC_008818	TC	3	6	7421	7426	0 %	50 %	0 %	50 %	124026914
88	NC_008818	CAG	2	6	7506	7511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026914
89	NC_008818	CGC	2	6	7528	7533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026914
90	NC_008818	GTT	2	6	7534	7539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026914
91	NC_008818	AGC	2	6	7563	7568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026914
92	NC_008818	TCC	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026914
93	NC_008818	AGT	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026914
94	NC_008818	GCA	3	9	7621	7629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026914
95	NC_008818	TA	3	6	7631	7636	50 %	50 %	0 %	0 %	124026914
96	NC_008818	AGC	2	6	7661	7666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026914
97	NC_008818	TTC	2	6	7675	7680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026914
98	NC_008818	AACA	2	8	7708	7715	75 %	0 %	0 %	25 %	124026914
99	NC_008818	GA	3	6	7723	7728	50 %	0 %	50 %	0 %	124026914
100	NC_008818	GAG	2	6	7762	7767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026914
101	NC_008818	GCC	2	6	7769	7774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026914
102	NC_008818	TGC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026914
103	NC_008818	TTG	2	6	7826	7831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026914
104	NC_008818	TGG	3	9	8066	8074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026915
105	NC_008818	TG	3	6	8075	8080	0 %	50 %	50 %	0 %	124026915
106	NC_008818	TG	3	6	8083	8088	0 %	50 %	50 %	0 %	124026915
107	NC_008818	AGT	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026915
108	NC_008818	GTG	2	6	8140	8145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026915
109	NC_008818	AGGT	2	8	8150	8157	25 %	25 %	50 %	0 %	124026915
110	NC_008818	AGT	2	6	8163	8168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026915
111	NC_008818	GTAC	2	8	8287	8294	25 %	25 %	25 %	25 %	124026915
112	NC_008818	CTG	2	6	8302	8307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026915
113	NC_008818	GCA	2	6	8343	8348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026915
114	NC_008818	GGT	2	6	8394	8399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026915
115	NC_008818	TG	3	6	8426	8431	0 %	50 %	50 %	0 %	124026915
116	NC_008818	CAA	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026916
117	NC_008818	CTT	2	6	8529	8534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026916
118	NC_008818	ATG	2	6	8562	8567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026916
119	NC_008818	TAT	2	6	8654	8659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026916
120	NC_008818	AGC	2	6	8760	8765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026916
121	NC_008818	TTG	2	6	8793	8798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026916
122	NC_008818	GTG	2	6	8875	8880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026916
123	NC_008818	TCC	2	6	8935	8940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026916
124	NC_008818	GTA	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026916
125	NC_008818	GCA	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026916
126	NC_008818	CTG	3	9	8977	8985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026916
127	NC_008818	GCT	4	12	8988	8999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026916
128	NC_008818	CAG	2	6	9023	9028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026916
129	NC_008818	CGT	2	6	9091	9096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026916
130	NC_008818	TAG	2	6	9138	9143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026916
131	NC_008818	ATT	2	6	9150	9155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026916
132	NC_008818	CCT	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026916
133	NC_008818	GGCT	2	8	9193	9200	0 %	25 %	50 %	25 %	124026916
134	NC_008818	CTC	2	6	9238	9243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026917
135	NC_008818	TCC	2	6	9246	9251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026917
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142	NC_008818	TC	3	6	9589	9594	0 %	50 %	0 %	50 %	124026917
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261	NC_008818	GCA	2	6	16773	16778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026924
262	NC_008818	TCGGGT	2	12	16795	16806	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	124026925
263	NC_008818	TCT	2	6	16835	16840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026925
264	NC_008818	GCATA	2	10	16939	16948	40 %	20 %	20 %	20 %	124026925
265	NC_008818	TCG	2	6	17042	17047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026925
266	NC_008818	ATGT	2	8	17071	17078	25 %	50 %	25 %	0 %	124026925
267	NC_008818	CT	3	6	17106	17111	0 %	50 %	0 %	50 %	124026925
268	NC_008818	ATT	2	6	17122	17127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026925
269	NC_008818	CTA	2	6	17174	17179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026925
270	NC_008818	TCG	2	6	17185	17190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026925
271	NC_008818	TA	3	6	17198	17203	50 %	50 %	0 %	0 %	124026925
272	NC_008818	TCT	2	6	17263	17268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026925
273	NC_008818	CAG	2	6	17282	17287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026925
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275	NC_008818	CAA	2	6	17423	17428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026925
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279	NC_008818	TC	3	6	17731	17736	0 %	50 %	0 %	50 %	124026926
280	NC_008818	CTC	2	6	17742	17747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026926
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282	NC_008818	TCG	2	6	17918	17923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026926
283	NC_008818	AGT	2	6	17927	17932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026926
284	NC_008818	TAG	2	6	17943	17948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026926
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286	NC_008818	TAGCC	2	10	18086	18095	20 %	20 %	20 %	40 %	124026926
287	NC_008818	CCT	2	6	18124	18129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026926
288	NC_008818	TGT	2	6	18297	18302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026926
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291	NC_008818	TGCG	2	8	18453	18460	0 %	25 %	50 %	25 %	124026926
292	NC_008818	CGTTC	2	10	18583	18592	0 %	40 %	20 %	40 %	124026926
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300	NC_008818	CTATGC	2	12	19266	19277	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124026928
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