MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008818	CAGC	2	8	230529	230536	25 %	0 %	25 %	50 %	124027140
4002	NC_008818	GCA	2	6	230540	230545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027140
4003	NC_008818	GCG	2	6	230546	230551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027140
4004	NC_008818	CCT	2	6	230569	230574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027140
4005	NC_008818	GCCAG	2	10	230609	230618	20 %	0 %	40 %	40 %	124027140
4006	NC_008818	GGGCCT	2	12	232380	232391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124027141
4007	NC_008818	CTT	2	6	232448	232453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027141
4008	NC_008818	CTA	2	6	232514	232519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027141
4009	NC_008818	GAG	3	9	232551	232559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027141
4010	NC_008818	CTA	2	6	232571	232576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027141
4011	NC_008818	AGG	2	6	232603	232608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027141
4012	NC_008818	CCG	2	6	232800	232805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027141
4013	NC_008818	GGC	2	6	232908	232913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027141
4014	NC_008818	AGC	2	6	233061	233066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027142
4015	NC_008818	AAG	2	6	233078	233083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027142
4016	NC_008818	CAT	2	6	233092	233097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027142
4017	NC_008818	CT	3	6	233100	233105	0 %	50 %	0 %	50 %	124027142
4018	NC_008818	ACC	2	6	233106	233111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027142
4019	NC_008818	CGA	2	6	233131	233136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027142
4020	NC_008818	GT	3	6	233170	233175	0 %	50 %	50 %	0 %	124027142
4021	NC_008818	TAT	2	6	233267	233272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027142
4022	NC_008818	CTG	2	6	233278	233283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027142
4023	NC_008818	AGT	2	6	233296	233301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027142
4024	NC_008818	GGCA	2	8	233348	233355	25 %	0 %	50 %	25 %	124027142
4025	NC_008818	GTG	2	6	233383	233388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027142
4026	NC_008818	TGC	2	6	233390	233395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027142
4027	NC_008818	CAG	2	6	233413	233418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027142
4028	NC_008818	CTG	2	6	233419	233424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027142
4029	NC_008818	GCG	2	6	233427	233432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027142
4030	NC_008818	TGC	2	6	233441	233446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027142
4031	NC_008818	CAGC	2	8	233646	233653	25 %	0 %	25 %	50 %	124027142
4032	NC_008818	CAG	2	6	233732	233737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027142
4033	NC_008818	CTT	2	6	233844	233849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027143
4034	NC_008818	AAC	2	6	233854	233859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027143
4035	NC_008818	TA	3	6	233862	233867	50 %	50 %	0 %	0 %	124027143
4036	NC_008818	AGT	2	6	233939	233944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027143
4037	NC_008818	GGC	2	6	233946	233951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027143
4038	NC_008818	AACCC	2	10	233995	234004	40 %	0 %	0 %	60 %	124027143
4039	NC_008818	AGC	2	6	234012	234017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027143
4040	NC_008818	TGC	2	6	234036	234041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027143
4041	NC_008818	CCT	2	6	234053	234058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027143
4042	NC_008818	GGC	3	9	234161	234169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027143
4043	NC_008818	AGT	2	6	234334	234339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027143
4044	NC_008818	GCC	2	6	234378	234383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027143
4045	NC_008818	AGC	2	6	234399	234404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027143
4046	NC_008818	AGG	2	6	234413	234418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027143
4047	NC_008818	TCG	2	6	234436	234441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027143
4048	NC_008818	TAGGC	2	10	234481	234490	20 %	20 %	40 %	20 %	124027143
4049	NC_008818	ACCA	2	8	234501	234508	50 %	0 %	0 %	50 %	124027143
4050	NC_008818	GCT	2	6	234532	234537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027143
4051	NC_008818	C	7	7	234573	234579	0 %	0 %	0 %	100 %	124027143
4052	NC_008818	TGG	2	6	234582	234587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027143
4053	NC_008818	CTC	2	6	234728	234733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027144
4054	NC_008818	GCA	2	6	234770	234775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027144
4055	NC_008818	G	6	6	234862	234867	0 %	0 %	100 %	0 %	124027144
4056	NC_008818	GCC	2	6	234871	234876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027144
4057	NC_008818	ACT	2	6	234905	234910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027144
4058	NC_008818	CT	3	6	235030	235035	0 %	50 %	0 %	50 %	124027144
4059	NC_008818	CGC	2	6	235186	235191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027144
4060	NC_008818	ACC	2	6	235232	235237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027144
4061	NC_008818	GTG	2	6	235256	235261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027144
4062	NC_008818	GCG	3	9	235513	235521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027144
4063	NC_008818	CGG	2	6	235535	235540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027144
4064	NC_008818	CT	3	6	235612	235617	0 %	50 %	0 %	50 %	124027144
4065	NC_008818	CGC	3	9	235650	235658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027144
4066	NC_008818	TCA	2	6	235676	235681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027144
4067	NC_008818	CGT	2	6	235704	235709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027144
4068	NC_008818	A	6	6	235780	235785	100 %	0 %	0 %	0 %	124027145
4069	NC_008818	TCT	2	6	235876	235881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027145
4070	NC_008818	TCC	2	6	236094	236099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027145
4071	NC_008818	TCC	2	6	236250	236255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027145
4072	NC_008818	CT	4	8	236320	236327	0 %	50 %	0 %	50 %	124027145
4073	NC_008818	GCTC	2	8	236467	236474	0 %	25 %	25 %	50 %	124027145
4074	NC_008818	CCCT	2	8	236621	236628	0 %	25 %	0 %	75 %	124027146
4075	NC_008818	TGCC	2	8	236710	236717	0 %	25 %	25 %	50 %	124027146
4076	NC_008818	GCG	2	6	236734	236739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027146
4077	NC_008818	GT	3	6	236752	236757	0 %	50 %	50 %	0 %	124027146
4078	NC_008818	CTG	2	6	236902	236907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027146
4079	NC_008818	GT	3	6	236913	236918	0 %	50 %	50 %	0 %	124027146
4080	NC_008818	GTA	2	6	236986	236991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027146
4081	NC_008818	TAA	2	6	237019	237024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027146
4082	NC_008818	CGC	2	6	237052	237057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027146
4083	NC_008818	CTC	2	6	237062	237067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027146
4084	NC_008818	AGC	2	6	237069	237074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027146
4085	NC_008818	CTCAGC	2	12	237080	237091	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124027146
4086	NC_008818	G	6	6	237121	237126	0 %	0 %	100 %	0 %	124027146
4087	NC_008818	CCG	2	6	237196	237201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027146
4088	NC_008818	GAA	2	6	237299	237304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027146
4089	NC_008818	TC	3	6	237375	237380	0 %	50 %	0 %	50 %	124027146
4090	NC_008818	TACA	2	8	237609	237616	50 %	25 %	0 %	25 %	124027147
4091	NC_008818	GAC	2	6	237634	237639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027147
4092	NC_008818	GCG	2	6	237662	237667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027147
4093	NC_008818	CCT	2	6	237722	237727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027147
4094	NC_008818	CTA	2	6	237762	237767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027147
4095	NC_008818	ACC	2	6	237776	237781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027147
4096	NC_008818	GCA	2	6	237826	237831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027147
4097	NC_008818	CTC	2	6	237834	237839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027147
4098	NC_008818	GTG	2	6	237844	237849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027147
4099	NC_008818	ACT	2	6	237881	237886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027147
4100	NC_008818	GGC	2	6	237904	237909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027147
4101	NC_008818	GAG	2	6	237975	237980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027147
4102	NC_008818	GA	3	6	237985	237990	50 %	0 %	50 %	0 %	124027147
4103	NC_008818	CAA	2	6	238004	238009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027147
4104	NC_008818	GCT	2	6	238011	238016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027147
4105	NC_008818	AGC	2	6	238017	238022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027147
4106	NC_008818	ATGGGG	2	12	238075	238086	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	124027147
4107	NC_008818	CGG	2	6	238090	238095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027147
4108	NC_008818	GAG	2	6	238096	238101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027147
4109	NC_008818	G	6	6	238115	238120	0 %	0 %	100 %	0 %	124027147
4110	NC_008818	TGG	2	6	238160	238165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027147
4111	NC_008818	GTG	2	6	238195	238200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027147
4112	NC_008818	AG	3	6	238209	238214	50 %	0 %	50 %	0 %	124027147
4113	NC_008818	GCA	2	6	238261	238266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027147
4114	NC_008818	CTG	2	6	238328	238333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027147
4115	NC_008818	GGA	2	6	238374	238379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027147
4116	NC_008818	GGA	2	6	238425	238430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027148
4117	NC_008818	TGC	3	9	238524	238532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027148
4118	NC_008818	AAC	2	6	238533	238538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027148
4119	NC_008818	GAG	2	6	238554	238559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027148
4120	NC_008818	TAT	2	6	238656	238661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027148
4121	NC_008818	AT	3	6	238694	238699	50 %	50 %	0 %	0 %	124027148
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4362	NC_008818	GCT	2	6	251507	251512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027162
4363	NC_008818	TCG	2	6	251529	251534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027162
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4481	NC_008818	TGC	2	6	259152	259157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027170
4482	NC_008818	GGGCC	2	10	259172	259181	0 %	0 %	60 %	40 %	124027170
4483	NC_008818	GTC	2	6	259189	259194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027170
4484	NC_008818	AGT	2	6	259221	259226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027170
4485	NC_008818	CTT	2	6	259359	259364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027170
4486	NC_008818	AGC	2	6	259424	259429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027170
4487	NC_008818	CTGG	2	8	259496	259503	0 %	25 %	50 %	25 %	124027170
4488	NC_008818	CGA	2	6	259530	259535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027170
4489	NC_008818	GCA	2	6	259618	259623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027170
4490	NC_008818	CAGC	2	8	259884	259891	25 %	0 %	25 %	50 %	124027171
4491	NC_008818	CCCG	2	8	259924	259931	0 %	0 %	25 %	75 %	124027171
4492	NC_008818	CTC	3	9	260004	260012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027171
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4494	NC_008818	TGCC	2	8	260071	260078	0 %	25 %	25 %	50 %	124027171
4495	NC_008818	CGG	2	6	260112	260117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027171
4496	NC_008818	CTT	2	6	260121	260126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027171
4497	NC_008818	CGT	2	6	260267	260272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027171
4498	NC_008818	CT	3	6	260317	260322	0 %	50 %	0 %	50 %	124027171
4499	NC_008818	CAG	2	6	260402	260407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027171
4500	NC_008818	GAC	2	6	260418	260423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027171

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