MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008818	TACT	2	8	201382	201389	25 %	50 %	0 %	25 %	124027115
3502	NC_008818	GT	3	6	201397	201402	0 %	50 %	50 %	0 %	124027115
3503	NC_008818	CTA	2	6	201404	201409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027115
3504	NC_008818	CTC	2	6	201471	201476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3505	NC_008818	TTC	2	6	201523	201528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027115
3506	NC_008818	TCC	2	6	201530	201535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3507	NC_008818	CGT	2	6	201550	201555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3508	NC_008818	CTC	2	6	201748	201753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3509	NC_008818	GCA	2	6	201754	201759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3510	NC_008818	GGCT	2	8	201770	201777	0 %	25 %	50 %	25 %	124027115
3511	NC_008818	TCT	2	6	201791	201796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027115
3512	NC_008818	CAC	2	6	201828	201833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027115
3513	NC_008818	GCT	2	6	201879	201884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3514	NC_008818	CAGGC	2	10	201979	201988	20 %	0 %	40 %	40 %	124027115
3515	NC_008818	GCG	2	6	201998	202003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027115
3516	NC_008818	C	6	6	202030	202035	0 %	0 %	0 %	100 %	124027115
3517	NC_008818	CAG	2	6	202037	202042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3518	NC_008818	GCC	2	6	202173	202178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027115
3519	NC_008818	AGC	2	6	202182	202187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3520	NC_008818	GAG	2	6	202191	202196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027115
3521	NC_008818	GAA	2	6	202263	202268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027115
3522	NC_008818	TTG	2	6	202288	202293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027115
3523	NC_008818	CAG	2	6	202308	202313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3524	NC_008818	GAG	2	6	202401	202406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027115
3525	NC_008818	CTC	2	6	202422	202427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3526	NC_008818	CCA	2	6	202448	202453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027115
3527	NC_008818	TCC	2	6	202463	202468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3528	NC_008818	ACT	2	6	202504	202509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027115
3529	NC_008818	TCC	2	6	202553	202558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3530	NC_008818	TCC	2	6	202612	202617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3531	NC_008818	GTC	2	6	202632	202637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3532	NC_008818	CA	3	6	202657	202662	50 %	0 %	0 %	50 %	124027115
3533	NC_008818	TCC	2	6	202663	202668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3534	NC_008818	GCA	2	6	202673	202678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3535	NC_008818	CTC	2	6	202749	202754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3536	NC_008818	GCC	2	6	202771	202776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027115
3537	NC_008818	CCT	2	6	202785	202790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3538	NC_008818	CAG	2	6	202812	202817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3539	NC_008818	GTGC	2	8	202847	202854	0 %	25 %	50 %	25 %	124027115
3540	NC_008818	AGCGT	2	10	202947	202956	20 %	20 %	40 %	20 %	124027115
3541	NC_008818	CT	3	6	202960	202965	0 %	50 %	0 %	50 %	124027115
3542	NC_008818	GTA	2	6	202995	203000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027115
3543	NC_008818	CCG	2	6	203081	203086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027115
3544	NC_008818	AGCC	2	8	203270	203277	25 %	0 %	25 %	50 %	124027115
3545	NC_008818	GCC	2	6	203324	203329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027115
3546	NC_008818	ACT	2	6	203337	203342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027115
3547	NC_008818	CCG	2	6	203364	203369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027115
3548	NC_008818	CTC	2	6	203385	203390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3549	NC_008818	CTC	2	6	203395	203400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3550	NC_008818	CTC	2	6	203403	203408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3551	NC_008818	CTC	2	6	203427	203432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3552	NC_008818	TCC	2	6	203441	203446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3553	NC_008818	CCT	2	6	203451	203456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3554	NC_008818	CCT	2	6	203459	203464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3555	NC_008818	CTG	2	6	203496	203501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3556	NC_008818	GCTGGA	2	12	203567	203578	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124027115
3557	NC_008818	CGT	2	6	203672	203677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027115
3558	NC_008818	TACGAA	2	12	203679	203690	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	124027115
3559	NC_008818	CTC	2	6	203787	203792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027115
3560	NC_008818	CTT	2	6	203811	203816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027115
3561	NC_008818	CGGG	2	8	203854	203861	0 %	0 %	75 %	25 %	124027115
3562	NC_008818	GGC	2	6	204018	204023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027115
3563	NC_008818	GC	3	6	204065	204070	0 %	0 %	50 %	50 %	124027115
3564	NC_008818	CCTC	2	8	204122	204129	0 %	25 %	0 %	75 %	124027115
3565	NC_008818	GGAC	2	8	204206	204213	25 %	0 %	50 %	25 %	124027115
3566	NC_008818	ATC	2	6	204270	204275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027115
3567	NC_008818	GCC	2	6	204285	204290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027115
3568	NC_008818	GCCCC	2	10	204331	204340	0 %	0 %	20 %	80 %	124027115
3569	NC_008818	TTC	2	6	204346	204351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027115
3570	NC_008818	GCC	3	9	205434	205442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027116
3571	NC_008818	AGT	2	6	205450	205455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027116
3572	NC_008818	TGG	3	9	205487	205495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027116
3573	NC_008818	CAC	2	6	205512	205517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027116
3574	NC_008818	TGCT	2	8	205532	205539	0 %	50 %	25 %	25 %	124027116
3575	NC_008818	CGC	2	6	205610	205615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027116
3576	NC_008818	GT	3	6	205653	205658	0 %	50 %	50 %	0 %	124027116
3577	NC_008818	CGA	2	6	205706	205711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027116
3578	NC_008818	TCA	2	6	205744	205749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027116
3579	NC_008818	GTCAT	2	10	205768	205777	20 %	40 %	20 %	20 %	124027116
3580	NC_008818	GGC	2	6	206039	206044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027117
3581	NC_008818	ATC	2	6	206067	206072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027117
3582	NC_008818	CGGGC	2	10	206112	206121	0 %	0 %	60 %	40 %	124027117
3583	NC_008818	GAG	2	6	206269	206274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027117
3584	NC_008818	GTG	2	6	206411	206416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027117
3585	NC_008818	GTG	3	9	206485	206493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027117
3586	NC_008818	AGC	2	6	206532	206537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027117
3587	NC_008818	GTG	2	6	206658	206663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027117
3588	NC_008818	GCCAC	2	10	206712	206721	20 %	0 %	20 %	60 %	124027117
3589	NC_008818	TAGC	2	8	206828	206835	25 %	25 %	25 %	25 %	124027117
3590	NC_008818	CGGA	2	8	206897	206904	25 %	0 %	50 %	25 %	124027117
3591	NC_008818	CGA	2	6	206988	206993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027117
3592	NC_008818	GGC	2	6	207010	207015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027117
3593	NC_008818	ATC	2	6	207137	207142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027118
3594	NC_008818	AGC	2	6	207206	207211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3595	NC_008818	TCA	2	6	207318	207323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027118
3596	NC_008818	CGT	2	6	207324	207329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3597	NC_008818	ATG	2	6	207356	207361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027118
3598	NC_008818	TAT	2	6	207373	207378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027118
3599	NC_008818	AGC	2	6	207445	207450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3600	NC_008818	CCG	2	6	207526	207531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027118
3601	NC_008818	TCC	2	6	207575	207580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027118
3602	NC_008818	GCT	2	6	207593	207598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3603	NC_008818	AGC	2	6	207662	207667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3604	NC_008818	CAG	2	6	207703	207708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3605	NC_008818	TCT	2	6	207777	207782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027118
3606	NC_008818	CGA	2	6	207858	207863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3607	NC_008818	C	6	6	207879	207884	0 %	0 %	0 %	100 %	124027118
3608	NC_008818	ACA	2	6	207974	207979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027118
3609	NC_008818	CTA	2	6	207981	207986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027118
3610	NC_008818	TTC	2	6	208031	208036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027118
3611	NC_008818	CAA	2	6	208080	208085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027118
3612	NC_008818	GGC	2	6	208137	208142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027118
3613	NC_008818	CTC	2	6	208148	208153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027118
3614	NC_008818	ATC	2	6	208178	208183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027118
3615	NC_008818	CAC	2	6	208184	208189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027118
3616	NC_008818	GCT	2	6	208192	208197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3617	NC_008818	CGG	2	6	208198	208203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027118
3618	NC_008818	GAA	2	6	208213	208218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027118
3619	NC_008818	CAG	2	6	208234	208239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3620	NC_008818	GGT	2	6	208269	208274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027118
3621	NC_008818	GAT	2	6	208282	208287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027118
3622	NC_008818	AGC	2	6	208288	208293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027118
3623	NC_008818	TGC	2	6	208387	208392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027118
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3724	NC_008818	GTATG	2	10	214144	214153	20 %	40 %	40 %	0 %	124027123
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3733	NC_008818	GCT	2	6	214828	214833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027124
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3863	NC_008818	TCG	2	6	222544	222549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027132
3864	NC_008818	GCC	2	6	222609	222614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027132
3865	NC_008818	CT	3	6	222630	222635	0 %	50 %	0 %	50 %	124027132
3866	NC_008818	TCT	2	6	222640	222645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027132
3867	NC_008818	GTC	2	6	222771	222776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027133
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3874	NC_008818	GTA	2	6	223293	223298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027133
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3881	NC_008818	AGC	2	6	223579	223584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027133
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3896	NC_008818	CCT	2	6	224590	224595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027134
3897	NC_008818	GCA	2	6	224596	224601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027134
3898	NC_008818	GAG	2	6	224657	224662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027134
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3975	NC_008818	TCCTC	2	10	229344	229353	0 %	40 %	0 %	60 %	124027140
3976	NC_008818	TATGT	2	10	229418	229427	20 %	60 %	20 %	0 %	124027140
3977	NC_008818	TAG	2	6	229458	229463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027140
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3982	NC_008818	CGGCT	2	10	229735	229744	0 %	20 %	40 %	40 %	124027140
3983	NC_008818	ATG	2	6	229831	229836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027140
3984	NC_008818	AGC	2	6	229907	229912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027140
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3986	NC_008818	CTA	2	6	229983	229988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027140
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3988	NC_008818	TCCTC	2	10	230064	230073	0 %	40 %	0 %	60 %	124027140
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3991	NC_008818	GTG	2	6	230223	230228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027140
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3993	NC_008818	TAT	2	6	230302	230307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027140
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3995	NC_008818	TCC	2	6	230351	230356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027140
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3999	NC_008818	TCA	2	6	230456	230461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027140
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