MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_008818	AGG	2	6	1658558	1658563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028506
28002	NC_008818	GCT	2	6	1658621	1658626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028506
28003	NC_008818	GCTT	2	8	1658643	1658650	0 %	50 %	25 %	25 %	124028506
28004	NC_008818	AC	3	6	1658709	1658714	50 %	0 %	0 %	50 %	124028506
28005	NC_008818	TGAGC	2	10	1658815	1658824	20 %	20 %	40 %	20 %	124028506
28006	NC_008818	CTT	2	6	1658828	1658833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028506
28007	NC_008818	GAG	3	9	1658839	1658847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028506
28008	NC_008818	GAG	2	6	1658875	1658880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028506
28009	NC_008818	CAA	2	6	1658979	1658984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028506
28010	NC_008818	CGG	2	6	1658990	1658995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028506
28011	NC_008818	ACC	2	6	1659010	1659015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028506
28012	NC_008818	GCA	2	6	1659053	1659058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028506
28013	NC_008818	GAA	2	6	1659078	1659083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028506
28014	NC_008818	GGCA	2	8	1659088	1659095	25 %	0 %	50 %	25 %	124028506
28015	NC_008818	GCC	3	9	1659106	1659114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028506
28016	NC_008818	CAA	2	6	1659132	1659137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028506
28017	NC_008818	CTA	2	6	1659302	1659307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028507
28018	NC_008818	AC	3	6	1659320	1659325	50 %	0 %	0 %	50 %	124028507
28019	NC_008818	AGA	2	6	1659331	1659336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028507
28020	NC_008818	GA	3	6	1659374	1659379	50 %	0 %	50 %	0 %	124028507
28021	NC_008818	CTA	2	6	1659401	1659406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028507
28022	NC_008818	GCCA	2	8	1659438	1659445	25 %	0 %	25 %	50 %	124028507
28023	NC_008818	AGC	2	6	1659457	1659462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028507
28024	NC_008818	CTT	2	6	1659496	1659501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028507
28025	NC_008818	GA	3	6	1659514	1659519	50 %	0 %	50 %	0 %	124028507
28026	NC_008818	GGA	2	6	1659566	1659571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028507
28027	NC_008818	TAG	2	6	1659801	1659806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028507
28028	NC_008818	CAG	2	6	1659813	1659818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028507
28029	NC_008818	AGG	2	6	1659840	1659845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028507
28030	NC_008818	AAT	2	6	1659856	1659861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028507
28031	NC_008818	CTC	2	6	1659968	1659973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028507
28032	NC_008818	GA	3	6	1659987	1659992	50 %	0 %	50 %	0 %	124028507
28033	NC_008818	GAG	2	6	1660028	1660033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028507
28034	NC_008818	GC	3	6	1660034	1660039	0 %	0 %	50 %	50 %	124028507
28035	NC_008818	ACT	2	6	1660051	1660056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028507
28036	NC_008818	ACA	2	6	1660115	1660120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028508
28037	NC_008818	CAG	2	6	1660161	1660166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028508
28038	NC_008818	CAA	2	6	1660224	1660229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028508
28039	NC_008818	CCT	2	6	1660275	1660280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028508
28040	NC_008818	CAA	2	6	1660281	1660286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028508
28041	NC_008818	CAA	2	6	1660297	1660302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028508
28042	NC_008818	GCT	2	6	1660311	1660316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028508
28043	NC_008818	CTC	2	6	1660360	1660365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028508
28044	NC_008818	ACC	2	6	1660397	1660402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028508

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.