MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_008818	CCA	2	6	1536693	1536698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028376
26002	NC_008818	ATGG	2	8	1536795	1536802	25 %	25 %	50 %	0 %	124028376
26003	NC_008818	AG	3	6	1536807	1536812	50 %	0 %	50 %	0 %	124028376
26004	NC_008818	AGG	2	6	1536930	1536935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028376
26005	NC_008818	AGC	2	6	1537012	1537017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028376
26006	NC_008818	CCT	2	6	1537083	1537088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028377
26007	NC_008818	CTC	2	6	1537096	1537101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028377
26008	NC_008818	CCT	2	6	1537129	1537134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028377
26009	NC_008818	AAG	2	6	1537135	1537140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028377
26010	NC_008818	TCT	2	6	1537164	1537169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028377
26011	NC_008818	TCG	2	6	1537208	1537213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028377
26012	NC_008818	AC	3	6	1537217	1537222	50 %	0 %	0 %	50 %	124028377
26013	NC_008818	ATT	2	6	1537265	1537270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028377
26014	NC_008818	CCG	2	6	1537310	1537315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028377
26015	NC_008818	AGA	2	6	1537328	1537333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028377
26016	NC_008818	CAATGC	2	12	1537599	1537610	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124028378
26017	NC_008818	GAG	2	6	1537693	1537698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028378
26018	NC_008818	TTG	2	6	1537700	1537705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028378
26019	NC_008818	TTG	2	6	1537754	1537759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028378
26020	NC_008818	TAC	2	6	1537798	1537803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028378
26021	NC_008818	CTA	2	6	1537814	1537819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028378
26022	NC_008818	TTG	2	6	1537832	1537837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028378
26023	NC_008818	GGT	2	6	1537876	1537881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028378
26024	NC_008818	GAG	2	6	1537945	1537950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028378
26025	NC_008818	AGG	2	6	1537996	1538001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028378
26026	NC_008818	CAA	2	6	1538015	1538020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028378
26027	NC_008818	CTA	2	6	1538120	1538125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028378
26028	NC_008818	GCT	2	6	1538140	1538145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028378
26029	NC_008818	AAG	2	6	1538215	1538220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028378
26030	NC_008818	CTTG	2	8	1538352	1538359	0 %	50 %	25 %	25 %	124028378
26031	NC_008818	CAT	2	6	1538406	1538411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028378
26032	NC_008818	AGC	2	6	1538412	1538417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028378
26033	NC_008818	GTC	2	6	1538452	1538457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028378
26034	NC_008818	AGC	2	6	1538461	1538466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028378
26035	NC_008818	CA	3	6	1538568	1538573	50 %	0 %	0 %	50 %	124028378
26036	NC_008818	GGC	2	6	1538605	1538610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028378
26037	NC_008818	TAG	2	6	1538651	1538656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028378
26038	NC_008818	CTA	2	6	1538731	1538736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028378
26039	NC_008818	CCA	2	6	1538783	1538788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028378
26040	NC_008818	GCC	2	6	1539047	1539052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028379
26041	NC_008818	GCA	2	6	1539088	1539093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028379
26042	NC_008818	GTA	2	6	1539122	1539127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028379
26043	NC_008818	TCA	2	6	1539155	1539160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028379
26044	NC_008818	CCA	2	6	1539189	1539194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028379
26045	NC_008818	CGA	2	6	1539202	1539207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028379
26046	NC_008818	ATG	2	6	1539216	1539221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028379
26047	NC_008818	AT	3	6	1539225	1539230	50 %	50 %	0 %	0 %	124028379
26048	NC_008818	GAT	2	6	1539266	1539271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028379
26049	NC_008818	ACC	2	6	1539308	1539313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028379
26050	NC_008818	TAA	2	6	1539322	1539327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028379
26051	NC_008818	ACT	2	6	1539377	1539382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028379
26052	NC_008818	AG	3	6	1539439	1539444	50 %	0 %	50 %	0 %	124028379
26053	NC_008818	ACA	2	6	1539522	1539527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028379
26054	NC_008818	GGA	2	6	1539613	1539618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028379
26055	NC_008818	GAG	2	6	1539653	1539658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028379
26056	NC_008818	CAT	2	6	1539706	1539711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028379
26057	NC_008818	ACT	2	6	1539801	1539806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028379
26058	NC_008818	AGCA	2	8	1539832	1539839	50 %	0 %	25 %	25 %	124028379
26059	NC_008818	TGG	2	6	1539881	1539886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028379
26060	NC_008818	TACG	2	8	1539905	1539912	25 %	25 %	25 %	25 %	124028379
26061	NC_008818	CGA	2	6	1539913	1539918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028379
26062	NC_008818	TGG	2	6	1539938	1539943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028379
26063	NC_008818	GAA	2	6	1539964	1539969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028379
26064	NC_008818	CTA	2	6	1540048	1540053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028379
26065	NC_008818	TA	3	6	1540052	1540057	50 %	50 %	0 %	0 %	124028379
26066	NC_008818	CA	3	6	1540239	1540244	50 %	0 %	0 %	50 %	124028379
26067	NC_008818	AAG	2	6	1541211	1541216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028380
26068	NC_008818	CGAG	2	8	1541233	1541240	25 %	0 %	50 %	25 %	124028380
26069	NC_008818	CTG	2	6	1541398	1541403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028380
26070	NC_008818	AG	3	6	1541406	1541411	50 %	0 %	50 %	0 %	124028380
26071	NC_008818	GA	3	6	1541426	1541431	50 %	0 %	50 %	0 %	124028380
26072	NC_008818	TGC	2	6	1542093	1542098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028381
26073	NC_008818	AGT	2	6	1542112	1542117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028381
26074	NC_008818	GCCT	2	8	1542210	1542217	0 %	25 %	25 %	50 %	124028381
26075	NC_008818	CGC	2	6	1542224	1542229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028381
26076	NC_008818	TGC	3	9	1542231	1542239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028381
26077	NC_008818	TAG	2	6	1542252	1542257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028381
26078	NC_008818	CTG	2	6	1542308	1542313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028381
26079	NC_008818	AGG	2	6	1542349	1542354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028381
26080	NC_008818	GCTG	2	8	1542468	1542475	0 %	25 %	50 %	25 %	124028381
26081	NC_008818	CAC	2	6	1542561	1542566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028381
26082	NC_008818	ACT	2	6	1542655	1542660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028381
26083	NC_008818	AGT	2	6	1542757	1542762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028381
26084	NC_008818	CCT	2	6	1542832	1542837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028381
26085	NC_008818	TC	3	6	1542909	1542914	0 %	50 %	0 %	50 %	124028381
26086	NC_008818	TAGC	2	8	1543033	1543040	25 %	25 %	25 %	25 %	124028381
26087	NC_008818	ACA	3	9	1543075	1543083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028381
26088	NC_008818	GC	3	6	1543090	1543095	0 %	0 %	50 %	50 %	124028381
26089	NC_008818	TCC	2	6	1543098	1543103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028381
26090	NC_008818	CGC	2	6	1543105	1543110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028381
26091	NC_008818	CCG	2	6	1543112	1543117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028381
26092	NC_008818	ACT	2	6	1543284	1543289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028382
26093	NC_008818	AC	3	6	1543290	1543295	50 %	0 %	0 %	50 %	124028382
26094	NC_008818	CCG	2	6	1543424	1543429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028382
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26096	NC_008818	TAA	2	6	1543452	1543457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028382
26097	NC_008818	AGA	2	6	1543518	1543523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028382
26098	NC_008818	CCG	2	6	1543636	1543641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028382
26099	NC_008818	AGC	2	6	1543722	1543727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028382
26100	NC_008818	GTA	2	6	1543730	1543735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028382
26101	NC_008818	CAC	2	6	1543786	1543791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028382
26102	NC_008818	ATC	2	6	1543805	1543810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028382
26103	NC_008818	AGC	2	6	1543836	1543841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028382
26104	NC_008818	ATA	2	6	1543865	1543870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028382
26105	NC_008818	TCA	2	6	1543872	1543877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028382
26106	NC_008818	AAT	2	6	1543921	1543926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028382
26107	NC_008818	CGAG	2	8	1543956	1543963	25 %	0 %	50 %	25 %	124028382
26108	NC_008818	CAA	2	6	1543972	1543977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028382
26109	NC_008818	CTACA	2	10	1544045	1544054	40 %	20 %	0 %	40 %	124028382
26110	NC_008818	GCCA	2	8	1544061	1544068	25 %	0 %	25 %	50 %	124028382
26111	NC_008818	CAC	2	6	1544082	1544087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028382
26112	NC_008818	CCA	2	6	1544150	1544155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028382
26113	NC_008818	CTC	2	6	1545519	1545524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028383
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26115	NC_008818	GTC	2	6	1545535	1545540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028383
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26230	NC_008818	GGA	2	6	1551838	1551843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028388
26231	NC_008818	GTA	2	6	1551866	1551871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028388
26232	NC_008818	GGC	2	6	1551872	1551877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028388
26233	NC_008818	GAGG	2	8	1551997	1552004	25 %	0 %	75 %	0 %	124028388
26234	NC_008818	GTT	2	6	1552115	1552120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028388
26235	NC_008818	GAAGCT	2	12	1552121	1552132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	124028388
26236	NC_008818	GAG	2	6	1552142	1552147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028388
26237	NC_008818	GGT	2	6	1552182	1552187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028388
26238	NC_008818	CTA	2	6	1552196	1552201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028388
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26242	NC_008818	CGT	2	6	1552330	1552335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028388
26243	NC_008818	GGCT	2	8	1552365	1552372	0 %	25 %	50 %	25 %	124028388
26244	NC_008818	CTCTAC	2	12	1552379	1552390	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	124028388
26245	NC_008818	ACC	2	6	1552410	1552415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028388
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26247	NC_008818	AGCT	2	8	1552518	1552525	25 %	25 %	25 %	25 %	124028388
26248	NC_008818	GGA	2	6	1552593	1552598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028388
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26250	NC_008818	GCA	2	6	1552662	1552667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028389
26251	NC_008818	TCG	2	6	1552770	1552775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028389
26252	NC_008818	CTC	2	6	1552802	1552807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028389
26253	NC_008818	CG	3	6	1552818	1552823	0 %	0 %	50 %	50 %	124028389
26254	NC_008818	TGCA	2	8	1552834	1552841	25 %	25 %	25 %	25 %	124028389
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26257	NC_008818	GGC	2	6	1553231	1553236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028390
26258	NC_008818	GCA	2	6	1553427	1553432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028390
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26261	NC_008818	CTAC	2	8	1553551	1553558	25 %	25 %	0 %	50 %	124028390
26262	NC_008818	CTG	3	9	1553586	1553594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028390
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26331	NC_008818	CCAC	2	8	1558737	1558744	25 %	0 %	0 %	75 %	124028393
26332	NC_008818	AGG	2	6	1558854	1558859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028393
26333	NC_008818	CT	3	6	1558937	1558942	0 %	50 %	0 %	50 %	124028393
26334	NC_008818	CT	3	6	1558955	1558960	0 %	50 %	0 %	50 %	124028393
26335	NC_008818	CAT	2	6	1559018	1559023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028393
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26337	NC_008818	ACG	2	6	1559061	1559066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028393
26338	NC_008818	AGT	2	6	1559085	1559090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028393
26339	NC_008818	ATT	2	6	1559166	1559171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028393
26340	NC_008818	TGC	2	6	1559222	1559227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028393
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26343	NC_008818	GCT	3	9	1559274	1559282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028393
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