MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_008818	CGT	2	6	1425839	1425844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028270
24002	NC_008818	TGC	2	6	1425851	1425856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028270
24003	NC_008818	TTA	2	6	1426202	1426207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028271
24004	NC_008818	CCT	2	6	1426223	1426228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028271
24005	NC_008818	CCT	2	6	1426243	1426248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028271
24006	NC_008818	AAC	2	6	1426335	1426340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028271
24007	NC_008818	GTC	2	6	1426346	1426351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028271
24008	NC_008818	CTA	2	6	1426363	1426368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028271
24009	NC_008818	GCA	2	6	1426390	1426395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028271
24010	NC_008818	CCT	2	6	1426613	1426618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028271
24011	NC_008818	CAA	2	6	1426688	1426693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028271
24012	NC_008818	TTG	2	6	1427007	1427012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028271
24013	NC_008818	ATGCTA	2	12	1427058	1427069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	124028271
24014	NC_008818	GAG	2	6	1427084	1427089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028271
24015	NC_008818	GA	3	6	1427099	1427104	50 %	0 %	50 %	0 %	124028271
24016	NC_008818	AGC	2	6	1427130	1427135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028271
24017	NC_008818	GAG	2	6	1427243	1427248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028271
24018	NC_008818	GTT	2	6	1427535	1427540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028272
24019	NC_008818	GCT	2	6	1427551	1427556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028272
24020	NC_008818	CCT	2	6	1427563	1427568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028272
24021	NC_008818	TAG	2	6	1427624	1427629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028272
24022	NC_008818	CAC	2	6	1427699	1427704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028272
24023	NC_008818	AGT	2	6	1427737	1427742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028272
24024	NC_008818	GCT	2	6	1427835	1427840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028272
24025	NC_008818	CTCGG	2	10	1427847	1427856	0 %	20 %	40 %	40 %	124028272
24026	NC_008818	ATG	2	6	1427898	1427903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028272
24027	NC_008818	TTA	2	6	1427911	1427916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028272
24028	NC_008818	AGT	2	6	1427923	1427928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028272
24029	NC_008818	CGC	2	6	1427932	1427937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028272
24030	NC_008818	GGA	2	6	1427938	1427943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028272
24031	NC_008818	TCC	2	6	1427988	1427993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028272
24032	NC_008818	AGCA	2	8	1428068	1428075	50 %	0 %	25 %	25 %	124028272
24033	NC_008818	GAT	2	6	1428125	1428130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028272
24034	NC_008818	CCA	2	6	1428201	1428206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028272
24035	NC_008818	AGCCAC	2	12	1428224	1428235	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124028272
24036	NC_008818	CTAGC	2	10	1428395	1428404	20 %	20 %	20 %	40 %	124028273
24037	NC_008818	CCA	2	6	1428434	1428439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028273
24038	NC_008818	GCA	2	6	1428451	1428456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028273
24039	NC_008818	TAT	2	6	1428513	1428518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028273
24040	NC_008818	GTG	2	6	1428525	1428530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028273
24041	NC_008818	AGC	3	9	1428624	1428632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028273
24042	NC_008818	GCC	2	6	1428663	1428668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028273
24043	NC_008818	CTT	2	6	1429200	1429205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24044	NC_008818	CAG	2	6	1429227	1429232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24045	NC_008818	TCT	2	6	1429238	1429243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24046	NC_008818	TTA	2	6	1429262	1429267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028274
24047	NC_008818	CTC	2	6	1429323	1429328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24048	NC_008818	ACG	2	6	1429330	1429335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24049	NC_008818	TTCC	2	8	1429356	1429363	0 %	50 %	0 %	50 %	124028274
24050	NC_008818	GCG	2	6	1429377	1429382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028274
24051	NC_008818	CT	3	6	1429389	1429394	0 %	50 %	0 %	50 %	124028274
24052	NC_008818	AGT	2	6	1429408	1429413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028274
24053	NC_008818	GCC	2	6	1429549	1429554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028274
24054	NC_008818	CCT	2	6	1429602	1429607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24055	NC_008818	TCT	2	6	1429655	1429660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24056	NC_008818	CCG	2	6	1429661	1429666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028274
24057	NC_008818	AGC	2	6	1429708	1429713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24058	NC_008818	GCG	2	6	1429831	1429836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028274
24059	NC_008818	ATAGT	2	10	1429854	1429863	40 %	40 %	20 %	0 %	124028274
24060	NC_008818	GGC	2	6	1429872	1429877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028274
24061	NC_008818	TCC	2	6	1429900	1429905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24062	NC_008818	CCA	2	6	1429952	1429957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028274
24063	NC_008818	CT	3	6	1429999	1430004	0 %	50 %	0 %	50 %	124028274
24064	NC_008818	TCC	2	6	1430059	1430064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24065	NC_008818	TTC	2	6	1430089	1430094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24066	NC_008818	CCT	2	6	1430172	1430177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24067	NC_008818	TCG	2	6	1430182	1430187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24068	NC_008818	AGG	2	6	1430224	1430229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028274
24069	NC_008818	TTC	2	6	1430254	1430259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24070	NC_008818	TCCA	2	8	1430260	1430267	25 %	25 %	0 %	50 %	124028274
24071	NC_008818	CTTGCT	2	12	1430292	1430303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	124028274
24072	NC_008818	TCT	2	6	1430306	1430311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24073	NC_008818	GGA	2	6	1430339	1430344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028274
24074	NC_008818	TAC	2	6	1430376	1430381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028274
24075	NC_008818	GTCTG	2	10	1430416	1430425	0 %	40 %	40 %	20 %	124028274
24076	NC_008818	TG	3	6	1430499	1430504	0 %	50 %	50 %	0 %	124028274
24077	NC_008818	ATCC	2	8	1430517	1430524	25 %	25 %	0 %	50 %	124028274
24078	NC_008818	CAA	2	6	1430531	1430536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028274
24079	NC_008818	TCA	2	6	1430552	1430557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028274
24080	NC_008818	CGC	3	9	1430558	1430566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028274
24081	NC_008818	ACG	2	6	1430671	1430676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24082	NC_008818	TGC	2	6	1430787	1430792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24083	NC_008818	CTTC	2	8	1430835	1430842	0 %	50 %	0 %	50 %	124028274
24084	NC_008818	GTA	2	6	1430883	1430888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028274
24085	NC_008818	CAG	2	6	1430911	1430916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24086	NC_008818	CAG	2	6	1430952	1430957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24087	NC_008818	CCA	2	6	1430978	1430983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028274
24088	NC_008818	TGCT	2	8	1430986	1430993	0 %	50 %	25 %	25 %	124028274
24089	NC_008818	CCT	2	6	1430996	1431001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24090	NC_008818	GCG	2	6	1431059	1431064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028274
24091	NC_008818	TCT	2	6	1431103	1431108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24092	NC_008818	TAC	2	6	1431132	1431137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028274
24093	NC_008818	CTC	2	6	1431147	1431152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24094	NC_008818	TG	3	6	1431180	1431185	0 %	50 %	50 %	0 %	124028274
24095	NC_008818	TCGTGG	2	12	1431193	1431204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	124028274
24096	NC_008818	TGG	2	6	1431208	1431213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028274
24097	NC_008818	CCT	2	6	1431221	1431226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24098	NC_008818	CGG	2	6	1431247	1431252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028274
24099	NC_008818	CCT	2	6	1431308	1431313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24100	NC_008818	CGC	2	6	1431356	1431361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028274
24101	NC_008818	TCG	2	6	1431385	1431390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24102	NC_008818	TAT	2	6	1431417	1431422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028274
24103	NC_008818	CGA	2	6	1431506	1431511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24104	NC_008818	GCT	2	6	1431537	1431542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028274
24105	NC_008818	TAC	2	6	1431573	1431578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028274
24106	NC_008818	GCG	2	6	1431579	1431584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028274
24107	NC_008818	TGA	2	6	1431620	1431625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028274
24108	NC_008818	GTCTC	2	10	1431656	1431665	0 %	40 %	20 %	40 %	124028274
24109	NC_008818	TAG	2	6	1431730	1431735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028274
24110	NC_008818	CTT	2	6	1431813	1431818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24111	NC_008818	CAGC	2	8	1431856	1431863	25 %	0 %	25 %	50 %	124028274
24112	NC_008818	CCTCAT	2	12	1431885	1431896	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	124028274
24113	NC_008818	CG	3	6	1431931	1431936	0 %	0 %	50 %	50 %	124028274
24114	NC_008818	GTTG	2	8	1431957	1431964	0 %	50 %	50 %	0 %	124028274
24115	NC_008818	TCC	2	6	1432006	1432011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028274
24116	NC_008818	CTT	3	9	1432017	1432025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028274
24117	NC_008818	AT	3	6	1432035	1432040	50 %	50 %	0 %	0 %	124028274
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24119	NC_008818	TAT	2	6	1432172	1432177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028275
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24228	NC_008818	AG	3	6	1438192	1438197	50 %	0 %	50 %	0 %	124028280
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24341	NC_008818	GCCA	2	8	1444703	1444710	25 %	0 %	25 %	50 %	124028287
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24458	NC_008818	TGC	2	6	1450886	1450891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028293
24459	NC_008818	GA	3	6	1450903	1450908	50 %	0 %	50 %	0 %	124028293
24460	NC_008818	CCT	2	6	1450942	1450947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028293
24461	NC_008818	TGG	2	6	1450966	1450971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028293
24462	NC_008818	AG	3	6	1451000	1451005	50 %	0 %	50 %	0 %	124028293
24463	NC_008818	GCG	2	6	1451047	1451052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028293
24464	NC_008818	CCT	2	6	1451146	1451151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028294
24465	NC_008818	CT	3	6	1451232	1451237	0 %	50 %	0 %	50 %	124028294
24466	NC_008818	CTC	2	6	1451315	1451320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028294
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24472	NC_008818	CGC	2	6	1451642	1451647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028294
24473	NC_008818	CCT	2	6	1451683	1451688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028294
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24477	NC_008818	CGG	2	6	1451825	1451830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028294
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24481	NC_008818	CCT	2	6	1451905	1451910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028294
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24483	NC_008818	CAT	2	6	1451932	1451937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028294
24484	NC_008818	GTC	2	6	1452005	1452010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028294
24485	NC_008818	GTC	2	6	1452101	1452106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028294
24486	NC_008818	CTG	2	6	1452154	1452159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028294
24487	NC_008818	AGCC	2	8	1452231	1452238	25 %	0 %	25 %	50 %	124028294
24488	NC_008818	TA	3	6	1452255	1452260	50 %	50 %	0 %	0 %	124028294
24489	NC_008818	CTT	2	6	1452278	1452283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028294
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24491	NC_008818	TCG	2	6	1452456	1452461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028294
24492	NC_008818	AGC	2	6	1452606	1452611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028294
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24494	NC_008818	GCA	2	6	1452679	1452684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028294
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