MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_008818	CCT	2	6	1368105	1368110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028225
23002	NC_008818	ATC	2	6	1368127	1368132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028225
23003	NC_008818	TCC	2	6	1368179	1368184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028225
23004	NC_008818	GGC	2	6	1368268	1368273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028225
23005	NC_008818	GTA	2	6	1368849	1368854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028226
23006	NC_008818	CGC	2	6	1368890	1368895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028226
23007	NC_008818	GC	3	6	1368925	1368930	0 %	0 %	50 %	50 %	124028226
23008	NC_008818	CCA	2	6	1368953	1368958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028226
23009	NC_008818	GCG	2	6	1368963	1368968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028226
23010	NC_008818	GATCAA	2	12	1369040	1369051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	124028226
23011	NC_008818	GGC	2	6	1369086	1369091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028226
23012	NC_008818	AGT	2	6	1369097	1369102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028226
23013	NC_008818	TGC	2	6	1369189	1369194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028226
23014	NC_008818	TAA	2	6	1369304	1369309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028226
23015	NC_008818	AGG	2	6	1369363	1369368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028226
23016	NC_008818	CAA	2	6	1369378	1369383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028226
23017	NC_008818	CAA	2	6	1369387	1369392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028226
23018	NC_008818	GTA	3	9	1369482	1369490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028226
23019	NC_008818	CTAC	2	8	1369499	1369506	25 %	25 %	0 %	50 %	124028226
23020	NC_008818	TGG	2	6	1369742	1369747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028227
23021	NC_008818	GAT	2	6	1369857	1369862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028227
23022	NC_008818	G	6	6	1369867	1369872	0 %	0 %	100 %	0 %	124028227
23023	NC_008818	TGT	2	6	1369999	1370004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028227
23024	NC_008818	ACT	2	6	1370032	1370037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028227
23025	NC_008818	CCG	2	6	1370094	1370099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028227
23026	NC_008818	CGG	2	6	1370106	1370111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028227
23027	NC_008818	CGC	2	6	1370121	1370126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028227
23028	NC_008818	TTC	2	6	1370127	1370132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028227
23029	NC_008818	TGT	2	6	1370150	1370155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028227
23030	NC_008818	AGC	2	6	1370287	1370292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028227
23031	NC_008818	AGC	2	6	1370306	1370311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028227
23032	NC_008818	GCTTAC	2	12	1370319	1370330	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124028227
23033	NC_008818	AGC	2	6	1370480	1370485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028227
23034	NC_008818	CAA	2	6	1370489	1370494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028227
23035	NC_008818	GTCCAC	2	12	1370508	1370519	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124028227
23036	NC_008818	GCA	2	6	1370556	1370561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028227
23037	NC_008818	GCT	2	6	1370579	1370584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028227
23038	NC_008818	TC	3	6	1370605	1370610	0 %	50 %	0 %	50 %	124028227
23039	NC_008818	GAA	2	6	1370660	1370665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028227
23040	NC_008818	CAC	2	6	1370765	1370770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028228
23041	NC_008818	CAG	2	6	1370804	1370809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028228
23042	NC_008818	CTCC	2	8	1370854	1370861	0 %	25 %	0 %	75 %	124028228
23043	NC_008818	CCA	2	6	1370862	1370867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028228
23044	NC_008818	CT	3	6	1370897	1370902	0 %	50 %	0 %	50 %	124028228
23045	NC_008818	CT	3	6	1370940	1370945	0 %	50 %	0 %	50 %	124028228
23046	NC_008818	TAG	2	6	1370954	1370959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028228
23047	NC_008818	ATC	2	6	1370972	1370977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028228
23048	NC_008818	CG	3	6	1370996	1371001	0 %	0 %	50 %	50 %	124028228
23049	NC_008818	GCG	2	6	1371006	1371011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028228
23050	NC_008818	CCT	2	6	1371016	1371021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028228
23051	NC_008818	GAG	2	6	1371035	1371040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028228
23052	NC_008818	AGG	2	6	1371045	1371050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028228
23053	NC_008818	TGGC	2	8	1371091	1371098	0 %	25 %	50 %	25 %	124028228
23054	NC_008818	CTG	2	6	1371261	1371266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028228
23055	NC_008818	GCC	2	6	1371303	1371308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028228
23056	NC_008818	CAC	2	6	1371323	1371328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028228
23057	NC_008818	CTC	2	6	1371332	1371337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028228
23058	NC_008818	ACA	2	6	1371435	1371440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028228
23059	NC_008818	ACC	2	6	1371465	1371470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028228
23060	NC_008818	CGG	2	6	1371496	1371501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028228
23061	NC_008818	CGT	2	6	1371556	1371561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028228
23062	NC_008818	GAA	2	6	1371569	1371574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028228
23063	NC_008818	TCG	2	6	1371642	1371647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028228
23064	NC_008818	TGGC	2	8	1371691	1371698	0 %	25 %	50 %	25 %	124028228
23065	NC_008818	TCT	2	6	1371855	1371860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028229
23066	NC_008818	ACG	2	6	1371874	1371879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028229
23067	NC_008818	TGG	2	6	1371925	1371930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028229
23068	NC_008818	AGC	2	6	1371934	1371939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028229
23069	NC_008818	ACC	2	6	1371942	1371947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028229
23070	NC_008818	GTT	2	6	1371962	1371967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028229
23071	NC_008818	GAA	2	6	1371991	1371996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028229
23072	NC_008818	AGG	2	6	1372038	1372043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028229
23073	NC_008818	TACA	2	8	1372220	1372227	50 %	25 %	0 %	25 %	124028229
23074	NC_008818	CGG	2	6	1372243	1372248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028229
23075	NC_008818	AAG	2	6	1372277	1372282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028229
23076	NC_008818	GCC	2	6	1372324	1372329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028229
23077	NC_008818	GAG	2	6	1372340	1372345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028229
23078	NC_008818	AAG	2	6	1372424	1372429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028229
23079	NC_008818	CAG	2	6	1372455	1372460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028229
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23081	NC_008818	CAG	2	6	1372473	1372478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028229
23082	NC_008818	CTA	2	6	1372522	1372527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028229
23083	NC_008818	GAG	2	6	1372550	1372555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028229
23084	NC_008818	CAA	2	6	1372567	1372572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028229
23085	NC_008818	AGGC	2	8	1372581	1372588	25 %	0 %	50 %	25 %	124028229
23086	NC_008818	AC	3	6	1372591	1372596	50 %	0 %	0 %	50 %	124028229
23087	NC_008818	CAA	2	6	1372597	1372602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028229
23088	NC_008818	GGC	2	6	1372643	1372648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028229
23089	NC_008818	TCC	2	6	1372740	1372745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028229
23090	NC_008818	CTG	2	6	1372761	1372766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028229
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23092	NC_008818	CAAGGT	2	12	1372822	1372833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	124028229
23093	NC_008818	GCA	2	6	1372866	1372871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028229
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23095	NC_008818	ATA	2	6	1372937	1372942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028229
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23097	NC_008818	ACA	2	6	1373088	1373093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028229
23098	NC_008818	ACA	2	6	1373100	1373105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028229
23099	NC_008818	GAG	3	9	1373204	1373212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028229
23100	NC_008818	AG	4	8	1373215	1373222	50 %	0 %	50 %	0 %	124028229
23101	NC_008818	TGG	2	6	1373225	1373230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028229
23102	NC_008818	CAG	2	6	1373331	1373336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028229
23103	NC_008818	AGC	2	6	1373434	1373439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028229
23104	NC_008818	AGA	2	6	1373493	1373498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028229
23105	NC_008818	GCG	2	6	1373607	1373612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028229
23106	NC_008818	GGC	2	6	1373627	1373632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028229
23107	NC_008818	TGC	2	6	1373643	1373648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028229
23108	NC_008818	AG	3	6	1373729	1373734	50 %	0 %	50 %	0 %	124028229
23109	NC_008818	AGGA	2	8	1373759	1373766	50 %	0 %	50 %	0 %	124028229
23110	NC_008818	AG	3	6	1373770	1373775	50 %	0 %	50 %	0 %	124028229
23111	NC_008818	CCG	2	6	1373821	1373826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028229
23112	NC_008818	ACG	3	9	1373928	1373936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028229
23113	NC_008818	CAA	2	6	1373976	1373981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028229
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23115	NC_008818	GCG	2	6	1374017	1374022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028229
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23220	NC_008818	CCTGC	2	10	1381051	1381060	0 %	20 %	20 %	60 %	124028235
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23222	NC_008818	GAGG	2	8	1381154	1381161	25 %	0 %	75 %	0 %	124028235
23223	NC_008818	TG	3	6	1381163	1381168	0 %	50 %	50 %	0 %	124028235
23224	NC_008818	TCA	2	6	1381240	1381245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028235
23225	NC_008818	GAT	2	6	1381284	1381289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028235
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23227	NC_008818	GCT	2	6	1381383	1381388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028235
23228	NC_008818	CTC	2	6	1381428	1381433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028235
23229	NC_008818	TGC	2	6	1381448	1381453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028235
23230	NC_008818	GGA	2	6	1381472	1381477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028235
23231	NC_008818	GCG	2	6	1381531	1381536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028235
23232	NC_008818	GAG	2	6	1381551	1381556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028235
23233	NC_008818	AGG	2	6	1381686	1381691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028235
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23236	NC_008818	AGG	2	6	1381732	1381737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028235
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23348	NC_008818	CTA	2	6	1387996	1388001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028239
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