MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_008818	GCT	2	6	1243357	1243362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028096
21002	NC_008818	GGA	2	6	1243413	1243418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028096
21003	NC_008818	TC	3	6	1243420	1243425	0 %	50 %	0 %	50 %	124028096
21004	NC_008818	TTC	2	6	1243433	1243438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028096
21005	NC_008818	GTAGC	2	10	1243472	1243481	20 %	20 %	40 %	20 %	124028096
21006	NC_008818	CAG	2	6	1243594	1243599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028096
21007	NC_008818	GCCA	2	8	1243615	1243622	25 %	0 %	25 %	50 %	124028096
21008	NC_008818	AG	3	6	1243785	1243790	50 %	0 %	50 %	0 %	124028097
21009	NC_008818	AGT	2	6	1243839	1243844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028097
21010	NC_008818	ACA	2	6	1243883	1243888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028097
21011	NC_008818	ATG	2	6	1243937	1243942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028097
21012	NC_008818	CTT	2	6	1243954	1243959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028097
21013	NC_008818	TC	4	8	1244024	1244031	0 %	50 %	0 %	50 %	124028097
21014	NC_008818	TAC	2	6	1244151	1244156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028097
21015	NC_008818	CTC	2	6	1244203	1244208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028097
21016	NC_008818	TTTC	2	8	1244247	1244254	0 %	75 %	0 %	25 %	124028097
21017	NC_008818	CAG	2	6	1244626	1244631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21018	NC_008818	CCG	2	6	1244801	1244806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028098
21019	NC_008818	ATG	2	6	1244876	1244881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028098
21020	NC_008818	CGT	2	6	1244906	1244911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21021	NC_008818	GAG	2	6	1244930	1244935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21022	NC_008818	TGT	2	6	1244947	1244952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028098
21023	NC_008818	CTA	2	6	1244984	1244989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028098
21024	NC_008818	AAG	2	6	1244990	1244995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028098
21025	NC_008818	CACC	2	8	1244998	1245005	25 %	0 %	0 %	75 %	124028098
21026	NC_008818	GCAT	2	8	1245042	1245049	25 %	25 %	25 %	25 %	124028098
21027	NC_008818	CAG	2	6	1245132	1245137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21028	NC_008818	GTT	2	6	1245313	1245318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028098
21029	NC_008818	AGG	2	6	1245350	1245355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21030	NC_008818	TTG	2	6	1245378	1245383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028098
21031	NC_008818	AGT	2	6	1245403	1245408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028098
21032	NC_008818	GA	3	6	1245451	1245456	50 %	0 %	50 %	0 %	124028098
21033	NC_008818	GCT	2	6	1245457	1245462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21034	NC_008818	AAG	2	6	1245586	1245591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028098
21035	NC_008818	CGAG	2	8	1245598	1245605	25 %	0 %	50 %	25 %	124028098
21036	NC_008818	GAG	2	6	1245664	1245669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21037	NC_008818	TAG	2	6	1245675	1245680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028098
21038	NC_008818	AGATA	2	10	1245814	1245823	60 %	20 %	20 %	0 %	124028098
21039	NC_008818	TAG	2	6	1245870	1245875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028098
21040	NC_008818	GAG	2	6	1245983	1245988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21041	NC_008818	ATA	2	6	1246076	1246081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028098
21042	NC_008818	GAG	2	6	1246256	1246261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21043	NC_008818	TTC	2	6	1246340	1246345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028098
21044	NC_008818	AAG	2	6	1246427	1246432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028098
21045	NC_008818	AT	3	6	1246481	1246486	50 %	50 %	0 %	0 %	124028098
21046	NC_008818	AGC	2	6	1246504	1246509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21047	NC_008818	TGC	3	9	1246516	1246524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21048	NC_008818	GCT	2	6	1246528	1246533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21049	NC_008818	GAG	2	6	1246564	1246569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21050	NC_008818	AGC	2	6	1246603	1246608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21051	NC_008818	GAT	2	6	1246625	1246630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028098
21052	NC_008818	GCTG	2	8	1246650	1246657	0 %	25 %	50 %	25 %	124028098
21053	NC_008818	AAGC	2	8	1246660	1246667	50 %	0 %	25 %	25 %	124028098
21054	NC_008818	GGA	2	6	1246702	1246707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21055	NC_008818	CAA	2	6	1246725	1246730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028098
21056	NC_008818	TTGAG	2	10	1246773	1246782	20 %	40 %	40 %	0 %	124028098
21057	NC_008818	CAC	2	6	1246851	1246856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124028098
21058	NC_008818	GAG	2	6	1246865	1246870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21059	NC_008818	GGC	2	6	1246886	1246891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028098
21060	NC_008818	TATC	2	8	1246902	1246909	25 %	50 %	0 %	25 %	124028098
21061	NC_008818	GACAA	2	10	1246928	1246937	60 %	0 %	20 %	20 %	124028098
21062	NC_008818	TCA	2	6	1247037	1247042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028098
21063	NC_008818	CAG	2	6	1247108	1247113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028098
21064	NC_008818	GCAA	2	8	1247160	1247167	50 %	0 %	25 %	25 %	124028098
21065	NC_008818	A	6	6	1247184	1247189	100 %	0 %	0 %	0 %	124028098
21066	NC_008818	TGA	2	6	1247254	1247259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028098
21067	NC_008818	GGA	2	6	1247311	1247316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21068	NC_008818	GTT	2	6	1247318	1247323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028098
21069	NC_008818	GAG	2	6	1247336	1247341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028098
21070	NC_008818	CAA	2	6	1247367	1247372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028098
21071	NC_008818	GCCA	2	8	1247398	1247405	25 %	0 %	25 %	50 %	124028098
21072	NC_008818	TAG	2	6	1247409	1247414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028098
21073	NC_008818	AGT	2	6	1247479	1247484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028099
21074	NC_008818	ATA	2	6	1247544	1247549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028099
21075	NC_008818	CCT	2	6	1247723	1247728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028099
21076	NC_008818	AGGT	2	8	1247751	1247758	25 %	25 %	50 %	0 %	124028099
21077	NC_008818	AGA	2	6	1247827	1247832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124028099
21078	NC_008818	CTA	2	6	1247833	1247838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028099
21079	NC_008818	TAGTGC	2	12	1247872	1247883	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	124028099
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21081	NC_008818	TGG	2	6	1247986	1247991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028099
21082	NC_008818	GCA	2	6	1248024	1248029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028099
21083	NC_008818	GATA	2	8	1248069	1248076	50 %	25 %	25 %	0 %	124028099
21084	NC_008818	CTA	2	6	1248103	1248108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028099
21085	NC_008818	ATA	2	6	1248531	1248536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028100
21086	NC_008818	GGC	2	6	1248581	1248586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028100
21087	NC_008818	TGG	2	6	1248625	1248630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124028100
21088	NC_008818	TTG	2	6	1248721	1248726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028100
21089	NC_008818	GAG	2	6	1248741	1248746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028100
21090	NC_008818	ATG	2	6	1248784	1248789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028100
21091	NC_008818	GC	3	6	1248862	1248867	0 %	0 %	50 %	50 %	124028100
21092	NC_008818	AGG	2	6	1248945	1248950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028100
21093	NC_008818	CCCT	2	8	1249180	1249187	0 %	25 %	0 %	75 %	124028100
21094	NC_008818	GGC	2	6	1249194	1249199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028100
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21096	NC_008818	AG	3	6	1249550	1249555	50 %	0 %	50 %	0 %	124028101
21097	NC_008818	AGGAT	2	10	1249591	1249600	40 %	20 %	40 %	0 %	124028101
21098	NC_008818	TTG	2	6	1249735	1249740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028101
21099	NC_008818	CTA	2	6	1249854	1249859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028101
21100	NC_008818	TTG	2	6	1249873	1249878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028101
21101	NC_008818	CTG	2	6	1249933	1249938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028101
21102	NC_008818	CTG	2	6	1249960	1249965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028101
21103	NC_008818	GCA	2	6	1250001	1250006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028101
21104	NC_008818	AGC	2	6	1250102	1250107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028101
21105	NC_008818	TTC	2	6	1250333	1250338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028102
21106	NC_008818	TAT	2	6	1250410	1250415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124028102
21107	NC_008818	CGT	2	6	1250466	1250471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028102
21108	NC_008818	AGC	2	6	1250570	1250575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028102
21109	NC_008818	CAA	2	6	1250613	1250618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124028102
21110	NC_008818	TGAT	2	8	1250637	1250644	25 %	50 %	25 %	0 %	124028102
21111	NC_008818	CT	3	6	1250683	1250688	0 %	50 %	0 %	50 %	124028102
21112	NC_008818	GCT	2	6	1250690	1250695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028102
21113	NC_008818	TCT	2	6	1250709	1250714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028102
21114	NC_008818	CATA	2	8	1250842	1250849	50 %	25 %	0 %	25 %	124028102
21115	NC_008818	CGC	2	6	1250859	1250864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028102
21116	NC_008818	TGC	2	6	1250893	1250898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028102
21117	NC_008818	TCTG	2	8	1250939	1250946	0 %	50 %	25 %	25 %	124028102
21118	NC_008818	TTC	2	6	1250947	1250952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028102
21119	NC_008818	CTC	2	6	1250998	1251003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028102
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21121	NC_008818	TG	3	6	1251101	1251106	0 %	50 %	50 %	0 %	124028102
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21233	NC_008818	CTT	2	6	1258237	1258242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028108
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21344	NC_008818	CTC	2	6	1264537	1264542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124028116
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21348	NC_008818	GTT	2	6	1264757	1264762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028116
21349	NC_008818	TGC	2	6	1264774	1264779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028116
21350	NC_008818	CAT	2	6	1264789	1264794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028116
21351	NC_008818	TAC	2	6	1264813	1264818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028116
21352	NC_008818	CATAT	2	10	1264987	1264996	40 %	40 %	0 %	20 %	124028116
21353	NC_008818	CGT	3	9	1265420	1265428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028117
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21359	NC_008818	GCA	2	6	1265592	1265597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028117
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21432	NC_008818	TC	3	6	1269521	1269526	0 %	50 %	0 %	50 %	124028122
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21447	NC_008818	TGT	2	6	1270314	1270319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124028122
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21451	NC_008818	TGA	2	6	1270837	1270842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124028123
21452	NC_008818	GTC	2	6	1270880	1270885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124028123
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21455	NC_008818	GAG	2	6	1271024	1271029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028123
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21458	NC_008818	TAA	2	6	1271208	1271213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124028124
21459	NC_008818	AGC	2	6	1271331	1271336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028124
21460	NC_008818	CTATTG	2	12	1271369	1271380	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	124028124
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21462	NC_008818	GCC	2	6	1271463	1271468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124028124
21463	NC_008818	CTA	2	6	1271555	1271560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124028124
21464	NC_008818	AGG	2	6	1271662	1271667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124028124
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21488	NC_008818	GGC	2	6	1272935	1272940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124028127
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21492	NC_008818	GCA	3	9	1273316	1273324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124028128
21493	NC_008818	TCT	2	6	1273399	1273404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124028128
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