MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_008818	GAT	2	6	1118887	1118892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027970
19002	NC_008818	CAT	2	6	1118928	1118933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027970
19003	NC_008818	AGG	2	6	1118969	1118974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027970
19004	NC_008818	GAA	2	6	1119060	1119065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027970
19005	NC_008818	GAG	2	6	1119070	1119075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027970
19006	NC_008818	AGC	2	6	1119086	1119091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027970
19007	NC_008818	TGGT	2	8	1119104	1119111	0 %	50 %	50 %	0 %	124027970
19008	NC_008818	AGG	2	6	1119149	1119154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027970
19009	NC_008818	CATG	2	8	1119164	1119171	25 %	25 %	25 %	25 %	124027970
19010	NC_008818	CAT	2	6	1119214	1119219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027970
19011	NC_008818	TGT	2	6	1119273	1119278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027970
19012	NC_008818	AAG	2	6	1119364	1119369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027970
19013	NC_008818	GT	3	6	1119374	1119379	0 %	50 %	50 %	0 %	124027970
19014	NC_008818	AAG	2	6	1119432	1119437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027970
19015	NC_008818	CTA	2	6	1119450	1119455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027970
19016	NC_008818	GCG	2	6	1119483	1119488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027970
19017	NC_008818	AAT	2	6	1119508	1119513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027970
19018	NC_008818	CCG	2	6	1119649	1119654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027971
19019	NC_008818	GGC	2	6	1119702	1119707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027971
19020	NC_008818	TGC	2	6	1119728	1119733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027971
19021	NC_008818	AGC	2	6	1119761	1119766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027971
19022	NC_008818	TCG	2	6	1119796	1119801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027971
19023	NC_008818	GAG	2	6	1119810	1119815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027971
19024	NC_008818	GAG	2	6	1119834	1119839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027971
19025	NC_008818	AGGGA	2	10	1120078	1120087	40 %	0 %	60 %	0 %	124027972
19026	NC_008818	AG	3	6	1120131	1120136	50 %	0 %	50 %	0 %	124027972
19027	NC_008818	AG	5	10	1120141	1120150	50 %	0 %	50 %	0 %	124027972
19028	NC_008818	ACA	2	6	1120183	1120188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027972
19029	NC_008818	TTG	2	6	1120240	1120245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027972
19030	NC_008818	CGT	2	6	1120280	1120285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027972
19031	NC_008818	AAG	2	6	1120287	1120292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027972
19032	NC_008818	GAT	2	6	1120419	1120424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027973
19033	NC_008818	AAAG	2	8	1120427	1120434	75 %	0 %	25 %	0 %	124027973
19034	NC_008818	CGC	2	6	1120458	1120463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027973
19035	NC_008818	GTT	2	6	1120573	1120578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027973
19036	NC_008818	CAA	2	6	1120598	1120603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027973
19037	NC_008818	AG	3	6	1120617	1120622	50 %	0 %	50 %	0 %	124027973
19038	NC_008818	CTC	2	6	1120628	1120633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027973
19039	NC_008818	TCCT	2	8	1120766	1120773	0 %	50 %	0 %	50 %	124027973
19040	NC_008818	GTG	2	6	1120775	1120780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027973
19041	NC_008818	TTG	2	6	1120781	1120786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027973
19042	NC_008818	GA	3	6	1120839	1120844	50 %	0 %	50 %	0 %	124027973
19043	NC_008818	TCC	2	6	1120878	1120883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027973
19044	NC_008818	TCCC	2	8	1120899	1120906	0 %	25 %	0 %	75 %	124027973
19045	NC_008818	GAA	2	6	1120927	1120932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027973
19046	NC_008818	CGA	2	6	1121070	1121075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027973
19047	NC_008818	GAG	2	6	1121104	1121109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027973
19048	NC_008818	TGCA	2	8	1121110	1121117	25 %	25 %	25 %	25 %	124027973
19049	NC_008818	GCT	2	6	1121188	1121193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027973
19050	NC_008818	ACG	2	6	1121240	1121245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027973
19051	NC_008818	GGC	2	6	1121271	1121276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027973
19052	NC_008818	AG	3	6	1121310	1121315	50 %	0 %	50 %	0 %	124027973
19053	NC_008818	GCT	2	6	1121322	1121327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027973
19054	NC_008818	CT	3	6	1121331	1121336	0 %	50 %	0 %	50 %	124027973
19055	NC_008818	GCC	2	6	1121341	1121346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027973
19056	NC_008818	CGC	2	6	1121347	1121352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027973
19057	NC_008818	AAG	2	6	1121371	1121376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027973
19058	NC_008818	AG	3	6	1121380	1121385	50 %	0 %	50 %	0 %	124027973
19059	NC_008818	GAA	2	6	1121389	1121394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027973
19060	NC_008818	CAA	2	6	1121411	1121416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027973
19061	NC_008818	ATG	2	6	1121432	1121437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027973
19062	NC_008818	CTG	2	6	1121468	1121473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027973
19063	NC_008818	TCG	3	9	1121597	1121605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027973
19064	NC_008818	GAG	2	6	1121695	1121700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027973
19065	NC_008818	GGA	2	6	1121741	1121746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027973
19066	NC_008818	TAA	2	6	1121774	1121779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027973
19067	NC_008818	CGG	2	6	1121802	1121807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027973
19068	NC_008818	GCCA	2	8	1121815	1121822	25 %	0 %	25 %	50 %	124027973
19069	NC_008818	TCT	2	6	1121903	1121908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027973
19070	NC_008818	GCT	2	6	1121962	1121967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027973
19071	NC_008818	GCT	2	6	1122043	1122048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027973
19072	NC_008818	TA	3	6	1122103	1122108	50 %	50 %	0 %	0 %	124027973
19073	NC_008818	TAG	2	6	1122173	1122178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027973
19074	NC_008818	GAG	4	12	1122195	1122206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027973
19075	NC_008818	CCT	2	6	1122273	1122278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027973
19076	NC_008818	AGA	2	6	1122390	1122395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027973
19077	NC_008818	GCC	2	6	1122396	1122401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027973
19078	NC_008818	TAC	2	6	1122416	1122421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027973
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19082	NC_008818	TGC	2	6	1122490	1122495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027974
19083	NC_008818	AAG	2	6	1122598	1122603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027974
19084	NC_008818	TGG	2	6	1122689	1122694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027975
19085	NC_008818	AGT	2	6	1122697	1122702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027975
19086	NC_008818	CAG	2	6	1122706	1122711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027975
19087	NC_008818	CTG	2	6	1122761	1122766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027975
19088	NC_008818	CAG	2	6	1122768	1122773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027975
19089	NC_008818	GTCT	2	8	1122899	1122906	0 %	50 %	25 %	25 %	124027975
19090	NC_008818	GCA	2	6	1122934	1122939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027975
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19092	NC_008818	CAG	2	6	1123011	1123016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027975
19093	NC_008818	CT	3	6	1123017	1123022	0 %	50 %	0 %	50 %	124027975
19094	NC_008818	TTC	2	6	1123025	1123030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027975
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19098	NC_008818	CAG	2	6	1123101	1123106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027975
19099	NC_008818	AG	3	6	1123154	1123159	50 %	0 %	50 %	0 %	124027975
19100	NC_008818	CTA	2	6	1123172	1123177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027975
19101	NC_008818	TC	4	8	1123340	1123347	0 %	50 %	0 %	50 %	124027975
19102	NC_008818	CTCC	2	8	1123366	1123373	0 %	25 %	0 %	75 %	124027976
19103	NC_008818	TGC	2	6	1123432	1123437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027976
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19105	NC_008818	TAT	2	6	1123507	1123512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027976
19106	NC_008818	ACA	2	6	1123622	1123627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027976
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19108	NC_008818	GCTG	2	8	1123851	1123858	0 %	25 %	50 %	25 %	124027976
19109	NC_008818	CGT	2	6	1123860	1123865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027976
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19111	NC_008818	TAT	2	6	1123930	1123935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027976
19112	NC_008818	GT	3	6	1123999	1124004	0 %	50 %	50 %	0 %	124027976
19113	NC_008818	ATG	2	6	1124006	1124011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027976
19114	NC_008818	ATA	2	6	1124012	1124017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027976
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19116	NC_008818	TGGGG	2	10	1124079	1124088	0 %	20 %	80 %	0 %	124027976
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19233	NC_008818	ATC	2	6	1134844	1134849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027984
19234	NC_008818	GTA	2	6	1134944	1134949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027984
19235	NC_008818	TCT	2	6	1134993	1134998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027984
19236	NC_008818	AAG	2	6	1135030	1135035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027984
19237	NC_008818	CGA	2	6	1135068	1135073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027984
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19239	NC_008818	TGCTTC	2	12	1135361	1135372	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	124027984
19240	NC_008818	TGT	2	6	1135464	1135469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027984
19241	NC_008818	AG	3	6	1135483	1135488	50 %	0 %	50 %	0 %	124027984
19242	NC_008818	CAGC	2	8	1135665	1135672	25 %	0 %	25 %	50 %	124027984
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19244	NC_008818	GCT	2	6	1135738	1135743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027984
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19246	NC_008818	CGA	2	6	1135877	1135882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027985
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19250	NC_008818	TGC	2	6	1135999	1136004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027985
19251	NC_008818	TGC	2	6	1136054	1136059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027985
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19259	NC_008818	AT	3	6	1136538	1136543	50 %	50 %	0 %	0 %	124027986
19260	NC_008818	GCT	2	6	1136544	1136549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027986
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19262	NC_008818	GCA	2	6	1136649	1136654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027986
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19272	NC_008818	GTT	2	6	1137807	1137812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027988
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19331	NC_008818	GA	3	6	1141007	1141012	50 %	0 %	50 %	0 %	124027990
19332	NC_008818	CTA	2	6	1141131	1141136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027990
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19336	NC_008818	CGCTA	2	10	1141300	1141309	20 %	20 %	20 %	40 %	124027990
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19339	NC_008818	TAC	2	6	1141413	1141418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027990
19340	NC_008818	ACT	2	6	1141744	1141749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027991
19341	NC_008818	CAT	2	6	1141802	1141807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027991
19342	NC_008818	TCC	2	6	1141852	1141857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027991
19343	NC_008818	ATTA	2	8	1141866	1141873	50 %	50 %	0 %	0 %	124027991
19344	NC_008818	CGAG	2	8	1141903	1141910	25 %	0 %	50 %	25 %	124027991
19345	NC_008818	CTT	2	6	1141950	1141955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027991
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