MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008818	GCG	2	6	56244	56249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026968
1002	NC_008818	TCT	2	6	56408	56413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026968
1003	NC_008818	GCTA	2	8	56439	56446	25 %	25 %	25 %	25 %	124026968
1004	NC_008818	AAGGCC	2	12	56469	56480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026968
1005	NC_008818	TAA	2	6	56492	56497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124026968
1006	NC_008818	ACG	2	6	56556	56561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026968
1007	NC_008818	AGT	2	6	56587	56592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026968
1008	NC_008818	TGC	2	6	56610	56615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026968
1009	NC_008818	TCGTA	2	10	56691	56700	20 %	40 %	20 %	20 %	124026968
1010	NC_008818	AGA	2	6	56796	56801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026968
1011	NC_008818	ACT	2	6	56812	56817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026968
1012	NC_008818	TTG	2	6	56846	56851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026968
1013	NC_008818	TAT	2	6	56874	56879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026968
1014	NC_008818	GGC	2	6	56916	56921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026968
1015	NC_008818	TAA	2	6	56922	56927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124026968
1016	NC_008818	TCC	2	6	56933	56938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026968
1017	NC_008818	GCC	2	6	56962	56967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026968
1018	NC_008818	CCT	2	6	56982	56987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026969
1019	NC_008818	AGC	2	6	57001	57006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1020	NC_008818	CTG	2	6	57039	57044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1021	NC_008818	TTTA	2	8	57061	57068	25 %	75 %	0 %	0 %	124026969
1022	NC_008818	TCC	2	6	57080	57085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026969
1023	NC_008818	TCT	3	9	57180	57188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026969
1024	NC_008818	TGCT	2	8	57220	57227	0 %	50 %	25 %	25 %	124026969
1025	NC_008818	CTA	2	6	57246	57251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026969
1026	NC_008818	TCT	2	6	57438	57443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026969
1027	NC_008818	TC	3	6	57577	57582	0 %	50 %	0 %	50 %	124026969
1028	NC_008818	CGT	2	6	57639	57644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1029	NC_008818	GAA	2	6	57732	57737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026969
1030	NC_008818	TGTAC	2	10	57804	57813	20 %	40 %	20 %	20 %	124026969
1031	NC_008818	ATC	2	6	57829	57834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026969
1032	NC_008818	CAT	2	6	57870	57875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026969
1033	NC_008818	GCT	2	6	57882	57887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1034	NC_008818	AGCT	2	8	57918	57925	25 %	25 %	25 %	25 %	124026969
1035	NC_008818	TGC	3	9	57928	57936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1036	NC_008818	CAG	2	6	58042	58047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1037	NC_008818	GCC	3	9	58081	58089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026969
1038	NC_008818	GGT	2	6	58139	58144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026969
1039	NC_008818	AGT	2	6	58279	58284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026969
1040	NC_008818	GGT	2	6	58304	58309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026969
1041	NC_008818	GCT	2	6	58320	58325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1042	NC_008818	GCT	2	6	58347	58352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1043	NC_008818	CTG	2	6	58353	58358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1044	NC_008818	GCT	2	6	58359	58364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1045	NC_008818	GCT	2	6	58368	58373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1046	NC_008818	GTG	2	6	58385	58390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026969
1047	NC_008818	GTT	2	6	58394	58399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026969
1048	NC_008818	GCT	2	6	58401	58406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026969
1049	NC_008818	CCT	2	6	58729	58734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026970
1050	NC_008818	GTT	2	6	58745	58750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026970
1051	NC_008818	TC	3	6	58754	58759	0 %	50 %	0 %	50 %	124026970
1052	NC_008818	ACAGCT	2	12	58787	58798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124026970
1053	NC_008818	ATG	2	6	58868	58873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026970
1054	NC_008818	CGG	2	6	58875	58880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026970
1055	NC_008818	GTA	2	6	58901	58906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026970
1056	NC_008818	CGAG	2	8	58911	58918	25 %	0 %	50 %	25 %	124026970
1057	NC_008818	GCA	2	6	58963	58968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026970
1058	NC_008818	TA	3	6	59053	59058	50 %	50 %	0 %	0 %	124026970
1059	NC_008818	AGG	2	6	59079	59084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026970
1060	NC_008818	CAT	2	6	59091	59096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026970
1061	NC_008818	GTG	2	6	59160	59165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026970
1062	NC_008818	AGG	2	6	59169	59174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026970
1063	NC_008818	TCT	2	6	59197	59202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026970
1064	NC_008818	AGA	2	6	59260	59265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026970
1065	NC_008818	GCC	2	6	59314	59319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026970
1066	NC_008818	ATG	2	6	59328	59333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026970
1067	NC_008818	GCT	2	6	59338	59343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026970
1068	NC_008818	CGA	2	6	59398	59403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026970
1069	NC_008818	CAT	2	6	59449	59454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026970
1070	NC_008818	ATA	2	6	59459	59464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124026970
1071	NC_008818	GGA	2	6	59473	59478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026970
1072	NC_008818	TAG	2	6	59487	59492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026970
1073	NC_008818	GCT	2	6	59567	59572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026970
1074	NC_008818	CCT	2	6	59674	59679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026970
1075	NC_008818	TTC	2	6	59693	59698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026970
1076	NC_008818	CAA	2	6	59770	59775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026970
1077	NC_008818	GAG	2	6	59783	59788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026970
1078	NC_008818	CAAG	2	8	59973	59980	50 %	0 %	25 %	25 %	124026970
1079	NC_008818	AGCGCT	2	12	60046	60057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124026970
1080	NC_008818	GAA	2	6	60061	60066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026970
1081	NC_008818	GGT	2	6	60070	60075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026970
1082	NC_008818	GAG	2	6	60363	60368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026971
1083	NC_008818	TGG	2	6	60470	60475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026971
1084	NC_008818	GTT	2	6	60519	60524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026971
1085	NC_008818	GAC	2	6	60528	60533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026971
1086	NC_008818	AGTGT	2	10	60553	60562	20 %	40 %	40 %	0 %	124026971
1087	NC_008818	GCT	2	6	60765	60770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026971
1088	NC_008818	CTC	2	6	60900	60905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026971
1089	NC_008818	ACCATG	2	12	60934	60945	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124026971
1090	NC_008818	TCC	2	6	61095	61100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026971
1091	NC_008818	CAT	2	6	61128	61133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026971
1092	NC_008818	TCAC	2	8	61141	61148	25 %	25 %	0 %	50 %	124026971
1093	NC_008818	CGA	2	6	61190	61195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026971
1094	NC_008818	CACGTA	2	12	61232	61243	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124026971
1095	NC_008818	GCTG	2	8	61255	61262	0 %	25 %	50 %	25 %	124026971
1096	NC_008818	TAG	2	6	61366	61371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026971
1097	NC_008818	AG	3	6	61370	61375	50 %	0 %	50 %	0 %	124026971
1098	NC_008818	AAT	2	6	61463	61468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124026971
1099	NC_008818	TGCA	2	8	61525	61532	25 %	25 %	25 %	25 %	124026971
1100	NC_008818	GAA	2	6	61574	61579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026971
1101	NC_008818	GAG	2	6	61662	61667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026971
1102	NC_008818	ACC	2	6	61766	61771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124026971
1103	NC_008818	ACT	2	6	61806	61811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026971
1104	NC_008818	TGA	2	6	61904	61909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026971
1105	NC_008818	AAG	2	6	61956	61961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026971
1106	NC_008818	CGT	2	6	62000	62005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026971
1107	NC_008818	ACAATA	2	12	62082	62093	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	124026971
1108	NC_008818	CCAGC	2	10	62127	62136	20 %	0 %	20 %	60 %	124026971
1109	NC_008818	AGC	2	6	62146	62151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026971
1110	NC_008818	CA	3	6	62165	62170	50 %	0 %	0 %	50 %	124026971
1111	NC_008818	CAGC	2	8	62175	62182	25 %	0 %	25 %	50 %	124026971
1112	NC_008818	AG	3	6	62210	62215	50 %	0 %	50 %	0 %	124026971
1113	NC_008818	AAC	2	6	62224	62229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026971
1114	NC_008818	TTG	2	6	62239	62244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026971
1115	NC_008818	CAGC	2	8	62262	62269	25 %	0 %	25 %	50 %	124026971
1116	NC_008818	CAA	2	6	62296	62301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026971
1117	NC_008818	CAA	2	6	62305	62310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026971
1118	NC_008818	GGC	2	6	62384	62389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026971
1119	NC_008818	AGG	2	6	62409	62414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026971
1120	NC_008818	T	6	6	62460	62465	0 %	100 %	0 %	0 %	124026972
1121	NC_008818	AT	3	6	62522	62527	50 %	50 %	0 %	0 %	124026972
1122	NC_008818	CT	3	6	62588	62593	0 %	50 %	0 %	50 %	124026972
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1124	NC_008818	TGC	2	6	62757	62762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026972
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1373	NC_008818	CAT	2	6	79853	79858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026989
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