MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008818	CAC	2	6	30389	30394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124026940
502	NC_008818	GAG	2	6	30414	30419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026940
503	NC_008818	GAG	2	6	30496	30501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026940
504	NC_008818	CCCA	2	8	30522	30529	25 %	0 %	0 %	75 %	124026940
505	NC_008818	AGC	2	6	30532	30537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026940
506	NC_008818	AAT	2	6	30557	30562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124026940
507	NC_008818	GCTC	2	8	30648	30655	0 %	25 %	25 %	50 %	124026940
508	NC_008818	GCT	2	6	30683	30688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026940
509	NC_008818	AGCATA	2	12	30717	30728	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	124026940
510	NC_008818	ACT	2	6	30859	30864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026940
511	NC_008818	GGA	2	6	30898	30903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026940
512	NC_008818	GGGCA	2	10	30923	30932	20 %	0 %	60 %	20 %	124026940
513	NC_008818	CGA	2	6	30947	30952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026940
514	NC_008818	GAC	2	6	30960	30965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026940
515	NC_008818	AAG	2	6	30999	31004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026940
516	NC_008818	CT	3	6	31037	31042	0 %	50 %	0 %	50 %	124026941
517	NC_008818	CTA	2	6	31050	31055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026941
518	NC_008818	CCTT	2	8	31060	31067	0 %	50 %	0 %	50 %	124026941
519	NC_008818	CAA	2	6	31078	31083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026941
520	NC_008818	CGG	2	6	31136	31141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026941
521	NC_008818	CT	3	6	31214	31219	0 %	50 %	0 %	50 %	124026941
522	NC_008818	CGA	2	6	31231	31236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026941
523	NC_008818	GGT	2	6	31253	31258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026941
524	NC_008818	GCC	2	6	31394	31399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026941
525	NC_008818	TCA	2	6	31413	31418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026941
526	NC_008818	CAC	2	6	31447	31452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124026941
527	NC_008818	AAG	2	6	31502	31507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026941
528	NC_008818	AGC	2	6	31652	31657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026941
529	NC_008818	GCG	2	6	31699	31704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026941
530	NC_008818	GAG	2	6	31730	31735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026941
531	NC_008818	CTT	2	6	31760	31765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026941
532	NC_008818	CACC	2	8	31806	31813	25 %	0 %	0 %	75 %	124026942
533	NC_008818	TAG	2	6	31836	31841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026942
534	NC_008818	AGG	2	6	31862	31867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026942
535	NC_008818	CAA	2	6	31885	31890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026942
536	NC_008818	TAACG	2	10	31911	31920	40 %	20 %	20 %	20 %	124026942
537	NC_008818	TAGG	2	8	31996	32003	25 %	25 %	50 %	0 %	124026942
538	NC_008818	CTC	2	6	32149	32154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026942
539	NC_008818	TCC	2	6	32174	32179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026942
540	NC_008818	TCG	2	6	32228	32233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026942
541	NC_008818	GAG	2	6	32269	32274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026942
542	NC_008818	CTC	2	6	32443	32448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026942
543	NC_008818	CAG	2	6	32449	32454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026942
544	NC_008818	AG	3	6	32621	32626	50 %	0 %	50 %	0 %	124026943
545	NC_008818	GAG	2	6	32734	32739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026943
546	NC_008818	TCTA	2	8	32752	32759	25 %	50 %	0 %	25 %	124026943
547	NC_008818	TTG	2	6	32808	32813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026943
548	NC_008818	AAC	2	6	32875	32880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026943
549	NC_008818	ACT	2	6	32925	32930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026943
550	NC_008818	GAC	2	6	32951	32956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026943
551	NC_008818	AG	3	6	32966	32971	50 %	0 %	50 %	0 %	124026943
552	NC_008818	AT	3	6	32994	32999	50 %	50 %	0 %	0 %	124026943
553	NC_008818	GAA	2	6	33073	33078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026943
554	NC_008818	TGGA	2	8	33192	33199	25 %	25 %	50 %	0 %	124026943
555	NC_008818	GAG	2	6	33269	33274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026943
556	NC_008818	CTT	2	6	33289	33294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026943
557	NC_008818	AAG	2	6	33302	33307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026943
558	NC_008818	GCA	2	6	33308	33313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026943
559	NC_008818	GCT	2	6	33316	33321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026943
560	NC_008818	GGT	2	6	33329	33334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026943
561	NC_008818	AAGC	2	8	33337	33344	50 %	0 %	25 %	25 %	124026943
562	NC_008818	TGG	2	6	33356	33361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026943
563	NC_008818	CGG	2	6	33373	33378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026943
564	NC_008818	ACA	2	6	33401	33406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026943
565	NC_008818	ATG	2	6	33417	33422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026943
566	NC_008818	GCG	2	6	33480	33485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026943
567	NC_008818	CGA	2	6	33510	33515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026943
568	NC_008818	TA	3	6	33597	33602	50 %	50 %	0 %	0 %	124026944
569	NC_008818	GTA	2	6	33633	33638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026944
570	NC_008818	TC	3	6	33639	33644	0 %	50 %	0 %	50 %	124026944
571	NC_008818	CAA	2	6	33753	33758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026944
572	NC_008818	ACT	2	6	33769	33774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026944
573	NC_008818	GAA	2	6	33798	33803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026944
574	NC_008818	GCT	2	6	33862	33867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026944
575	NC_008818	TCCT	2	8	33877	33884	0 %	50 %	0 %	50 %	124026944
576	NC_008818	CAC	2	6	33944	33949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124026944
577	NC_008818	TCG	2	6	34022	34027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026944
578	NC_008818	GGA	2	6	34235	34240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026945
579	NC_008818	ATA	2	6	34243	34248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124026945
580	NC_008818	ATC	2	6	34264	34269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026945
581	NC_008818	CTA	2	6	34272	34277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026945
582	NC_008818	GAA	2	6	34280	34285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026945
583	NC_008818	TAG	2	6	34442	34447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026945
584	NC_008818	GTC	2	6	34493	34498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026945
585	NC_008818	TG	4	8	34500	34507	0 %	50 %	50 %	0 %	124026945
586	NC_008818	TGT	2	6	34512	34517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026945
587	NC_008818	GCA	2	6	34544	34549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026945
588	NC_008818	GCT	2	6	34579	34584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026945
589	NC_008818	AG	3	6	34615	34620	50 %	0 %	50 %	0 %	124026945
590	NC_008818	GGA	2	6	34639	34644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026945
591	NC_008818	AGA	2	6	34697	34702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026945
592	NC_008818	TGC	2	6	34743	34748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026945
593	NC_008818	TAC	2	6	34767	34772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026945
594	NC_008818	GCGT	2	8	34854	34861	0 %	25 %	50 %	25 %	124026945
595	NC_008818	TGC	2	6	34887	34892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026945
596	NC_008818	AGA	2	6	34898	34903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026945
597	NC_008818	CTC	2	6	34979	34984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026946
598	NC_008818	AGT	2	6	35111	35116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026946
599	NC_008818	GTT	2	6	35138	35143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026946
600	NC_008818	GCA	2	6	35168	35173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026946
601	NC_008818	GGC	2	6	35209	35214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026946
602	NC_008818	TAG	2	6	35250	35255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026946
603	NC_008818	GCTGA	2	10	35279	35288	20 %	20 %	40 %	20 %	124026946
604	NC_008818	TGC	2	6	35295	35300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026946
605	NC_008818	ATA	2	6	35321	35326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124026946
606	NC_008818	CTGC	2	8	35327	35334	0 %	25 %	25 %	50 %	124026946
607	NC_008818	TCA	2	6	35487	35492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026947
608	NC_008818	CCT	2	6	35514	35519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026947
609	NC_008818	TC	5	10	35532	35541	0 %	50 %	0 %	50 %	124026947
610	NC_008818	GCA	2	6	35604	35609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026947
611	NC_008818	AGC	2	6	35626	35631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026947
612	NC_008818	CAC	2	6	35643	35648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124026947
613	NC_008818	CT	3	6	35685	35690	0 %	50 %	0 %	50 %	124026947
614	NC_008818	AG	3	6	35757	35762	50 %	0 %	50 %	0 %	124026947
615	NC_008818	CCT	2	6	35866	35871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026947
616	NC_008818	TTA	2	6	35977	35982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026948
617	NC_008818	CG	3	6	36082	36087	0 %	0 %	50 %	50 %	124026948
618	NC_008818	ATCT	2	8	36103	36110	25 %	50 %	0 %	25 %	124026948
619	NC_008818	AAC	2	6	36211	36216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026948
620	NC_008818	TC	3	6	36227	36232	0 %	50 %	0 %	50 %	124026948
621	NC_008818	AGC	2	6	36254	36259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026948
622	NC_008818	CCT	2	6	36289	36294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026948
623	NC_008818	CCT	2	6	36297	36302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026948
624	NC_008818	TCG	2	6	36326	36331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026948
625	NC_008818	CT	3	6	36350	36355	0 %	50 %	0 %	50 %	124026948
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