MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008818	CTT	2	6	345682	345687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027252
6002	NC_008818	GTG	2	6	345709	345714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027252
6003	NC_008818	TGA	2	6	345766	345771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027252
6004	NC_008818	GT	3	6	345849	345854	0 %	50 %	50 %	0 %	124027252
6005	NC_008818	CAG	2	6	345873	345878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027252
6006	NC_008818	CATGT	2	10	345889	345898	20 %	40 %	20 %	20 %	124027252
6007	NC_008818	GTA	2	6	345925	345930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027252
6008	NC_008818	CAG	2	6	346008	346013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027252
6009	NC_008818	GCC	2	6	346019	346024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027252
6010	NC_008818	GCATT	2	10	346418	346427	20 %	40 %	20 %	20 %	124027253
6011	NC_008818	GCA	2	6	346445	346450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027253
6012	NC_008818	TAC	2	6	346780	346785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027253
6013	NC_008818	GCA	2	6	346925	346930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027253
6014	NC_008818	TA	3	6	346932	346937	50 %	50 %	0 %	0 %	124027253
6015	NC_008818	AGT	2	6	346953	346958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027253
6016	NC_008818	AG	3	6	346970	346975	50 %	0 %	50 %	0 %	124027253
6017	NC_008818	GGA	2	6	347007	347012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027253
6018	NC_008818	C	6	6	347075	347080	0 %	0 %	0 %	100 %	124027253
6019	NC_008818	CATG	2	8	347090	347097	25 %	25 %	25 %	25 %	124027254
6020	NC_008818	GGAT	2	8	347106	347113	25 %	25 %	50 %	0 %	124027254
6021	NC_008818	ATA	2	6	347164	347169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027254
6022	NC_008818	AGC	2	6	347187	347192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027254
6023	NC_008818	AAG	2	6	347211	347216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027254
6024	NC_008818	TCT	2	6	347270	347275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027254
6025	NC_008818	GCA	2	6	347287	347292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027254
6026	NC_008818	GCCA	2	8	347380	347387	25 %	0 %	25 %	50 %	124027254
6027	NC_008818	CTA	2	6	347422	347427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027254
6028	NC_008818	AGC	2	6	347432	347437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027254
6029	NC_008818	GGC	2	6	347476	347481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027254
6030	NC_008818	CGA	2	6	347507	347512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027254
6031	NC_008818	GAT	2	6	347673	347678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027254
6032	NC_008818	GAG	2	6	347680	347685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027254
6033	NC_008818	CGC	2	6	347777	347782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027254
6034	NC_008818	GGTTT	2	10	347784	347793	0 %	60 %	40 %	0 %	124027254
6035	NC_008818	AAG	2	6	347824	347829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027254
6036	NC_008818	GAA	2	6	347836	347841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027254
6037	NC_008818	CAA	2	6	347891	347896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027254
6038	NC_008818	GA	4	8	347923	347930	50 %	0 %	50 %	0 %	124027254
6039	NC_008818	AG	3	6	347946	347951	50 %	0 %	50 %	0 %	124027254
6040	NC_008818	AGA	2	6	347958	347963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027254
6041	NC_008818	TGGGT	2	10	348234	348243	0 %	40 %	60 %	0 %	124027255
6042	NC_008818	AAT	2	6	348255	348260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027255
6043	NC_008818	AAG	2	6	348346	348351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027255
6044	NC_008818	AGG	2	6	348357	348362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027255
6045	NC_008818	CCT	2	6	348390	348395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027255
6046	NC_008818	CGG	2	6	348396	348401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027255
6047	NC_008818	AAT	2	6	348402	348407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027255
6048	NC_008818	CTGG	2	8	348451	348458	0 %	25 %	50 %	25 %	124027255
6049	NC_008818	AGG	2	6	348468	348473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027255
6050	NC_008818	TCG	2	6	348491	348496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027255
6051	NC_008818	TAA	2	6	348506	348511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027255
6052	NC_008818	AGG	2	6	348543	348548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027255
6053	NC_008818	GAA	2	6	348561	348566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027255
6054	NC_008818	CAG	2	6	348577	348582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027255
6055	NC_008818	TAT	2	6	348977	348982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027256
6056	NC_008818	AGG	2	6	349048	349053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6057	NC_008818	GAG	2	6	349096	349101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6058	NC_008818	TTG	2	6	349118	349123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027256
6059	NC_008818	TGC	2	6	349191	349196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6060	NC_008818	GAG	2	6	349282	349287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6061	NC_008818	TGC	2	6	349290	349295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6062	NC_008818	TGC	2	6	349325	349330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6063	NC_008818	TGT	2	6	349443	349448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027256
6064	NC_008818	CAT	2	6	349463	349468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027256
6065	NC_008818	AGG	2	6	349478	349483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6066	NC_008818	CGTTGC	2	12	349523	349534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6067	NC_008818	GAT	2	6	349579	349584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027256
6068	NC_008818	GTT	2	6	349597	349602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027256
6069	NC_008818	GCTA	2	8	349608	349615	25 %	25 %	25 %	25 %	124027256
6070	NC_008818	TGG	2	6	349624	349629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027256
6071	NC_008818	CTG	2	6	349729	349734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6072	NC_008818	GAG	2	6	349741	349746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6073	NC_008818	AGC	2	6	349873	349878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6074	NC_008818	TGC	2	6	349907	349912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6075	NC_008818	AGCCT	2	10	349916	349925	20 %	20 %	20 %	40 %	124027256
6076	NC_008818	GTG	2	6	349930	349935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027256
6077	NC_008818	TGGA	2	8	349987	349994	25 %	25 %	50 %	0 %	124027256
6078	NC_008818	CGT	2	6	350061	350066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
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6080	NC_008818	TGC	2	6	350175	350180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6081	NC_008818	CTT	2	6	350185	350190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027256
6082	NC_008818	CGG	2	6	350288	350293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027256
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6086	NC_008818	CTG	2	6	350455	350460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6087	NC_008818	CGG	2	6	350511	350516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027256
6088	NC_008818	GCT	2	6	350523	350528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6089	NC_008818	CTA	2	6	350536	350541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027256
6090	NC_008818	CCT	2	6	350652	350657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027256
6091	NC_008818	CTA	2	6	350743	350748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027256
6092	NC_008818	AGCCG	2	10	350772	350781	20 %	0 %	40 %	40 %	124027256
6093	NC_008818	GCC	2	6	350803	350808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027256
6094	NC_008818	CTC	2	6	350818	350823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027256
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6099	NC_008818	AGC	2	6	350912	350917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6100	NC_008818	CA	3	6	350919	350924	50 %	0 %	0 %	50 %	124027256
6101	NC_008818	CTG	2	6	350959	350964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6102	NC_008818	GAG	2	6	350995	351000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6103	NC_008818	GAGG	2	8	351015	351022	25 %	0 %	75 %	0 %	124027256
6104	NC_008818	AACT	2	8	351038	351045	50 %	25 %	0 %	25 %	124027256
6105	NC_008818	GAG	3	9	351046	351054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
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6107	NC_008818	GAG	2	6	351136	351141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6108	NC_008818	CCA	2	6	351142	351147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027256
6109	NC_008818	GGTGA	2	10	351172	351181	20 %	20 %	60 %	0 %	124027256
6110	NC_008818	TCC	2	6	351269	351274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027256
6111	NC_008818	GGA	2	6	351282	351287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6112	NC_008818	GCT	2	6	351310	351315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6113	NC_008818	AC	3	6	351434	351439	50 %	0 %	0 %	50 %	124027256
6114	NC_008818	GAG	2	6	351454	351459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027256
6115	NC_008818	AGC	2	6	351479	351484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6116	NC_008818	GCA	2	6	351505	351510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027256
6117	NC_008818	GA	3	6	351559	351564	50 %	0 %	50 %	0 %	124027256
6118	NC_008818	TCTCC	2	10	351600	351609	0 %	40 %	0 %	60 %	124027256
6119	NC_008818	ATT	2	6	351622	351627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124027256
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6482	NC_008818	AGC	2	6	372247	372252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027277
6483	NC_008818	GTTAGG	2	12	372254	372265	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	124027277
6484	NC_008818	GCG	2	6	372288	372293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027277
6485	NC_008818	GCG	2	6	372324	372329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027277
6486	NC_008818	GCT	2	6	372613	372618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027278
6487	NC_008818	TAC	2	6	372749	372754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027278
6488	NC_008818	CCA	2	6	372759	372764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027278
6489	NC_008818	AAGG	2	8	372771	372778	50 %	0 %	50 %	0 %	124027278
6490	NC_008818	GAG	2	6	372868	372873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027278
6491	NC_008818	AAG	2	6	372889	372894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027278
6492	NC_008818	AGC	2	6	372925	372930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027278
6493	NC_008818	CGC	2	6	372961	372966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027278
6494	NC_008818	ACG	2	6	372992	372997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027278
6495	NC_008818	ATA	2	6	373000	373005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027278
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6497	NC_008818	CTGC	2	8	373083	373090	0 %	25 %	25 %	50 %	124027278
6498	NC_008818	AGT	2	6	373104	373109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027278
6499	NC_008818	GAG	2	6	373212	373217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027278
6500	NC_008818	GCT	2	6	373243	373248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027278

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