MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 28044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008818	ACCC	2	8	260539	260546	25 %	0 %	0 %	75 %	124027171
4502	NC_008818	GCCA	2	8	260548	260555	25 %	0 %	25 %	50 %	124027171
4503	NC_008818	CA	3	6	260749	260754	50 %	0 %	0 %	50 %	124027171
4504	NC_008818	CAA	2	6	260783	260788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027171
4505	NC_008818	CCTC	2	8	260789	260796	0 %	25 %	0 %	75 %	124027171
4506	NC_008818	CGACAA	2	12	261050	261061	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	124027172
4507	NC_008818	GTT	2	6	261069	261074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027172
4508	NC_008818	AC	3	6	261167	261172	50 %	0 %	0 %	50 %	124027172
4509	NC_008818	CCA	2	6	261359	261364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027172
4510	NC_008818	CAG	2	6	261370	261375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027172
4511	NC_008818	CA	3	6	261414	261419	50 %	0 %	0 %	50 %	124027172
4512	NC_008818	AGG	2	6	261433	261438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027172
4513	NC_008818	GCT	2	6	261450	261455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027172
4514	NC_008818	GGC	2	6	261603	261608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027172
4515	NC_008818	GA	3	6	261651	261656	50 %	0 %	50 %	0 %	124027172
4516	NC_008818	TC	3	6	261737	261742	0 %	50 %	0 %	50 %	124027172
4517	NC_008818	AACAG	2	10	261777	261786	60 %	0 %	20 %	20 %	124027172
4518	NC_008818	GAA	2	6	261816	261821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027172
4519	NC_008818	TAGC	2	8	261838	261845	25 %	25 %	25 %	25 %	124027172
4520	NC_008818	TG	3	6	261857	261862	0 %	50 %	50 %	0 %	124027172
4521	NC_008818	AGC	2	6	261871	261876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027172
4522	NC_008818	GCT	2	6	262139	262144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027173
4523	NC_008818	TGT	2	6	262291	262296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027173
4524	NC_008818	GCC	2	6	262325	262330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027173
4525	NC_008818	CTA	2	6	262375	262380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027173
4526	NC_008818	GAG	2	6	262412	262417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027173
4527	NC_008818	CAC	2	6	262418	262423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027173
4528	NC_008818	TGG	2	6	262463	262468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027173
4529	NC_008818	AGG	2	6	262485	262490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027173
4530	NC_008818	GGT	2	6	262511	262516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027173
4531	NC_008818	GCC	2	6	262598	262603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027173
4532	NC_008818	CTT	2	6	262724	262729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027173
4533	NC_008818	CTA	2	6	262738	262743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027173
4534	NC_008818	CT	3	6	263202	263207	0 %	50 %	0 %	50 %	124027174
4535	NC_008818	TAC	2	6	263228	263233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027174
4536	NC_008818	CTC	2	6	263268	263273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027174
4537	NC_008818	AGC	2	6	263287	263292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027174
4538	NC_008818	CCG	2	6	263321	263326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027174
4539	NC_008818	GAG	2	6	263480	263485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027174
4540	NC_008818	CTC	2	6	263496	263501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027174
4541	NC_008818	GCC	2	6	263551	263556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027174
4542	NC_008818	CCATA	2	10	263855	263864	40 %	20 %	0 %	40 %	124027175
4543	NC_008818	TAA	2	6	263876	263881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027175
4544	NC_008818	GTG	2	6	263923	263928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027175
4545	NC_008818	ATA	2	6	263977	263982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027175
4546	NC_008818	CTC	2	6	263995	264000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027175
4547	NC_008818	GTG	2	6	264064	264069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027175
4548	NC_008818	TCT	2	6	264077	264082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027175
4549	NC_008818	ACT	2	6	264083	264088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027175
4550	NC_008818	TGC	2	6	264158	264163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027175
4551	NC_008818	GCT	2	6	264168	264173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027175
4552	NC_008818	CGC	2	6	264189	264194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027175
4553	NC_008818	CCA	2	6	264286	264291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027175
4554	NC_008818	CA	3	6	264326	264331	50 %	0 %	0 %	50 %	124027175
4555	NC_008818	TGA	2	6	264392	264397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027175
4556	NC_008818	GTG	2	6	264409	264414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027175
4557	NC_008818	GGA	2	6	264444	264449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027175
4558	NC_008818	ATA	2	6	264496	264501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027176
4559	NC_008818	TC	3	6	264514	264519	0 %	50 %	0 %	50 %	124027176
4560	NC_008818	CAGCTG	2	12	264601	264612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124027176
4561	NC_008818	GTG	2	6	264619	264624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027176
4562	NC_008818	TGC	2	6	264659	264664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027176
4563	NC_008818	GTA	2	6	264667	264672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027176
4564	NC_008818	GAC	2	6	264689	264694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027176
4565	NC_008818	CGT	2	6	264820	264825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027176
4566	NC_008818	ACT	2	6	264900	264905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027176
4567	NC_008818	CACC	2	8	264914	264921	25 %	0 %	0 %	75 %	124027176
4568	NC_008818	CGA	2	6	264986	264991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027176
4569	NC_008818	CCA	2	6	265060	265065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027176
4570	NC_008818	CCCTC	2	10	265144	265153	0 %	20 %	0 %	80 %	124027176
4571	NC_008818	CGC	2	6	265175	265180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027176
4572	NC_008818	TGT	2	6	265223	265228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027176
4573	NC_008818	CTGG	2	8	265237	265244	0 %	25 %	50 %	25 %	124027176
4574	NC_008818	AGCT	2	8	265283	265290	25 %	25 %	25 %	25 %	124027176
4575	NC_008818	GCT	2	6	265301	265306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027176
4576	NC_008818	AGG	2	6	265407	265412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027176
4577	NC_008818	CT	3	6	265434	265439	0 %	50 %	0 %	50 %	124027176
4578	NC_008818	AGCC	2	8	265440	265447	25 %	0 %	25 %	50 %	124027176
4579	NC_008818	TCA	2	6	265456	265461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027176
4580	NC_008818	CGG	2	6	265473	265478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027177
4581	NC_008818	GCA	2	6	265525	265530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027177
4582	NC_008818	CCT	2	6	265545	265550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027177
4583	NC_008818	AGC	2	6	265551	265556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027177
4584	NC_008818	CGG	2	6	265677	265682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027177
4585	NC_008818	ATGT	2	8	265687	265694	25 %	50 %	25 %	0 %	124027177
4586	NC_008818	TGT	2	6	265731	265736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027177
4587	NC_008818	GC	3	6	265737	265742	0 %	0 %	50 %	50 %	124027177
4588	NC_008818	AG	3	6	265743	265748	50 %	0 %	50 %	0 %	124027177
4589	NC_008818	TAC	2	6	265755	265760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027177
4590	NC_008818	GAG	2	6	265761	265766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027177
4591	NC_008818	CCA	2	6	265772	265777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027177
4592	NC_008818	CGC	2	6	265835	265840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027177
4593	NC_008818	TGT	2	6	265863	265868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027177
4594	NC_008818	TGC	2	6	265914	265919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027177
4595	NC_008818	AGG	2	6	265933	265938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027177
4596	NC_008818	GTG	2	6	265950	265955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027177
4597	NC_008818	TGA	2	6	266103	266108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027178
4598	NC_008818	GGA	2	6	266121	266126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027178
4599	NC_008818	AGG	2	6	266164	266169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027178
4600	NC_008818	GAG	2	6	266185	266190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027178
4601	NC_008818	ACC	2	6	266229	266234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027178
4602	NC_008818	CT	3	6	266262	266267	0 %	50 %	0 %	50 %	124027178
4603	NC_008818	ACC	2	6	266321	266326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027178
4604	NC_008818	GCT	2	6	266433	266438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027178
4605	NC_008818	ACT	2	6	266451	266456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027178
4606	NC_008818	CTC	2	6	266538	266543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027178
4607	NC_008818	CTC	2	6	266566	266571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027178
4608	NC_008818	CCT	2	6	266580	266585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027178
4609	NC_008818	TAG	2	6	266612	266617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027178
4610	NC_008818	GCC	2	6	266653	266658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027178
4611	NC_008818	TGC	2	6	266661	266666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027178
4612	NC_008818	GAG	2	6	266668	266673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027178
4613	NC_008818	TC	3	6	266700	266705	0 %	50 %	0 %	50 %	124027178
4614	NC_008818	CT	3	6	266707	266712	0 %	50 %	0 %	50 %	124027178
4615	NC_008818	ATGG	2	8	266715	266722	25 %	25 %	50 %	0 %	124027178
4616	NC_008818	GGC	2	6	266733	266738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027178
4617	NC_008818	GAG	2	6	266746	266751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027178
4618	NC_008818	CGA	2	6	266757	266762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027178
4619	NC_008818	AGC	2	6	266796	266801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027178
4620	NC_008818	AGG	2	6	266819	266824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027178
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4622	NC_008818	GGA	2	6	266877	266882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027178
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4986	NC_008818	CGG	2	6	285890	285895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027197
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4988	NC_008818	CTT	2	6	285922	285927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027197
4989	NC_008818	CGA	2	6	285928	285933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027197
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