MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 61747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008789	GTC	3	9	49984	49992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996858
1002	NC_008789	GCG	2	6	50007	50012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1003	NC_008789	CCT	2	6	50016	50021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996858
1004	NC_008789	GCC	2	6	50084	50089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996858
1005	NC_008789	CG	3	6	50130	50135	0 %	0 %	50 %	50 %	121996858
1006	NC_008789	GCC	2	6	50141	50146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996858
1007	NC_008789	GCC	2	6	50150	50155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996858
1008	NC_008789	TCAG	2	8	50165	50172	25 %	25 %	25 %	25 %	121996858
1009	NC_008789	ACC	2	6	50459	50464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996858
1010	NC_008789	TGG	2	6	50525	50530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996858
1011	NC_008789	GGGCC	2	10	50539	50548	0 %	0 %	60 %	40 %	121996858
1012	NC_008789	CAT	2	6	50572	50577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996858
1013	NC_008789	TCG	2	6	50606	50611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996858
1014	NC_008789	GCG	2	6	50617	50622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1015	NC_008789	CTC	2	6	50668	50673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996858
1016	NC_008789	CTT	2	6	50806	50811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121996858
1017	NC_008789	CGA	2	6	50838	50843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996858
1018	NC_008789	GGC	2	6	50869	50874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1019	NC_008789	GTC	2	6	50893	50898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996858
1020	NC_008789	CAT	2	6	50977	50982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996858
1021	NC_008789	CCT	2	6	51009	51014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996858
1022	NC_008789	CGG	2	6	51060	51065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1023	NC_008789	CGG	2	6	51077	51082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1024	NC_008789	GCG	2	6	51133	51138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1025	NC_008789	TCG	2	6	51158	51163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996858
1026	NC_008789	GGCC	2	8	51215	51222	0 %	0 %	50 %	50 %	121996859
1027	NC_008789	CGG	2	6	51397	51402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996859
1028	NC_008789	GC	3	6	51430	51435	0 %	0 %	50 %	50 %	121996859
1029	NC_008789	TGC	2	6	51466	51471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996859
1030	NC_008789	CAC	2	6	51492	51497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996859
1031	NC_008789	GGT	2	6	51537	51542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996859
1032	NC_008789	TGC	2	6	51550	51555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996859
1033	NC_008789	C	6	6	51555	51560	0 %	0 %	0 %	100 %	121996859
1034	NC_008789	GATC	2	8	51602	51609	25 %	25 %	25 %	25 %	121996859
1035	NC_008789	TCG	2	6	51628	51633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996859
1036	NC_008789	GAG	2	6	51655	51660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996859
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1038	NC_008789	CAGC	2	8	51735	51742	25 %	0 %	25 %	50 %	121996859
1039	NC_008789	CGG	2	6	51800	51805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996859
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1041	NC_008789	CAG	2	6	51864	51869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996859
1042	NC_008789	CGG	2	6	51961	51966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996859
1043	NC_008789	CTC	2	6	52041	52046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996859
1044	NC_008789	TCG	2	6	52066	52071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996859
1045	NC_008789	CAT	2	6	52073	52078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996859
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1049	NC_008789	GGT	2	6	52669	52674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996860
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1051	NC_008789	GAC	2	6	52706	52711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996860
1052	NC_008789	GCG	2	6	52718	52723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996860
1053	NC_008789	ACC	2	6	52809	52814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996860
1054	NC_008789	CGA	2	6	52831	52836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996860
1055	NC_008789	CG	3	6	52852	52857	0 %	0 %	50 %	50 %	121996860
1056	NC_008789	GCG	2	6	52896	52901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996860
1057	NC_008789	ACC	3	9	52913	52921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996860
1058	NC_008789	CA	3	6	52988	52993	50 %	0 %	0 %	50 %	121996860
1059	NC_008789	CTG	2	6	53069	53074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996860
1060	NC_008789	GGT	3	9	53089	53097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996860
1061	NC_008789	GCG	2	6	53115	53120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996860
1062	NC_008789	CGG	2	6	53183	53188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996860
1063	NC_008789	TTC	2	6	53255	53260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121996860
1064	NC_008789	GCC	2	6	53366	53371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996860
1065	NC_008789	CGA	2	6	53380	53385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996860
1066	NC_008789	GCC	2	6	53469	53474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996860
1067	NC_008789	TGC	2	6	53565	53570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996860
1068	NC_008789	CTTAAG	2	12	53639	53650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121996860
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1070	NC_008789	CGA	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996860
1071	NC_008789	CGA	2	6	53856	53861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996861
1072	NC_008789	CAA	2	6	53979	53984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121996861
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1076	NC_008789	CGA	2	6	54144	54149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996861
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1081	NC_008789	CGGCC	2	10	54391	54400	0 %	0 %	40 %	60 %	121996862
1082	NC_008789	GC	3	6	54493	54498	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
1083	NC_008789	GCA	2	6	54604	54609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996862
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1088	NC_008789	GGT	2	6	54892	54897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996862
1089	NC_008789	CAG	2	6	54905	54910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996862
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1092	NC_008789	GCT	2	6	55084	55089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996862
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1094	NC_008789	CGG	2	6	55138	55143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996862
1095	NC_008789	CCT	3	9	55186	55194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996862
1096	NC_008789	ACCCA	2	10	55239	55248	40 %	0 %	0 %	60 %	121996862
1097	NC_008789	GCA	2	6	55354	55359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996862
1098	NC_008789	CTG	2	6	55361	55366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996862
1099	NC_008789	CTC	2	6	55385	55390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996862
1100	NC_008789	GATA	2	8	55510	55517	50 %	25 %	25 %	0 %	121996862
1101	NC_008789	GCA	2	6	55537	55542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996862
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1103	NC_008789	TCG	3	9	55590	55598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996862
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1105	NC_008789	GCCG	2	8	55642	55649	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
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1107	NC_008789	ATC	2	6	55746	55751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996862
1108	NC_008789	GC	3	6	55913	55918	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
1109	NC_008789	GGCC	2	8	55966	55973	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
1110	NC_008789	CAGGCG	2	12	55979	55990	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121996862
1111	NC_008789	CGG	2	6	55994	55999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996862
1112	NC_008789	CCCAG	2	10	56053	56062	20 %	0 %	20 %	60 %	121996862
1113	NC_008789	GCG	2	6	56095	56100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996862
1114	NC_008789	ACC	2	6	56112	56117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996862
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1123	NC_008789	GCA	2	6	56613	56618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996862
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1125	NC_008789	CCG	2	6	56662	56667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996862
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1498	NC_008789	CCT	2	6	72614	72619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996872
1499	NC_008789	GCG	2	6	72628	72633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996872
1500	NC_008789	AGC	3	9	72667	72675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996872

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