MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 75646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_008358	GAC	2	6	141781	141786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797326
3003	NC_008358	CTG	2	6	141800	141805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797326
3004	NC_008358	AAG	2	6	141826	141831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797326
3005	NC_008358	ATG	2	6	142001	142006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800066
3006	NC_008358	TGC	2	6	142045	142050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800066
3007	NC_008358	GC	3	6	142059	142064	0 %	0 %	50 %	50 %	114800066
3008	NC_008358	CCG	2	6	142073	142078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800066
3009	NC_008358	GTC	2	6	142136	142141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800066
3010	NC_008358	GT	3	6	142212	142217	0 %	50 %	50 %	0 %	114800066
3011	NC_008358	TCGC	2	8	142246	142253	0 %	25 %	25 %	50 %	114800066
3012	NC_008358	GGC	2	6	142352	142357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800066
3013	NC_008358	CGG	2	6	142374	142379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800066
3014	NC_008358	CG	3	6	142381	142386	0 %	0 %	50 %	50 %	114800066
3015	NC_008358	CCG	2	6	142398	142403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800066
3016	NC_008358	GCA	2	6	142486	142491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800066
3017	NC_008358	TTC	2	6	142526	142531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114800066
3018	NC_008358	AAG	2	6	142709	142714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797110
3019	NC_008358	CT	3	6	142732	142737	0 %	50 %	0 %	50 %	114797110
3020	NC_008358	GGCG	2	8	142799	142806	0 %	0 %	75 %	25 %	114797110
3021	NC_008358	TTC	2	6	142822	142827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797110
3022	NC_008358	CG	3	6	142834	142839	0 %	0 %	50 %	50 %	114797110
3023	NC_008358	GTG	2	6	142926	142931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114797110
3024	NC_008358	GC	4	8	142945	142952	0 %	0 %	50 %	50 %	114797110
3025	NC_008358	AAG	2	6	143133	143138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114799876
3026	NC_008358	CG	3	6	143153	143158	0 %	0 %	50 %	50 %	114799876
3027	NC_008358	GGC	2	6	143193	143198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799876
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3029	NC_008358	GC	3	6	143279	143284	0 %	0 %	50 %	50 %	114799876
3030	NC_008358	AGC	2	6	143301	143306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799876
3031	NC_008358	GCG	2	6	143353	143358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799876
3032	NC_008358	ATC	2	6	143364	143369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799876
3033	NC_008358	ACA	2	6	143386	143391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799876
3034	NC_008358	CG	3	6	143397	143402	0 %	0 %	50 %	50 %	114799876
3035	NC_008358	GACA	2	8	143405	143412	50 %	0 %	25 %	25 %	114799876
3036	NC_008358	A	6	6	143429	143434	100 %	0 %	0 %	0 %	114799876
3037	NC_008358	GGC	2	6	143436	143441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799876
3038	NC_008358	ACC	2	6	143451	143456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114799876
3039	NC_008358	CAT	2	6	143543	143548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799876
3040	NC_008358	GGCG	2	8	143549	143556	0 %	0 %	75 %	25 %	114799876
3041	NC_008358	ATC	2	6	143679	143684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799876
3042	NC_008358	TGA	2	6	143734	143739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799876
3043	NC_008358	CGA	2	6	143765	143770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799876
3044	NC_008358	GGC	2	6	143902	143907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798254
3045	NC_008358	GGCG	2	8	143919	143926	0 %	0 %	75 %	25 %	114798254
3046	NC_008358	GGTC	2	8	144020	144027	0 %	25 %	50 %	25 %	114798254
3047	NC_008358	GTC	2	6	144100	144105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798254
3048	NC_008358	TCG	2	6	144107	144112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798254
3049	NC_008358	GC	3	6	144159	144164	0 %	0 %	50 %	50 %	114798254
3050	NC_008358	GCC	2	6	144207	144212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798254
3051	NC_008358	GAA	2	6	144219	144224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798254
3052	NC_008358	GCG	2	6	144288	144293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798254
3053	NC_008358	GAA	2	6	144375	144380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798254
3054	NC_008358	GCG	2	6	144448	144453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798254
3055	NC_008358	CGA	2	6	144494	144499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798254
3056	NC_008358	GA	3	6	144498	144503	50 %	0 %	50 %	0 %	114798254
3057	NC_008358	GCC	2	6	144522	144527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798254
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3059	NC_008358	GCC	2	6	144606	144611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798254
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3061	NC_008358	GAA	2	6	144717	144722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798254
3062	NC_008358	GGC	2	6	144753	144758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798254
3063	NC_008358	TTG	2	6	144799	144804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114798254
3064	NC_008358	TGA	2	6	144896	144901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798254
3065	NC_008358	CGA	2	6	144965	144970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798254
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3108	NC_008358	CG	3	6	147019	147024	0 %	0 %	50 %	50 %	114799790
3109	NC_008358	GCG	2	6	147046	147051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799790
3110	NC_008358	TCCA	2	8	147060	147067	25 %	25 %	0 %	50 %	114799790
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3373	NC_008358	ATC	2	6	161231	161236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797610
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3475	NC_008358	GC	3	6	166825	166830	0 %	0 %	50 %	50 %	114798757
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3482	NC_008358	GTT	2	6	167033	167038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114798757
3483	NC_008358	AGC	2	6	167065	167070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797635
3484	NC_008358	GGA	2	6	167099	167104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114797635
3485	NC_008358	CAT	2	6	167159	167164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797635
3486	NC_008358	GCCTGC	2	12	167180	167191	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114797635
3487	NC_008358	CCA	2	6	167195	167200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797635
3488	NC_008358	CG	4	8	167698	167705	0 %	0 %	50 %	50 %	114800245
3489	NC_008358	CGC	2	6	167713	167718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800245
3490	NC_008358	TCGC	2	8	167765	167772	0 %	25 %	25 %	50 %	114800245
3491	NC_008358	TCGGT	2	10	167832	167841	0 %	40 %	40 %	20 %	114800245
3492	NC_008358	A	6	6	167918	167923	100 %	0 %	0 %	0 %	114800245
3493	NC_008358	GC	3	6	167945	167950	0 %	0 %	50 %	50 %	114800245
3494	NC_008358	AC	3	6	168050	168055	50 %	0 %	0 %	50 %	114800245
3495	NC_008358	ACTG	2	8	168068	168075	25 %	25 %	25 %	25 %	114800245
3496	NC_008358	GACG	2	8	168076	168083	25 %	0 %	50 %	25 %	114800245
3497	NC_008358	CG	3	6	168082	168087	0 %	0 %	50 %	50 %	114800245
3498	NC_008358	CA	3	6	168154	168159	50 %	0 %	0 %	50 %	114800245
3499	NC_008358	GCG	2	6	168165	168170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800245
3500	NC_008358	GGC	2	6	168214	168219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800245

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