MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 36808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	TGTGA	2	10	378	387	20 %	40 %	40 %	0 %	113460150
2	NC_008309	AAT	2	6	519	524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
3	NC_008309	ATTT	2	8	556	563	25 %	75 %	0 %	0 %	113460150
4	NC_008309	TAA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
5	NC_008309	T	6	6	624	629	0 %	100 %	0 %	0 %	113460150
6	NC_008309	TAG	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460150
7	NC_008309	GAA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460150
8	NC_008309	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460150
9	NC_008309	GTTA	2	8	686	693	25 %	50 %	25 %	0 %	113460150
10	NC_008309	TAA	2	6	794	799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
11	NC_008309	AGAT	2	8	830	837	50 %	25 %	25 %	0 %	113460150
12	NC_008309	TCT	2	6	888	893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460150
13	NC_008309	AT	3	6	916	921	50 %	50 %	0 %	0 %	113460150
14	NC_008309	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460150
15	NC_008309	TGA	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460150
16	NC_008309	AAT	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
17	NC_008309	TAT	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460150
18	NC_008309	AT	3	6	2013	2018	50 %	50 %	0 %	0 %	113460151
19	NC_008309	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460151
20	NC_008309	TCG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
21	NC_008309	CAA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460151
22	NC_008309	TGA	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460151
23	NC_008309	T	8	8	2298	2305	0 %	100 %	0 %	0 %	113460151
24	NC_008309	TAA	2	6	2408	2413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460151
25	NC_008309	G	6	6	2499	2504	0 %	0 %	100 %	0 %	113460151
26	NC_008309	ACAG	2	8	2533	2540	50 %	0 %	25 %	25 %	113460151
27	NC_008309	TGC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
28	NC_008309	CTG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
29	NC_008309	CTT	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460151
30	NC_008309	AAAT	2	8	2651	2658	75 %	25 %	0 %	0 %	113460151
31	NC_008309	TGG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460151
32	NC_008309	GTA	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460151
33	NC_008309	GATT	2	8	2798	2805	25 %	50 %	25 %	0 %	113460151
34	NC_008309	ATT	2	6	2836	2841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460151
35	NC_008309	AAAT	2	8	2865	2872	75 %	25 %	0 %	0 %	113460151
36	NC_008309	G	6	6	3024	3029	0 %	0 %	100 %	0 %	113460151
37	NC_008309	CTG	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
38	NC_008309	CAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460151
39	NC_008309	A	6	6	3154	3159	100 %	0 %	0 %	0 %	113460151
40	NC_008309	T	7	7	3248	3254	0 %	100 %	0 %	0 %	113460151
41	NC_008309	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460151
42	NC_008309	TACT	2	8	3395	3402	25 %	50 %	0 %	25 %	113460152
43	NC_008309	CTAG	2	8	3408	3415	25 %	25 %	25 %	25 %	113460152
44	NC_008309	GTT	2	6	3448	3453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460152
45	NC_008309	ATC	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460152
46	NC_008309	CAG	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460152
47	NC_008309	ATC	2	6	3593	3598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460152
48	NC_008309	CCA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460152
49	NC_008309	T	6	6	3624	3629	0 %	100 %	0 %	0 %	113460152
50	NC_008309	TGC	2	6	3635	3640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460152
51	NC_008309	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460152
52	NC_008309	AAT	2	6	3767	3772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460152
53	NC_008309	ACA	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460152
54	NC_008309	ACT	2	6	4019	4024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460153
55	NC_008309	CTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460153
56	NC_008309	AGA	2	6	4073	4078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
57	NC_008309	ATT	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460153
58	NC_008309	T	7	7	4121	4127	0 %	100 %	0 %	0 %	113460153
59	NC_008309	TGA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
60	NC_008309	GTA	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
61	NC_008309	AT	3	6	4283	4288	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
62	NC_008309	GAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
63	NC_008309	TTAA	2	8	4482	4489	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
64	NC_008309	GAA	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
65	NC_008309	TA	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
66	NC_008309	CGG	2	6	4532	4537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460153
67	NC_008309	AAT	2	6	4578	4583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460153
68	NC_008309	T	6	6	4685	4690	0 %	100 %	0 %	0 %	113460153
69	NC_008309	CAA	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460153
70	NC_008309	AACC	2	8	4707	4714	50 %	0 %	0 %	50 %	113460153
71	NC_008309	CAA	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460153
72	NC_008309	GTA	2	6	4983	4988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
73	NC_008309	CAT	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460153
74	NC_008309	CTT	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460153
75	NC_008309	A	7	7	5304	5310	100 %	0 %	0 %	0 %	113460153
76	NC_008309	CGAT	2	8	5320	5327	25 %	25 %	25 %	25 %	113460153
77	NC_008309	TATC	2	8	5332	5339	25 %	50 %	0 %	25 %	113460153
78	NC_008309	TGCT	2	8	5637	5644	0 %	50 %	25 %	25 %	113460154
79	NC_008309	TCC	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460154
80	NC_008309	AGC	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
81	NC_008309	CTT	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460154
82	NC_008309	T	6	6	5963	5968	0 %	100 %	0 %	0 %	113460154
83	NC_008309	T	6	6	6023	6028	0 %	100 %	0 %	0 %	113460154
84	NC_008309	CAAG	2	8	6052	6059	50 %	0 %	25 %	25 %	113460154
85	NC_008309	CAT	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
86	NC_008309	TCA	2	6	6097	6102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
87	NC_008309	AT	3	6	6271	6276	50 %	50 %	0 %	0 %	113460154
88	NC_008309	C	6	6	6322	6327	0 %	0 %	0 %	100 %	113460154
89	NC_008309	TAA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
90	NC_008309	CAA	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
91	NC_008309	ATT	2	6	6436	6441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460154
92	NC_008309	TAA	2	6	6570	6575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
93	NC_008309	TCA	2	6	6589	6594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
94	NC_008309	GTT	2	6	6599	6604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460154
95	NC_008309	TTC	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460154
96	NC_008309	AAT	2	6	6669	6674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
97	NC_008309	ATA	2	6	6756	6761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
98	NC_008309	TCA	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
99	NC_008309	CTC	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460154
100	NC_008309	TAAG	2	8	6923	6930	50 %	25 %	25 %	0 %	113460154
101	NC_008309	G	6	6	6930	6935	0 %	0 %	100 %	0 %	113460154
102	NC_008309	AAT	2	6	6942	6947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
103	NC_008309	CGCT	2	8	6948	6955	0 %	25 %	25 %	50 %	113460154
104	NC_008309	TGT	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460154
105	NC_008309	CAA	2	6	7004	7009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
106	NC_008309	TTC	2	6	7161	7166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460154
107	NC_008309	TGC	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460154
108	NC_008309	TGT	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460154
109	NC_008309	GAC	2	6	7205	7210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
110	NC_008309	GCA	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
111	NC_008309	CAA	2	6	7455	7460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
112	NC_008309	GCA	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
113	NC_008309	AATTG	2	10	7543	7552	40 %	40 %	20 %	0 %	113460154
114	NC_008309	GAC	3	9	7580	7588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
115	NC_008309	GGC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460154
116	NC_008309	T	6	6	7757	7762	0 %	100 %	0 %	0 %	113460154
117	NC_008309	TCA	2	6	7813	7818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
118	NC_008309	GCCA	2	8	7968	7975	25 %	0 %	25 %	50 %	113460154
119	NC_008309	TTAG	2	8	8008	8015	25 %	50 %	25 %	0 %	113460154
120	NC_008309	TAA	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
121	NC_008309	CAG	2	6	8033	8038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
122	NC_008309	T	7	7	8040	8046	0 %	100 %	0 %	0 %	113460154
123	NC_008309	CAT	3	9	8048	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
124	NC_008309	A	6	6	8057	8062	100 %	0 %	0 %	0 %	113460154
125	NC_008309	ACA	2	6	8090	8095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
126	NC_008309	TCA	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
127	NC_008309	TG	3	6	8160	8165	0 %	50 %	50 %	0 %	113460154
128	NC_008309	TAAA	2	8	8333	8340	75 %	25 %	0 %	0 %	113460155
129	NC_008309	ACGCC	2	10	8359	8368	20 %	0 %	20 %	60 %	113460155
130	NC_008309	ATAA	2	8	8369	8376	75 %	25 %	0 %	0 %	113460155
131	NC_008309	AGC	2	6	8385	8390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460155
132	NC_008309	T	6	6	8439	8444	0 %	100 %	0 %	0 %	113460155
133	NC_008309	CTTT	2	8	8470	8477	0 %	75 %	0 %	25 %	113460155
134	NC_008309	ATCAAT	2	12	8526	8537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	113460155
135	NC_008309	TGA	2	6	8570	8575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460155
136	NC_008309	CTA	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460155
137	NC_008309	TTG	2	6	8697	8702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460155
138	NC_008309	TAA	2	6	8709	8714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460155
139	NC_008309	TTTGG	2	10	8765	8774	0 %	60 %	40 %	0 %	113460155
140	NC_008309	TAT	2	6	8825	8830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460155
141	NC_008309	AAT	2	6	8836	8841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460155
142	NC_008309	T	7	7	8856	8862	0 %	100 %	0 %	0 %	113460155
143	NC_008309	AAC	2	6	8888	8893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460155
144	NC_008309	TGT	3	9	8902	8910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460155
145	NC_008309	GCTC	2	8	8923	8930	0 %	25 %	25 %	50 %	113460155
146	NC_008309	A	7	7	8973	8979	100 %	0 %	0 %	0 %	113460155
147	NC_008309	TGT	2	6	8989	8994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460155
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150	NC_008309	T	6	6	9125	9130	0 %	100 %	0 %	0 %	113460155
151	NC_008309	CTAA	2	8	9139	9146	50 %	25 %	0 %	25 %	113460156
152	NC_008309	TAAA	2	8	9155	9162	75 %	25 %	0 %	0 %	113460156
153	NC_008309	TGTT	2	8	9309	9316	0 %	75 %	25 %	0 %	113460156
154	NC_008309	T	7	7	9399	9405	0 %	100 %	0 %	0 %	113460156
155	NC_008309	TGT	2	6	9442	9447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460156
156	NC_008309	A	8	8	9494	9501	100 %	0 %	0 %	0 %	113460156
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160	NC_008309	TG	3	6	9667	9672	0 %	50 %	50 %	0 %	113460156
161	NC_008309	TTG	2	6	9682	9687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460156
162	NC_008309	TCT	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460157
163	NC_008309	T	6	6	9749	9754	0 %	100 %	0 %	0 %	113460157
164	NC_008309	T	6	6	9855	9860	0 %	100 %	0 %	0 %	113460157
165	NC_008309	CAA	2	6	9880	9885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460157
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167	NC_008309	TGT	2	6	9918	9923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460157
168	NC_008309	TTC	2	6	9938	9943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460157
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170	NC_008309	ATT	2	6	10073	10078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460157
171	NC_008309	AAC	2	6	10120	10125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460157
172	NC_008309	T	7	7	10139	10145	0 %	100 %	0 %	0 %	113460157
173	NC_008309	T	6	6	10376	10381	0 %	100 %	0 %	0 %	113460158
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177	NC_008309	TTTTA	2	10	10598	10607	20 %	80 %	0 %	0 %	113460158
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256	NC_008309	ATA	2	6	14945	14950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460163
257	NC_008309	GAA	2	6	14953	14958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460163
258	NC_008309	GAA	2	6	14962	14967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460163
259	NC_008309	TATTT	2	10	14980	14989	20 %	80 %	0 %	0 %	113460163
260	NC_008309	GAT	2	6	15019	15024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460163
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262	NC_008309	ATG	2	6	15087	15092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460164
263	NC_008309	T	6	6	15107	15112	0 %	100 %	0 %	0 %	113460164
264	NC_008309	AGC	2	6	15125	15130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460164
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