MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 36808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008309	CGA	2	6	184260	184265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460345
3502	NC_008309	CTT	2	6	184288	184293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460345
3503	NC_008309	TCA	3	9	184386	184394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460345
3504	NC_008309	ACG	2	6	184505	184510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460345
3505	NC_008309	CAA	2	6	184528	184533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460345
3506	NC_008309	ACA	2	6	184551	184556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460345
3507	NC_008309	AAT	2	6	184584	184589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460345
3508	NC_008309	CAT	2	6	184607	184612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460345
3509	NC_008309	TTCC	2	8	184699	184706	0 %	50 %	0 %	50 %	113460345
3510	NC_008309	AAG	2	6	184931	184936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460345
3511	NC_008309	TCA	2	6	184959	184964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460345
3512	NC_008309	TCT	2	6	184965	184970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460345
3513	NC_008309	TTG	2	6	184982	184987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460345
3514	NC_008309	AAT	2	6	185003	185008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460345
3515	NC_008309	ATCT	2	8	185020	185027	25 %	50 %	0 %	25 %	113460345
3516	NC_008309	TCA	2	6	185076	185081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460345
3517	NC_008309	CAA	2	6	185149	185154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460345
3518	NC_008309	TGA	2	6	185181	185186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460345
3519	NC_008309	CAA	2	6	185248	185253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460345
3520	NC_008309	ACG	2	6	185267	185272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460345
3521	NC_008309	AT	3	6	185295	185300	50 %	50 %	0 %	0 %	113460345
3522	NC_008309	GTT	2	6	185319	185324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460345
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3524	NC_008309	TCA	2	6	185427	185432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460345
3525	NC_008309	ATAA	2	8	185433	185440	75 %	25 %	0 %	0 %	113460345
3526	NC_008309	CTT	3	9	185452	185460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460345
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3529	NC_008309	AGAA	2	8	185546	185553	75 %	0 %	25 %	0 %	113460345
3530	NC_008309	T	6	6	185664	185669	0 %	100 %	0 %	0 %	113460345
3531	NC_008309	ACG	2	6	185672	185677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460345
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3534	NC_008309	TTCA	2	8	185810	185817	25 %	50 %	0 %	25 %	113460345
3535	NC_008309	CCT	2	6	185826	185831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460345
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3540	NC_008309	GTT	2	6	185962	185967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460345
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3542	NC_008309	ATT	2	6	186029	186034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460345
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3544	NC_008309	TAA	2	6	186113	186118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460345
3545	NC_008309	TTG	2	6	186227	186232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460345
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3549	NC_008309	AAT	2	6	186566	186571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460346
3550	NC_008309	CAGT	2	8	186577	186584	25 %	25 %	25 %	25 %	113460346
3551	NC_008309	AAT	2	6	186596	186601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460346
3552	NC_008309	AAGA	2	8	186638	186645	75 %	0 %	25 %	0 %	113460346
3553	NC_008309	TAA	2	6	186671	186676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460346
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3556	NC_008309	AAAT	2	8	186728	186735	75 %	25 %	0 %	0 %	113460346
3557	NC_008309	CCA	2	6	186743	186748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460346
3558	NC_008309	GA	4	8	186816	186823	50 %	0 %	50 %	0 %	113460346
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3562	NC_008309	AACC	2	8	187230	187237	50 %	0 %	0 %	50 %	113460347
3563	NC_008309	TATT	2	8	187251	187258	25 %	75 %	0 %	0 %	113460347
3564	NC_008309	ACA	2	6	187262	187267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460347
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3569	NC_008309	TGA	2	6	187447	187452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460348
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3574	NC_008309	TTG	2	6	187674	187679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460348
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3578	NC_008309	A	6	6	187949	187954	100 %	0 %	0 %	0 %	113460348
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3588	NC_008309	ACCA	2	8	188749	188756	50 %	0 %	0 %	50 %	113460348
3589	NC_008309	ACCG	2	8	188779	188786	25 %	0 %	25 %	50 %	113460348
3590	NC_008309	CA	3	6	188908	188913	50 %	0 %	0 %	50 %	113460348
3591	NC_008309	CAA	2	6	188928	188933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460348
3592	NC_008309	A	6	6	188944	188949	100 %	0 %	0 %	0 %	113460348
3593	NC_008309	ACA	2	6	189007	189012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460348
3594	NC_008309	CTGTGG	2	12	189123	189134	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	113460348
3595	NC_008309	TTA	2	6	189143	189148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460348
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3597	NC_008309	TCA	2	6	189246	189251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460349
3598	NC_008309	A	6	6	189281	189286	100 %	0 %	0 %	0 %	113460349
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3602	NC_008309	GT	3	6	189534	189539	0 %	50 %	50 %	0 %	113460349
3603	NC_008309	ATG	2	6	189552	189557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460349
3604	NC_008309	TTGC	2	8	189629	189636	0 %	50 %	25 %	25 %	113460349
3605	NC_008309	TTA	2	6	189650	189655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460349
3606	NC_008309	AGC	3	9	189748	189756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460349
3607	NC_008309	ATT	2	6	189764	189769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460349
3608	NC_008309	GGT	2	6	189770	189775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460349
3609	NC_008309	ATT	2	6	189823	189828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460349
3610	NC_008309	AAT	2	6	189889	189894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460349
3611	NC_008309	TAAAAT	2	12	189922	189933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460349
3612	NC_008309	A	6	6	189963	189968	100 %	0 %	0 %	0 %	113460349
3613	NC_008309	TTG	2	6	189996	190001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460349
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3617	NC_008309	TGA	2	6	190260	190265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460349
3618	NC_008309	AATC	2	8	190285	190292	50 %	25 %	0 %	25 %	113460349
3619	NC_008309	CCG	2	6	190317	190322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113460349
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3625	NC_008309	GCA	2	6	190463	190468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460349
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3741	NC_008309	AGCTG	2	10	198202	198211	20 %	20 %	40 %	20 %	113460355
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3988	NC_008309	ACCG	2	8	212319	212326	25 %	0 %	25 %	50 %	113460355
3989	NC_008309	TGT	2	6	212394	212399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460355
3990	NC_008309	T	6	6	212864	212869	0 %	100 %	0 %	0 %	113460356
3991	NC_008309	AAG	2	6	212890	212895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460356
3992	NC_008309	TGT	2	6	212911	212916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460356
3993	NC_008309	AAT	2	6	212955	212960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460356
3994	NC_008309	AGGT	2	8	213104	213111	25 %	25 %	50 %	0 %	113460356
3995	NC_008309	TCA	2	6	213112	213117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460356
3996	NC_008309	TGT	3	9	213169	213177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460356
3997	NC_008309	CCG	2	6	213178	213183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113460356
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3999	NC_008309	CTT	2	6	213248	213253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460356
4000	NC_008309	TCA	2	6	213262	213267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460356

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